MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_014532	CGC	2	6	343937	343942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543887
7002	NC_014532	TGA	2	6	343994	343999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543887
7003	NC_014532	GCGCG	2	10	344075	344084	0 %	0 %	60 %	40 %	307543887
7004	NC_014532	TGT	2	6	344093	344098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543887
7005	NC_014532	GCA	2	6	344105	344110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543887
7006	NC_014532	TCG	2	6	344119	344124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543887
7007	NC_014532	GGC	2	6	344196	344201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543887
7008	NC_014532	TGGG	2	8	344224	344231	0 %	25 %	75 %	0 %	307543887
7009	NC_014532	CAT	2	6	344238	344243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543887
7010	NC_014532	GCC	2	6	344253	344258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543887
7011	NC_014532	CCG	2	6	344278	344283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543887
7012	NC_014532	CAT	2	6	344510	344515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543888
7013	NC_014532	CTT	2	6	344534	344539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543888
7014	NC_014532	GCG	3	9	344583	344591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543888
7015	NC_014532	GAC	2	6	344624	344629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543888
7016	NC_014532	TGC	2	6	344656	344661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543888
7017	NC_014532	CCGG	2	8	344728	344735	0 %	0 %	50 %	50 %	307543888
7018	NC_014532	CGG	2	6	344768	344773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543888
7019	NC_014532	TGC	2	6	344824	344829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543888
7020	NC_014532	AGG	2	6	344830	344835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543888
7021	NC_014532	CTG	2	6	344844	344849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543888
7022	NC_014532	GCG	3	9	344878	344886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543888
7023	NC_014532	GGC	2	6	344898	344903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543888
7024	NC_014532	GTG	2	6	344935	344940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543888
7025	NC_014532	GCT	3	9	344957	344965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543888
7026	NC_014532	TCG	2	6	345079	345084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543888
7027	NC_014532	GTG	2	6	345157	345162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543888
7028	NC_014532	G	6	6	345170	345175	0 %	0 %	100 %	0 %	307543888
7029	NC_014532	GGC	2	6	345204	345209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543888
7030	NC_014532	GTTGCC	2	12	345236	345247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543888
7031	NC_014532	GCT	2	6	345260	345265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543888
7032	NC_014532	TGG	3	9	345334	345342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543888
7033	NC_014532	CCA	2	6	345343	345348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543888
7034	NC_014532	TAT	2	6	345399	345404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307543888
7035	NC_014532	ATC	2	6	345519	345524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543888
7036	NC_014532	CGTG	2	8	345572	345579	0 %	25 %	50 %	25 %	307543888
7037	NC_014532	CTGG	2	8	345590	345597	0 %	25 %	50 %	25 %	307543888
7038	NC_014532	CGG	2	6	345613	345618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543888
7039	NC_014532	GAT	2	6	345686	345691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543888
7040	NC_014532	TCAG	2	8	345705	345712	25 %	25 %	25 %	25 %	307543888
7041	NC_014532	CTGGC	2	10	345718	345727	0 %	20 %	40 %	40 %	307543888
7042	NC_014532	GCAC	2	8	345756	345763	25 %	0 %	25 %	50 %	307543888
7043	NC_014532	CAGC	2	8	345836	345843	25 %	0 %	25 %	50 %	307543888
7044	NC_014532	GTG	2	6	345849	345854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543888
7045	NC_014532	GCG	2	6	345863	345868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543888
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7047	NC_014532	CGAG	2	8	346109	346116	25 %	0 %	50 %	25 %	307543889
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7049	NC_014532	TTCC	2	8	346151	346158	0 %	50 %	0 %	50 %	307543889
7050	NC_014532	GGC	2	6	346175	346180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543889
7051	NC_014532	CGG	2	6	346262	346267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543889
7052	NC_014532	AGA	2	6	346285	346290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543889
7053	NC_014532	CGA	2	6	346326	346331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543889
7054	NC_014532	ATC	2	6	346356	346361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543889
7055	NC_014532	TTC	2	6	346386	346391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543889
7056	NC_014532	GCT	2	6	346462	346467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543889
7057	NC_014532	TGG	2	6	346474	346479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543889
7058	NC_014532	TTG	2	6	346629	346634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543889
7059	NC_014532	AGCA	2	8	346701	346708	50 %	0 %	25 %	25 %	307543889
7060	NC_014532	CGA	2	6	346712	346717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543889
7061	NC_014532	GCG	2	6	346730	346735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543889
7062	NC_014532	CTG	2	6	346749	346754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543889
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7226	NC_014532	TCAA	2	8	355916	355923	50 %	25 %	0 %	25 %	307543896
7227	NC_014532	TCA	2	6	355940	355945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543896
7228	NC_014532	CTA	2	6	355947	355952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543896
7229	NC_014532	C	6	6	355955	355960	0 %	0 %	0 %	100 %	307543896
7230	NC_014532	GCA	2	6	355993	355998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543896
7231	NC_014532	TTG	2	6	355999	356004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543896
7232	NC_014532	CGGC	2	8	356009	356016	0 %	0 %	50 %	50 %	307543896
7233	NC_014532	TGGTC	2	10	356019	356028	0 %	40 %	40 %	20 %	307543896
7234	NC_014532	GATC	2	8	356061	356068	25 %	25 %	25 %	25 %	307543896
7235	NC_014532	GCG	2	6	356076	356081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543896
7236	NC_014532	CTT	2	6	356142	356147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543896
7237	NC_014532	CGG	2	6	356160	356165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543896
7238	NC_014532	GCT	3	9	356178	356186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543896
7239	NC_014532	TCAG	2	8	356213	356220	25 %	25 %	25 %	25 %	307543896
7240	NC_014532	GC	3	6	356268	356273	0 %	0 %	50 %	50 %	307543896
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7245	NC_014532	ATG	2	6	356553	356558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543896
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7357	NC_014532	TGC	2	6	365191	365196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543902
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7359	NC_014532	CGA	2	6	365279	365284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543902
7360	NC_014532	CATCG	2	10	365361	365370	20 %	20 %	20 %	40 %	307543902
7361	NC_014532	GTC	2	6	365424	365429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543902
7362	NC_014532	AAAG	2	8	365434	365441	75 %	0 %	25 %	0 %	307543902
7363	NC_014532	CAGT	2	8	365642	365649	25 %	25 %	25 %	25 %	307543903
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7479	NC_014532	CCG	2	6	370623	370628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543906
7480	NC_014532	GTG	2	6	370701	370706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543906
7481	NC_014532	C	6	6	370708	370713	0 %	0 %	0 %	100 %	307543906
7482	NC_014532	CGAC	2	8	370765	370772	25 %	0 %	25 %	50 %	307543906
7483	NC_014532	CCG	2	6	370816	370821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543906
7484	NC_014532	CTG	2	6	370857	370862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543906
7485	NC_014532	GTG	2	6	370935	370940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543906
7486	NC_014532	GCC	2	6	370947	370952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543906
7487	NC_014532	AGCG	2	8	370972	370979	25 %	0 %	50 %	25 %	307543906
7488	NC_014532	CAG	2	6	371010	371015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543906
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7491	NC_014532	CGT	2	6	371135	371140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543906
7492	NC_014532	CCG	2	6	371182	371187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543906
7493	NC_014532	TAC	2	6	371244	371249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543906
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7497	NC_014532	GCTG	2	8	371489	371496	0 %	25 %	50 %	25 %	307543906
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7499	NC_014532	GCC	2	6	371725	371730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543907
7500	NC_014532	GCTG	2	8	371759	371766	0 %	25 %	50 %	25 %	307543907

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