MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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72002	NC_014532	GCG	2	6	3553114	3553119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546616
72003	NC_014532	CTG	2	6	3553124	3553129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546616
72004	NC_014532	CGC	2	6	3553210	3553215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546616
72005	NC_014532	CGA	2	6	3553237	3553242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546616
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72116	NC_014532	CGG	2	6	3558666	3558671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546623
72117	NC_014532	GCC	2	6	3558731	3558736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546623
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72120	NC_014532	TCC	2	6	3558782	3558787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307546623
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72124	NC_014532	CGGTAC	2	12	3558979	3558990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307546623
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72127	NC_014532	CTG	2	6	3559166	3559171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546623
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72143	NC_014532	TCAG	2	8	3560406	3560413	25 %	25 %	25 %	25 %	307546624
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72145	NC_014532	CGG	2	6	3560440	3560445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546624
72146	NC_014532	GCTG	2	8	3560454	3560461	0 %	25 %	50 %	25 %	307546624
72147	NC_014532	GGCC	2	8	3560512	3560519	0 %	0 %	50 %	50 %	307546624
72148	NC_014532	GGC	2	6	3560644	3560649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546624
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72151	NC_014532	GCG	2	6	3560719	3560724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546624
72152	NC_014532	CCG	2	6	3560738	3560743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546624
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72154	NC_014532	GCA	2	6	3560771	3560776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546624
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72161	NC_014532	G	6	6	3561759	3561764	0 %	0 %	100 %	0 %	307546625
72162	NC_014532	TCC	2	6	3561767	3561772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307546625
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72183	NC_014532	CAT	2	6	3564166	3564171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546627
72184	NC_014532	GC	3	6	3564190	3564195	0 %	0 %	50 %	50 %	307546627
72185	NC_014532	TCT	2	6	3564216	3564221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546627
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72194	NC_014532	CAAC	2	8	3564770	3564777	50 %	0 %	0 %	50 %	307546628
72195	NC_014532	TCT	2	6	3564875	3564880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546628
72196	NC_014532	ACTG	3	12	3564962	3564973	25 %	25 %	25 %	25 %	307546628
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72198	NC_014532	GATATG	2	12	3565163	3565174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307546629
72199	NC_014532	GAC	2	6	3565180	3565185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546629
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72201	NC_014532	CCA	2	6	3565249	3565254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546629
72202	NC_014532	C	8	8	3565288	3565295	0 %	0 %	0 %	100 %	307546629
72203	NC_014532	CGA	2	6	3565525	3565530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546629
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72205	NC_014532	ATC	2	6	3565661	3565666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546629
72206	NC_014532	TCTT	2	8	3567344	3567351	0 %	75 %	0 %	25 %	307546630
72207	NC_014532	GAA	2	6	3567573	3567578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307546630
72208	NC_014532	GTC	2	6	3567589	3567594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72209	NC_014532	GGT	2	6	3567621	3567626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546630
72210	NC_014532	GAT	2	6	3567657	3567662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307546630
72211	NC_014532	CCGG	2	8	3567765	3567772	0 %	0 %	50 %	50 %	307546630
72212	NC_014532	CG	4	8	3567815	3567822	0 %	0 %	50 %	50 %	307546630
72213	NC_014532	CTGG	2	8	3567825	3567832	0 %	25 %	50 %	25 %	307546630
72214	NC_014532	GTC	2	6	3567934	3567939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72215	NC_014532	GATCGC	2	12	3567940	3567951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72216	NC_014532	GGT	2	6	3567987	3567992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546630
72217	NC_014532	G	7	7	3568011	3568017	0 %	0 %	100 %	0 %	307546630
72218	NC_014532	CCG	2	6	3568040	3568045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546630
72219	NC_014532	CGG	2	6	3568088	3568093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546630
72220	NC_014532	ACG	2	6	3568138	3568143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72221	NC_014532	GAC	2	6	3568149	3568154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72222	NC_014532	GCA	2	6	3568200	3568205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72223	NC_014532	CAG	2	6	3568237	3568242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72224	NC_014532	CGGA	2	8	3568297	3568304	25 %	0 %	50 %	25 %	307546630
72225	NC_014532	GAC	2	6	3568333	3568338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72226	NC_014532	CAG	2	6	3568342	3568347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546630
72227	NC_014532	CAC	2	6	3568453	3568458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546630
72228	NC_014532	CAT	2	6	3568461	3568466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546630
72229	NC_014532	CAC	2	6	3568470	3568475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546630
72230	NC_014532	TGAG	2	8	3568499	3568506	25 %	25 %	50 %	0 %	307546630
72231	NC_014532	GAATG	2	10	3568510	3568519	40 %	20 %	40 %	0 %	307546630
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72330	NC_014532	CGC	3	9	3573815	3573823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546636
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72333	NC_014532	CCCTGG	2	12	3573903	3573914	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307546636
72334	NC_014532	GGT	2	6	3573927	3573932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546636
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72341	NC_014532	GGC	2	6	3574254	3574259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546636
72342	NC_014532	TC	3	6	3574265	3574270	0 %	50 %	0 %	50 %	307546636
72343	NC_014532	TGC	2	6	3574280	3574285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546636
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72345	NC_014532	CCGGAT	3	18	3574365	3574382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307546636
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72461	NC_014532	TGG	2	6	3579693	3579698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546641
72462	NC_014532	ACC	2	6	3579761	3579766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546641
72463	NC_014532	GGC	2	6	3579767	3579772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546641
72464	NC_014532	TGGG	2	8	3579773	3579780	0 %	25 %	75 %	0 %	307546641
72465	NC_014532	TGA	2	6	3579822	3579827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307546641
72466	NC_014532	TG	3	6	3579839	3579844	0 %	50 %	50 %	0 %	307546641
72467	NC_014532	C	6	6	3579861	3579866	0 %	0 %	0 %	100 %	307546641
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72470	NC_014532	GCCG	2	8	3579935	3579942	0 %	0 %	50 %	50 %	307546641
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72472	NC_014532	GCTG	2	8	3580002	3580009	0 %	25 %	50 %	25 %	307546641
72473	NC_014532	TTCC	2	8	3580030	3580037	0 %	50 %	0 %	50 %	307546641
72474	NC_014532	CTG	2	6	3580052	3580057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546641
72475	NC_014532	TGA	2	6	3580080	3580085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307546641
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72481	NC_014532	GT	3	6	3580694	3580699	0 %	50 %	50 %	0 %	307546643
72482	NC_014532	CGA	3	9	3580766	3580774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546643
72483	NC_014532	TGA	2	6	3580804	3580809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307546643
72484	NC_014532	ACC	2	6	3580953	3580958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546644
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72486	NC_014532	CCTGGC	2	12	3580982	3580993	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307546644
72487	NC_014532	ACA	2	6	3580994	3580999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307546644
72488	NC_014532	G	6	6	3581040	3581045	0 %	0 %	100 %	0 %	307546644
72489	NC_014532	CCT	2	6	3581083	3581088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307546644
72490	NC_014532	TGG	2	6	3581089	3581094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546644
72491	NC_014532	TCG	2	6	3581125	3581130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546644
72492	NC_014532	CGG	2	6	3581200	3581205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546644
72493	NC_014532	TCG	2	6	3581221	3581226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546644
72494	NC_014532	CTGG	2	8	3581234	3581241	0 %	25 %	50 %	25 %	307546644
72495	NC_014532	TGG	2	6	3581372	3581377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546645
72496	NC_014532	GGC	2	6	3581383	3581388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546645
72497	NC_014532	TGG	2	6	3581425	3581430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546645
72498	NC_014532	GGT	2	6	3581445	3581450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546645
72499	NC_014532	CTG	2	6	3581485	3581490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546645
72500	NC_014532	GCA	2	6	3581498	3581503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546645

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