MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_014532	CGACGC	2	12	3357025	3357036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	307546450
68002	NC_014532	CAC	2	6	3357095	3357100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546450
68003	NC_014532	CCTT	2	8	3357132	3357139	0 %	50 %	0 %	50 %	307546450
68004	NC_014532	ACC	2	6	3357153	3357158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546450
68005	NC_014532	TTCA	2	8	3357457	3357464	25 %	50 %	0 %	25 %	307546451
68006	NC_014532	TCGG	2	8	3357480	3357487	0 %	25 %	50 %	25 %	307546451
68007	NC_014532	CTC	2	6	3357506	3357511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307546451
68008	NC_014532	TCG	2	6	3357528	3357533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546451
68009	NC_014532	CAG	2	6	3357551	3357556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546451
68010	NC_014532	GTG	2	6	3357620	3357625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546451
68011	NC_014532	AGC	2	6	3357633	3357638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546451
68012	NC_014532	CCG	2	6	3357650	3357655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546451
68013	NC_014532	CAG	2	6	3357695	3357700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546451
68014	NC_014532	CGT	2	6	3357703	3357708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546451
68015	NC_014532	TGGC	2	8	3357787	3357794	0 %	25 %	50 %	25 %	307546451
68016	NC_014532	CGC	3	9	3357799	3357807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546451
68017	NC_014532	CCA	2	6	3357853	3357858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546451
68018	NC_014532	CCA	4	12	3357889	3357900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546451
68019	NC_014532	GGGC	2	8	3357902	3357909	0 %	0 %	75 %	25 %	307546451
68020	NC_014532	GGC	2	6	3357943	3357948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546451
68021	NC_014532	CAT	2	6	3358015	3358020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546451
68022	NC_014532	CGCA	2	8	3358028	3358035	25 %	0 %	25 %	50 %	307546451
68023	NC_014532	TCA	2	6	3358048	3358053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546451
68024	NC_014532	GCC	3	9	3358064	3358072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546451
68025	NC_014532	CGGTG	2	10	3358090	3358099	0 %	20 %	60 %	20 %	307546451
68026	NC_014532	CCCGT	2	10	3358162	3358171	0 %	20 %	20 %	60 %	307546451
68027	NC_014532	ACG	2	6	3358218	3358223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546451
68028	NC_014532	CGA	2	6	3358272	3358277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546452
68029	NC_014532	CCGG	2	8	3358282	3358289	0 %	0 %	50 %	50 %	307546452
68030	NC_014532	CCTC	2	8	3358302	3358309	0 %	25 %	0 %	75 %	307546452
68031	NC_014532	TCG	2	6	3358316	3358321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546452
68032	NC_014532	GGA	2	6	3358323	3358328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307546452
68033	NC_014532	TGA	2	6	3358377	3358382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307546452
68034	NC_014532	GGT	2	6	3358444	3358449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546452
68035	NC_014532	ACG	2	6	3358451	3358456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546452
68036	NC_014532	TCG	2	6	3358487	3358492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546452
68037	NC_014532	GCA	2	6	3358656	3358661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546452
68038	NC_014532	TCA	2	6	3358800	3358805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546452
68039	NC_014532	GC	3	6	3358896	3358901	0 %	0 %	50 %	50 %	307546453
68040	NC_014532	GAA	2	6	3358975	3358980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307546453
68041	NC_014532	CGGTCA	2	12	3359025	3359036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307546453
68042	NC_014532	CTT	2	6	3359053	3359058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546453
68043	NC_014532	ACC	2	6	3359322	3359327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546454
68044	NC_014532	GCC	2	6	3359331	3359336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546454
68045	NC_014532	CCG	2	6	3359350	3359355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546454
68046	NC_014532	ACC	2	6	3359367	3359372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546454
68047	NC_014532	CAT	2	6	3359376	3359381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546454
68048	NC_014532	CAT	2	6	3359397	3359402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546454
68049	NC_014532	GCC	2	6	3359412	3359417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546454
68050	NC_014532	CTT	2	6	3359430	3359435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546454
68051	NC_014532	CAT	2	6	3359436	3359441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307546454
68052	NC_014532	TGC	2	6	3359458	3359463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546454
68053	NC_014532	CAG	2	6	3359466	3359471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546454
68054	NC_014532	ACCGGC	2	12	3359496	3359507	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	307546454
68055	NC_014532	TGA	2	6	3359534	3359539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307546454
68056	NC_014532	GCG	2	6	3359547	3359552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546454
68057	NC_014532	GCC	2	6	3359679	3359684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546454
68058	NC_014532	TCT	2	6	3359687	3359692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546454
68059	NC_014532	GCT	2	6	3359696	3359701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546454
68060	NC_014532	CTT	2	6	3359742	3359747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546454
68061	NC_014532	CTT	2	6	3359751	3359756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546454
68062	NC_014532	CGCCCA	2	12	3359888	3359899	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307546454
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68065	NC_014532	TCG	2	6	3360121	3360126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546454
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68068	NC_014532	CAC	2	6	3360156	3360161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546454
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68071	NC_014532	GCT	2	6	3360225	3360230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546454
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68081	NC_014532	CGG	2	6	3360413	3360418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546454
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68087	NC_014532	GCC	2	6	3360998	3361003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546455
68088	NC_014532	GCACT	2	10	3361006	3361015	20 %	20 %	20 %	40 %	307546455
68089	NC_014532	CT	3	6	3361088	3361093	0 %	50 %	0 %	50 %	307546455
68090	NC_014532	CCA	2	6	3361108	3361113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307546455
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68092	NC_014532	GGCC	2	8	3361208	3361215	0 %	0 %	50 %	50 %	307546455
68093	NC_014532	CTG	3	9	3361221	3361229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546455
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68098	NC_014532	CTG	2	6	3361578	3361583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546455
68099	NC_014532	CTGG	2	8	3361595	3361602	0 %	25 %	50 %	25 %	307546455
68100	NC_014532	TGC	3	9	3361651	3361659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546455
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68103	NC_014532	CTG	3	9	3361820	3361828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546456
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68106	NC_014532	GA	3	6	3361917	3361922	50 %	0 %	50 %	0 %	307546456
68107	NC_014532	CGAC	2	8	3361960	3361967	25 %	0 %	25 %	50 %	307546456
68108	NC_014532	CAA	2	6	3361990	3361995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307546456
68109	NC_014532	CAA	2	6	3362002	3362007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307546456
68110	NC_014532	GGC	2	6	3362011	3362016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307546456
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68113	NC_014532	TTC	2	6	3362045	3362050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546456
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68115	NC_014532	TCT	2	6	3362106	3362111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307546456
68116	NC_014532	CGC	2	6	3362134	3362139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546456
68117	NC_014532	GCT	2	6	3362197	3362202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307546456
68118	NC_014532	CTGG	2	8	3362215	3362222	0 %	25 %	50 %	25 %	307546456
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68222	NC_014532	GC	3	6	3367005	3367010	0 %	0 %	50 %	50 %	307546460
68223	NC_014532	GGCC	2	8	3367013	3367020	0 %	0 %	50 %	50 %	307546460
68224	NC_014532	AGC	2	6	3367114	3367119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307546460
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68228	NC_014532	GC	3	6	3367466	3367471	0 %	0 %	50 %	50 %	307546460
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68482	NC_014532	TGG	2	6	3380247	3380252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307546472
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68488	NC_014532	GC	3	6	3380536	3380541	0 %	0 %	50 %	50 %	307546472
68489	NC_014532	CTC	2	6	3380623	3380628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307546473
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68491	NC_014532	GCC	2	6	3380740	3380745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546473
68492	NC_014532	CCGCG	2	10	3380746	3380755	0 %	0 %	40 %	60 %	307546473
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68494	NC_014532	CGC	2	6	3380944	3380949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307546473
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68500	NC_014532	GCCGC	2	10	3381524	3381533	0 %	0 %	40 %	60 %	307546474

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