MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014532	CTG	2	6	271261	271266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5502	NC_014532	CAG	2	6	271300	271305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5503	NC_014532	GAA	2	6	271318	271323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543818
5504	NC_014532	GCT	2	6	271390	271395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5505	NC_014532	ATC	2	6	271501	271506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543818
5506	NC_014532	TCG	2	6	271519	271524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5507	NC_014532	TGA	2	6	271580	271585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543818
5508	NC_014532	TCA	2	6	271604	271609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543818
5509	NC_014532	TTC	2	6	271660	271665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543818
5510	NC_014532	GCT	2	6	271701	271706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5511	NC_014532	CTGG	2	8	271740	271747	0 %	25 %	50 %	25 %	307543818
5512	NC_014532	CGC	2	6	271795	271800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543818
5513	NC_014532	TGCG	2	8	271823	271830	0 %	25 %	50 %	25 %	307543818
5514	NC_014532	GAG	2	6	271846	271851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543818
5515	NC_014532	CGA	2	6	271857	271862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5516	NC_014532	TTC	2	6	271864	271869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543818
5517	NC_014532	GCG	2	6	271934	271939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543818
5518	NC_014532	TCG	2	6	271982	271987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5519	NC_014532	AAG	2	6	271988	271993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543818
5520	NC_014532	GTC	2	6	271994	271999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5521	NC_014532	GATCA	2	10	272095	272104	40 %	20 %	20 %	20 %	307543818
5522	NC_014532	CAC	2	6	272187	272192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543818
5523	NC_014532	ATG	2	6	272302	272307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543818
5524	NC_014532	GCC	2	6	272319	272324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543818
5525	NC_014532	AGG	2	6	272330	272335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543818
5526	NC_014532	CCG	2	6	272336	272341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543818
5527	NC_014532	CAA	2	6	272352	272357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543818
5528	NC_014532	TTC	2	6	272362	272367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543818
5529	NC_014532	GTCG	2	8	272395	272402	0 %	25 %	50 %	25 %	307543818
5530	NC_014532	CGA	2	6	272523	272528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5531	NC_014532	ACC	2	6	272534	272539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543818
5532	NC_014532	CCG	2	6	272547	272552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543818
5533	NC_014532	GCGG	2	8	272613	272620	0 %	0 %	75 %	25 %	307543818
5534	NC_014532	TC	3	6	272631	272636	0 %	50 %	0 %	50 %	307543818
5535	NC_014532	CGG	3	9	272693	272701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543818
5536	NC_014532	TTC	2	6	272710	272715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543818
5537	NC_014532	CCAG	2	8	272720	272727	25 %	0 %	25 %	50 %	307543818
5538	NC_014532	AAC	2	6	272749	272754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543818
5539	NC_014532	CGT	2	6	272779	272784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5540	NC_014532	GGT	2	6	272803	272808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543818
5541	NC_014532	CGA	2	6	272997	273002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5542	NC_014532	GCC	2	6	273077	273082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543818
5543	NC_014532	CGA	2	6	273087	273092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5544	NC_014532	GAC	2	6	273120	273125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5545	NC_014532	GGT	2	6	273174	273179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543818
5546	NC_014532	GGC	3	9	273186	273194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543818
5547	NC_014532	ACG	3	9	273215	273223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5548	NC_014532	TGG	2	6	273293	273298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543818
5549	NC_014532	CGT	2	6	273352	273357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5550	NC_014532	GTG	2	6	273394	273399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543818
5551	NC_014532	ATC	2	6	273418	273423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543818
5552	NC_014532	GGC	2	6	273424	273429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543818
5553	NC_014532	TGG	2	6	273524	273529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543818
5554	NC_014532	GTCC	2	8	273554	273561	0 %	25 %	25 %	50 %	307543818
5555	NC_014532	TCCA	2	8	273685	273692	25 %	25 %	0 %	50 %	307543818
5556	NC_014532	TC	3	6	273713	273718	0 %	50 %	0 %	50 %	307543818
5557	NC_014532	GAG	2	6	273739	273744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543818
5558	NC_014532	GGTC	2	8	273825	273832	0 %	25 %	50 %	25 %	307543818
5559	NC_014532	GAA	2	6	273889	273894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543818
5560	NC_014532	GCT	2	6	273897	273902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5561	NC_014532	GC	3	6	273903	273908	0 %	0 %	50 %	50 %	307543818
5562	NC_014532	TGCG	2	8	273950	273957	0 %	25 %	50 %	25 %	307543818
5563	NC_014532	CAG	2	6	274048	274053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5564	NC_014532	CGA	2	6	274056	274061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5565	NC_014532	ATCGC	2	10	274088	274097	20 %	20 %	20 %	40 %	307543818
5566	NC_014532	GTC	2	6	274144	274149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
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5569	NC_014532	CGA	2	6	274188	274193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5570	NC_014532	CAG	2	6	274216	274221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5571	NC_014532	CTG	2	6	274261	274266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5572	NC_014532	CGA	2	6	274275	274280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5573	NC_014532	AAG	2	6	274327	274332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543818
5574	NC_014532	CGA	2	6	274350	274355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
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5579	NC_014532	TGC	2	6	274625	274630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543818
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5585	NC_014532	ACG	2	6	274874	274879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5586	NC_014532	TACATG	2	12	274921	274932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307543818
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5588	NC_014532	TGG	2	6	274949	274954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543818
5589	NC_014532	ATGC	2	8	274963	274970	25 %	25 %	25 %	25 %	307543818
5590	NC_014532	GC	3	6	274969	274974	0 %	0 %	50 %	50 %	307543818
5591	NC_014532	GGC	2	6	275014	275019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543818
5592	NC_014532	CGG	2	6	275031	275036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543818
5593	NC_014532	CGA	2	6	275121	275126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543818
5594	NC_014532	CCATG	2	10	275172	275181	20 %	20 %	20 %	40 %	307543818
5595	NC_014532	CGCT	2	8	275227	275234	0 %	25 %	25 %	50 %	307543818
5596	NC_014532	CATCGA	2	12	275238	275249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307543818
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5601	NC_014532	GTC	2	6	275784	275789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543819
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5603	NC_014532	ACG	2	6	275830	275835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543819
5604	NC_014532	GAG	2	6	275856	275861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543819
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5619	NC_014532	CCA	2	6	276523	276528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543819
5620	NC_014532	GCC	2	6	276534	276539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543819
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5623	NC_014532	GCT	2	6	276665	276670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543819
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5737	NC_014532	CGTC	2	8	282273	282280	0 %	25 %	25 %	50 %	307543822
5738	NC_014532	GGT	2	6	282286	282291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543822
5739	NC_014532	CGA	3	9	282351	282359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543822
5740	NC_014532	TCG	2	6	282389	282394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543822
5741	NC_014532	GCG	2	6	282395	282400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543822
5742	NC_014532	AGC	2	6	282446	282451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543822
5743	NC_014532	GAT	2	6	282480	282485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543822
5744	NC_014532	AAGG	2	8	282574	282581	50 %	0 %	50 %	0 %	307543822
5745	NC_014532	CAAGGC	2	12	282588	282599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543822
5746	NC_014532	TGC	2	6	282602	282607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543822
5747	NC_014532	TGA	2	6	282617	282622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543822
5748	NC_014532	GAG	2	6	282643	282648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543822
5749	NC_014532	GATG	2	8	282702	282709	25 %	25 %	50 %	0 %	307543822
5750	NC_014532	CGCC	2	8	282713	282720	0 %	0 %	25 %	75 %	307543822
5751	NC_014532	GCTG	2	8	282747	282754	0 %	25 %	50 %	25 %	307543822
5752	NC_014532	CGT	2	6	282849	282854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543822
5753	NC_014532	TCA	2	6	282863	282868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543822
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5755	NC_014532	CGG	2	6	283031	283036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543823
5756	NC_014532	AGCGCG	2	12	283078	283089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	307543823
5757	NC_014532	GCC	2	6	283197	283202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543823
5758	NC_014532	GCC	2	6	283233	283238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543823
5759	NC_014532	CTG	2	6	283272	283277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543823
5760	NC_014532	TCG	2	6	283303	283308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543823
5761	NC_014532	CGA	3	9	283334	283342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543823
5762	NC_014532	GCT	2	6	283346	283351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543823
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5767	NC_014532	TCT	2	6	283573	283578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543823
5768	NC_014532	GTG	2	6	283599	283604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543823
5769	NC_014532	CAT	2	6	283625	283630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543823
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5771	NC_014532	TCG	2	6	283654	283659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543823
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5850	NC_014532	CCAT	2	8	288010	288017	25 %	25 %	0 %	50 %	307543831
5851	NC_014532	AAG	2	6	288045	288050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543831
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5854	NC_014532	TCG	2	6	288154	288159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543831
5855	NC_014532	CGT	2	6	288201	288206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543831
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5857	NC_014532	CGG	2	6	288281	288286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543831
5858	NC_014532	TGCG	2	8	288343	288350	0 %	25 %	50 %	25 %	307543831
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5978	NC_014532	GCC	2	6	294194	294199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543845
5979	NC_014532	CGT	2	6	294217	294222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543845
5980	NC_014532	CAA	2	6	294231	294236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543845
5981	NC_014532	AGC	2	6	294253	294258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543845
5982	NC_014532	CTG	2	6	294319	294324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543845
5983	NC_014532	CGG	3	9	294434	294442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543845
5984	NC_014532	TTC	2	6	294448	294453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543845
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5988	NC_014532	CT	3	6	294602	294607	0 %	50 %	0 %	50 %	307543845
5989	NC_014532	TTC	3	9	294664	294672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543845
5990	NC_014532	TCGTGG	2	12	294692	294703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	307543845
5991	NC_014532	TCA	2	6	294704	294709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543845
5992	NC_014532	TGA	2	6	294764	294769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543845
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