MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014532	CAGC	2	8	240042	240049	25 %	0 %	25 %	50 %	307543794
5002	NC_014532	CAC	2	6	240051	240056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543794
5003	NC_014532	GCC	2	6	240058	240063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543794
5004	NC_014532	GAT	3	9	240126	240134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543794
5005	NC_014532	GGC	2	6	240164	240169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543794
5006	NC_014532	GCC	2	6	240217	240222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543794
5007	NC_014532	CCA	2	6	240230	240235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543794
5008	NC_014532	GA	3	6	240247	240252	50 %	0 %	50 %	0 %	307543794
5009	NC_014532	ATG	2	6	240322	240327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543794
5010	NC_014532	CGG	2	6	240348	240353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543794
5011	NC_014532	CCG	2	6	240364	240369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543794
5012	NC_014532	GGC	3	9	240375	240383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543794
5013	NC_014532	CTT	2	6	240420	240425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543794
5014	NC_014532	GCC	2	6	240528	240533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543794
5015	NC_014532	CGGC	2	8	240541	240548	0 %	0 %	50 %	50 %	307543794
5016	NC_014532	AGT	2	6	240572	240577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543794
5017	NC_014532	GGC	2	6	240603	240608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543794
5018	NC_014532	GAT	2	6	240612	240617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543794
5019	NC_014532	GAT	2	6	240624	240629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543794
5020	NC_014532	CCG	2	6	240644	240649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543794
5021	NC_014532	TCG	2	6	240650	240655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543794
5022	NC_014532	CTGA	2	8	240684	240691	25 %	25 %	25 %	25 %	307543794
5023	NC_014532	CCGA	2	8	240700	240707	25 %	0 %	25 %	50 %	307543794
5024	NC_014532	GAT	2	6	240777	240782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543794
5025	NC_014532	CGG	2	6	240805	240810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543794
5026	NC_014532	CAG	2	6	240825	240830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543794
5027	NC_014532	GAAG	2	8	240870	240877	50 %	0 %	50 %	0 %	307543794
5028	NC_014532	GC	3	6	240889	240894	0 %	0 %	50 %	50 %	307543794
5029	NC_014532	CAG	2	6	240915	240920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543794
5030	NC_014532	CGGCCA	2	12	240926	240937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	307543794
5031	NC_014532	CCG	2	6	240962	240967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543794
5032	NC_014532	CAG	2	6	241005	241010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543794
5033	NC_014532	CTG	2	6	241101	241106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543794
5034	NC_014532	CAT	2	6	241107	241112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543794
5035	NC_014532	AG	3	6	241133	241138	50 %	0 %	50 %	0 %	307543794
5036	NC_014532	CAG	2	6	241146	241151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543794
5037	NC_014532	CAGC	2	8	241161	241168	25 %	0 %	25 %	50 %	307543794
5038	NC_014532	GGC	2	6	241176	241181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543794
5039	NC_014532	TCG	2	6	241198	241203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543794
5040	NC_014532	AAC	2	6	241345	241350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543794
5041	NC_014532	CGT	2	6	241430	241435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543794
5042	NC_014532	GGA	2	6	241437	241442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543794
5043	NC_014532	GCA	2	6	241634	241639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543795
5044	NC_014532	GATG	2	8	241685	241692	25 %	25 %	50 %	0 %	307543795
5045	NC_014532	TTC	2	6	241881	241886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543795
5046	NC_014532	GAT	2	6	241899	241904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543795
5047	NC_014532	GCTG	2	8	241928	241935	0 %	25 %	50 %	25 %	307543795
5048	NC_014532	CGG	2	6	241937	241942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543795
5049	NC_014532	CGG	2	6	241955	241960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543795
5050	NC_014532	GCC	2	6	241998	242003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543795
5051	NC_014532	GCC	2	6	242016	242021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543795
5052	NC_014532	GCC	2	6	242089	242094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543795
5053	NC_014532	CGG	2	6	242258	242263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543795
5054	NC_014532	TGG	2	6	242273	242278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543795
5055	NC_014532	GCC	2	6	242331	242336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543795
5056	NC_014532	CGC	3	9	242345	242353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543795
5057	NC_014532	CCAG	2	8	242388	242395	25 %	0 %	25 %	50 %	307543795
5058	NC_014532	GCC	2	6	242415	242420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543795
5059	NC_014532	TGA	2	6	243119	243124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543796
5060	NC_014532	CAT	2	6	243135	243140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543796
5061	NC_014532	ATG	2	6	243154	243159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543796
5062	NC_014532	GAA	2	6	243193	243198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543796
5063	NC_014532	GA	3	6	243237	243242	50 %	0 %	50 %	0 %	307543796
5064	NC_014532	GCC	2	6	243268	243273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543796
5065	NC_014532	ATGA	2	8	243337	243344	50 %	25 %	25 %	0 %	307543796
5066	NC_014532	ATC	2	6	243370	243375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543796
5067	NC_014532	TGA	2	6	243393	243398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543796
5068	NC_014532	GTC	2	6	243421	243426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543796
5069	NC_014532	CAA	2	6	243432	243437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543796
5070	NC_014532	GAA	2	6	243475	243480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543796
5071	NC_014532	AGA	2	6	243558	243563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543796
5072	NC_014532	GCCCT	2	10	243650	243659	0 %	20 %	20 %	60 %	307543796
5073	NC_014532	GATC	2	8	243669	243676	25 %	25 %	25 %	25 %	307543796
5074	NC_014532	CTG	2	6	243707	243712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543796
5075	NC_014532	AGA	2	6	243786	243791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543796
5076	NC_014532	GAA	2	6	243853	243858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543796
5077	NC_014532	CAT	2	6	243876	243881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543796
5078	NC_014532	CAG	2	6	244119	244124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543797
5079	NC_014532	CGT	2	6	244126	244131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543797
5080	NC_014532	CATC	2	8	244239	244246	25 %	25 %	0 %	50 %	307543797
5081	NC_014532	TC	4	8	244275	244282	0 %	50 %	0 %	50 %	307543797
5082	NC_014532	CGG	2	6	244306	244311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543797
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5085	NC_014532	CCG	2	6	244464	244469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543797
5086	NC_014532	GGA	2	6	244545	244550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543797
5087	NC_014532	GAG	2	6	244567	244572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543797
5088	NC_014532	GATC	2	8	244644	244651	25 %	25 %	25 %	25 %	307543797
5089	NC_014532	TG	3	6	244664	244669	0 %	50 %	50 %	0 %	307543797
5090	NC_014532	GGC	2	6	244832	244837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543797
5091	NC_014532	GTG	2	6	245065	245070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543798
5092	NC_014532	GTG	2	6	245084	245089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543798
5093	NC_014532	GAAA	2	8	245235	245242	75 %	0 %	25 %	0 %	307543798
5094	NC_014532	GAA	2	6	245326	245331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543798
5095	NC_014532	CGGT	2	8	245367	245374	0 %	25 %	50 %	25 %	307543798
5096	NC_014532	TGT	2	6	245378	245383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543798
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5099	NC_014532	GAA	2	6	245590	245595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543798
5100	NC_014532	CGG	2	6	245625	245630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543798
5101	NC_014532	CAA	2	6	245712	245717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543798
5102	NC_014532	GACAAG	2	12	245839	245850	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307543798
5103	NC_014532	TGA	2	6	245960	245965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543798
5104	NC_014532	GCA	3	9	245999	246007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543798
5105	NC_014532	CAC	2	6	246037	246042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543798
5106	NC_014532	GCG	2	6	246059	246064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543798
5107	NC_014532	TAC	2	6	246088	246093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543798
5108	NC_014532	GCCG	2	8	246101	246108	0 %	0 %	50 %	50 %	307543798
5109	NC_014532	GGA	2	6	246144	246149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543798
5110	NC_014532	GA	3	6	246212	246217	50 %	0 %	50 %	0 %	307543798
5111	NC_014532	TC	3	6	246331	246336	0 %	50 %	0 %	50 %	307543798
5112	NC_014532	GCA	2	6	246341	246346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543798
5113	NC_014532	CTG	2	6	246445	246450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543798
5114	NC_014532	GCC	2	6	246454	246459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543798
5115	NC_014532	GAA	2	6	246465	246470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543798
5116	NC_014532	GGGCAT	2	12	246501	246512	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307543798
5117	NC_014532	GC	3	6	246529	246534	0 %	0 %	50 %	50 %	307543798
5118	NC_014532	GACG	2	8	246606	246613	25 %	0 %	50 %	25 %	307543798
5119	NC_014532	ATCC	2	8	246644	246651	25 %	25 %	0 %	50 %	307543798
5120	NC_014532	GAA	2	6	246705	246710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543798
5121	NC_014532	TGA	2	6	246721	246726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543798
5122	NC_014532	CCG	2	6	246728	246733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543799
5123	NC_014532	CTG	2	6	246738	246743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543799
5124	NC_014532	GAT	2	6	246746	246751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543799
5125	NC_014532	CGT	2	6	246755	246760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543799
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5136	NC_014532	GAC	2	6	247413	247418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543800
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5139	NC_014532	GGCGG	2	10	247572	247581	0 %	0 %	80 %	20 %	307543800
5140	NC_014532	GGA	2	6	247646	247651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543800
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5153	NC_014532	CTC	2	6	248192	248197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543801
5154	NC_014532	TCC	2	6	248238	248243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543801
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5181	NC_014532	GCCCC	2	10	249225	249234	0 %	0 %	20 %	80 %	307543802
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5192	NC_014532	TGG	2	6	249628	249633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543802
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5232	NC_014532	GATGGT	2	12	251390	251401	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307543803
5233	NC_014532	CTT	2	6	251420	251425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543803
5234	NC_014532	GGTG	2	8	251435	251442	0 %	25 %	75 %	0 %	307543803
5235	NC_014532	ATC	2	6	251479	251484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543803
5236	NC_014532	GCG	2	6	251499	251504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543803
5237	NC_014532	GCT	2	6	251537	251542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543803
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5239	NC_014532	CTG	5	15	251679	251693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543803
5240	NC_014532	TCG	2	6	251706	251711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543803
5241	NC_014532	GGC	3	9	251771	251779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543803
5242	NC_014532	GGT	2	6	251780	251785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543803
5243	NC_014532	CTG	2	6	251811	251816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543803
5244	NC_014532	CCG	2	6	251895	251900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543803
5245	NC_014532	GGC	2	6	251919	251924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543803
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5248	NC_014532	GTA	2	6	252054	252059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543803
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5355	NC_014532	TGC	2	6	256872	256877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543808
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5479	NC_014532	GCC	2	6	270255	270260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543816
5480	NC_014532	GAAG	2	8	270410	270417	50 %	0 %	50 %	0 %	307543816
5481	NC_014532	CCG	2	6	270421	270426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543816
5482	NC_014532	GCTG	2	8	270443	270450	0 %	25 %	50 %	25 %	307543816
5483	NC_014532	GAA	2	6	270471	270476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543816
5484	NC_014532	GCC	2	6	270477	270482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543816
5485	NC_014532	AGA	2	6	270589	270594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543817
5486	NC_014532	CAT	2	6	270595	270600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543817
5487	NC_014532	CCG	2	6	270675	270680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543817
5488	NC_014532	CTG	2	6	270681	270686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543817
5489	NC_014532	CGT	2	6	270688	270693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543817
5490	NC_014532	GGCC	2	8	270694	270701	0 %	0 %	50 %	50 %	307543817
5491	NC_014532	TGG	2	6	270709	270714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543817
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5493	NC_014532	AAG	2	6	270776	270781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543817
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5495	NC_014532	GGCCTG	2	12	270815	270826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	307543817
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5500	NC_014532	GATG	2	8	271245	271252	25 %	25 %	50 %	0 %	307543818

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