MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014532	TCC	2	6	215583	215588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543773
4502	NC_014532	GCT	2	6	215620	215625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4503	NC_014532	GCG	3	9	215631	215639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543773
4504	NC_014532	GCGCC	2	10	215656	215665	0 %	0 %	40 %	60 %	307543773
4505	NC_014532	TTG	2	6	215688	215693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543773
4506	NC_014532	GAT	2	6	215723	215728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543773
4507	NC_014532	GCC	2	6	215769	215774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543773
4508	NC_014532	TCG	2	6	215781	215786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4509	NC_014532	TGG	2	6	215790	215795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543773
4510	NC_014532	CAC	2	6	215810	215815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543773
4511	NC_014532	GTC	2	6	215849	215854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4512	NC_014532	GTC	2	6	215897	215902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4513	NC_014532	GCT	2	6	215926	215931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4514	NC_014532	CGA	2	6	215989	215994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4515	NC_014532	CGA	2	6	216013	216018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4516	NC_014532	GGC	2	6	216044	216049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543773
4517	NC_014532	GGT	3	9	216110	216118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543773
4518	NC_014532	CGG	2	6	216154	216159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543773
4519	NC_014532	GA	3	6	216216	216221	50 %	0 %	50 %	0 %	307543773
4520	NC_014532	GCA	2	6	216223	216228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4521	NC_014532	CGG	2	6	216298	216303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543773
4522	NC_014532	TCG	2	6	216505	216510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543774
4523	NC_014532	ACG	2	6	216513	216518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543774
4524	NC_014532	CCG	2	6	216607	216612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543774
4525	NC_014532	GTG	2	6	216652	216657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543774
4526	NC_014532	CAGC	2	8	216700	216707	25 %	0 %	25 %	50 %	307543774
4527	NC_014532	CGG	2	6	216725	216730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543774
4528	NC_014532	GCC	2	6	216765	216770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543774
4529	NC_014532	CTTT	2	8	216844	216851	0 %	75 %	0 %	25 %	307543774
4530	NC_014532	CGAC	2	8	216871	216878	25 %	0 %	25 %	50 %	307543774
4531	NC_014532	GGCCTG	2	12	216915	216926	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	307543774
4532	NC_014532	CAG	2	6	216939	216944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543774
4533	NC_014532	CCTT	2	8	216964	216971	0 %	50 %	0 %	50 %	307543774
4534	NC_014532	CGG	2	6	216983	216988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543774
4535	NC_014532	GGC	2	6	217116	217121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543774
4536	NC_014532	GCG	2	6	217201	217206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543774
4537	NC_014532	TGG	3	9	217307	217315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543774
4538	NC_014532	ACC	2	6	217366	217371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543774
4539	NC_014532	TGC	2	6	217378	217383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543774
4540	NC_014532	GGC	3	9	217503	217511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543775
4541	NC_014532	CAG	3	9	217551	217559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543775
4542	NC_014532	GGC	2	6	217614	217619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543775
4543	NC_014532	GCG	2	6	217693	217698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543775
4544	NC_014532	CCG	2	6	217718	217723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543775
4545	NC_014532	CG	3	6	217722	217727	0 %	0 %	50 %	50 %	307543775
4546	NC_014532	GTC	2	6	217734	217739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543775
4547	NC_014532	CGGC	2	8	217742	217749	0 %	0 %	50 %	50 %	307543775
4548	NC_014532	GCC	2	6	217815	217820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543775
4549	NC_014532	GCC	2	6	217920	217925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543775
4550	NC_014532	CGC	2	6	218000	218005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543775
4551	NC_014532	GTCGCC	2	12	218040	218051	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307543775
4552	NC_014532	CGA	2	6	218090	218095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543775
4553	NC_014532	GTG	2	6	218134	218139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543775
4554	NC_014532	AGCG	2	8	218194	218201	25 %	0 %	50 %	25 %	307543776
4555	NC_014532	TCG	2	6	218233	218238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543776
4556	NC_014532	TCA	2	6	218243	218248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543776
4557	NC_014532	CAT	2	6	218265	218270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543776
4558	NC_014532	AGT	2	6	218285	218290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543776
4559	NC_014532	CAG	2	6	218355	218360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543776
4560	NC_014532	CGC	2	6	218414	218419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543776
4561	NC_014532	TGG	2	6	218515	218520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543776
4562	NC_014532	TCGA	2	8	218548	218555	25 %	25 %	25 %	25 %	307543776
4563	NC_014532	GCCGAT	2	12	218598	218609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307543776
4564	NC_014532	GTC	2	6	218661	218666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543776
4565	NC_014532	GCG	3	9	218674	218682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543776
4566	NC_014532	CAT	2	6	218700	218705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543776
4567	NC_014532	GC	3	6	218817	218822	0 %	0 %	50 %	50 %	307543776
4568	NC_014532	TGT	2	6	218837	218842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543776
4569	NC_014532	CAGG	2	8	218862	218869	25 %	0 %	50 %	25 %	307543776
4570	NC_014532	CCACG	2	10	218870	218879	20 %	0 %	20 %	60 %	307543776
4571	NC_014532	CGG	2	6	218888	218893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543776
4572	NC_014532	CGA	2	6	218928	218933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543776
4573	NC_014532	AAG	2	6	218986	218991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543776
4574	NC_014532	ACC	2	6	219009	219014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543776
4575	NC_014532	GGT	2	6	219071	219076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543776
4576	NC_014532	GGC	2	6	219081	219086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543776
4577	NC_014532	CCA	2	6	219131	219136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543776
4578	NC_014532	TGA	2	6	219152	219157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543776
4579	NC_014532	CG	3	6	219561	219566	0 %	0 %	50 %	50 %	307543777
4580	NC_014532	GAG	2	6	219590	219595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543777
4581	NC_014532	GGC	2	6	219600	219605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543777
4582	NC_014532	GCG	2	6	219733	219738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543777
4583	NC_014532	CAA	2	6	219798	219803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543777
4584	NC_014532	GC	3	6	219856	219861	0 %	0 %	50 %	50 %	307543777
4585	NC_014532	ATG	2	6	219869	219874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543777
4586	NC_014532	TGGAG	2	10	219906	219915	20 %	20 %	60 %	0 %	307543777
4587	NC_014532	GC	3	6	219985	219990	0 %	0 %	50 %	50 %	307543777
4588	NC_014532	TGA	2	6	220146	220151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543778
4589	NC_014532	TCG	2	6	220269	220274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543778
4590	NC_014532	CGT	2	6	220331	220336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543778
4591	NC_014532	TGG	2	6	220356	220361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543778
4592	NC_014532	ATC	2	6	220419	220424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543778
4593	NC_014532	TCG	2	6	220452	220457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543778
4594	NC_014532	TCGT	2	8	220526	220533	0 %	50 %	25 %	25 %	307543778
4595	NC_014532	GT	3	6	220532	220537	0 %	50 %	50 %	0 %	307543778
4596	NC_014532	GGC	2	6	220544	220549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543778
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4599	NC_014532	ATG	2	6	220841	220846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543778
4600	NC_014532	TTGCCA	2	12	220950	220961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307543778
4601	NC_014532	GCC	2	6	220976	220981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543778
4602	NC_014532	GCC	2	6	221078	221083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543778
4603	NC_014532	GC	3	6	221529	221534	0 %	0 %	50 %	50 %	307543779
4604	NC_014532	CAT	2	6	221659	221664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543779
4605	NC_014532	CGTGC	2	10	221677	221686	0 %	20 %	40 %	40 %	307543779
4606	NC_014532	ATG	2	6	221736	221741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543779
4607	NC_014532	GGC	2	6	221768	221773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543779
4608	NC_014532	AAG	2	6	221969	221974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543779
4609	NC_014532	TGG	2	6	221991	221996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543779
4610	NC_014532	CGG	2	6	222103	222108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543779
4611	NC_014532	TGC	2	6	222174	222179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543779
4612	NC_014532	TCGG	2	8	222186	222193	0 %	25 %	50 %	25 %	307543779
4613	NC_014532	CAT	2	6	222241	222246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543779
4614	NC_014532	CA	3	6	222359	222364	50 %	0 %	0 %	50 %	307543779
4615	NC_014532	ACG	2	6	222384	222389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543779
4616	NC_014532	TGA	2	6	222399	222404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543779
4617	NC_014532	TGAA	2	8	222445	222452	50 %	25 %	25 %	0 %	307543779
4618	NC_014532	TCA	2	6	222509	222514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543780
4619	NC_014532	GTC	2	6	222592	222597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543780
4620	NC_014532	GGC	2	6	222603	222608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543780
4621	NC_014532	ACC	2	6	222622	222627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543780
4622	NC_014532	GTG	2	6	222628	222633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543780
4623	NC_014532	GCA	2	6	222645	222650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543780
4624	NC_014532	GGA	2	6	222651	222656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543780
4625	NC_014532	CCG	2	6	222665	222670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543780
4626	NC_014532	GGC	2	6	222744	222749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543780
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4630	NC_014532	CGGCG	2	10	223008	223017	0 %	0 %	60 %	40 %	307543780
4631	NC_014532	CGA	2	6	223062	223067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543780
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4635	NC_014532	CCAT	2	8	223168	223175	25 %	25 %	0 %	50 %	307543781
4636	NC_014532	GACG	2	8	223176	223183	25 %	0 %	50 %	25 %	307543781
4637	NC_014532	GGA	2	6	223218	223223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543781
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4639	NC_014532	ACG	2	6	223327	223332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543781
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4642	NC_014532	ACA	2	6	223523	223528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543781
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4645	NC_014532	CGA	2	6	223614	223619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543781
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4649	NC_014532	AGC	2	6	223790	223795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543781
4650	NC_014532	CCA	2	6	223821	223826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543781
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4652	NC_014532	CGG	2	6	224048	224053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543781
4653	NC_014532	TC	3	6	224065	224070	0 %	50 %	0 %	50 %	307543781
4654	NC_014532	GC	3	6	224076	224081	0 %	0 %	50 %	50 %	307543781
4655	NC_014532	GGGGC	2	10	224113	224122	0 %	0 %	80 %	20 %	307543781
4656	NC_014532	TCG	2	6	224158	224163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543781
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4660	NC_014532	CGG	2	6	224353	224358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543781
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4719	NC_014532	CAT	2	6	227165	227170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543784
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4724	NC_014532	CGCGCT	2	12	227326	227337	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307543784
4725	NC_014532	TGC	2	6	227346	227351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543784
4726	NC_014532	GTG	3	9	227361	227369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543784
4727	NC_014532	CGA	2	6	227389	227394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543784
4728	NC_014532	G	6	6	227431	227436	0 %	0 %	100 %	0 %	307543784
4729	NC_014532	CGT	2	6	227902	227907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543785
4730	NC_014532	TCG	2	6	227925	227930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543785
4731	NC_014532	ACG	2	6	227931	227936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543785
4732	NC_014532	GCCG	2	8	227972	227979	0 %	0 %	50 %	50 %	307543785
4733	NC_014532	GGT	2	6	227996	228001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543785
4734	NC_014532	GGCC	2	8	228055	228062	0 %	0 %	50 %	50 %	307543785
4735	NC_014532	CGG	2	6	228088	228093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543785
4736	NC_014532	GCA	2	6	228094	228099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543785
4737	NC_014532	CGG	2	6	228168	228173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543785
4738	NC_014532	GGC	2	6	228194	228199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543785
4739	NC_014532	GATCAG	2	12	228233	228244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307543785
4740	NC_014532	GCC	2	6	228278	228283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543785
4741	NC_014532	TGC	2	6	228303	228308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543785
4742	NC_014532	GCG	2	6	228381	228386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543785
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4744	NC_014532	TGC	2	6	228445	228450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543785
4745	NC_014532	GCT	2	6	228463	228468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543785
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4852	NC_014532	CCAT	2	8	233845	233852	25 %	25 %	0 %	50 %	307543788
4853	NC_014532	ACC	3	9	233868	233876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543788
4854	NC_014532	GCTC	2	8	233911	233918	0 %	25 %	25 %	50 %	307543788
4855	NC_014532	ACG	2	6	233941	233946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543788
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4982	NC_014532	GTGGCA	2	12	239503	239514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307543794
4983	NC_014532	AGA	2	6	239567	239572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543794
4984	NC_014532	GCC	2	6	239593	239598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543794
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4986	NC_014532	AGG	2	6	239666	239671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543794
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4991	NC_014532	CCA	2	6	239771	239776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543794
4992	NC_014532	GGC	2	6	239781	239786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543794
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4994	NC_014532	CAG	2	6	239823	239828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543794
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