MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014323	TCA	2	6	837498	837503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310094
19002	NC_014323	GCCGC	2	10	837518	837527	0 %	0 %	40 %	60 %	300310094
19003	NC_014323	GATC	2	8	837561	837568	25 %	25 %	25 %	25 %	300310094
19004	NC_014323	GGC	2	6	837652	837657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310094
19005	NC_014323	GC	3	6	837681	837686	0 %	0 %	50 %	50 %	300310094
19006	NC_014323	CGAC	2	8	837752	837759	25 %	0 %	25 %	50 %	300310094
19007	NC_014323	GCT	2	6	837871	837876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19008	NC_014323	CAG	2	6	837880	837885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19009	NC_014323	TGC	2	6	837890	837895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19010	NC_014323	TTC	2	6	837904	837909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310094
19011	NC_014323	CGT	2	6	837918	837923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19012	NC_014323	GAGG	2	8	837925	837932	25 %	0 %	75 %	0 %	300310094
19013	NC_014323	CGG	2	6	837936	837941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310094
19014	NC_014323	CCACGG	2	12	837942	837953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300310094
19015	NC_014323	TGG	2	6	838008	838013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310094
19016	NC_014323	GCA	2	6	838032	838037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19017	NC_014323	GCA	2	6	838068	838073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19018	NC_014323	CG	3	6	838086	838091	0 %	0 %	50 %	50 %	300310094
19019	NC_014323	CCT	2	6	838098	838103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300310094
19020	NC_014323	CAG	2	6	838108	838113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19021	NC_014323	GCC	2	6	838130	838135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310094
19022	NC_014323	GC	3	6	838159	838164	0 %	0 %	50 %	50 %	300310094
19023	NC_014323	GCA	2	6	838167	838172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19024	NC_014323	CAG	2	6	838177	838182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19025	NC_014323	CAG	2	6	838258	838263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19026	NC_014323	GCC	2	6	838292	838297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310094
19027	NC_014323	GGC	2	6	838342	838347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310094
19028	NC_014323	CCAG	2	8	838365	838372	25 %	0 %	25 %	50 %	300310094
19029	NC_014323	GC	3	6	838407	838412	0 %	0 %	50 %	50 %	300310094
19030	NC_014323	CCGG	2	8	838417	838424	0 %	0 %	50 %	50 %	300310094
19031	NC_014323	GTCA	2	8	838447	838454	25 %	25 %	25 %	25 %	300310094
19032	NC_014323	GGCG	2	8	838473	838480	0 %	0 %	75 %	25 %	300310094
19033	NC_014323	GGC	2	6	838510	838515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310094
19034	NC_014323	GTC	2	6	838516	838521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19035	NC_014323	GGC	2	6	838546	838551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310094
19036	NC_014323	TGG	2	6	838580	838585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310094
19037	NC_014323	GCG	2	6	838625	838630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310094
19038	NC_014323	GGCG	2	8	838635	838642	0 %	0 %	75 %	25 %	300310094
19039	NC_014323	AGC	2	6	838691	838696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19040	NC_014323	GCA	2	6	838710	838715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19041	NC_014323	CAG	2	6	838717	838722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310094
19042	NC_014323	GTC	2	6	838901	838906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310095
19043	NC_014323	CG	3	6	838953	838958	0 %	0 %	50 %	50 %	300310095
19044	NC_014323	GC	3	6	838965	838970	0 %	0 %	50 %	50 %	300310095
19045	NC_014323	GAT	2	6	838975	838980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310095
19046	NC_014323	CGC	2	6	838992	838997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310095
19047	NC_014323	TGG	3	9	839004	839012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310095
19048	NC_014323	GCC	2	6	839062	839067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310095
19049	NC_014323	CGC	2	6	839079	839084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310095
19050	NC_014323	GCC	2	6	839101	839106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310095
19051	NC_014323	GGCT	2	8	839138	839145	0 %	25 %	50 %	25 %	300310095
19052	NC_014323	T	6	6	839242	839247	0 %	100 %	0 %	0 %	300310096
19053	NC_014323	GCCC	2	8	839301	839308	0 %	0 %	25 %	75 %	300310096
19054	NC_014323	TGA	2	6	839382	839387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310096
19055	NC_014323	GGCCA	2	10	839422	839431	20 %	0 %	40 %	40 %	300310096
19056	NC_014323	GCC	2	6	839453	839458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310096
19057	NC_014323	TTTC	2	8	839550	839557	0 %	75 %	0 %	25 %	300310096
19058	NC_014323	AGC	2	6	839603	839608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310096
19059	NC_014323	GTG	2	6	839663	839668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310096
19060	NC_014323	CGG	2	6	839677	839682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310096
19061	NC_014323	AGG	2	6	839686	839691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300310096
19062	NC_014323	GGT	2	6	839693	839698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310096
19063	NC_014323	GCC	2	6	839764	839769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310096
19064	NC_014323	CGA	2	6	839838	839843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310096
19065	NC_014323	CGTA	2	8	839858	839865	25 %	25 %	25 %	25 %	300310096
19066	NC_014323	AATG	2	8	839882	839889	50 %	25 %	25 %	0 %	300310096
19067	NC_014323	CAG	3	9	840016	840024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310096
19068	NC_014323	AGA	2	6	840054	840059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310096
19069	NC_014323	AGG	2	6	840065	840070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300310096
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19071	NC_014323	CAA	2	6	840483	840488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300310097
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19073	NC_014323	GCGATG	2	12	840610	840621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300310097
19074	NC_014323	GCCA	2	8	840624	840631	25 %	0 %	25 %	50 %	300310097
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19076	NC_014323	GCA	2	6	840713	840718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310097
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19080	NC_014323	A	6	6	840852	840857	100 %	0 %	0 %	0 %	300310097
19081	NC_014323	CAA	2	6	840860	840865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300310097
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19085	NC_014323	CG	3	6	841039	841044	0 %	0 %	50 %	50 %	300310097
19086	NC_014323	CGC	2	6	841063	841068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310097
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19090	NC_014323	AACCC	2	10	841194	841203	40 %	0 %	0 %	60 %	300310097
19091	NC_014323	CGC	2	6	841242	841247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310097
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19104	NC_014323	GCA	2	6	841562	841567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310097
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19120	NC_014323	GCC	2	6	842405	842410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310098
19121	NC_014323	GCC	2	6	842416	842421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310098
19122	NC_014323	GGA	2	6	842442	842447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300310098
19123	NC_014323	GCA	2	6	842458	842463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310098
19124	NC_014323	CGC	2	6	842501	842506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310098
19125	NC_014323	GC	3	6	842505	842510	0 %	0 %	50 %	50 %	300310098
19126	NC_014323	CACCAG	2	12	842526	842537	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300310098
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19129	NC_014323	GAG	2	6	842584	842589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300310098
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19131	NC_014323	AGCA	2	8	842668	842675	50 %	0 %	25 %	25 %	300310098
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19135	NC_014323	GGCCGA	2	12	842778	842789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300310098
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19138	NC_014323	GC	3	6	842930	842935	0 %	0 %	50 %	50 %	300310098
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19145	NC_014323	CTG	2	6	843115	843120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310098
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19152	NC_014323	CTG	2	6	843405	843410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310098
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19210	NC_014323	ATCG	2	8	845565	845572	25 %	25 %	25 %	25 %	300310099
19211	NC_014323	TGC	2	6	845587	845592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310099
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19215	NC_014323	TTGCTG	2	12	845804	845815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	300310100
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19222	NC_014323	CTG	2	6	845986	845991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310100
19223	NC_014323	GTGC	2	8	846035	846042	0 %	25 %	50 %	25 %	300310100
19224	NC_014323	CGT	2	6	846064	846069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310100
19225	NC_014323	GTCAC	2	10	846170	846179	20 %	20 %	20 %	40 %	300310100
19226	NC_014323	GTCC	2	8	846232	846239	0 %	25 %	25 %	50 %	300310100
19227	NC_014323	TGC	2	6	846350	846355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310101
19228	NC_014323	ATC	2	6	846449	846454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310101
19229	NC_014323	CAA	2	6	846496	846501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300310101
19230	NC_014323	TCG	2	6	846512	846517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310101
19231	NC_014323	GC	3	6	846531	846536	0 %	0 %	50 %	50 %	300310101
19232	NC_014323	CGC	3	9	846534	846542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310101
19233	NC_014323	CCGC	2	8	846649	846656	0 %	0 %	25 %	75 %	300310101
19234	NC_014323	GT	3	6	846701	846706	0 %	50 %	50 %	0 %	300310101
19235	NC_014323	GAT	2	6	846882	846887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310102
19236	NC_014323	GCA	2	6	846962	846967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310102
19237	NC_014323	TGAC	2	8	847022	847029	25 %	25 %	25 %	25 %	300310102
19238	NC_014323	GCG	3	9	847100	847108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310102
19239	NC_014323	GCA	2	6	847109	847114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310102
19240	NC_014323	CTG	2	6	847119	847124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310102
19241	NC_014323	GCCTG	2	10	847149	847158	0 %	20 %	40 %	40 %	300310102
19242	NC_014323	AC	3	6	847238	847243	50 %	0 %	0 %	50 %	300310102
19243	NC_014323	CT	3	6	847261	847266	0 %	50 %	0 %	50 %	300310102
19244	NC_014323	CTG	2	6	847367	847372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310102
19245	NC_014323	GC	3	6	847480	847485	0 %	0 %	50 %	50 %	300310103
19246	NC_014323	CTGC	2	8	847498	847505	0 %	25 %	25 %	50 %	300310103
19247	NC_014323	GC	5	10	847504	847513	0 %	0 %	50 %	50 %	300310103
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19252	NC_014323	GAT	2	6	847664	847669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310103
19253	NC_014323	CTT	2	6	847681	847686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310103
19254	NC_014323	TGG	2	6	847759	847764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310103
19255	NC_014323	GGA	2	6	847847	847852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300310103
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19275	NC_014323	CGGG	2	8	849053	849060	0 %	0 %	75 %	25 %	300310103
19276	NC_014323	GC	3	6	849110	849115	0 %	0 %	50 %	50 %	300310103
19277	NC_014323	CG	3	6	849197	849202	0 %	0 %	50 %	50 %	300310103
19278	NC_014323	GTAC	2	8	849245	849252	25 %	25 %	25 %	25 %	300310103
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19280	NC_014323	GCTG	2	8	849343	849350	0 %	25 %	50 %	25 %	300310103
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19283	NC_014323	CGG	2	6	849411	849416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310103
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19330	NC_014323	CGA	2	6	851550	851555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310106
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19332	NC_014323	GCC	3	9	851609	851617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310106
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19340	NC_014323	GCA	2	6	851924	851929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310106
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19342	NC_014323	CATGGC	2	12	851967	851978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300310106
19343	NC_014323	GCAG	2	8	852015	852022	25 %	0 %	50 %	25 %	300310106
19344	NC_014323	GGC	2	6	852090	852095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310106
19345	NC_014323	TGA	2	6	852119	852124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310106
19346	NC_014323	GGGC	2	8	852134	852141	0 %	0 %	75 %	25 %	300310106
19347	NC_014323	GCC	2	6	852399	852404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310107
19348	NC_014323	CTG	2	6	852468	852473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310107
19349	NC_014323	A	6	6	852541	852546	100 %	0 %	0 %	0 %	300310107
19350	NC_014323	AGA	2	6	852562	852567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310107
19351	NC_014323	GAC	2	6	852569	852574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310107
19352	NC_014323	CAG	2	6	852587	852592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310107
19353	NC_014323	GCA	2	6	852695	852700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310107
19354	NC_014323	GTC	2	6	852749	852754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310107
19355	NC_014323	TGG	2	6	852793	852798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310107
19356	NC_014323	AACTGG	2	12	852936	852947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300310107
19357	NC_014323	CGG	2	6	853004	853009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310107
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19359	NC_014323	GCT	2	6	853064	853069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310107
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19478	NC_014323	GCA	2	6	859982	859987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310113
19479	NC_014323	CAG	2	6	860033	860038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310113
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19481	NC_014323	CTGG	2	8	860099	860106	0 %	25 %	50 %	25 %	300310113
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19483	NC_014323	TACC	2	8	860195	860202	25 %	25 %	0 %	50 %	300310113
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