MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_014323	GCT	3	9	815411	815419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310081
18503	NC_014323	TCGC	2	8	815441	815448	0 %	25 %	25 %	50 %	300310081
18504	NC_014323	CTG	2	6	815460	815465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310081
18505	NC_014323	CGC	3	9	815510	815518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310081
18506	NC_014323	GCA	2	6	815552	815557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310081
18507	NC_014323	TCG	2	6	815602	815607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310081
18508	NC_014323	ACG	2	6	815617	815622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310081
18509	NC_014323	CG	3	6	815626	815631	0 %	0 %	50 %	50 %	300310081
18510	NC_014323	GGCC	2	8	815681	815688	0 %	0 %	50 %	50 %	300310081
18511	NC_014323	TGCGCC	2	12	815716	815727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300310081
18512	NC_014323	GC	5	10	815770	815779	0 %	0 %	50 %	50 %	300310081
18513	NC_014323	GC	3	6	815852	815857	0 %	0 %	50 %	50 %	300310081
18514	NC_014323	CGG	2	6	815897	815902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310081
18515	NC_014323	CTGGG	2	10	815907	815916	0 %	20 %	60 %	20 %	300310081
18516	NC_014323	CACCG	2	10	815930	815939	20 %	0 %	20 %	60 %	300310081
18517	NC_014323	CAG	2	6	815943	815948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310081
18518	NC_014323	GAC	2	6	815986	815991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310081
18519	NC_014323	CAG	2	6	816068	816073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310082
18520	NC_014323	TGC	2	6	816092	816097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
18521	NC_014323	GC	3	6	816111	816116	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
18522	NC_014323	GCT	2	6	816155	816160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
18523	NC_014323	TGGC	2	8	816317	816324	0 %	25 %	50 %	25 %	300310082
18524	NC_014323	CTCG	2	8	816332	816339	0 %	25 %	25 %	50 %	300310082
18525	NC_014323	CTG	3	9	816372	816380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
18526	NC_014323	GCT	2	6	816383	816388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
18527	NC_014323	GGCATC	3	18	816512	816529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300310082
18528	NC_014323	GCAG	2	8	816545	816552	25 %	0 %	50 %	25 %	300310082
18529	NC_014323	AGC	2	6	816556	816561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310082
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18531	NC_014323	GC	3	6	816587	816592	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
18532	NC_014323	GGC	2	6	816594	816599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310082
18533	NC_014323	ACC	2	6	816624	816629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310082
18534	NC_014323	GTC	2	6	816669	816674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
18535	NC_014323	CTG	2	6	816711	816716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
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18539	NC_014323	GAT	2	6	816807	816812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310082
18540	NC_014323	CTG	2	6	816861	816866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
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18543	NC_014323	CAT	2	6	816947	816952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310082
18544	NC_014323	CGA	2	6	816962	816967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310082
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18546	NC_014323	GGCC	2	8	816998	817005	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
18547	NC_014323	ACG	2	6	817009	817014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310082
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18550	NC_014323	AAG	2	6	817089	817094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310082
18551	NC_014323	CGC	2	6	817109	817114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310082
18552	NC_014323	CGC	2	6	817122	817127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310082
18553	NC_014323	TCA	2	6	817135	817140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310082
18554	NC_014323	ACCG	2	8	817151	817158	25 %	0 %	25 %	50 %	300310082
18555	NC_014323	AAG	2	6	817159	817164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310082
18556	NC_014323	TGC	2	6	817177	817182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
18557	NC_014323	GC	3	6	817181	817186	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
18558	NC_014323	ACG	2	6	817228	817233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310082
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18560	NC_014323	CG	3	6	817358	817363	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
18561	NC_014323	CGC	2	6	817397	817402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310082
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18567	NC_014323	CAG	2	6	817598	817603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310082
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18573	NC_014323	GCT	2	6	817796	817801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310082
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18576	NC_014323	GAT	2	6	817878	817883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310082
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18586	NC_014323	CAT	3	9	818240	818248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310082
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18588	NC_014323	GCC	2	6	818304	818309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310082
18589	NC_014323	CCGC	2	8	818345	818352	0 %	0 %	25 %	75 %	300310082
18590	NC_014323	CTA	2	6	818405	818410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310082
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18595	NC_014323	GC	3	6	818535	818540	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
18596	NC_014323	GC	4	8	818560	818567	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
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18599	NC_014323	GC	3	6	818625	818630	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
18600	NC_014323	CGGC	2	8	818668	818675	0 %	0 %	50 %	50 %	300310082
18601	NC_014323	AAG	2	6	818676	818681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310082
18602	NC_014323	GCCC	2	8	818837	818844	0 %	0 %	25 %	75 %	300310083
18603	NC_014323	CAG	2	6	818972	818977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310083
18604	NC_014323	GCCTGA	2	12	819022	819033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300310083
18605	NC_014323	GCT	2	6	819056	819061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310083
18606	NC_014323	TGC	2	6	819073	819078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310083
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18608	NC_014323	GC	5	10	819100	819109	0 %	0 %	50 %	50 %	300310083
18609	NC_014323	GGC	2	6	819153	819158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310083
18610	NC_014323	TCCT	2	8	819195	819202	0 %	50 %	0 %	50 %	300310083
18611	NC_014323	CCG	2	6	819209	819214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310083
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18616	NC_014323	ACA	2	6	819562	819567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300310083
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