MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014323	GCAG	2	8	750155	750162	25 %	0 %	50 %	25 %	300310021
17002	NC_014323	CAG	2	6	750174	750179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310021
17003	NC_014323	GCA	2	6	750209	750214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310021
17004	NC_014323	GGTCA	2	10	750225	750234	20 %	20 %	40 %	20 %	300310021
17005	NC_014323	GAG	2	6	750352	750357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300310021
17006	NC_014323	GCT	2	6	750380	750385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310021
17007	NC_014323	GC	3	6	750450	750455	0 %	0 %	50 %	50 %	300310021
17008	NC_014323	CCAGGC	2	12	750521	750532	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300310021
17009	NC_014323	GGC	2	6	750558	750563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310021
17010	NC_014323	CGG	2	6	750641	750646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310021
17011	NC_014323	CG	3	6	750660	750665	0 %	0 %	50 %	50 %	300310021
17012	NC_014323	GC	3	6	750672	750677	0 %	0 %	50 %	50 %	300310021
17013	NC_014323	ACG	2	6	750679	750684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310021
17014	NC_014323	GGT	2	6	750705	750710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310021
17015	NC_014323	GCA	3	9	750809	750817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310021
17016	NC_014323	CG	4	8	750824	750831	0 %	0 %	50 %	50 %	300310021
17017	NC_014323	CAT	2	6	750840	750845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310021
17018	NC_014323	GTT	2	6	750858	750863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300310021
17019	NC_014323	GGC	2	6	750903	750908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310021
17020	NC_014323	CGT	2	6	750965	750970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310021
17021	NC_014323	GCGG	2	8	750999	751006	0 %	0 %	75 %	25 %	300310021
17022	NC_014323	CAG	2	6	751041	751046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310021
17023	NC_014323	CAG	2	6	751158	751163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310021
17024	NC_014323	GA	3	6	751219	751224	50 %	0 %	50 %	0 %	300310021
17025	NC_014323	AG	3	6	751227	751232	50 %	0 %	50 %	0 %	300310021
17026	NC_014323	TGG	2	6	751238	751243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310021
17027	NC_014323	CGT	2	6	751503	751508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310022
17028	NC_014323	A	7	7	751517	751523	100 %	0 %	0 %	0 %	300310022
17029	NC_014323	ACC	2	6	751567	751572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310022
17030	NC_014323	AGCAA	2	10	751577	751586	60 %	0 %	20 %	20 %	300310022
17031	NC_014323	CTG	2	6	751609	751614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310022
17032	NC_014323	GAT	2	6	751618	751623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310022
17033	NC_014323	GCT	2	6	751689	751694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310022
17034	NC_014323	GCC	2	6	751695	751700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310022
17035	NC_014323	GC	3	6	751713	751718	0 %	0 %	50 %	50 %	300310022
17036	NC_014323	AGC	2	6	751805	751810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310022
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17039	NC_014323	CCTGG	2	10	751974	751983	0 %	20 %	40 %	40 %	300310022
17040	NC_014323	GC	3	6	752005	752010	0 %	0 %	50 %	50 %	300310022
17041	NC_014323	CGG	2	6	752143	752148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310023
17042	NC_014323	CCAG	2	8	752212	752219	25 %	0 %	25 %	50 %	300310023
17043	NC_014323	TTC	2	6	752228	752233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310023
17044	NC_014323	GTC	2	6	752237	752242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310023
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17047	NC_014323	TCT	2	6	752317	752322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310023
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17049	NC_014323	GCA	2	6	752353	752358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310023
17050	NC_014323	ATC	2	6	752379	752384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310023
17051	NC_014323	TGCA	2	8	752528	752535	25 %	25 %	25 %	25 %	300310023
17052	NC_014323	TGA	2	6	752590	752595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310023
17053	NC_014323	T	6	6	752894	752899	0 %	100 %	0 %	0 %	300310024
17054	NC_014323	GCC	2	6	752946	752951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310024
17055	NC_014323	GTG	2	6	752982	752987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310024
17056	NC_014323	GC	3	6	752994	752999	0 %	0 %	50 %	50 %	300310024
17057	NC_014323	GCT	2	6	753019	753024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310024
17058	NC_014323	GCG	4	12	753030	753041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310024
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17060	NC_014323	TTC	2	6	753074	753079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310024
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17062	NC_014323	GGCT	2	8	753144	753151	0 %	25 %	50 %	25 %	300310024
17063	NC_014323	TGA	3	9	753202	753210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310024
17064	NC_014323	GAT	2	6	753212	753217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310024
17065	NC_014323	CAG	2	6	753218	753223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310024
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17068	NC_014323	GTC	3	9	753272	753280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310024
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17084	NC_014323	ATG	2	6	754177	754182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310026
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17354	NC_014323	GCA	2	6	766211	766216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310039
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17477	NC_014323	CTG	3	9	771493	771501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310043
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17480	NC_014323	TGC	2	6	771573	771578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310043
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