MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014323	CAC	2	6	665141	665146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309943
15002	NC_014323	ACC	2	6	665148	665153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309943
15003	NC_014323	TTC	2	6	665186	665191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309943
15004	NC_014323	AAG	2	6	665291	665296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309943
15005	NC_014323	GAA	2	6	665299	665304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309943
15006	NC_014323	AGC	2	6	665421	665426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15007	NC_014323	CGA	2	6	665440	665445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15008	NC_014323	CGA	2	6	665500	665505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15009	NC_014323	CGC	2	6	665572	665577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309944
15010	NC_014323	TCT	2	6	665638	665643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309944
15011	NC_014323	GAC	2	6	665685	665690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15012	NC_014323	GGTC	2	8	665692	665699	0 %	25 %	50 %	25 %	300309944
15013	NC_014323	CAG	2	6	665705	665710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15014	NC_014323	GTT	2	6	665735	665740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309944
15015	NC_014323	GTC	2	6	665804	665809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15016	NC_014323	GGC	2	6	665891	665896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309944
15017	NC_014323	GCTG	2	8	665905	665912	0 %	25 %	50 %	25 %	300309944
15018	NC_014323	GAG	2	6	665933	665938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309944
15019	NC_014323	CGC	2	6	665956	665961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309944
15020	NC_014323	CGA	2	6	665968	665973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15021	NC_014323	CAG	2	6	665978	665983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15022	NC_014323	CTG	2	6	666017	666022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15023	NC_014323	TCA	2	6	666046	666051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309944
15024	NC_014323	CGA	2	6	666074	666079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15025	NC_014323	TGA	2	6	666100	666105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309944
15026	NC_014323	TCT	2	6	666106	666111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309944
15027	NC_014323	GGC	2	6	666145	666150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309944
15028	NC_014323	GC	3	6	666157	666162	0 %	0 %	50 %	50 %	300309944
15029	NC_014323	TCG	2	6	666165	666170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15030	NC_014323	CGA	2	6	666196	666201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15031	NC_014323	CG	3	6	666214	666219	0 %	0 %	50 %	50 %	300309944
15032	NC_014323	CCG	2	6	666235	666240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309944
15033	NC_014323	CGA	2	6	666256	666261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309944
15034	NC_014323	ATG	2	6	666285	666290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309944
15035	NC_014323	GC	3	6	666339	666344	0 %	0 %	50 %	50 %	300309944
15036	NC_014323	ACCG	2	8	666347	666354	25 %	0 %	25 %	50 %	300309944
15037	NC_014323	CCAG	2	8	666516	666523	25 %	0 %	25 %	50 %	300309945
15038	NC_014323	GCA	2	6	666576	666581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309945
15039	NC_014323	CTG	2	6	666622	666627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309945
15040	NC_014323	TCG	2	6	666653	666658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309945
15041	NC_014323	GGC	2	6	666703	666708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309945
15042	NC_014323	GCG	2	6	666752	666757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309945
15043	NC_014323	GGCC	2	8	666774	666781	0 %	0 %	50 %	50 %	300309945
15044	NC_014323	GCA	2	6	666849	666854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309945
15045	NC_014323	CGT	2	6	666867	666872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309945
15046	NC_014323	TGC	2	6	666888	666893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309945
15047	NC_014323	GC	3	6	666892	666897	0 %	0 %	50 %	50 %	300309945
15048	NC_014323	GCG	2	6	667033	667038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309945
15049	NC_014323	GCC	3	9	667064	667072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309945
15050	NC_014323	CGG	2	6	667074	667079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309945
15051	NC_014323	GC	3	6	667118	667123	0 %	0 %	50 %	50 %	300309945
15052	NC_014323	TCG	2	6	667154	667159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309945
15053	NC_014323	GGC	2	6	667189	667194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309945
15054	NC_014323	GCA	2	6	667262	667267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309946
15055	NC_014323	TCG	2	6	667319	667324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309946
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15059	NC_014323	CG	3	6	667527	667532	0 %	0 %	50 %	50 %	300309946
15060	NC_014323	GCT	2	6	667671	667676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309946
15061	NC_014323	GCG	2	6	667700	667705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309946
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15065	NC_014323	CGC	2	6	667925	667930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309946
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15067	NC_014323	TGC	2	6	668042	668047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309946
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15070	NC_014323	TGC	2	6	668281	668286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309947
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15072	NC_014323	ATCC	2	8	668384	668391	25 %	25 %	0 %	50 %	300309947
15073	NC_014323	GTG	2	6	668439	668444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309947
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15082	NC_014323	GC	3	6	668742	668747	0 %	0 %	50 %	50 %	300309947
15083	NC_014323	GC	3	6	668784	668789	0 %	0 %	50 %	50 %	300309947
15084	NC_014323	GC	3	6	668814	668819	0 %	0 %	50 %	50 %	300309947
15085	NC_014323	TGC	2	6	668824	668829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309947
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15088	NC_014323	GCC	2	6	668934	668939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309947
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15091	NC_014323	GC	3	6	669159	669164	0 %	0 %	50 %	50 %	300309947
15092	NC_014323	TCCAC	2	10	669196	669205	20 %	20 %	0 %	60 %	300309947
15093	NC_014323	TGA	2	6	669230	669235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309947
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15096	NC_014323	GC	4	8	669369	669376	0 %	0 %	50 %	50 %	300309947
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15102	NC_014323	CGA	2	6	669638	669643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309947
15103	NC_014323	CGG	2	6	669659	669664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309947
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15107	NC_014323	AAG	2	6	669780	669785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309947
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15109	NC_014323	GC	3	6	669837	669842	0 %	0 %	50 %	50 %	300309947
15110	NC_014323	GAA	2	6	669846	669851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309947
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15115	NC_014323	ACCGA	2	10	669983	669992	40 %	0 %	20 %	40 %	300309948
15116	NC_014323	CCTGC	2	10	670067	670076	0 %	20 %	20 %	60 %	300309948
15117	NC_014323	CG	3	6	670107	670112	0 %	0 %	50 %	50 %	300309948
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15119	NC_014323	TGG	2	6	670136	670141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309948
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15357	NC_014323	TGG	3	9	681402	681410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309957
15358	NC_014323	GCC	2	6	681424	681429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309957
15359	NC_014323	GCA	2	6	681430	681435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309957
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15361	NC_014323	GC	3	6	681512	681517	0 %	0 %	50 %	50 %	300309957
15362	NC_014323	GC	3	6	681562	681567	0 %	0 %	50 %	50 %	300309957
15363	NC_014323	CTG	2	6	681572	681577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309957
15364	NC_014323	CTG	2	6	681587	681592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309957
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15370	NC_014323	GGT	3	9	681899	681907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309958
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15375	NC_014323	GC	3	6	682180	682185	0 %	0 %	50 %	50 %	300309958
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15378	NC_014323	CGA	2	6	682229	682234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309958
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15380	NC_014323	TGA	2	6	682426	682431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309958
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15462	NC_014323	CGACC	2	10	685303	685312	20 %	0 %	20 %	60 %	300309961
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15473	NC_014323	GC	4	8	685546	685553	0 %	0 %	50 %	50 %	300309961
15474	NC_014323	TGC	2	6	685558	685563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309961
15475	NC_014323	ATG	2	6	685564	685569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309961
15476	NC_014323	G	6	6	685576	685581	0 %	0 %	100 %	0 %	300309961
15477	NC_014323	TGC	2	6	685612	685617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309961
15478	NC_014323	GCC	2	6	685619	685624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309961
15479	NC_014323	GGCC	2	8	685645	685652	0 %	0 %	50 %	50 %	300309961
15480	NC_014323	CGG	2	6	685685	685690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309961
15481	NC_014323	GTG	3	9	685746	685754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309961
15482	NC_014323	GGC	2	6	685882	685887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309961
15483	NC_014323	TGG	2	6	685891	685896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309961
15484	NC_014323	CGCT	2	8	685983	685990	0 %	25 %	25 %	50 %	300309961
15485	NC_014323	GCA	2	6	686005	686010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309961
15486	NC_014323	CAT	3	9	686021	686029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309961
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15488	NC_014323	CAG	2	6	686111	686116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309961
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15490	NC_014323	ACA	2	6	686147	686152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309961
15491	NC_014323	TCA	2	6	686170	686175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309961
15492	NC_014323	TGCC	2	8	686210	686217	0 %	25 %	25 %	50 %	300309961
15493	NC_014323	TGG	2	6	686249	686254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309962
15494	NC_014323	GCT	2	6	686292	686297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309962
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15496	NC_014323	CGGCAA	2	12	686331	686342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309962
15497	NC_014323	CTG	2	6	686356	686361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309962
15498	NC_014323	GCT	2	6	686364	686369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309962
15499	NC_014323	GCC	2	6	686376	686381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309962
15500	NC_014323	TGG	3	9	686390	686398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309962

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