MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014323	CCCG	2	8	643017	643024	0 %	0 %	25 %	75 %	300309919
14502	NC_014323	CAG	2	6	643170	643175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309919
14503	NC_014323	CGC	2	6	643217	643222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309919
14504	NC_014323	CGCC	2	8	643265	643272	0 %	0 %	25 %	75 %	300309919
14505	NC_014323	GGC	2	6	643275	643280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309919
14506	NC_014323	CCTT	2	8	643306	643313	0 %	50 %	0 %	50 %	300309919
14507	NC_014323	CG	3	6	643356	643361	0 %	0 %	50 %	50 %	300309919
14508	NC_014323	TGGC	2	8	643364	643371	0 %	25 %	50 %	25 %	300309919
14509	NC_014323	GGCA	2	8	643382	643389	25 %	0 %	50 %	25 %	300309919
14510	NC_014323	CAG	2	6	643401	643406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309919
14511	NC_014323	CGATG	2	10	643418	643427	20 %	20 %	40 %	20 %	300309919
14512	NC_014323	GTT	2	6	643482	643487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309919
14513	NC_014323	GGC	2	6	643530	643535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309919
14514	NC_014323	TTG	2	6	643572	643577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309919
14515	NC_014323	GC	3	6	643625	643630	0 %	0 %	50 %	50 %	300309919
14516	NC_014323	GC	4	8	643644	643651	0 %	0 %	50 %	50 %	300309919
14517	NC_014323	GCC	2	6	643668	643673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309919
14518	NC_014323	GCC	2	6	643677	643682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309919
14519	NC_014323	TCATT	2	10	643733	643742	20 %	60 %	0 %	20 %	300309919
14520	NC_014323	ATC	2	6	643902	643907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309920
14521	NC_014323	CGG	2	6	643949	643954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309920
14522	NC_014323	CCATG	2	10	644023	644032	20 %	20 %	20 %	40 %	300309920
14523	NC_014323	GCA	2	6	644083	644088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309920
14524	NC_014323	GAC	2	6	644192	644197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309920
14525	NC_014323	GCG	2	6	644206	644211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309920
14526	NC_014323	TTGGGG	2	12	644217	644228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309920
14527	NC_014323	CGG	2	6	644254	644259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309920
14528	NC_014323	GCT	2	6	644267	644272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309920
14529	NC_014323	GC	3	6	644705	644710	0 %	0 %	50 %	50 %	300309921
14530	NC_014323	GATGCC	2	12	644784	644795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309921
14531	NC_014323	GCC	2	6	644803	644808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309921
14532	NC_014323	TTG	2	6	644827	644832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309921
14533	NC_014323	TGTAGC	2	12	644909	644920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300309921
14534	NC_014323	GGCG	2	8	644982	644989	0 %	0 %	75 %	25 %	300309921
14535	NC_014323	GCTGGT	2	12	645006	645017	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300309921
14536	NC_014323	GGCG	2	8	645050	645057	0 %	0 %	75 %	25 %	300309921
14537	NC_014323	TCG	2	6	645082	645087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309921
14538	NC_014323	CGA	2	6	645095	645100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309921
14539	NC_014323	GGA	2	6	645237	645242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309921
14540	NC_014323	GCG	2	6	645268	645273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309921
14541	NC_014323	TTCCAG	2	12	645369	645380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300309921
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14543	NC_014323	CGG	2	6	645422	645427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309921
14544	NC_014323	GGC	2	6	645543	645548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309922
14545	NC_014323	GTT	2	6	645554	645559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309922
14546	NC_014323	CAG	2	6	645564	645569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309922
14547	NC_014323	CAG	2	6	645687	645692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309922
14548	NC_014323	GAT	2	6	645707	645712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309922
14549	NC_014323	GGT	2	6	645732	645737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309922
14550	NC_014323	CGC	2	6	645821	645826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309922
14551	NC_014323	CGT	2	6	645833	645838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309922
14552	NC_014323	GCG	2	6	645840	645845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309922
14553	NC_014323	CAG	2	6	645885	645890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309922
14554	NC_014323	CCTT	2	8	645895	645902	0 %	50 %	0 %	50 %	300309922
14555	NC_014323	CGG	2	6	645945	645950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309922
14556	NC_014323	CTG	2	6	645951	645956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309922
14557	NC_014323	GCC	2	6	646044	646049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309922
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14559	NC_014323	ACC	2	6	646158	646163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309922
14560	NC_014323	CG	3	6	646178	646183	0 %	0 %	50 %	50 %	300309922
14561	NC_014323	GCG	2	6	646226	646231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309922
14562	NC_014323	ACC	2	6	646234	646239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309922
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14564	NC_014323	CAG	2	6	646281	646286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309922
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14567	NC_014323	CAG	2	6	646532	646537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309923
14568	NC_014323	CGA	2	6	646555	646560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309923
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14572	NC_014323	GCCA	2	8	646668	646675	25 %	0 %	25 %	50 %	300309923
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14577	NC_014323	GAA	2	6	646829	646834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309923
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14582	NC_014323	GGCTT	2	10	647105	647114	0 %	40 %	40 %	20 %	300309924
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14599	NC_014323	GCCG	2	8	647737	647744	0 %	0 %	50 %	50 %	300309924
14600	NC_014323	CGG	2	6	647757	647762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309924
14601	NC_014323	GCG	2	6	647778	647783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309924
14602	NC_014323	CGA	2	6	647865	647870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309924
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14604	NC_014323	GCA	3	9	648117	648125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309924
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