MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014323	CGC	2	6	47102	47107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309380
1002	NC_014323	TGA	2	6	47108	47113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309380
1003	NC_014323	CTC	2	6	47127	47132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309380
1004	NC_014323	GGC	2	6	47201	47206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309380
1005	NC_014323	GC	3	6	47236	47241	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
1006	NC_014323	TGC	2	6	47245	47250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309380
1007	NC_014323	CGC	3	9	47282	47290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309380
1008	NC_014323	CAG	2	6	47298	47303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309380
1009	NC_014323	TGA	2	6	47315	47320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309380
1010	NC_014323	GGC	2	6	47324	47329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309380
1011	NC_014323	GGC	2	6	47364	47369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309380
1012	NC_014323	GCC	2	6	47420	47425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309380
1013	NC_014323	CG	3	6	47427	47432	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
1014	NC_014323	GC	3	6	47447	47452	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
1015	NC_014323	CAG	2	6	47511	47516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309380
1016	NC_014323	GCG	2	6	47543	47548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309380
1017	NC_014323	CGG	2	6	47555	47560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309380
1018	NC_014323	AGC	2	6	47643	47648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309381
1019	NC_014323	GGC	2	6	47701	47706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309381
1020	NC_014323	GCG	2	6	47755	47760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309381
1021	NC_014323	TCG	2	6	47777	47782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309381
1022	NC_014323	AGC	2	6	47783	47788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309381
1023	NC_014323	TCCAGC	2	12	47792	47803	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309381
1024	NC_014323	CAG	2	6	47812	47817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309381
1025	NC_014323	GCG	2	6	47832	47837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309381
1026	NC_014323	GCGCCA	2	12	47841	47852	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300309381
1027	NC_014323	GCG	2	6	47899	47904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309381
1028	NC_014323	GC	3	6	47948	47953	0 %	0 %	50 %	50 %	300309381
1029	NC_014323	CGCT	2	8	47978	47985	0 %	25 %	25 %	50 %	300309381
1030	NC_014323	CAG	2	6	47989	47994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309381
1031	NC_014323	CCG	2	6	48021	48026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309381
1032	NC_014323	GAC	2	6	48045	48050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309381
1033	NC_014323	TGG	2	6	48077	48082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309381
1034	NC_014323	GGCA	2	8	48142	48149	25 %	0 %	50 %	25 %	300309381
1035	NC_014323	CTC	2	6	48215	48220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309382
1036	NC_014323	TGG	2	6	48256	48261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309382
1037	NC_014323	CCA	2	6	48293	48298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309382
1038	NC_014323	CGA	2	6	48395	48400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309382
1039	NC_014323	GGGC	2	8	48441	48448	0 %	0 %	75 %	25 %	300309382
1040	NC_014323	TGCA	2	8	48498	48505	25 %	25 %	25 %	25 %	300309382
1041	NC_014323	GC	3	6	48519	48524	0 %	0 %	50 %	50 %	300309382
1042	NC_014323	CG	3	6	48533	48538	0 %	0 %	50 %	50 %	300309382
1043	NC_014323	GCGCG	2	10	48566	48575	0 %	0 %	60 %	40 %	300309382
1044	NC_014323	CCAGG	2	10	48588	48597	20 %	0 %	40 %	40 %	300309382
1045	NC_014323	GAT	2	6	48612	48617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309382
1046	NC_014323	GC	3	6	48622	48627	0 %	0 %	50 %	50 %	300309382
1047	NC_014323	GGCG	2	8	48650	48657	0 %	0 %	75 %	25 %	300309382
1048	NC_014323	CTG	2	6	48669	48674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309382
1049	NC_014323	CAG	2	6	48678	48683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309382
1050	NC_014323	CGG	2	6	48704	48709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309382
1051	NC_014323	GCA	2	6	48719	48724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309382
1052	NC_014323	TTC	2	6	48783	48788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309382
1053	NC_014323	TGTCT	2	10	48794	48803	0 %	60 %	20 %	20 %	300309382
1054	NC_014323	GCGGGC	2	12	49000	49011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309383
1055	NC_014323	CAC	2	6	49030	49035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309383
1056	NC_014323	CCA	2	6	49068	49073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309383
1057	NC_014323	CGA	2	6	49146	49151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309383
1058	NC_014323	GGC	2	6	49167	49172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309383
1059	NC_014323	CCA	2	6	49215	49220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309383
1060	NC_014323	CAG	2	6	49264	49269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309383
1061	NC_014323	GGC	2	6	49312	49317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309383
1062	NC_014323	CTT	2	6	49369	49374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309383
1063	NC_014323	GCCG	2	8	49438	49445	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
1064	NC_014323	GC	3	6	49467	49472	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
1065	NC_014323	GCA	2	6	49476	49481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309383
1066	NC_014323	CCGA	2	8	49514	49521	25 %	0 %	25 %	50 %	300309383
1067	NC_014323	GCGCG	2	10	49539	49548	0 %	0 %	60 %	40 %	300309383
1068	NC_014323	CTT	2	6	49564	49569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309383
1069	NC_014323	CGT	2	6	49615	49620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309383
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1072	NC_014323	GC	3	6	49697	49702	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
1073	NC_014323	CG	3	6	49737	49742	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
1074	NC_014323	CAG	2	6	49756	49761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309383
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1080	NC_014323	GC	3	6	49887	49892	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
1081	NC_014323	GCCA	2	8	49909	49916	25 %	0 %	25 %	50 %	300309383
1082	NC_014323	GCA	2	6	49917	49922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309383
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1088	NC_014323	GGCC	2	8	50127	50134	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
1089	NC_014323	GAA	2	6	50159	50164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309383
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1091	NC_014323	TCG	2	6	50476	50481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309384
1092	NC_014323	GCC	3	9	50499	50507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309384
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1094	NC_014323	CCA	2	6	50530	50535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309384
1095	NC_014323	GCC	3	9	50539	50547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309384
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1098	NC_014323	CCAC	2	8	50593	50600	25 %	0 %	0 %	75 %	300309384
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1101	NC_014323	GAT	2	6	50667	50672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309384
1102	NC_014323	GC	3	6	50694	50699	0 %	0 %	50 %	50 %	300309384
1103	NC_014323	GTG	3	9	50724	50732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309384
1104	NC_014323	GCT	2	6	50813	50818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309384
1105	NC_014323	CGC	2	6	50828	50833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309384
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1107	NC_014323	GTG	2	6	50895	50900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309384
1108	NC_014323	GTG	2	6	50934	50939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309384
1109	NC_014323	GGCC	2	8	50954	50961	0 %	0 %	50 %	50 %	300309384
1110	NC_014323	CCG	2	6	51026	51031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309384
1111	NC_014323	TCACCC	2	12	51037	51048	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	300309384
1112	NC_014323	AGC	2	6	51064	51069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309384
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1114	NC_014323	CCG	2	6	51127	51132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309384
1115	NC_014323	TGC	2	6	51208	51213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309384
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1117	NC_014323	CG	3	6	51275	51280	0 %	0 %	50 %	50 %	300309384
1118	NC_014323	GAAG	2	8	51305	51312	50 %	0 %	50 %	0 %	300309384
1119	NC_014323	CGG	2	6	51319	51324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309384
1120	NC_014323	GC	3	6	51391	51396	0 %	0 %	50 %	50 %	300309385
1121	NC_014323	GGCG	2	8	51419	51426	0 %	0 %	75 %	25 %	300309385
1122	NC_014323	CAG	2	6	51456	51461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309385
1123	NC_014323	GT	3	6	51467	51472	0 %	50 %	50 %	0 %	300309385
1124	NC_014323	GCC	2	6	51474	51479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309385
1125	NC_014323	GC	3	6	51490	51495	0 %	0 %	50 %	50 %	300309385
1126	NC_014323	AGT	2	6	51500	51505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309385
1127	NC_014323	GCA	2	6	51534	51539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309385
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1130	NC_014323	CAT	2	6	51623	51628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309385
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1243	NC_014323	GC	4	8	56132	56139	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
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1246	NC_014323	CGG	2	6	56227	56232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309387
1247	NC_014323	GCCT	2	8	56241	56248	0 %	25 %	25 %	50 %	300309387
1248	NC_014323	TGG	2	6	56251	56256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309387
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1251	NC_014323	GTG	3	9	56470	56478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309388
1252	NC_014323	GGT	2	6	56508	56513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309388
1253	NC_014323	GCG	2	6	56514	56519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309388
1254	NC_014323	GCC	2	6	56531	56536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309388
1255	NC_014323	CAC	3	9	56541	56549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309388
1256	NC_014323	TGC	2	6	56600	56605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309388
1257	NC_014323	TCA	2	6	56735	56740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309388
1258	NC_014323	CGC	2	6	56779	56784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309388
1259	NC_014323	TCA	2	6	56825	56830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309388
1260	NC_014323	GC	4	8	56873	56880	0 %	0 %	50 %	50 %	300309388
1261	NC_014323	CTG	2	6	56896	56901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309388
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1264	NC_014323	GTG	3	9	57067	57075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309388
1265	NC_014323	CCA	2	6	57158	57163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309388
1266	NC_014323	CATG	2	8	57276	57283	25 %	25 %	25 %	25 %	300309388
1267	NC_014323	AGCG	2	8	57295	57302	25 %	0 %	50 %	25 %	300309388
1268	NC_014323	CTG	2	6	57319	57324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309388
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1270	NC_014323	GC	3	6	57445	57450	0 %	0 %	50 %	50 %	300309388
1271	NC_014323	CAT	2	6	57474	57479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309388
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1280	NC_014323	TGG	2	6	58298	58303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309389
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1283	NC_014323	GA	3	6	58426	58431	50 %	0 %	50 %	0 %	300309389
1284	NC_014323	CGCCCT	2	12	58896	58907	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	300309390
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