MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014323	CTTGC	2	10	619524	619533	0 %	40 %	20 %	40 %	300309898
14002	NC_014323	CTG	2	6	619536	619541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309898
14003	NC_014323	TTGC	2	8	619590	619597	0 %	50 %	25 %	25 %	300309898
14004	NC_014323	GT	3	6	619602	619607	0 %	50 %	50 %	0 %	300309898
14005	NC_014323	TTC	2	6	619634	619639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309898
14006	NC_014323	GTG	2	6	619749	619754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309898
14007	NC_014323	GCG	2	6	619758	619763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309898
14008	NC_014323	GCG	2	6	619768	619773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309898
14009	NC_014323	CG	3	6	619795	619800	0 %	0 %	50 %	50 %	300309898
14010	NC_014323	ATG	2	6	619863	619868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309898
14011	NC_014323	CGGA	2	8	619921	619928	25 %	0 %	50 %	25 %	300309898
14012	NC_014323	TCA	2	6	619945	619950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309898
14013	NC_014323	TGCT	2	8	619962	619969	0 %	50 %	25 %	25 %	300309898
14014	NC_014323	TGA	2	6	619973	619978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309898
14015	NC_014323	TGC	2	6	619984	619989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309898
14016	NC_014323	GCGTG	2	10	619994	620003	0 %	20 %	60 %	20 %	300309898
14017	NC_014323	CGC	2	6	620021	620026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309898
14018	NC_014323	TGG	2	6	620113	620118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309898
14019	NC_014323	GGC	2	6	620135	620140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309898
14020	NC_014323	TGC	3	9	620206	620214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309898
14021	NC_014323	TGG	2	6	620220	620225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309898
14022	NC_014323	TGG	2	6	620260	620265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309898
14023	NC_014323	ATC	2	6	620271	620276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309898
14024	NC_014323	AGC	2	6	620334	620339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309898
14025	NC_014323	TGG	2	6	620359	620364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309898
14026	NC_014323	TGT	2	6	620374	620379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309898
14027	NC_014323	CCA	2	6	620413	620418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309898
14028	NC_014323	GT	3	6	620451	620456	0 %	50 %	50 %	0 %	300309898
14029	NC_014323	GCC	2	6	620466	620471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309898
14030	NC_014323	GCG	2	6	620512	620517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309898
14031	NC_014323	GGC	2	6	620582	620587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309899
14032	NC_014323	GCA	2	6	620601	620606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309899
14033	NC_014323	CTG	2	6	620766	620771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309899
14034	NC_014323	CTT	2	6	620874	620879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309899
14035	NC_014323	TCC	2	6	620881	620886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309899
14036	NC_014323	GAT	2	6	620909	620914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309899
14037	NC_014323	GA	3	6	620987	620992	50 %	0 %	50 %	0 %	300309899
14038	NC_014323	ATT	2	6	621103	621108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300309899
14039	NC_014323	ACT	2	6	621123	621128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309899
14040	NC_014323	TGC	2	6	621543	621548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309900
14041	NC_014323	CGG	2	6	621645	621650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309900
14042	NC_014323	AT	3	6	621660	621665	50 %	50 %	0 %	0 %	300309900
14043	NC_014323	GTCAGC	2	12	621706	621717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309900
14044	NC_014323	GAT	2	6	621789	621794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309900
14045	NC_014323	ACAT	2	8	621902	621909	50 %	25 %	0 %	25 %	300309900
14046	NC_014323	TCA	2	6	622010	622015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309901
14047	NC_014323	TCTT	2	8	622062	622069	0 %	75 %	0 %	25 %	300309901
14048	NC_014323	GGC	2	6	622184	622189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309901
14049	NC_014323	AGAAC	2	10	622202	622211	60 %	0 %	20 %	20 %	300309901
14050	NC_014323	GCG	2	6	622225	622230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309901
14051	NC_014323	TGG	2	6	622250	622255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309901
14052	NC_014323	GCC	2	6	622267	622272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309901
14053	NC_014323	CTC	2	6	622314	622319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309901
14054	NC_014323	GTCA	2	8	622356	622363	25 %	25 %	25 %	25 %	300309901
14055	NC_014323	ATG	2	6	622373	622378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309901
14056	NC_014323	AAG	2	6	622408	622413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309901
14057	NC_014323	ACCT	2	8	622414	622421	25 %	25 %	0 %	50 %	300309901
14058	NC_014323	CGG	2	6	622434	622439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309901
14059	NC_014323	TCT	2	6	622488	622493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309901
14060	NC_014323	GT	4	8	622534	622541	0 %	50 %	50 %	0 %	300309901
14061	NC_014323	GGC	2	6	622575	622580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309901
14062	NC_014323	GGC	2	6	622596	622601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309901
14063	NC_014323	GGC	2	6	622623	622628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309901
14064	NC_014323	GCA	2	6	622752	622757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309902
14065	NC_014323	TTC	2	6	622772	622777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309902
14066	NC_014323	CGG	2	6	622799	622804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309902
14067	NC_014323	CAT	2	6	622813	622818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309902
14068	NC_014323	TAC	2	6	622829	622834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309902
14069	NC_014323	TTG	2	6	622870	622875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309902
14070	NC_014323	GCC	2	6	622964	622969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309902
14071	NC_014323	GCG	2	6	622993	622998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309902
14072	NC_014323	GGC	2	6	623013	623018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309902
14073	NC_014323	AG	3	6	623020	623025	50 %	0 %	50 %	0 %	300309902
14074	NC_014323	CGC	2	6	623026	623031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309902
14075	NC_014323	GCA	2	6	623034	623039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309902
14076	NC_014323	TGC	2	6	623118	623123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309902
14077	NC_014323	ACA	2	6	623175	623180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309902
14078	NC_014323	ACC	2	6	623343	623348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309902
14079	NC_014323	GCC	2	6	623493	623498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309903
14080	NC_014323	CAA	2	6	623559	623564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309903
14081	NC_014323	TTG	2	6	623585	623590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309903
14082	NC_014323	GC	3	6	623600	623605	0 %	0 %	50 %	50 %	300309903
14083	NC_014323	AGG	2	6	623700	623705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309903
14084	NC_014323	TGC	3	9	623706	623714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14085	NC_014323	ACG	2	6	623778	623783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14086	NC_014323	GGAA	2	8	623805	623812	50 %	0 %	50 %	0 %	300309903
14087	NC_014323	TCA	2	6	623823	623828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309903
14088	NC_014323	CCA	2	6	623850	623855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309903
14089	NC_014323	AGG	2	6	623877	623882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309903
14090	NC_014323	GAA	2	6	623904	623909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309903
14091	NC_014323	GGC	2	6	623917	623922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309903
14092	NC_014323	TGC	2	6	624062	624067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14093	NC_014323	TCG	2	6	624077	624082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14094	NC_014323	ACC	2	6	624106	624111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309903
14095	NC_014323	GGT	2	6	624125	624130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309903
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14098	NC_014323	GAT	2	6	624226	624231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309903
14099	NC_014323	GGC	2	6	624286	624291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309903
14100	NC_014323	CT	3	6	624301	624306	0 %	50 %	0 %	50 %	300309903
14101	NC_014323	AGG	2	6	624354	624359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309903
14102	NC_014323	TCG	2	6	624362	624367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14103	NC_014323	GCC	2	6	624388	624393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309903
14104	NC_014323	GCA	2	6	624401	624406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14105	NC_014323	GCT	2	6	624531	624536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14106	NC_014323	GCT	2	6	624546	624551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14107	NC_014323	ACAT	2	8	624596	624603	50 %	25 %	0 %	25 %	300309903
14108	NC_014323	GGC	2	6	624604	624609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309903
14109	NC_014323	GGC	2	6	624640	624645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309903
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14111	NC_014323	CGG	2	6	624690	624695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309903
14112	NC_014323	TG	3	6	624707	624712	0 %	50 %	50 %	0 %	300309903
14113	NC_014323	CTT	2	6	624733	624738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309903
14114	NC_014323	GTC	2	6	624742	624747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309903
14115	NC_014323	GCGT	2	8	624767	624774	0 %	25 %	50 %	25 %	300309903
14116	NC_014323	GCGA	2	8	624843	624850	25 %	0 %	50 %	25 %	300309903
14117	NC_014323	TCA	2	6	624911	624916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309903
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14119	NC_014323	GCCT	2	8	625045	625052	0 %	25 %	25 %	50 %	300309903
14120	NC_014323	CAGG	2	8	625056	625063	25 %	0 %	50 %	25 %	300309903
14121	NC_014323	GGCT	2	8	625071	625078	0 %	25 %	50 %	25 %	300309903
14122	NC_014323	TTC	2	6	625089	625094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309903
14123	NC_014323	TCAG	2	8	625155	625162	25 %	25 %	25 %	25 %	300309904
14124	NC_014323	TGGC	2	8	625173	625180	0 %	25 %	50 %	25 %	300309904
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14128	NC_014323	GCA	2	6	625301	625306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309904
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14224	NC_014323	AAGG	2	8	629191	629198	50 %	0 %	50 %	0 %	300309906
14225	NC_014323	ATC	2	6	629209	629214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309906
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14229	NC_014323	GCCA	2	8	629350	629357	25 %	0 %	25 %	50 %	300309906
14230	NC_014323	ACC	2	6	629425	629430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309906
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14233	NC_014323	CAG	3	9	629592	629600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309906
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14235	NC_014323	CA	4	8	629655	629662	50 %	0 %	0 %	50 %	300309906
14236	NC_014323	ACG	2	6	629668	629673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309906
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14238	NC_014323	CCAGG	2	10	629844	629853	20 %	0 %	40 %	40 %	300309906
14239	NC_014323	TCT	2	6	629906	629911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309906
14240	NC_014323	CAT	2	6	630106	630111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309907
14241	NC_014323	GGC	2	6	630133	630138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309907
14242	NC_014323	TGC	2	6	630177	630182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309907
14243	NC_014323	GCA	2	6	630265	630270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309907
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14245	NC_014323	GC	3	6	630299	630304	0 %	0 %	50 %	50 %	300309907
14246	NC_014323	CGG	2	6	630308	630313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309907
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14347	NC_014323	AGGA	2	8	636673	636680	50 %	0 %	50 %	0 %	300309914
14348	NC_014323	C	6	6	636694	636699	0 %	0 %	0 %	100 %	300309914
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14354	NC_014323	GGCC	2	8	636905	636912	0 %	0 %	50 %	50 %	300309914
14355	NC_014323	CAG	2	6	636954	636959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309914
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14477	NC_014323	AG	3	6	641893	641898	50 %	0 %	50 %	0 %	300309918
14478	NC_014323	CAC	3	9	641929	641937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309918
14479	NC_014323	GC	3	6	641947	641952	0 %	0 %	50 %	50 %	300309918
14480	NC_014323	CAGGT	2	10	641993	642002	20 %	20 %	40 %	20 %	300309918
14481	NC_014323	GGT	2	6	642052	642057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309918
14482	NC_014323	CAGCT	2	10	642089	642098	20 %	20 %	20 %	40 %	300309918
14483	NC_014323	ATG	2	6	642230	642235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309918
14484	NC_014323	CAT	2	6	642241	642246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309918
14485	NC_014323	GCG	2	6	642285	642290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309918
14486	NC_014323	TGG	2	6	642306	642311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309918
14487	NC_014323	AGG	2	6	642312	642317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309918
14488	NC_014323	CGGT	2	8	642330	642337	0 %	25 %	50 %	25 %	300309918
14489	NC_014323	CCG	2	6	642338	642343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309918
14490	NC_014323	ACC	2	6	642371	642376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309918
14491	NC_014323	GCCG	2	8	642382	642389	0 %	0 %	50 %	50 %	300309918
14492	NC_014323	GCG	2	6	642396	642401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309918
14493	NC_014323	CCA	2	6	642429	642434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309918
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14495	NC_014323	GTT	2	6	642448	642453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309918
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14497	NC_014323	AG	3	6	642610	642615	50 %	0 %	50 %	0 %	300309918
14498	NC_014323	TGC	2	6	642657	642662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309918
14499	NC_014323	ACC	2	6	642710	642715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309918
14500	NC_014323	CG	3	6	643011	643016	0 %	0 %	50 %	50 %	300309919

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