MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014323	GTC	2	6	574840	574845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13002	NC_014323	CGC	2	6	574864	574869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13003	NC_014323	GCC	2	6	574883	574888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13004	NC_014323	TCA	2	6	574931	574936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309862
13005	NC_014323	TCC	2	6	574943	574948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309862
13006	NC_014323	GCGT	2	8	574962	574969	0 %	25 %	50 %	25 %	300309862
13007	NC_014323	CTG	2	6	574998	575003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13008	NC_014323	GACT	2	8	575010	575017	25 %	25 %	25 %	25 %	300309862
13009	NC_014323	CGG	2	6	575022	575027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309862
13010	NC_014323	GAC	2	6	575045	575050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13011	NC_014323	CT	3	6	575054	575059	0 %	50 %	0 %	50 %	300309862
13012	NC_014323	CGC	2	6	575080	575085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13013	NC_014323	CGG	2	6	575094	575099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309862
13014	NC_014323	CTG	2	6	575126	575131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13015	NC_014323	AGT	2	6	575147	575152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309862
13016	NC_014323	TGC	2	6	575172	575177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13017	NC_014323	CCG	2	6	575187	575192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13018	NC_014323	GCCA	2	8	575246	575253	25 %	0 %	25 %	50 %	300309862
13019	NC_014323	GC	3	6	575288	575293	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
13020	NC_014323	CGA	2	6	575365	575370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13021	NC_014323	CGC	2	6	575377	575382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13022	NC_014323	CAGC	2	8	575551	575558	25 %	0 %	25 %	50 %	300309862
13023	NC_014323	GC	3	6	575650	575655	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
13024	NC_014323	CGC	3	9	575683	575691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13025	NC_014323	TGCA	2	8	575751	575758	25 %	25 %	25 %	25 %	300309862
13026	NC_014323	GCT	2	6	575794	575799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13027	NC_014323	GGC	2	6	575800	575805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309862
13028	NC_014323	GCA	2	6	575967	575972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13029	NC_014323	GCA	2	6	575977	575982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309862
13030	NC_014323	ACC	2	6	576078	576083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309862
13031	NC_014323	CAGC	2	8	576103	576110	25 %	0 %	25 %	50 %	300309862
13032	NC_014323	GC	3	6	576146	576151	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
13033	NC_014323	GCCA	2	8	576164	576171	25 %	0 %	25 %	50 %	300309862
13034	NC_014323	GCC	2	6	576257	576262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13035	NC_014323	AAG	2	6	576279	576284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309862
13036	NC_014323	GCC	2	6	576290	576295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13037	NC_014323	CGC	2	6	576308	576313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13038	NC_014323	GCC	2	6	576315	576320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
13039	NC_014323	GC	4	8	576373	576380	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
13040	NC_014323	GC	3	6	576384	576389	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
13041	NC_014323	ATG	2	6	576403	576408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309862
13042	NC_014323	GCC	2	6	576748	576753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309863
13043	NC_014323	CTG	2	6	576793	576798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309863
13044	NC_014323	CCA	2	6	576854	576859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309863
13045	NC_014323	TGCTGG	2	12	576902	576913	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300309863
13046	NC_014323	CGA	2	6	576942	576947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309863
13047	NC_014323	TGA	2	6	576948	576953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309863
13048	NC_014323	GCC	2	6	576970	576975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309863
13049	NC_014323	GGT	2	6	576990	576995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309863
13050	NC_014323	CCG	2	6	577010	577015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309863
13051	NC_014323	CCA	2	6	577019	577024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309863
13052	NC_014323	CGTGGG	2	12	577041	577052	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300309863
13053	NC_014323	AGC	2	6	577083	577088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309863
13054	NC_014323	TGGCC	2	10	577098	577107	0 %	20 %	40 %	40 %	300309863
13055	NC_014323	ACC	3	9	577108	577116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309863
13056	NC_014323	GC	3	6	577170	577175	0 %	0 %	50 %	50 %	300309863
13057	NC_014323	ATC	2	6	577180	577185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309863
13058	NC_014323	GGC	2	6	577186	577191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309863
13059	NC_014323	GTG	2	6	577192	577197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309863
13060	NC_014323	GCG	2	6	577213	577218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309863
13061	NC_014323	CG	3	6	577240	577245	0 %	0 %	50 %	50 %	300309863
13062	NC_014323	GC	3	6	577260	577265	0 %	0 %	50 %	50 %	300309864
13063	NC_014323	GC	4	8	577288	577295	0 %	0 %	50 %	50 %	300309864
13064	NC_014323	CGG	2	6	577307	577312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309864
13065	NC_014323	CCG	2	6	577334	577339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309864
13066	NC_014323	GCC	2	6	577355	577360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309864
13067	NC_014323	GC	3	6	577378	577383	0 %	0 %	50 %	50 %	300309864
13068	NC_014323	TCG	2	6	577390	577395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309864
13069	NC_014323	GCGG	2	8	577400	577407	0 %	0 %	75 %	25 %	300309864
13070	NC_014323	GC	3	6	577471	577476	0 %	0 %	50 %	50 %	300309864
13071	NC_014323	CCG	2	6	577535	577540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309864
13072	NC_014323	ATG	2	6	577555	577560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309864
13073	NC_014323	ATG	2	6	577597	577602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309864
13074	NC_014323	GTG	2	6	577624	577629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309864
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13079	NC_014323	CGC	2	6	577872	577877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309864
13080	NC_014323	ACCC	2	8	577887	577894	25 %	0 %	0 %	75 %	300309864
13081	NC_014323	TGGC	2	8	577915	577922	0 %	25 %	50 %	25 %	300309864
13082	NC_014323	GCG	2	6	577923	577928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309864
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13085	NC_014323	CAG	2	6	578058	578063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309864
13086	NC_014323	GGC	2	6	578083	578088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309864
13087	NC_014323	CAG	2	6	578100	578105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309864
13088	NC_014323	CGC	3	9	578106	578114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309864
13089	NC_014323	CGG	2	6	578116	578121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309864
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13091	NC_014323	GGT	2	6	578251	578256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309865
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13099	NC_014323	TGA	2	6	578508	578513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309865
13100	NC_014323	TGA	2	6	578553	578558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309865
13101	NC_014323	CGG	4	12	578574	578585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309865
13102	NC_014323	GCA	2	6	578619	578624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309865
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13104	NC_014323	GC	3	6	578660	578665	0 %	0 %	50 %	50 %	300309865
13105	NC_014323	GC	3	6	578702	578707	0 %	0 %	50 %	50 %	300309865
13106	NC_014323	CGA	2	6	578739	578744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309865
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13108	NC_014323	TGC	2	6	578937	578942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309865
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13110	NC_014323	TGA	2	6	579051	579056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309865
13111	NC_014323	GC	3	6	579079	579084	0 %	0 %	50 %	50 %	300309865
13112	NC_014323	CCT	2	6	579093	579098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309865
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13114	NC_014323	GCA	2	6	579183	579188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309865
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13117	NC_014323	CGG	2	6	579254	579259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309865
13118	NC_014323	CAT	2	6	579605	579610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309866
13119	NC_014323	CGC	2	6	579616	579621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
13120	NC_014323	CCG	2	6	579645	579650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
13121	NC_014323	CCG	2	6	579672	579677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
13122	NC_014323	CGC	3	9	579691	579699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
13123	NC_014323	GTG	2	6	579734	579739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309866
13124	NC_014323	GAA	2	6	579814	579819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309866
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13126	NC_014323	TGC	2	6	579960	579965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
13127	NC_014323	TGC	3	9	580011	580019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
13128	NC_014323	GGGCT	2	10	580034	580043	0 %	20 %	60 %	20 %	300309866
13129	NC_014323	CCCG	2	8	580096	580103	0 %	0 %	25 %	75 %	300309866
13130	NC_014323	GCC	2	6	580136	580141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
13131	NC_014323	CAT	2	6	580177	580182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309866
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13134	NC_014323	CGGC	2	8	580338	580345	0 %	0 %	50 %	50 %	300309866
13135	NC_014323	CGCCAC	2	12	580348	580359	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300309866
13136	NC_014323	CAG	2	6	580363	580368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309866
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13138	NC_014323	CTGG	2	8	580405	580412	0 %	25 %	50 %	25 %	300309866
13139	NC_014323	CGC	2	6	580430	580435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
13140	NC_014323	ACCT	2	8	580550	580557	25 %	25 %	0 %	50 %	300309866
13141	NC_014323	CCTCG	2	10	580597	580606	0 %	20 %	20 %	60 %	300309866
13142	NC_014323	CGG	2	6	580642	580647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309866
13143	NC_014323	CTG	2	6	580664	580669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
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13147	NC_014323	CTG	2	6	580694	580699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
13148	NC_014323	TGA	2	6	580719	580724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309866
13149	NC_014323	CTG	3	9	580727	580735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
13150	NC_014323	GCC	2	6	580862	580867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
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13153	NC_014323	GCT	2	6	580984	580989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
13154	NC_014323	GCT	3	9	580999	581007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
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13159	NC_014323	GC	3	6	581284	581289	0 %	0 %	50 %	50 %	300309867
13160	NC_014323	CAT	2	6	581323	581328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309867
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13163	NC_014323	CG	3	6	581400	581405	0 %	0 %	50 %	50 %	300309867
13164	NC_014323	GGC	2	6	581413	581418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309867
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13167	NC_014323	GCC	2	6	581612	581617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309867
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13172	NC_014323	TGG	2	6	581721	581726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309867
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13175	NC_014323	GC	3	6	581929	581934	0 %	0 %	50 %	50 %	300309867
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13195	NC_014323	CGG	2	6	582781	582786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309867
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13200	NC_014323	CGA	2	6	582916	582921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309867
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13202	NC_014323	GCG	2	6	583019	583024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309867
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13209	NC_014323	GC	3	6	583361	583366	0 %	0 %	50 %	50 %	300309868
13210	NC_014323	TGC	2	6	583420	583425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
13211	NC_014323	GCT	2	6	583432	583437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
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13213	NC_014323	TGC	2	6	583462	583467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
13214	NC_014323	GCGCA	2	10	583487	583496	20 %	0 %	40 %	40 %	300309868
13215	NC_014323	CAG	2	6	583502	583507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309868
13216	NC_014323	GTC	2	6	583520	583525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
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13221	NC_014323	CTG	2	6	583745	583750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
13222	NC_014323	GC	3	6	583856	583861	0 %	0 %	50 %	50 %	300309868
13223	NC_014323	GAT	2	6	583868	583873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309868
13224	NC_014323	GC	3	6	583896	583901	0 %	0 %	50 %	50 %	300309868
13225	NC_014323	AGG	2	6	583944	583949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309868
13226	NC_014323	GCG	2	6	583968	583973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309868
13227	NC_014323	CCA	3	9	583987	583995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309868
13228	NC_014323	AGGA	2	8	584163	584170	50 %	0 %	50 %	0 %	300309868
13229	NC_014323	GCCA	2	8	584175	584182	25 %	0 %	25 %	50 %	300309868
13230	NC_014323	ATC	2	6	584217	584222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309868
13231	NC_014323	GC	3	6	584236	584241	0 %	0 %	50 %	50 %	300309868
13232	NC_014323	GCA	2	6	584260	584265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309868
13233	NC_014323	CGC	2	6	584302	584307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309868
13234	NC_014323	CGG	2	6	584308	584313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309868
13235	NC_014323	GAA	3	9	584366	584374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309868
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13237	NC_014323	CAG	2	6	584477	584482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309868
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13358	NC_014323	CAT	2	6	590326	590331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309872
13359	NC_014323	GCG	2	6	590357	590362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309872
13360	NC_014323	CTG	2	6	590363	590368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309872
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13372	NC_014323	GC	3	6	591127	591132	0 %	0 %	50 %	50 %	300309873
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13467	NC_014323	CCAGG	2	10	594880	594889	20 %	0 %	40 %	40 %	300309875
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13477	NC_014323	CGG	2	6	595394	595399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309875
13478	NC_014323	GGC	2	6	595405	595410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309875
13479	NC_014323	GAA	2	6	595432	595437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309875
13480	NC_014323	ACGCGA	2	12	595446	595457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
13481	NC_014323	GCA	2	6	595467	595472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
13482	NC_014323	CAG	2	6	595582	595587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
13483	NC_014323	CTT	2	6	595641	595646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309875
13484	NC_014323	GCG	2	6	595662	595667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309875
13485	NC_014323	GGT	2	6	595669	595674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309875
13486	NC_014323	CAA	3	9	596053	596061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309876
13487	NC_014323	CGG	2	6	596209	596214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309876
13488	NC_014323	AGA	2	6	596223	596228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309876
13489	NC_014323	CCG	2	6	596253	596258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309876
13490	NC_014323	CAG	2	6	596266	596271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309876
13491	NC_014323	GCC	2	6	596312	596317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309876
13492	NC_014323	GCC	2	6	596329	596334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309876
13493	NC_014323	GGT	2	6	596335	596340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309876
13494	NC_014323	GCG	2	6	596371	596376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309876
13495	NC_014323	GC	3	6	596386	596391	0 %	0 %	50 %	50 %	300309876
13496	NC_014323	GATCAG	2	12	596392	596403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300309876
13497	NC_014323	ATC	2	6	596480	596485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309876
13498	NC_014323	TCAGCG	2	12	596502	596513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309876
13499	NC_014323	AGGT	2	8	596549	596556	25 %	25 %	50 %	0 %	300309876
13500	NC_014323	TGCGA	2	10	596559	596568	20 %	20 %	40 %	20 %	300309876

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