MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014323	CAG	2	6	552188	552193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12502	NC_014323	TTG	2	6	552195	552200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309841
12503	NC_014323	GCC	2	6	552204	552209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309841
12504	NC_014323	GCC	2	6	552221	552226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309841
12505	NC_014323	GCA	3	9	552265	552273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12506	NC_014323	CGC	2	6	552298	552303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309841
12507	NC_014323	GC	3	6	552324	552329	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12508	NC_014323	CTG	2	6	552365	552370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12509	NC_014323	CGT	2	6	552379	552384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12510	NC_014323	GCA	2	6	552454	552459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12511	NC_014323	GC	4	8	552494	552501	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12512	NC_014323	CCG	2	6	552507	552512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309841
12513	NC_014323	ATC	2	6	552564	552569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309841
12514	NC_014323	TCCACC	2	12	552633	552644	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	300309841
12515	NC_014323	CGT	2	6	552709	552714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12516	NC_014323	GCAG	2	8	552805	552812	25 %	0 %	50 %	25 %	300309841
12517	NC_014323	CGA	2	6	552820	552825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12518	NC_014323	GTC	2	6	552851	552856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12519	NC_014323	GC	3	6	552863	552868	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12520	NC_014323	GGT	2	6	552932	552937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309841
12521	NC_014323	AGC	2	6	553062	553067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12522	NC_014323	CAC	2	6	553091	553096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309841
12523	NC_014323	CCA	2	6	553109	553114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309841
12524	NC_014323	GCC	2	6	553122	553127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309841
12525	NC_014323	GC	3	6	553145	553150	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12526	NC_014323	TGG	2	6	553194	553199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309841
12527	NC_014323	GC	3	6	553209	553214	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12528	NC_014323	GTTC	2	8	553270	553277	0 %	50 %	25 %	25 %	300309841
12529	NC_014323	CAT	2	6	553608	553613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309842
12530	NC_014323	GCA	2	6	553681	553686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309842
12531	NC_014323	CGT	2	6	553688	553693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309842
12532	NC_014323	GGC	2	6	553716	553721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309842
12533	NC_014323	TGC	2	6	553737	553742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309842
12534	NC_014323	GCT	2	6	553782	553787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309842
12535	NC_014323	GCC	2	6	553834	553839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309842
12536	NC_014323	CAA	2	6	553947	553952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309842
12537	NC_014323	CGC	2	6	553974	553979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309842
12538	NC_014323	GCC	2	6	554027	554032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309842
12539	NC_014323	GCA	2	6	554034	554039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309842
12540	NC_014323	GAG	2	6	554113	554118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309842
12541	NC_014323	CTGCGC	2	12	554158	554169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300309842
12542	NC_014323	TGA	2	6	554174	554179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309842
12543	NC_014323	GC	3	6	554276	554281	0 %	0 %	50 %	50 %	300309842
12544	NC_014323	CGG	2	6	554517	554522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309843
12545	NC_014323	GCT	2	6	554568	554573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12546	NC_014323	GCA	2	6	554598	554603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12547	NC_014323	GC	3	6	554614	554619	0 %	0 %	50 %	50 %	300309843
12548	NC_014323	CGC	2	6	554679	554684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309843
12549	NC_014323	CCT	2	6	554703	554708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309843
12550	NC_014323	GCTC	2	8	554717	554724	0 %	25 %	25 %	50 %	300309843
12551	NC_014323	CGT	2	6	554735	554740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12552	NC_014323	GC	4	8	554753	554760	0 %	0 %	50 %	50 %	300309843
12553	NC_014323	TGC	2	6	554762	554767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12554	NC_014323	GTCGG	2	10	554782	554791	0 %	20 %	60 %	20 %	300309843
12555	NC_014323	GGA	2	6	554817	554822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309843
12556	NC_014323	TGAC	2	8	554825	554832	25 %	25 %	25 %	25 %	300309843
12557	NC_014323	GCC	2	6	554839	554844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309843
12558	NC_014323	GCA	2	6	554862	554867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12559	NC_014323	GGC	2	6	554878	554883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309843
12560	NC_014323	GCC	2	6	554897	554902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309843
12561	NC_014323	AACG	2	8	554933	554940	50 %	0 %	25 %	25 %	300309843
12562	NC_014323	GCG	2	6	554955	554960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309843
12563	NC_014323	ATC	2	6	555013	555018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309843
12564	NC_014323	CAG	2	6	555049	555054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12565	NC_014323	CGT	2	6	555056	555061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12566	NC_014323	GC	5	10	555069	555078	0 %	0 %	50 %	50 %	300309843
12567	NC_014323	GC	3	6	555087	555092	0 %	0 %	50 %	50 %	300309843
12568	NC_014323	GC	3	6	555110	555115	0 %	0 %	50 %	50 %	300309843
12569	NC_014323	CAC	2	6	555371	555376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309843
12570	NC_014323	CAGC	2	8	555472	555479	25 %	0 %	25 %	50 %	300309843
12571	NC_014323	CGT	2	6	555514	555519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12572	NC_014323	GGCA	2	8	555550	555557	25 %	0 %	50 %	25 %	300309843
12573	NC_014323	CCG	2	6	555603	555608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309843
12574	NC_014323	GGC	2	6	555615	555620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309843
12575	NC_014323	GCC	3	9	555626	555634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309843
12576	NC_014323	GCT	2	6	555657	555662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309843
12577	NC_014323	GGC	2	6	555680	555685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309843
12578	NC_014323	GCAC	2	8	555729	555736	25 %	0 %	25 %	50 %	300309843
12579	NC_014323	CCAG	2	8	555824	555831	25 %	0 %	25 %	50 %	300309844
12580	NC_014323	AGCG	2	8	555895	555902	25 %	0 %	50 %	25 %	300309844
12581	NC_014323	GC	3	6	556004	556009	0 %	0 %	50 %	50 %	300309844
12582	NC_014323	AC	3	6	556032	556037	50 %	0 %	0 %	50 %	300309844
12583	NC_014323	CAGG	2	8	556050	556057	25 %	0 %	50 %	25 %	300309844
12584	NC_014323	GCT	3	9	556259	556267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309844
12585	NC_014323	GGC	2	6	556271	556276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309844
12586	NC_014323	GAG	2	6	556299	556304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309844
12587	NC_014323	CCG	2	6	556342	556347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309844
12588	NC_014323	CAG	2	6	556356	556361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309844
12589	NC_014323	TGG	2	6	556400	556405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309844
12590	NC_014323	GAG	2	6	556440	556445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309844
12591	NC_014323	CTT	2	6	556496	556501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309844
12592	NC_014323	AGCGC	2	10	556702	556711	20 %	0 %	40 %	40 %	300309845
12593	NC_014323	CT	3	6	556714	556719	0 %	50 %	0 %	50 %	300309845
12594	NC_014323	TTG	2	6	556762	556767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309845
12595	NC_014323	CGG	2	6	556901	556906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309845
12596	NC_014323	TCA	2	6	556916	556921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309845
12597	NC_014323	GCA	2	6	556997	557002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309845
12598	NC_014323	CG	3	6	557009	557014	0 %	0 %	50 %	50 %	300309845
12599	NC_014323	GTC	2	6	557040	557045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309845
12600	NC_014323	GC	3	6	557064	557069	0 %	0 %	50 %	50 %	300309845
12601	NC_014323	ACA	2	6	557108	557113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309845
12602	NC_014323	CGC	2	6	557147	557152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309845
12603	NC_014323	ACCG	2	8	557246	557253	25 %	0 %	25 %	50 %	300309845
12604	NC_014323	GTC	2	6	557331	557336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309845
12605	NC_014323	CCG	2	6	557393	557398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309845
12606	NC_014323	TGG	2	6	557417	557422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309845
12607	NC_014323	AGC	2	6	557446	557451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309845
12608	NC_014323	GCG	2	6	557529	557534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309845
12609	NC_014323	ATC	2	6	557575	557580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309845
12610	NC_014323	TGC	2	6	557830	557835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309846
12611	NC_014323	CAT	2	6	557852	557857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309846
12612	NC_014323	CGG	2	6	557861	557866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
12613	NC_014323	GGGCT	2	10	557880	557889	0 %	20 %	60 %	20 %	300309846
12614	NC_014323	GCCG	2	8	557957	557964	0 %	0 %	50 %	50 %	300309846
12615	NC_014323	GCG	3	9	557967	557975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
12616	NC_014323	GCA	2	6	557987	557992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309846
12617	NC_014323	TGG	2	6	558001	558006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309846
12618	NC_014323	CTGC	2	8	558025	558032	0 %	25 %	25 %	50 %	300309846
12619	NC_014323	GGC	3	9	558035	558043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
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12740	NC_014323	GCC	2	6	563601	563606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309850
12741	NC_014323	AGC	2	6	563607	563612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309850
12742	NC_014323	TGG	2	6	563665	563670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309850
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12744	NC_014323	CTG	2	6	563823	563828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309851
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12747	NC_014323	GTCG	2	8	563932	563939	0 %	25 %	50 %	25 %	300309851
12748	NC_014323	CTG	2	6	563951	563956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309851
12749	NC_014323	GAC	2	6	563999	564004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309851
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12752	NC_014323	CTA	2	6	564327	564332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309852
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12754	NC_014323	GCCG	2	8	564390	564397	0 %	0 %	50 %	50 %	300309852
12755	NC_014323	GCT	2	6	564454	564459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309852
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12769	NC_014323	GC	3	6	564847	564852	0 %	0 %	50 %	50 %	300309852
12770	NC_014323	GCA	3	9	564918	564926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309852
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12774	NC_014323	GCGT	2	8	565127	565134	0 %	25 %	50 %	25 %	300309852
12775	NC_014323	CAG	2	6	565150	565155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309852
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12777	NC_014323	TGG	2	6	565361	565366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309852
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12783	NC_014323	CGCC	2	8	565553	565560	0 %	0 %	25 %	75 %	300309852
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12827	NC_014323	CGTG	2	8	567674	567681	0 %	25 %	50 %	25 %	300309855
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12832	NC_014323	TCC	2	6	567982	567987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309855
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12842	NC_014323	GCCAGC	2	12	568334	568345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300309856
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12845	NC_014323	GC	3	6	568367	568372	0 %	0 %	50 %	50 %	300309856
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12849	NC_014323	CGC	2	6	568552	568557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309856
12850	NC_014323	TCG	2	6	568625	568630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309856
12851	NC_014323	GCG	2	6	568644	568649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309856
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12854	NC_014323	GGC	2	6	568794	568799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309856
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12977	NC_014323	GC	3	6	574091	574096	0 %	0 %	50 %	50 %	300309861
12978	NC_014323	TGC	2	6	574097	574102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309861
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12981	NC_014323	CGC	2	6	574163	574168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309861
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