MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_014323	GCT	2	6	527788	527793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309819
12005	NC_014323	GGC	2	6	527794	527799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309819
12006	NC_014323	TCG	2	6	527860	527865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309819
12007	NC_014323	GCG	2	6	527920	527925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309819
12008	NC_014323	GCG	2	6	528199	528204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309819
12009	NC_014323	CCG	2	6	528274	528279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309819
12010	NC_014323	GTA	2	6	528290	528295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309819
12011	NC_014323	CGT	2	6	528320	528325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309819
12012	NC_014323	GGC	2	6	528345	528350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309819
12013	NC_014323	TGA	2	6	528364	528369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309819
12014	NC_014323	AGGA	2	8	528393	528400	50 %	0 %	50 %	0 %	300309819
12015	NC_014323	CAG	2	6	528419	528424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309819
12016	NC_014323	TACA	2	8	528446	528453	50 %	25 %	0 %	25 %	300309819
12017	NC_014323	CGGC	2	8	528465	528472	0 %	0 %	50 %	50 %	300309819
12018	NC_014323	TTG	2	6	528474	528479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309819
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12052	NC_014323	GGTGAT	2	12	529802	529813	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	300309819
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12057	NC_014323	CTTG	2	8	530121	530128	0 %	50 %	25 %	25 %	300309820
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12104	NC_014323	TGCC	2	8	532372	532379	0 %	25 %	25 %	50 %	300309821
12105	NC_014323	GCCT	2	8	532398	532405	0 %	25 %	25 %	50 %	300309821
12106	NC_014323	ACGC	2	8	532410	532417	25 %	0 %	25 %	50 %	300309821
12107	NC_014323	GC	3	6	532738	532743	0 %	0 %	50 %	50 %	300309822
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12114	NC_014323	GCTCA	2	10	533245	533254	20 %	20 %	20 %	40 %	300309823
12115	NC_014323	CTGG	2	8	533279	533286	0 %	25 %	50 %	25 %	300309823
12116	NC_014323	CGC	2	6	533299	533304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309823
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12120	NC_014323	TTC	2	6	533402	533407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309823
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12122	NC_014323	CGA	2	6	533726	533731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309824
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12155	NC_014323	GACT	2	8	534841	534848	25 %	25 %	25 %	25 %	300309825
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12239	NC_014323	GTG	2	6	538244	538249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309830
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12241	NC_014323	GC	3	6	538309	538314	0 %	0 %	50 %	50 %	300309830
12242	NC_014323	CGA	2	6	538342	538347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309830
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12329	NC_014323	ACGCA	2	10	543318	543327	40 %	0 %	20 %	40 %	300309834
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12350	NC_014323	CGG	2	6	544461	544466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309836
12351	NC_014323	AG	3	6	544469	544474	50 %	0 %	50 %	0 %	300309836
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12355	NC_014323	ACT	2	6	544673	544678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309836
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12357	NC_014323	TCT	2	6	544793	544798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309836
12358	NC_014323	CGCAG	2	10	544832	544841	20 %	0 %	40 %	40 %	300309836
12359	NC_014323	TCA	2	6	544866	544871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309836
12360	NC_014323	GA	3	6	544881	544886	50 %	0 %	50 %	0 %	300309836
12361	NC_014323	CTC	2	6	544916	544921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309836
12362	NC_014323	CGC	2	6	544960	544965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309836
12363	NC_014323	TG	3	6	544983	544988	0 %	50 %	50 %	0 %	300309836
12364	NC_014323	TTG	2	6	545002	545007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309836
12365	NC_014323	TAA	2	6	545083	545088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300309836
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12368	NC_014323	GA	3	6	545886	545891	50 %	0 %	50 %	0 %	300309837
12369	NC_014323	AACC	2	8	545923	545930	50 %	0 %	0 %	50 %	300309837
12370	NC_014323	GGGCG	2	10	545943	545952	0 %	0 %	80 %	20 %	300309837
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12373	NC_014323	GGACT	2	10	546157	546166	20 %	20 %	40 %	20 %	300309837
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12376	NC_014323	CTG	2	6	546206	546211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309837
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12381	NC_014323	CCTG	2	8	546465	546472	0 %	25 %	25 %	50 %	300309838
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12479	NC_014323	GC	3	6	551380	551385	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12480	NC_014323	GCC	2	6	551408	551413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309841
12481	NC_014323	AGCGC	2	10	551443	551452	20 %	0 %	40 %	40 %	300309841
12482	NC_014323	CTG	2	6	551492	551497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12483	NC_014323	CTG	2	6	551513	551518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12484	NC_014323	ACC	2	6	551547	551552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309841
12485	NC_014323	TGCC	2	8	551563	551570	0 %	25 %	25 %	50 %	300309841
12486	NC_014323	GC	4	8	551583	551590	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12487	NC_014323	CAG	2	6	551624	551629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12488	NC_014323	GC	3	6	551639	551644	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12489	NC_014323	GCA	2	6	551662	551667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12490	NC_014323	GCC	2	6	551672	551677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309841
12491	NC_014323	GGC	2	6	551707	551712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309841
12492	NC_014323	CGG	2	6	551717	551722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309841
12493	NC_014323	GC	3	6	551732	551737	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12494	NC_014323	GC	3	6	551841	551846	0 %	0 %	50 %	50 %	300309841
12495	NC_014323	TGG	2	6	551871	551876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309841
12496	NC_014323	TGCCGA	2	12	551890	551901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309841
12497	NC_014323	GCC	2	6	552024	552029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309841
12498	NC_014323	CACG	2	8	552061	552068	25 %	0 %	25 %	50 %	300309841
12499	NC_014323	ATC	2	6	552095	552100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309841
12500	NC_014323	C	6	6	552120	552125	0 %	0 %	0 %	100 %	300309841

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