MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124001	NC_014323	CTT	2	6	5466432	5466437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314043
124002	NC_014323	GGCCTG	2	12	5466459	5466470	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300314043
124003	NC_014323	TGG	2	6	5466497	5466502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314043
124004	NC_014323	TGA	2	6	5466521	5466526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314043
124005	NC_014323	TCC	2	6	5466547	5466552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300314043
124006	NC_014323	TGC	2	6	5466592	5466597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124007	NC_014323	CAG	2	6	5466684	5466689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124008	NC_014323	TCG	2	6	5466727	5466732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124009	NC_014323	CGT	2	6	5466776	5466781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124010	NC_014323	TGG	2	6	5466799	5466804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314043
124011	NC_014323	GTG	3	9	5466825	5466833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314043
124012	NC_014323	ATGCCC	2	12	5466858	5466869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300314043
124013	NC_014323	TCT	2	6	5466926	5466931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314043
124014	NC_014323	CAG	2	6	5466957	5466962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124015	NC_014323	GC	4	8	5467002	5467009	0 %	0 %	50 %	50 %	300314043
124016	NC_014323	GCC	2	6	5467042	5467047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314043
124017	NC_014323	GGC	2	6	5467053	5467058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314043
124018	NC_014323	GGTC	2	8	5467067	5467074	0 %	25 %	50 %	25 %	300314043
124019	NC_014323	CAG	3	9	5467080	5467088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124020	NC_014323	CGG	2	6	5467100	5467105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314043
124021	NC_014323	CTG	2	6	5467107	5467112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124022	NC_014323	GTG	2	6	5467125	5467130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314043
124023	NC_014323	TCA	2	6	5467214	5467219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314043
124024	NC_014323	AGGCC	2	10	5467244	5467253	20 %	0 %	40 %	40 %	300314043
124025	NC_014323	GGT	2	6	5467254	5467259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314043
124026	NC_014323	GCC	2	6	5467286	5467291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314043
124027	NC_014323	TCT	2	6	5467328	5467333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314043
124028	NC_014323	GCA	2	6	5467353	5467358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124029	NC_014323	GCT	2	6	5467368	5467373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124030	NC_014323	CGA	2	6	5467379	5467384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124031	NC_014323	CCA	2	6	5467406	5467411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314043
124032	NC_014323	TGA	3	9	5467445	5467453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314043
124033	NC_014323	AGC	2	6	5467495	5467500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124034	NC_014323	CAG	2	6	5467530	5467535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314043
124035	NC_014323	CGG	2	6	5467559	5467564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314043
124036	NC_014323	TGT	2	6	5467580	5467585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300314043
124037	NC_014323	GCG	2	6	5467740	5467745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314044
124038	NC_014323	TCT	2	6	5467746	5467751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314044
124039	NC_014323	GCA	2	6	5467782	5467787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314044
124040	NC_014323	GC	3	6	5467801	5467806	0 %	0 %	50 %	50 %	300314044
124041	NC_014323	GTT	2	6	5467912	5467917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300314044
124042	NC_014323	TCA	2	6	5467920	5467925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314044
124043	NC_014323	GCA	2	6	5467962	5467967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314044
124044	NC_014323	CGG	2	6	5467989	5467994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314044
124045	NC_014323	AGA	2	6	5468103	5468108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300314044
124046	NC_014323	CGC	2	6	5468112	5468117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314044
124047	NC_014323	CCTT	2	8	5468120	5468127	0 %	50 %	0 %	50 %	300314044
124048	NC_014323	TCT	2	6	5468133	5468138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314044
124049	NC_014323	TCA	2	6	5468288	5468293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314044
124050	NC_014323	TTC	2	6	5468362	5468367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314044
124051	NC_014323	TCG	2	6	5468659	5468664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124052	NC_014323	GGC	2	6	5468667	5468672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
124053	NC_014323	CGG	2	6	5468674	5468679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
124054	NC_014323	CG	3	6	5468693	5468698	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124055	NC_014323	CCT	2	6	5468729	5468734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300314045
124056	NC_014323	GCGG	2	8	5468739	5468746	0 %	0 %	75 %	25 %	300314045
124057	NC_014323	CTG	2	6	5468760	5468765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124058	NC_014323	GTG	2	6	5468784	5468789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314045
124059	NC_014323	TGC	2	6	5468794	5468799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124060	NC_014323	CAA	2	6	5468816	5468821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300314045
124061	NC_014323	GCC	2	6	5468860	5468865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314045
124062	NC_014323	CG	3	6	5468878	5468883	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124063	NC_014323	CTC	2	6	5468900	5468905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300314045
124064	NC_014323	ACG	2	6	5468950	5468955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124065	NC_014323	CTGGGA	2	12	5468981	5468992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300314045
124066	NC_014323	CCCG	2	8	5469094	5469101	0 %	0 %	25 %	75 %	300314045
124067	NC_014323	GGCC	2	8	5469122	5469129	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124068	NC_014323	GC	3	6	5469132	5469137	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124069	NC_014323	CGCC	2	8	5469214	5469221	0 %	0 %	25 %	75 %	300314045
124070	NC_014323	GCT	2	6	5469235	5469240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124071	NC_014323	CGG	4	12	5469241	5469252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
124072	NC_014323	TGC	2	6	5469295	5469300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124073	NC_014323	GC	4	8	5469308	5469315	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124074	NC_014323	CTG	2	6	5469321	5469326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124075	NC_014323	CAG	2	6	5469366	5469371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124076	NC_014323	CG	3	6	5469387	5469392	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124077	NC_014323	ATC	2	6	5469405	5469410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314045
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124079	NC_014323	CGC	2	6	5469430	5469435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314045
124080	NC_014323	TGC	2	6	5469439	5469444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124081	NC_014323	CGA	2	6	5469467	5469472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124082	NC_014323	TCC	2	6	5469475	5469480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300314045
124083	NC_014323	ACC	2	6	5469535	5469540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314045
124084	NC_014323	ACC	2	6	5469561	5469566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314045
124085	NC_014323	CGG	2	6	5469599	5469604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
124086	NC_014323	CTG	2	6	5469612	5469617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124087	NC_014323	GCT	2	6	5469623	5469628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124088	NC_014323	CCGG	2	8	5469698	5469705	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124089	NC_014323	TGC	2	6	5469808	5469813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124090	NC_014323	CG	3	6	5469823	5469828	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124091	NC_014323	GATC	2	8	5469872	5469879	25 %	25 %	25 %	25 %	300314045
124092	NC_014323	TC	3	6	5469887	5469892	0 %	50 %	0 %	50 %	300314045
124093	NC_014323	CG	3	6	5469898	5469903	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124094	NC_014323	CGA	2	6	5469910	5469915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124095	NC_014323	GC	4	8	5469925	5469932	0 %	0 %	50 %	50 %	300314045
124096	NC_014323	ACT	2	6	5469970	5469975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314045
124097	NC_014323	CGG	2	6	5469992	5469997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
124098	NC_014323	CGA	2	6	5470001	5470006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314045
124099	NC_014323	ACC	2	6	5470060	5470065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314045
124100	NC_014323	CCG	2	6	5470066	5470071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314045
124101	NC_014323	GTG	2	6	5470149	5470154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314045
124102	NC_014323	CAT	2	6	5470205	5470210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314045
124103	NC_014323	GGC	2	6	5470223	5470228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
124104	NC_014323	GCCA	2	8	5470242	5470249	25 %	0 %	25 %	50 %	300314045
124105	NC_014323	GGC	2	6	5470262	5470267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
124106	NC_014323	ACC	2	6	5470314	5470319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314046
124107	NC_014323	GCA	2	6	5470331	5470336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314046
124108	NC_014323	TGC	2	6	5470364	5470369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314046
124109	NC_014323	TCCC	2	8	5470379	5470386	0 %	25 %	0 %	75 %	300314046
124110	NC_014323	TGCGC	2	10	5470388	5470397	0 %	20 %	40 %	40 %	300314046
124111	NC_014323	GC	3	6	5470410	5470415	0 %	0 %	50 %	50 %	300314046
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124113	NC_014323	GGC	2	6	5470476	5470481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314046
124114	NC_014323	CGC	2	6	5470486	5470491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314046
124115	NC_014323	TGC	2	6	5470519	5470524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314046
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124342	NC_014323	CTG	2	6	5479937	5479942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314056
124343	NC_014323	GTA	2	6	5479958	5479963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314056
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124455	NC_014323	CGC	2	6	5484704	5484709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314059
124456	NC_014323	GCG	2	6	5484793	5484798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314059
124457	NC_014323	CT	3	6	5484804	5484809	0 %	50 %	0 %	50 %	300314059
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124462	NC_014323	GTG	2	6	5484957	5484962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314059
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124467	NC_014323	GGC	2	6	5485104	5485109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314059
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124478	NC_014323	TCG	2	6	5485808	5485813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314060
124479	NC_014323	GAC	2	6	5485857	5485862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314060
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124481	NC_014323	GTA	2	6	5485879	5485884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314060
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124483	NC_014323	CGGA	2	8	5485932	5485939	25 %	0 %	50 %	25 %	300314060
124484	NC_014323	CCTC	2	8	5485976	5485983	0 %	25 %	0 %	75 %	300314060
124485	NC_014323	CG	3	6	5486025	5486030	0 %	0 %	50 %	50 %	300314060
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124488	NC_014323	CAGCGA	2	12	5486128	5486139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314060
124489	NC_014323	GGA	2	6	5486149	5486154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300314060
124490	NC_014323	CGG	2	6	5486184	5486189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314060
124491	NC_014323	GC	3	6	5486209	5486214	0 %	0 %	50 %	50 %	300314060
124492	NC_014323	ATC	2	6	5486234	5486239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314060
124493	NC_014323	CAC	2	6	5486263	5486268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314060
124494	NC_014323	ATC	2	6	5486275	5486280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314060
124495	NC_014323	CGA	2	6	5486304	5486309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314060
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124498	NC_014323	GACC	2	8	5486466	5486473	25 %	0 %	25 %	50 %	300314060
124499	NC_014323	GC	3	6	5486482	5486487	0 %	0 %	50 %	50 %	300314060
124500	NC_014323	TTC	3	9	5486489	5486497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314060

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