MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123501	NC_014323	TCG	2	6	5444653	5444658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314024
123502	NC_014323	TGG	3	9	5444680	5444688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314024
123503	NC_014323	GTG	2	6	5444745	5444750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314024
123504	NC_014323	GGC	2	6	5444769	5444774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314024
123505	NC_014323	CCT	2	6	5444782	5444787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300314024
123506	NC_014323	CG	3	6	5444801	5444806	0 %	0 %	50 %	50 %	300314024
123507	NC_014323	GGC	3	9	5444820	5444828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314024
123508	NC_014323	CTT	2	6	5444858	5444863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314024
123509	NC_014323	CCG	2	6	5444864	5444869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314024
123510	NC_014323	CTG	2	6	5444871	5444876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314024
123511	NC_014323	GCGCT	2	10	5444997	5445006	0 %	20 %	40 %	40 %	300314025
123512	NC_014323	GCG	2	6	5445064	5445069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314025
123513	NC_014323	GGC	2	6	5445167	5445172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314025
123514	NC_014323	AGC	2	6	5445309	5445314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314025
123515	NC_014323	CCATT	2	10	5445357	5445366	20 %	40 %	0 %	40 %	300314025
123516	NC_014323	TG	3	6	5445414	5445419	0 %	50 %	50 %	0 %	300314025
123517	NC_014323	GCC	2	6	5445450	5445455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314025
123518	NC_014323	TGA	2	6	5445541	5445546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314025
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123520	NC_014323	CGC	2	6	5445777	5445782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314026
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123522	NC_014323	GC	3	6	5445853	5445858	0 %	0 %	50 %	50 %	300314026
123523	NC_014323	CGA	2	6	5445938	5445943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314026
123524	NC_014323	CTG	2	6	5445954	5445959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314026
123525	NC_014323	TGG	2	6	5445973	5445978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314026
123526	NC_014323	TGG	2	6	5446042	5446047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314026
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123534	NC_014323	CGG	2	6	5446846	5446851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314028
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123538	NC_014323	TCG	2	6	5446947	5446952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314028
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123542	NC_014323	GC	3	6	5447199	5447204	0 %	0 %	50 %	50 %	300314028
123543	NC_014323	CGG	2	6	5447236	5447241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314028
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123546	NC_014323	TCG	3	9	5447310	5447318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314028
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123548	NC_014323	TGC	2	6	5447350	5447355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314028
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123550	NC_014323	GAT	2	6	5447461	5447466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314028
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123552	NC_014323	CG	3	6	5447488	5447493	0 %	0 %	50 %	50 %	300314028
123553	NC_014323	CTG	2	6	5447516	5447521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314028
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123605	NC_014323	CCAG	2	8	5449281	5449288	25 %	0 %	25 %	50 %	300314030
123606	NC_014323	CAGG	2	8	5449321	5449328	25 %	0 %	50 %	25 %	300314030
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123614	NC_014323	GCA	2	6	5449451	5449456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314030
123615	NC_014323	CGA	2	6	5449464	5449469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314030
123616	NC_014323	TTC	2	6	5449478	5449483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314030
123617	NC_014323	TGA	2	6	5449551	5449556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314030
123618	NC_014323	GCAACA	2	12	5449569	5449580	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	300314030
123619	NC_014323	TCC	2	6	5449640	5449645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300314030
123620	NC_014323	GAT	2	6	5449825	5449830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314030
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123622	NC_014323	CGG	3	9	5449932	5449940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314030
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123624	NC_014323	GATT	2	8	5450014	5450021	25 %	50 %	25 %	0 %	300314030
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123626	NC_014323	GCC	2	6	5450162	5450167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314031
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123628	NC_014323	CGA	2	6	5450301	5450306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314031
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123630	NC_014323	CGA	2	6	5450412	5450417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314031
123631	NC_014323	TGC	2	6	5450447	5450452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314031
123632	NC_014323	ACC	2	6	5450492	5450497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314031
123633	NC_014323	TGCC	2	8	5450577	5450584	0 %	25 %	25 %	50 %	300314031
123634	NC_014323	AAT	2	6	5450586	5450591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300314031
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123665	NC_014323	GGC	2	6	5452006	5452011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314032
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123705	NC_014323	GC	4	8	5453692	5453699	0 %	0 %	50 %	50 %	300314033
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123716	NC_014323	ACT	2	6	5454385	5454390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314034
123717	NC_014323	CAG	2	6	5454396	5454401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314034
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123719	NC_014323	ATG	2	6	5454468	5454473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314034
123720	NC_014323	CGC	2	6	5454483	5454488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314034
123721	NC_014323	GC	3	6	5454522	5454527	0 %	0 %	50 %	50 %	300314034
123722	NC_014323	CTGG	2	8	5454542	5454549	0 %	25 %	50 %	25 %	300314034
123723	NC_014323	CGC	2	6	5454710	5454715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314035
123724	NC_014323	GCCGCT	2	12	5454719	5454730	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300314035
123725	NC_014323	CG	3	6	5454747	5454752	0 %	0 %	50 %	50 %	300314035
123726	NC_014323	GCG	3	9	5454771	5454779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314035
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123953	NC_014323	ACC	2	6	5464602	5464607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314042
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123955	NC_014323	GCA	2	6	5464663	5464668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314042
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