MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121501	NC_014323	TGG	2	6	5356608	5356613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
121502	NC_014323	TGC	2	6	5356686	5356691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
121503	NC_014323	GTG	2	6	5356706	5356711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
121504	NC_014323	GCG	2	6	5356712	5356717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313948
121505	NC_014323	CTG	3	9	5356721	5356729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
121506	NC_014323	ATC	2	6	5356745	5356750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313948
121507	NC_014323	CTG	2	6	5356775	5356780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
121508	NC_014323	GCC	2	6	5356787	5356792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313948
121509	NC_014323	TCT	2	6	5356806	5356811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313948
121510	NC_014323	GGC	2	6	5356858	5356863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313948
121511	NC_014323	GGT	2	6	5356873	5356878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
121512	NC_014323	TCAT	2	8	5356883	5356890	25 %	50 %	0 %	25 %	300313948
121513	NC_014323	CCAGCG	2	12	5356900	5356911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300313948
121514	NC_014323	ATG	2	6	5356916	5356921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313948
121515	NC_014323	CGACC	2	10	5356927	5356936	20 %	0 %	20 %	60 %	300313948
121516	NC_014323	CAT	2	6	5356963	5356968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313948
121517	NC_014323	CGGG	2	8	5356992	5356999	0 %	0 %	75 %	25 %	300313948
121518	NC_014323	GCTG	2	8	5357013	5357020	0 %	25 %	50 %	25 %	300313948
121519	NC_014323	ACC	2	6	5357060	5357065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313948
121520	NC_014323	TCT	2	6	5357073	5357078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313948
121521	NC_014323	GAA	2	6	5357090	5357095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313948
121522	NC_014323	TGC	2	6	5357118	5357123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
121523	NC_014323	CTG	3	9	5357135	5357143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
121524	NC_014323	CCT	2	6	5357194	5357199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313948
121525	NC_014323	TCT	2	6	5357220	5357225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313948
121526	NC_014323	GTG	2	6	5357273	5357278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
121527	NC_014323	GGC	2	6	5357306	5357311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313948
121528	NC_014323	GCTGGG	2	12	5357326	5357337	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300313948
121529	NC_014323	TGA	2	6	5357349	5357354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313948
121530	NC_014323	CG	3	6	5357574	5357579	0 %	0 %	50 %	50 %	300313949
121531	NC_014323	GCG	2	6	5357598	5357603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121532	NC_014323	GCG	2	6	5357613	5357618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121533	NC_014323	CTG	3	9	5357619	5357627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313949
121534	NC_014323	TGC	2	6	5357632	5357637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313949
121535	NC_014323	GGC	2	6	5357639	5357644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121536	NC_014323	CAC	2	6	5357651	5357656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313949
121537	NC_014323	GCC	2	6	5357668	5357673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313949
121538	NC_014323	GGC	2	6	5357676	5357681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121539	NC_014323	CTC	2	6	5357711	5357716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313949
121540	NC_014323	CGG	3	9	5357743	5357751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121541	NC_014323	GCG	2	6	5357761	5357766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121542	NC_014323	CTA	2	6	5357768	5357773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313949
121543	NC_014323	GAC	2	6	5357778	5357783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313949
121544	NC_014323	CTG	2	6	5357811	5357816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313949
121545	NC_014323	GCC	2	6	5357859	5357864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313949
121546	NC_014323	AGA	2	6	5357971	5357976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313949
121547	NC_014323	CGG	2	6	5358013	5358018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121548	NC_014323	CCT	2	6	5358040	5358045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313949
121549	NC_014323	TTCCA	2	10	5358111	5358120	20 %	40 %	0 %	40 %	300313949
121550	NC_014323	CAT	2	6	5358125	5358130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313949
121551	NC_014323	CCG	2	6	5358145	5358150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313949
121552	NC_014323	GCA	2	6	5358178	5358183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313949
121553	NC_014323	GAA	2	6	5358213	5358218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313949
121554	NC_014323	CGC	2	6	5358240	5358245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313949
121555	NC_014323	CCG	2	6	5358253	5358258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313949
121556	NC_014323	GGC	3	9	5358260	5358268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121557	NC_014323	CGATC	2	10	5358269	5358278	20 %	20 %	20 %	40 %	300313949
121558	NC_014323	GCC	2	6	5358353	5358358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313949
121559	NC_014323	GGC	2	6	5358371	5358376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121560	NC_014323	CCA	3	9	5358397	5358405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313949
121561	NC_014323	CGG	4	12	5358431	5358442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121562	NC_014323	CAT	2	6	5358443	5358448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313949
121563	NC_014323	CTA	2	6	5358515	5358520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313949
121564	NC_014323	CTG	2	6	5358576	5358581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313949
121565	NC_014323	TCG	2	6	5358598	5358603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313949
121566	NC_014323	CGG	2	6	5358670	5358675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313949
121567	NC_014323	GCC	2	6	5358684	5358689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313949
121568	NC_014323	CAGCG	2	10	5358702	5358711	20 %	0 %	40 %	40 %	300313949
121569	NC_014323	TCG	2	6	5358727	5358732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313949
121570	NC_014323	CGT	2	6	5358770	5358775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313950
121571	NC_014323	TCC	2	6	5358799	5358804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313950
121572	NC_014323	GC	3	6	5358806	5358811	0 %	0 %	50 %	50 %	300313950
121573	NC_014323	TTC	3	9	5358847	5358855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313950
121574	NC_014323	GCC	3	9	5358880	5358888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313950
121575	NC_014323	GCA	2	6	5358920	5358925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313950
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121577	NC_014323	GCCA	2	8	5359015	5359022	25 %	0 %	25 %	50 %	300313950
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121579	NC_014323	CG	3	6	5359079	5359084	0 %	0 %	50 %	50 %	300313950
121580	NC_014323	CAC	2	6	5359089	5359094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313950
121581	NC_014323	CGA	2	6	5359139	5359144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313950
121582	NC_014323	GCG	2	6	5359151	5359156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313950
121583	NC_014323	GCC	2	6	5359174	5359179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313950
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121585	NC_014323	CGC	2	6	5359332	5359337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313950
121586	NC_014323	GC	3	6	5359336	5359341	0 %	0 %	50 %	50 %	300313950
121587	NC_014323	ACC	2	6	5359351	5359356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313950
121588	NC_014323	CG	3	6	5359357	5359362	0 %	0 %	50 %	50 %	300313950
121589	NC_014323	GAT	2	6	5359434	5359439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313950
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121591	NC_014323	CGTT	2	8	5359456	5359463	0 %	50 %	25 %	25 %	300313950
121592	NC_014323	GTGG	2	8	5359470	5359477	0 %	25 %	75 %	0 %	300313950
121593	NC_014323	CAG	2	6	5359479	5359484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313950
121594	NC_014323	GA	3	6	5359492	5359497	50 %	0 %	50 %	0 %	300313950
121595	NC_014323	CAA	2	6	5359509	5359514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313950
121596	NC_014323	CTGG	2	8	5359515	5359522	0 %	25 %	50 %	25 %	300313950
121597	NC_014323	GGC	2	6	5359653	5359658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313950
121598	NC_014323	TGG	2	6	5359670	5359675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313950
121599	NC_014323	TGA	2	6	5359727	5359732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313951
121600	NC_014323	GC	3	6	5359739	5359744	0 %	0 %	50 %	50 %	300313951
121601	NC_014323	TGG	2	6	5359754	5359759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313951
121602	NC_014323	GCG	2	6	5359780	5359785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313951
121603	NC_014323	CAG	2	6	5359805	5359810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313951
121604	NC_014323	CTG	2	6	5359825	5359830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313951
121605	NC_014323	GGC	2	6	5359882	5359887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313951
121606	NC_014323	GCC	2	6	5359899	5359904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313951
121607	NC_014323	CTC	2	6	5359911	5359916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313951
121608	NC_014323	TGC	3	9	5359985	5359993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313951
121609	NC_014323	GCC	3	9	5360017	5360025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313951
121610	NC_014323	CTG	2	6	5360044	5360049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313951
121611	NC_014323	ACA	2	6	5360072	5360077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313951
121612	NC_014323	CAT	2	6	5360088	5360093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313951
121613	NC_014323	CGG	2	6	5360108	5360113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313951
121614	NC_014323	GC	3	6	5360124	5360129	0 %	0 %	50 %	50 %	300313951
121615	NC_014323	GC	3	6	5360146	5360151	0 %	0 %	50 %	50 %	300313951
121616	NC_014323	CGG	2	6	5360192	5360197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313951
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121620	NC_014323	GC	5	10	5360427	5360436	0 %	0 %	50 %	50 %	300313951
121621	NC_014323	GCT	2	6	5360544	5360549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313951
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121625	NC_014323	GCA	2	6	5360850	5360855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313951
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121719	NC_014323	GCCG	2	8	5364841	5364848	0 %	0 %	50 %	50 %	300313957
121720	NC_014323	GCC	2	6	5365105	5365110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313958
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121724	NC_014323	CGGC	2	8	5365214	5365221	0 %	0 %	50 %	50 %	300313958
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121945	NC_014323	ATC	2	6	5374034	5374039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313965
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121951	NC_014323	TGATGC	2	12	5374402	5374413	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300313966
121952	NC_014323	GTC	2	6	5374440	5374445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313966
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