MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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121002	NC_014323	CTT	2	6	5337582	5337587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313932
121003	NC_014323	CTG	2	6	5337589	5337594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313932
121004	NC_014323	CTGGGC	2	12	5337625	5337636	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300313932
121005	NC_014323	TGG	2	6	5337640	5337645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313932
121006	NC_014323	TGG	3	9	5337665	5337673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313932
121007	NC_014323	TGC	2	6	5337704	5337709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313932
121008	NC_014323	CAT	2	6	5337730	5337735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313932
121009	NC_014323	CAA	2	6	5337810	5337815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313932
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121011	NC_014323	CTG	2	6	5337832	5337837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313932
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121013	NC_014323	GGC	2	6	5337856	5337861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313932
121014	NC_014323	CCG	2	6	5337902	5337907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313932
121015	NC_014323	GCT	3	9	5337915	5337923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313932
121016	NC_014323	GTG	2	6	5337924	5337929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313932
121017	NC_014323	GC	3	6	5337963	5337968	0 %	0 %	50 %	50 %	300313932
121018	NC_014323	GCT	2	6	5337996	5338001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313932
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121023	NC_014323	CGG	2	6	5338185	5338190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313932
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121026	NC_014323	TGA	2	6	5338250	5338255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313932
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121041	NC_014323	TGG	2	6	5338633	5338638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313933
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121049	NC_014323	GCT	2	6	5338976	5338981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313933
121050	NC_014323	GGC	2	6	5338988	5338993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313933
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121053	NC_014323	TGA	2	6	5339104	5339109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313933
121054	NC_014323	CGG	2	6	5339117	5339122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313933
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121058	NC_014323	TGC	2	6	5339212	5339217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313933
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121097	NC_014323	AGC	2	6	5340527	5340532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313935
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121103	NC_014323	TCG	2	6	5340728	5340733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313935
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121109	NC_014323	GC	4	8	5341159	5341166	0 %	0 %	50 %	50 %	300313936
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121113	NC_014323	TGA	2	6	5341247	5341252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313936
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121222	NC_014323	TGC	2	6	5345647	5345652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313939
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121342	NC_014323	GC	3	6	5350479	5350484	0 %	0 %	50 %	50 %	300313942
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121442	NC_014323	GTG	2	6	5354438	5354443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313947
121443	NC_014323	GC	3	6	5354447	5354452	0 %	0 %	50 %	50 %	300313947
121444	NC_014323	TGG	2	6	5354535	5354540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313947
121445	NC_014323	CG	3	6	5354550	5354555	0 %	0 %	50 %	50 %	300313947
121446	NC_014323	CCG	3	9	5354557	5354565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313947
121447	NC_014323	CCG	2	6	5354569	5354574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313947
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121450	NC_014323	CAGC	2	8	5354758	5354765	25 %	0 %	25 %	50 %	300313947
121451	NC_014323	CGA	3	9	5354791	5354799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313947
121452	NC_014323	AAGG	2	8	5354831	5354838	50 %	0 %	50 %	0 %	300313947
121453	NC_014323	CAC	2	6	5354872	5354877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313947
121454	NC_014323	GC	3	6	5354911	5354916	0 %	0 %	50 %	50 %	300313947
121455	NC_014323	CATCGA	2	12	5354971	5354982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300313947
121456	NC_014323	GGT	2	6	5354992	5354997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313947
121457	NC_014323	GAA	2	6	5354999	5355004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313947
121458	NC_014323	GC	3	6	5355024	5355029	0 %	0 %	50 %	50 %	300313947
121459	NC_014323	CCT	2	6	5355081	5355086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313947
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121462	NC_014323	GCT	2	6	5355160	5355165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313947
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121473	NC_014323	CAA	2	6	5355637	5355642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313947
121474	NC_014323	GTG	2	6	5355647	5355652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313947
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121483	NC_014323	AAG	2	6	5355899	5355904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313947
121484	NC_014323	CATTGC	2	12	5355967	5355978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300313947
121485	NC_014323	GGT	2	6	5355982	5355987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313947
121486	NC_014323	GCCGC	2	10	5356016	5356025	0 %	0 %	40 %	60 %	300313947
121487	NC_014323	ACT	2	6	5356044	5356049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313947
121488	NC_014323	CGCC	2	8	5356092	5356099	0 %	0 %	25 %	75 %	300313947
121489	NC_014323	CCG	2	6	5356110	5356115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313947
121490	NC_014323	ATC	2	6	5356310	5356315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313948
121491	NC_014323	GC	3	6	5356341	5356346	0 %	0 %	50 %	50 %	300313948
121492	NC_014323	CGGC	2	8	5356398	5356405	0 %	0 %	50 %	50 %	300313948
121493	NC_014323	CCGG	2	8	5356416	5356423	0 %	0 %	50 %	50 %	300313948
121494	NC_014323	TGG	2	6	5356449	5356454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
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121497	NC_014323	GCT	3	9	5356495	5356503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
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