MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014323	GGC	3	9	500165	500173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309798
11502	NC_014323	TTC	2	6	500180	500185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309798
11503	NC_014323	CGC	2	6	500222	500227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309798
11504	NC_014323	CGG	3	9	500302	500310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309798
11505	NC_014323	GCCC	2	8	500322	500329	0 %	0 %	25 %	75 %	300309798
11506	NC_014323	TGC	2	6	500362	500367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309798
11507	NC_014323	TGC	2	6	500392	500397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309798
11508	NC_014323	GTG	2	6	500436	500441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309798
11509	NC_014323	CCT	2	6	500449	500454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309798
11510	NC_014323	GCG	2	6	500455	500460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309798
11511	NC_014323	GCC	2	6	500532	500537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309798
11512	NC_014323	GC	3	6	500540	500545	0 %	0 %	50 %	50 %	300309798
11513	NC_014323	GCGG	2	8	500548	500555	0 %	0 %	75 %	25 %	300309798
11514	NC_014323	GCG	3	9	500717	500725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309799
11515	NC_014323	GGCCCA	2	12	500764	500775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300309799
11516	NC_014323	GCT	2	6	500788	500793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309799
11517	NC_014323	CGG	2	6	500821	500826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309799
11518	NC_014323	GGC	2	6	500891	500896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309799
11519	NC_014323	CAA	2	6	500905	500910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309799
11520	NC_014323	TGA	2	6	500967	500972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309799
11521	NC_014323	CTTC	2	8	501012	501019	0 %	50 %	0 %	50 %	300309799
11522	NC_014323	GAT	2	6	501037	501042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309799
11523	NC_014323	GAA	2	6	501076	501081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309799
11524	NC_014323	TGG	2	6	501093	501098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309799
11525	NC_014323	TGG	2	6	501119	501124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309799
11526	NC_014323	CTTT	2	8	501192	501199	0 %	75 %	0 %	25 %	300309799
11527	NC_014323	GCA	2	6	501217	501222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309799
11528	NC_014323	TCCT	2	8	501229	501236	0 %	50 %	0 %	50 %	300309799
11529	NC_014323	TTC	2	6	501278	501283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309799
11530	NC_014323	CAC	2	6	501316	501321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309799
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11532	NC_014323	TCA	2	6	501438	501443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309799
11533	NC_014323	ACA	2	6	501450	501455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309799
11534	NC_014323	TGA	2	6	501466	501471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309799
11535	NC_014323	GGT	2	6	501511	501516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309799
11536	NC_014323	CGG	2	6	501520	501525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309799
11537	NC_014323	CGA	2	6	501559	501564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309799
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11539	NC_014323	ACC	2	6	501641	501646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309799
11540	NC_014323	CG	3	6	501778	501783	0 %	0 %	50 %	50 %	300309800
11541	NC_014323	CGC	2	6	501833	501838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309800
11542	NC_014323	CG	3	6	501870	501875	0 %	0 %	50 %	50 %	300309800
11543	NC_014323	TCT	2	6	501885	501890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309800
11544	NC_014323	GCG	2	6	501946	501951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309800
11545	NC_014323	CTT	2	6	501952	501957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309800
11546	NC_014323	GC	3	6	502032	502037	0 %	0 %	50 %	50 %	300309800
11547	NC_014323	GCCG	2	8	502057	502064	0 %	0 %	50 %	50 %	300309800
11548	NC_014323	GAAG	2	8	502069	502076	50 %	0 %	50 %	0 %	300309800
11549	NC_014323	ATC	2	6	502107	502112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309800
11550	NC_014323	TGC	2	6	502119	502124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309800
11551	NC_014323	CTG	2	6	502130	502135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309800
11552	NC_014323	CG	3	6	502211	502216	0 %	0 %	50 %	50 %	300309800
11553	NC_014323	CTG	2	6	502229	502234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309800
11554	NC_014323	GGA	2	6	502264	502269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309800
11555	NC_014323	TTC	2	6	502271	502276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309800
11556	NC_014323	TGC	2	6	502314	502319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309800
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11558	NC_014323	CGG	2	6	502417	502422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309800
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11560	NC_014323	CTG	2	6	502502	502507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309800
11561	NC_014323	TTC	2	6	502589	502594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309800
11562	NC_014323	GCC	2	6	502610	502615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309800
11563	NC_014323	GTG	2	6	502616	502621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309800
11564	NC_014323	GCCT	2	8	502622	502629	0 %	25 %	25 %	50 %	300309800
11565	NC_014323	TTG	2	6	502636	502641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309800
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11601	NC_014323	CGC	2	6	504316	504321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309802
11602	NC_014323	TGC	2	6	504360	504365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309802
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11604	NC_014323	CGG	2	6	504379	504384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309802
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11606	NC_014323	CG	3	6	504410	504415	0 %	0 %	50 %	50 %	300309802
11607	NC_014323	CTG	3	9	504434	504442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309802
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11611	NC_014323	GC	3	6	504599	504604	0 %	0 %	50 %	50 %	300309802
11612	NC_014323	CGGG	2	8	504607	504614	0 %	0 %	75 %	25 %	300309802
11613	NC_014323	TGA	2	6	504652	504657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309802
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11619	NC_014323	GGC	2	6	504908	504913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309803
11620	NC_014323	GCT	2	6	504938	504943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309803
11621	NC_014323	GGT	2	6	504983	504988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309803
11622	NC_014323	TTCGTG	2	12	505008	505019	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	300309803
11623	NC_014323	ATC	2	6	505059	505064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309803
11624	NC_014323	TCG	2	6	505081	505086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309803
11625	NC_014323	ATC	3	9	505101	505109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309803
11626	NC_014323	CGG	2	6	505126	505131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309803
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11630	NC_014323	CGG	2	6	505301	505306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309803
11631	NC_014323	CGG	2	6	505370	505375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309803
11632	NC_014323	TGC	2	6	505450	505455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309803
11633	NC_014323	CTG	2	6	505476	505481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309803
11634	NC_014323	TGA	2	6	505489	505494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309803
11635	NC_014323	CG	3	6	505504	505509	0 %	0 %	50 %	50 %	300309803
11636	NC_014323	ATG	3	9	505544	505552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309803
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11640	NC_014323	GCC	2	6	505681	505686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309804
11641	NC_014323	GCCA	2	8	505729	505736	25 %	0 %	25 %	50 %	300309804
11642	NC_014323	CAT	2	6	505768	505773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309804
11643	NC_014323	GCT	2	6	505788	505793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309804
11644	NC_014323	CTGG	2	8	505833	505840	0 %	25 %	50 %	25 %	300309804
11645	NC_014323	CTATCG	2	12	505851	505862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300309804
11646	NC_014323	GCG	2	6	505894	505899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309804
11647	NC_014323	TGG	2	6	505910	505915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309804
11648	NC_014323	CTA	2	6	505962	505967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309804
11649	NC_014323	GAG	2	6	506005	506010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309804
11650	NC_014323	CAG	2	6	506014	506019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309804
11651	NC_014323	GC	3	6	506090	506095	0 %	0 %	50 %	50 %	300309804
11652	NC_014323	GCG	2	6	506178	506183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309804
11653	NC_014323	GGT	2	6	506184	506189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309804
11654	NC_014323	CGA	2	6	506226	506231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309804
11655	NC_014323	CG	3	6	506253	506258	0 %	0 %	50 %	50 %	300309804
11656	NC_014323	GC	3	6	506315	506320	0 %	0 %	50 %	50 %	300309804
11657	NC_014323	CATG	2	8	506325	506332	25 %	25 %	25 %	25 %	300309804
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11659	NC_014323	GCT	2	6	506427	506432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309804
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11672	NC_014323	CGG	2	6	506886	506891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309804
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11674	NC_014323	GTG	2	6	506899	506904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309804
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11682	NC_014323	CGG	2	6	507502	507507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309805
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11742	NC_014323	GC	3	6	509343	509348	0 %	0 %	50 %	50 %	300309808
11743	NC_014323	TGC	2	6	509366	509371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309808
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11844	NC_014323	GGC	2	6	514224	514229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309813
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11853	NC_014323	CGT	2	6	514808	514813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309814
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11977	NC_014323	CTC	2	6	526650	526655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309818
11978	NC_014323	CGG	2	6	526667	526672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309818
11979	NC_014323	GTT	2	6	526686	526691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309818
11980	NC_014323	GCC	2	6	526699	526704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309818
11981	NC_014323	GCT	2	6	526712	526717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309818
11982	NC_014323	GAA	2	6	526734	526739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309818
11983	NC_014323	AGC	2	6	526847	526852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309818
11984	NC_014323	C	6	6	526852	526857	0 %	0 %	0 %	100 %	300309818
11985	NC_014323	GCA	2	6	526892	526897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309818
11986	NC_014323	GGCGA	2	10	526898	526907	20 %	0 %	60 %	20 %	300309818
11987	NC_014323	CGCT	2	8	526986	526993	0 %	25 %	25 %	50 %	300309819
11988	NC_014323	GAA	2	6	527021	527026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309819
11989	NC_014323	GCC	2	6	527069	527074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309819
11990	NC_014323	GC	3	6	527094	527099	0 %	0 %	50 %	50 %	300309819
11991	NC_014323	TGGC	2	8	527100	527107	0 %	25 %	50 %	25 %	300309819
11992	NC_014323	GCA	2	6	527137	527142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309819
11993	NC_014323	ATG	2	6	527169	527174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309819
11994	NC_014323	GAT	2	6	527258	527263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309819
11995	NC_014323	CAC	2	6	527291	527296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309819
11996	NC_014323	GC	3	6	527337	527342	0 %	0 %	50 %	50 %	300309819
11997	NC_014323	CAC	2	6	527381	527386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309819
11998	NC_014323	CAGC	2	8	527428	527435	25 %	0 %	25 %	50 %	300309819
11999	NC_014323	TTC	2	6	527498	527503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309819
12000	NC_014323	CGG	2	6	527537	527542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309819

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