MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
118501	NC_014323	GC	3	6	5233288	5233293	0 %	0 %	50 %	50 %	300313844
118502	NC_014323	GGC	2	6	5233364	5233369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313844
118503	NC_014323	GTC	2	6	5233398	5233403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313844
118504	NC_014323	GTG	2	6	5233429	5233434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313844
118505	NC_014323	CGT	2	6	5233445	5233450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313844
118506	NC_014323	CGT	2	6	5233897	5233902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313845
118507	NC_014323	GCA	2	6	5233995	5234000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313845
118508	NC_014323	TTC	2	6	5234014	5234019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313845
118509	NC_014323	GCC	2	6	5234047	5234052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313845
118510	NC_014323	CCG	2	6	5234069	5234074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313845
118511	NC_014323	GC	3	6	5234090	5234095	0 %	0 %	50 %	50 %	300313845
118512	NC_014323	CAG	2	6	5234125	5234130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313845
118513	NC_014323	CAG	2	6	5234161	5234166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313845
118514	NC_014323	CAG	2	6	5234257	5234262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313845
118515	NC_014323	CAGC	2	8	5234265	5234272	25 %	0 %	25 %	50 %	300313845
118516	NC_014323	AGC	2	6	5234294	5234299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313845
118517	NC_014323	CAAGGA	2	12	5234307	5234318	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	300313845
118518	NC_014323	CGCTG	2	10	5234358	5234367	0 %	20 %	40 %	40 %	300313845
118519	NC_014323	TTC	2	6	5234395	5234400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313845
118520	NC_014323	CGG	2	6	5234451	5234456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313845
118521	NC_014323	CAA	2	6	5234457	5234462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313845
118522	NC_014323	CGGTC	2	10	5234553	5234562	0 %	20 %	40 %	40 %	300313845
118523	NC_014323	ACG	3	9	5234654	5234662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313846
118524	NC_014323	GTC	2	6	5234668	5234673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313846
118525	NC_014323	TCG	2	6	5234675	5234680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313846
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118527	NC_014323	GC	3	6	5234739	5234744	0 %	0 %	50 %	50 %	300313846
118528	NC_014323	GCCG	2	8	5234793	5234800	0 %	0 %	50 %	50 %	300313846
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118531	NC_014323	CGC	2	6	5234850	5234855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313846
118532	NC_014323	ACA	2	6	5234870	5234875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313846
118533	NC_014323	GGC	2	6	5234935	5234940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313846
118534	NC_014323	CTCAAG	2	12	5234989	5235000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300313846
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118538	NC_014323	ACA	3	9	5235227	5235235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313846
118539	NC_014323	GC	3	6	5235253	5235258	0 %	0 %	50 %	50 %	300313846
118540	NC_014323	GC	3	6	5235326	5235331	0 %	0 %	50 %	50 %	300313846
118541	NC_014323	ACT	2	6	5235347	5235352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313846
118542	NC_014323	GCA	2	6	5235362	5235367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313846
118543	NC_014323	ACT	2	6	5235383	5235388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313846
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118547	NC_014323	CG	4	8	5235501	5235508	0 %	0 %	50 %	50 %	300313846
118548	NC_014323	AGG	2	6	5235536	5235541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313846
118549	NC_014323	TGC	2	6	5235602	5235607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313846
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118551	NC_014323	CGA	2	6	5235783	5235788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313846
118552	NC_014323	CGG	2	6	5235810	5235815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313846
118553	NC_014323	GCC	2	6	5235867	5235872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313846
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118555	NC_014323	CAC	3	9	5235948	5235956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313846
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118557	NC_014323	CCAC	2	8	5236181	5236188	25 %	0 %	0 %	75 %	300313846
118558	NC_014323	CGC	2	6	5236217	5236222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313846
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118610	NC_014323	AT	3	6	5238676	5238681	50 %	50 %	0 %	0 %	300313849
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118842	NC_014323	GCG	2	6	5248550	5248555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313858
118843	NC_014323	GGC	2	6	5248585	5248590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313858
118844	NC_014323	TGGTC	2	10	5248612	5248621	0 %	40 %	40 %	20 %	300313858
118845	NC_014323	GCG	2	6	5248630	5248635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313858
118846	NC_014323	GC	3	6	5248703	5248708	0 %	0 %	50 %	50 %	300313858
118847	NC_014323	GCC	2	6	5248751	5248756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313858
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118943	NC_014323	GC	3	6	5252343	5252348	0 %	0 %	50 %	50 %	300313861
118944	NC_014323	CAGTTG	2	12	5252393	5252404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300313861
118945	NC_014323	CTGAG	2	10	5252419	5252428	20 %	20 %	40 %	20 %	300313861
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118952	NC_014323	ATG	2	6	5253138	5253143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313862
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118954	NC_014323	GC	3	6	5253431	5253436	0 %	0 %	50 %	50 %	300313863
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