MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
118001	NC_014323	CCAG	2	8	5211492	5211499	25 %	0 %	25 %	50 %	300313829
118002	NC_014323	TCA	2	6	5211615	5211620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313829
118003	NC_014323	GC	3	6	5211709	5211714	0 %	0 %	50 %	50 %	300313829
118004	NC_014323	GCT	2	6	5211814	5211819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313829
118005	NC_014323	TGA	2	6	5211828	5211833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313829
118006	NC_014323	C	6	6	5211845	5211850	0 %	0 %	0 %	100 %	300313829
118007	NC_014323	GCT	2	6	5211861	5211866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313829
118008	NC_014323	ATC	2	6	5211869	5211874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313829
118009	NC_014323	GGC	2	6	5211890	5211895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313829
118010	NC_014323	GGC	2	6	5211922	5211927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313829
118011	NC_014323	TGC	2	6	5211941	5211946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313829
118012	NC_014323	GCG	2	6	5211947	5211952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313829
118013	NC_014323	TGC	2	6	5211975	5211980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313829
118014	NC_014323	GCC	2	6	5212003	5212008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313829
118015	NC_014323	ATC	2	6	5212037	5212042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313829
118016	NC_014323	ACC	2	6	5212043	5212048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313829
118017	NC_014323	CAG	2	6	5212060	5212065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313829
118018	NC_014323	GCA	2	6	5212074	5212079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313829
118019	NC_014323	GGC	2	6	5212157	5212162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313830
118020	NC_014323	CACG	2	8	5212201	5212208	25 %	0 %	25 %	50 %	300313830
118021	NC_014323	AGGCGC	2	12	5212245	5212256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300313830
118022	NC_014323	AGCG	2	8	5212278	5212285	25 %	0 %	50 %	25 %	300313830
118023	NC_014323	TTC	2	6	5212316	5212321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313830
118024	NC_014323	CGA	2	6	5212360	5212365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313830
118025	NC_014323	CAG	2	6	5212373	5212378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313830
118026	NC_014323	CCA	2	6	5212423	5212428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313830
118027	NC_014323	CGAG	2	8	5212447	5212454	25 %	0 %	50 %	25 %	300313830
118028	NC_014323	GTA	2	6	5212469	5212474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313830
118029	NC_014323	GCG	2	6	5212482	5212487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313830
118030	NC_014323	CTG	2	6	5212488	5212493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313830
118031	NC_014323	CGATGC	2	12	5212495	5212506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300313830
118032	NC_014323	GC	3	6	5212526	5212531	0 %	0 %	50 %	50 %	300313830
118033	NC_014323	CAG	2	6	5212532	5212537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313830
118034	NC_014323	CG	3	6	5212540	5212545	0 %	0 %	50 %	50 %	300313830
118035	NC_014323	CGGT	2	8	5212599	5212606	0 %	25 %	50 %	25 %	300313830
118036	NC_014323	ATG	2	6	5212629	5212634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313830
118037	NC_014323	CCGT	2	8	5212680	5212687	0 %	25 %	25 %	50 %	300313830
118038	NC_014323	GCA	2	6	5212693	5212698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313830
118039	NC_014323	CGT	2	6	5212765	5212770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313830
118040	NC_014323	TCT	2	6	5212828	5212833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313830
118041	NC_014323	TCG	2	6	5212839	5212844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313830
118042	NC_014323	ATTGCG	2	12	5212898	5212909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300313831
118043	NC_014323	TGC	2	6	5212963	5212968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313831
118044	NC_014323	GAA	2	6	5212976	5212981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313831
118045	NC_014323	TGG	2	6	5213011	5213016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313831
118046	NC_014323	GTC	2	6	5213018	5213023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313831
118047	NC_014323	CG	3	6	5213092	5213097	0 %	0 %	50 %	50 %	300313831
118048	NC_014323	GC	3	6	5213124	5213129	0 %	0 %	50 %	50 %	300313831
118049	NC_014323	CGGC	2	8	5213173	5213180	0 %	0 %	50 %	50 %	300313831
118050	NC_014323	GGT	2	6	5213266	5213271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313831
118051	NC_014323	CTG	2	6	5213306	5213311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313831
118052	NC_014323	ATG	2	6	5213361	5213366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313831
118053	NC_014323	CGC	2	6	5213380	5213385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313831
118054	NC_014323	TGC	2	6	5213392	5213397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313831
118055	NC_014323	GC	3	6	5213396	5213401	0 %	0 %	50 %	50 %	300313831
118056	NC_014323	GC	3	6	5213454	5213459	0 %	0 %	50 %	50 %	300313831
118057	NC_014323	GCA	2	6	5213476	5213481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313831
118058	NC_014323	GC	3	6	5213483	5213488	0 %	0 %	50 %	50 %	300313831
118059	NC_014323	GGC	2	6	5213498	5213503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313831
118060	NC_014323	CGC	2	6	5213620	5213625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313831
118061	NC_014323	CTT	2	6	5213636	5213641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313831
118062	NC_014323	GGGC	2	8	5213672	5213679	0 %	0 %	75 %	25 %	300313831
118063	NC_014323	GTA	2	6	5213711	5213716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313831
118064	NC_014323	GGC	2	6	5213747	5213752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313831
118065	NC_014323	TTG	2	6	5213769	5213774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313831
118066	NC_014323	AGC	2	6	5213775	5213780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313831
118067	NC_014323	TCCAGC	2	12	5213835	5213846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300313831
118068	NC_014323	GCC	2	6	5213960	5213965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313831
118069	NC_014323	CCA	2	6	5214053	5214058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313831
118070	NC_014323	GCA	2	6	5214061	5214066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313831
118071	NC_014323	CGG	2	6	5214092	5214097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313831
118072	NC_014323	CTGCGC	2	12	5214116	5214127	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300313831
118073	NC_014323	GC	3	6	5214154	5214159	0 %	0 %	50 %	50 %	300313831
118074	NC_014323	CCG	2	6	5214169	5214174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313831
118075	NC_014323	CGGGC	2	10	5214186	5214195	0 %	0 %	60 %	40 %	300313831
118076	NC_014323	GTGC	2	8	5214198	5214205	0 %	25 %	50 %	25 %	300313831
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118079	NC_014323	CTGCC	2	10	5214697	5214706	0 %	20 %	20 %	60 %	300313832
118080	NC_014323	CTGC	2	8	5214711	5214718	0 %	25 %	25 %	50 %	300313832
118081	NC_014323	CTG	2	6	5214735	5214740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313832
118082	NC_014323	GCC	2	6	5214741	5214746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313832
118083	NC_014323	GCCCTG	2	12	5214750	5214761	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300313832
118084	NC_014323	GCC	2	6	5214777	5214782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313832
118085	NC_014323	CCAG	2	8	5214787	5214794	25 %	0 %	25 %	50 %	300313832
118086	NC_014323	AAG	2	6	5214847	5214852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313832
118087	NC_014323	GCA	2	6	5214874	5214879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313832
118088	NC_014323	CG	3	6	5214941	5214946	0 %	0 %	50 %	50 %	300313832
118089	NC_014323	CGG	2	6	5214953	5214958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313832
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118091	NC_014323	TGG	2	6	5214973	5214978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313832
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118097	NC_014323	GCC	2	6	5215080	5215085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313832
118098	NC_014323	CGA	2	6	5215094	5215099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313832
118099	NC_014323	TTC	2	6	5215146	5215151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313832
118100	NC_014323	ACA	2	6	5215153	5215158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313832
118101	NC_014323	GCC	2	6	5215187	5215192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313832
118102	NC_014323	TTC	2	6	5215209	5215214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313832
118103	NC_014323	GCT	2	6	5215217	5215222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313832
118104	NC_014323	CCG	2	6	5215270	5215275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313832
118105	NC_014323	ACT	2	6	5215321	5215326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313832
118106	NC_014323	GAA	2	6	5215335	5215340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313832
118107	NC_014323	GGCT	2	8	5215508	5215515	0 %	25 %	50 %	25 %	300313832
118108	NC_014323	GCC	2	6	5215554	5215559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313832
118109	NC_014323	CGC	2	6	5215564	5215569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313832
118110	NC_014323	CAA	2	6	5215631	5215636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313832
118111	NC_014323	CCTGG	2	10	5215670	5215679	0 %	20 %	40 %	40 %	300313832
118112	NC_014323	CAA	2	6	5215712	5215717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313832
118113	NC_014323	TCT	2	6	5215729	5215734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313832
118114	NC_014323	GAT	2	6	5215781	5215786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313832
118115	NC_014323	CCA	2	6	5215810	5215815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313832
118116	NC_014323	GCG	2	6	5215920	5215925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313832
118117	NC_014323	GCA	2	6	5215964	5215969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313832
118118	NC_014323	TGC	2	6	5216191	5216196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313833
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118120	NC_014323	CCCTGC	2	12	5216233	5216244	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	300313833
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118127	NC_014323	GGT	2	6	5216510	5216515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313833
118128	NC_014323	ATC	2	6	5216517	5216522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313833
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118133	NC_014323	ATG	2	6	5216685	5216690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313833
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118228	NC_014323	GCA	2	6	5220135	5220140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313837
118229	NC_014323	GCG	2	6	5220184	5220189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313837
118230	NC_014323	CGA	2	6	5220205	5220210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313837
118231	NC_014323	GGC	3	9	5220254	5220262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313837
118232	NC_014323	GGC	2	6	5220281	5220286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313837
118233	NC_014323	GC	3	6	5220305	5220310	0 %	0 %	50 %	50 %	300313837
118234	NC_014323	CGGCA	2	10	5220320	5220329	20 %	0 %	40 %	40 %	300313837
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118343	NC_014323	CGG	2	6	5224875	5224880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313840
118344	NC_014323	GCGA	2	8	5224904	5224911	25 %	0 %	50 %	25 %	300313840
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118353	NC_014323	CGC	2	6	5225137	5225142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313840
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118424	NC_014323	T	6	6	5229597	5229602	0 %	100 %	0 %	0 %	300313842
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118442	NC_014323	GCTTC	2	10	5230644	5230653	0 %	40 %	20 %	40 %	300313843
118443	NC_014323	CAG	2	6	5230662	5230667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313843
118444	NC_014323	TCT	2	6	5230715	5230720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313843
118445	NC_014323	CT	3	6	5230730	5230735	0 %	50 %	0 %	50 %	300313843
118446	NC_014323	AG	3	6	5230748	5230753	50 %	0 %	50 %	0 %	300313843
118447	NC_014323	TGG	2	6	5230811	5230816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313843
118448	NC_014323	ATC	2	6	5230817	5230822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313843
118449	NC_014323	ATG	2	6	5230841	5230846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313843
118450	NC_014323	CTT	2	6	5230875	5230880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313843
118451	NC_014323	TCTT	2	8	5230886	5230893	0 %	75 %	0 %	25 %	300313843
118452	NC_014323	TGA	2	6	5230896	5230901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313843
118453	NC_014323	ACG	2	6	5230916	5230921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313843
118454	NC_014323	GAT	2	6	5230948	5230953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313843
118455	NC_014323	GGCG	2	8	5231037	5231044	0 %	0 %	75 %	25 %	300313843
118456	NC_014323	TGA	2	6	5231058	5231063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313843
118457	NC_014323	CCT	2	6	5231067	5231072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313843
118458	NC_014323	T	6	6	5231097	5231102	0 %	100 %	0 %	0 %	300313843
118459	NC_014323	AGC	2	6	5231105	5231110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313843
118460	NC_014323	GC	3	6	5231109	5231114	0 %	0 %	50 %	50 %	300313843
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118485	NC_014323	TGA	2	6	5232273	5232278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313843
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118499	NC_014323	GCCC	2	8	5233210	5233217	0 %	0 %	25 %	75 %	300313844
118500	NC_014323	GAT	2	6	5233232	5233237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313844

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