MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
117001	NC_014323	GCA	3	9	5170487	5170495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313792
117002	NC_014323	CAT	2	6	5170517	5170522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313792
117003	NC_014323	GGC	2	6	5170542	5170547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313792
117004	NC_014323	GGC	3	9	5170566	5170574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313792
117005	NC_014323	GCG	2	6	5170603	5170608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313792
117006	NC_014323	CCG	2	6	5170907	5170912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313793
117007	NC_014323	CCA	4	12	5170925	5170936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313793
117008	NC_014323	CTG	3	9	5170939	5170947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313793
117009	NC_014323	GGC	2	6	5170948	5170953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313793
117010	NC_014323	CGCCC	2	10	5170977	5170986	0 %	0 %	20 %	80 %	300313793
117011	NC_014323	GGT	2	6	5171061	5171066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313793
117012	NC_014323	GATCCA	2	12	5171082	5171093	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300313793
117013	NC_014323	GGC	2	6	5171155	5171160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313793
117014	NC_014323	CTG	2	6	5171176	5171181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313793
117015	NC_014323	GGC	2	6	5171224	5171229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313793
117016	NC_014323	GGT	2	6	5171289	5171294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313793
117017	NC_014323	GCG	2	6	5171353	5171358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313793
117018	NC_014323	GCGCAC	2	12	5171391	5171402	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300313793
117019	NC_014323	CGCTG	2	10	5171467	5171476	0 %	20 %	40 %	40 %	300313794
117020	NC_014323	GTA	2	6	5171483	5171488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313794
117021	NC_014323	CGT	2	6	5171501	5171506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117022	NC_014323	GCC	3	9	5171630	5171638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313794
117023	NC_014323	TGG	2	6	5171647	5171652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313794
117024	NC_014323	GC	3	6	5171663	5171668	0 %	0 %	50 %	50 %	300313794
117025	NC_014323	CCCAGC	2	12	5171670	5171681	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300313794
117026	NC_014323	C	6	6	5171707	5171712	0 %	0 %	0 %	100 %	300313794
117027	NC_014323	GCT	2	6	5171771	5171776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117028	NC_014323	GC	3	6	5171790	5171795	0 %	0 %	50 %	50 %	300313794
117029	NC_014323	GGC	2	6	5171810	5171815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313794
117030	NC_014323	GCC	2	6	5171829	5171834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313794
117031	NC_014323	TTCCAG	2	12	5171852	5171863	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300313794
117032	NC_014323	CGT	2	6	5171908	5171913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117033	NC_014323	GCG	2	6	5171949	5171954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313794
117034	NC_014323	GGC	2	6	5171976	5171981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313794
117035	NC_014323	TGGT	2	8	5172033	5172040	0 %	50 %	50 %	0 %	300313794
117036	NC_014323	CCGTGG	2	12	5172052	5172063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300313794
117037	NC_014323	CG	3	6	5172128	5172133	0 %	0 %	50 %	50 %	300313794
117038	NC_014323	TGC	2	6	5172154	5172159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117039	NC_014323	CTG	2	6	5172195	5172200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117040	NC_014323	GGC	2	6	5172211	5172216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313794
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117042	NC_014323	GCG	2	6	5172348	5172353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313794
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117047	NC_014323	CG	3	6	5172630	5172635	0 %	0 %	50 %	50 %	300313794
117048	NC_014323	TCG	2	6	5172657	5172662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117049	NC_014323	TCCTGG	2	12	5172693	5172704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117050	NC_014323	TGG	2	6	5172751	5172756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313794
117051	NC_014323	CGGGTA	2	12	5172795	5172806	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300313794
117052	NC_014323	CGC	2	6	5172811	5172816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313794
117053	NC_014323	GCA	2	6	5172826	5172831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117054	NC_014323	TTC	2	6	5172906	5172911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313794
117055	NC_014323	CGG	2	6	5172919	5172924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313794
117056	NC_014323	CAC	2	6	5172941	5172946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313794
117057	NC_014323	AGC	2	6	5172963	5172968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313794
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117060	NC_014323	GAC	2	6	5173088	5173093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313794
117061	NC_014323	CCCG	2	8	5173094	5173101	0 %	0 %	25 %	75 %	300313794
117062	NC_014323	GCA	2	6	5173138	5173143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313794
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117065	NC_014323	CGG	2	6	5173366	5173371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313794
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117069	NC_014323	GGCGCT	2	12	5173469	5173480	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300313794
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117082	NC_014323	GC	3	6	5174110	5174115	0 %	0 %	50 %	50 %	300313795
117083	NC_014323	GACGAT	2	12	5174192	5174203	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300313795
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117086	NC_014323	GCC	2	6	5174278	5174283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313795
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117095	NC_014323	CCA	2	6	5174522	5174527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313795
117096	NC_014323	GCG	2	6	5174556	5174561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313795
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117098	NC_014323	GCT	2	6	5174589	5174594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313795
117099	NC_014323	AG	3	6	5174598	5174603	50 %	0 %	50 %	0 %	300313795
117100	NC_014323	CAG	2	6	5174604	5174609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313795
117101	NC_014323	GC	3	6	5174631	5174636	0 %	0 %	50 %	50 %	300313795
117102	NC_014323	CAG	2	6	5174670	5174675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313795
117103	NC_014323	GCA	2	6	5174724	5174729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313795
117104	NC_014323	GCCAGC	2	12	5174731	5174742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300313795
117105	NC_014323	GGCC	2	8	5174801	5174808	0 %	0 %	50 %	50 %	300313795
117106	NC_014323	AGC	2	6	5174809	5174814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313795
117107	NC_014323	CG	4	8	5174879	5174886	0 %	0 %	50 %	50 %	300313795
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117110	NC_014323	CGG	2	6	5174963	5174968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313795
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117229	NC_014323	TTG	2	6	5179770	5179775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313801
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