MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
116501	NC_014323	TTC	2	6	5149486	5149491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313782
116502	NC_014323	TCG	2	6	5149559	5149564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116503	NC_014323	CGG	2	6	5149565	5149570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313782
116504	NC_014323	GTG	2	6	5149618	5149623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313782
116505	NC_014323	CAT	2	6	5149671	5149676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313782
116506	NC_014323	GCT	2	6	5149755	5149760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116507	NC_014323	CAC	2	6	5149768	5149773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313782
116508	NC_014323	AGC	2	6	5149774	5149779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116509	NC_014323	CGT	2	6	5149788	5149793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116510	NC_014323	GACGCC	2	12	5149798	5149809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300313782
116511	NC_014323	CAA	2	6	5149839	5149844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313782
116512	NC_014323	GCG	2	6	5149857	5149862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313782
116513	NC_014323	GAGC	2	8	5149874	5149881	25 %	0 %	50 %	25 %	300313783
116514	NC_014323	GCTGCC	2	12	5149931	5149942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300313783
116515	NC_014323	CGG	2	6	5149965	5149970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313783
116516	NC_014323	TGA	2	6	5150014	5150019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313783
116517	NC_014323	TCT	2	6	5150026	5150031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313783
116518	NC_014323	ATC	2	6	5150109	5150114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313783
116519	NC_014323	GCC	2	6	5150160	5150165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313783
116520	NC_014323	CAGC	2	8	5150176	5150183	25 %	0 %	25 %	50 %	300313783
116521	NC_014323	CG	3	6	5150185	5150190	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
116522	NC_014323	GCC	2	6	5150297	5150302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313783
116523	NC_014323	GCG	2	6	5150328	5150333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313783
116524	NC_014323	GAC	2	6	5150343	5150348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313783
116525	NC_014323	GCA	2	6	5150362	5150367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313783
116526	NC_014323	CG	4	8	5150372	5150379	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
116527	NC_014323	GCT	2	6	5150470	5150475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313783
116528	NC_014323	CCAG	2	8	5150482	5150489	25 %	0 %	25 %	50 %	300313783
116529	NC_014323	TCA	2	6	5150500	5150505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313783
116530	NC_014323	CG	3	6	5150593	5150598	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
116531	NC_014323	AGA	2	6	5150599	5150604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313783
116532	NC_014323	AGC	2	6	5150643	5150648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313783
116533	NC_014323	GC	3	6	5150668	5150673	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
116534	NC_014323	CCG	3	9	5150725	5150733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313783
116535	NC_014323	GCC	2	6	5150736	5150741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313783
116536	NC_014323	GCGCA	2	10	5150747	5150756	20 %	0 %	40 %	40 %	300313783
116537	NC_014323	GC	3	6	5150765	5150770	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
116538	NC_014323	CTT	2	6	5150798	5150803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313783
116539	NC_014323	GGC	2	6	5150837	5150842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313783
116540	NC_014323	GCCG	2	8	5150867	5150874	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
116541	NC_014323	CAG	2	6	5150921	5150926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313783
116542	NC_014323	CAT	2	6	5150933	5150938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313783
116543	NC_014323	CGGCG	2	10	5150956	5150965	0 %	0 %	60 %	40 %	300313783
116544	NC_014323	G	6	6	5150983	5150988	0 %	0 %	100 %	0 %	300313783
116545	NC_014323	G	6	6	5151002	5151007	0 %	0 %	100 %	0 %	300313783
116546	NC_014323	TCG	2	6	5151025	5151030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313783
116547	NC_014323	CGG	2	6	5151259	5151264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
116548	NC_014323	GCG	2	6	5151276	5151281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
116549	NC_014323	CAT	2	6	5151283	5151288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313784
116550	NC_014323	CAA	2	6	5151298	5151303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313784
116551	NC_014323	TCC	2	6	5151312	5151317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313784
116552	NC_014323	CT	3	6	5151333	5151338	0 %	50 %	0 %	50 %	300313784
116553	NC_014323	GACC	2	8	5151340	5151347	25 %	0 %	25 %	50 %	300313784
116554	NC_014323	AAG	2	6	5151389	5151394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313784
116555	NC_014323	CAC	2	6	5151497	5151502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313784
116556	NC_014323	CAT	2	6	5151526	5151531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313784
116557	NC_014323	GCC	2	6	5151538	5151543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313784
116558	NC_014323	GCT	2	6	5151544	5151549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313784
116559	NC_014323	GC	3	6	5151551	5151556	0 %	0 %	50 %	50 %	300313784
116560	NC_014323	GATC	2	8	5151613	5151620	25 %	25 %	25 %	25 %	300313784
116561	NC_014323	TCA	2	6	5151678	5151683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313784
116562	NC_014323	CTGG	2	8	5151718	5151725	0 %	25 %	50 %	25 %	300313784
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116564	NC_014323	GCC	2	6	5151803	5151808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313784
116565	NC_014323	GCG	2	6	5151900	5151905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
116566	NC_014323	GCG	3	9	5151915	5151923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
116567	NC_014323	CGG	2	6	5151985	5151990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
116568	NC_014323	GGTGCG	2	12	5151994	5152005	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300313784
116569	NC_014323	GC	3	6	5152011	5152016	0 %	0 %	50 %	50 %	300313784
116570	NC_014323	GCA	2	6	5152018	5152023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313784
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116572	NC_014323	GGT	2	6	5152117	5152122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313784
116573	NC_014323	CTG	2	6	5152190	5152195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313784
116574	NC_014323	AGC	2	6	5152277	5152282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313784
116575	NC_014323	GC	3	6	5152299	5152304	0 %	0 %	50 %	50 %	300313784
116576	NC_014323	CGG	2	6	5152342	5152347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
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116580	NC_014323	GGT	2	6	5152513	5152518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313784
116581	NC_014323	TCC	2	6	5152986	5152991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313785
116582	NC_014323	TCG	2	6	5153022	5153027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313785
116583	NC_014323	CATG	2	8	5153086	5153093	25 %	25 %	25 %	25 %	300313785
116584	NC_014323	ACG	2	6	5153122	5153127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
116585	NC_014323	CAT	2	6	5153134	5153139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313785
116586	NC_014323	CTG	2	6	5153177	5153182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313785
116587	NC_014323	GC	3	6	5153215	5153220	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
116588	NC_014323	TCA	3	9	5153265	5153273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313785
116589	NC_014323	GCC	4	12	5153285	5153296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313785
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116591	NC_014323	CCCG	2	8	5153380	5153387	0 %	0 %	25 %	75 %	300313785
116592	NC_014323	C	6	6	5153393	5153398	0 %	0 %	0 %	100 %	300313785
116593	NC_014323	GCG	2	6	5153399	5153404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
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116597	NC_014323	CGA	2	6	5153485	5153490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
116598	NC_014323	GCA	2	6	5153491	5153496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
116599	NC_014323	ACC	2	6	5153516	5153521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313785
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116602	NC_014323	GCAGC	2	10	5153646	5153655	20 %	0 %	40 %	40 %	300313785
116603	NC_014323	CAG	2	6	5153659	5153664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
116604	NC_014323	GCA	3	9	5153667	5153675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
116605	NC_014323	CGG	2	6	5153698	5153703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
116606	NC_014323	GCC	3	9	5153717	5153725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313785
116607	NC_014323	GGT	2	6	5153726	5153731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313785
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116609	NC_014323	GCA	4	12	5153750	5153761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
116610	NC_014323	CAG	2	6	5153766	5153771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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116612	NC_014323	CGA	2	6	5153992	5153997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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116614	NC_014323	GGT	2	6	5154043	5154048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313785
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116621	NC_014323	GCA	3	9	5154294	5154302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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