MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
116001	NC_014323	CGC	2	6	5127842	5127847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313765
116002	NC_014323	GCC	3	9	5127858	5127866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313765
116003	NC_014323	CAG	2	6	5127905	5127910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116004	NC_014323	TGCTGG	2	12	5128081	5128092	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300313765
116005	NC_014323	AGC	2	6	5128155	5128160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116006	NC_014323	GCA	2	6	5128186	5128191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116007	NC_014323	CGG	2	6	5128217	5128222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313765
116008	NC_014323	CAT	2	6	5128223	5128228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313765
116009	NC_014323	ACC	2	6	5128236	5128241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313765
116010	NC_014323	CCG	2	6	5128246	5128251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313765
116011	NC_014323	CGG	2	6	5128322	5128327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313765
116012	NC_014323	TCG	2	6	5128353	5128358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116013	NC_014323	GCA	2	6	5128391	5128396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116014	NC_014323	CCAG	2	8	5128444	5128451	25 %	0 %	25 %	50 %	300313765
116015	NC_014323	CAA	2	6	5128469	5128474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313765
116016	NC_014323	GGC	2	6	5128485	5128490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313765
116017	NC_014323	GC	3	6	5128590	5128595	0 %	0 %	50 %	50 %	300313765
116018	NC_014323	GCA	2	6	5128606	5128611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116019	NC_014323	ACCAGA	2	12	5128648	5128659	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	300313765
116020	NC_014323	CTG	2	6	5128671	5128676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116021	NC_014323	GCA	2	6	5128708	5128713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116022	NC_014323	CTA	2	6	5128730	5128735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313765
116023	NC_014323	ACT	2	6	5128741	5128746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313765
116024	NC_014323	CG	3	6	5128786	5128791	0 %	0 %	50 %	50 %	300313765
116025	NC_014323	CAA	2	6	5128793	5128798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313765
116026	NC_014323	GC	5	10	5128834	5128843	0 %	0 %	50 %	50 %	300313765
116027	NC_014323	CGC	2	6	5128855	5128860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313765
116028	NC_014323	GCA	2	6	5128870	5128875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116029	NC_014323	CTG	2	6	5128878	5128883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116030	NC_014323	GGAT	2	8	5128888	5128895	25 %	25 %	50 %	0 %	300313765
116031	NC_014323	CGA	2	6	5128922	5128927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116032	NC_014323	GCG	2	6	5128957	5128962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313765
116033	NC_014323	GCC	2	6	5129000	5129005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313765
116034	NC_014323	ACC	2	6	5129010	5129015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313765
116035	NC_014323	CGCGCC	2	12	5129094	5129105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313765
116036	NC_014323	ATG	2	6	5129110	5129115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313765
116037	NC_014323	CG	3	6	5129139	5129144	0 %	0 %	50 %	50 %	300313765
116038	NC_014323	CTGG	2	8	5129189	5129196	0 %	25 %	50 %	25 %	300313765
116039	NC_014323	CAA	2	6	5129348	5129353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313765
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116041	NC_014323	TGG	2	6	5129389	5129394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313765
116042	NC_014323	ACC	2	6	5129415	5129420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313765
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116046	NC_014323	GGC	3	9	5129538	5129546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313765
116047	NC_014323	ATG	2	6	5129556	5129561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313765
116048	NC_014323	GCA	2	6	5129584	5129589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313765
116049	NC_014323	CCG	2	6	5129622	5129627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313765
116050	NC_014323	CTA	2	6	5129693	5129698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313765
116051	NC_014323	GCG	2	6	5129700	5129705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313765
116052	NC_014323	CG	3	6	5129704	5129709	0 %	0 %	50 %	50 %	300313765
116053	NC_014323	CTA	2	6	5129843	5129848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313765
116054	NC_014323	CAGC	2	8	5129861	5129868	25 %	0 %	25 %	50 %	300313765
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116057	NC_014323	GGT	2	6	5129941	5129946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313765
116058	NC_014323	GGC	2	6	5129992	5129997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313766
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116064	NC_014323	GCT	2	6	5130210	5130215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313766
116065	NC_014323	CGG	2	6	5130219	5130224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313766
116066	NC_014323	GCA	2	6	5130281	5130286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313766
116067	NC_014323	CCAG	2	8	5130291	5130298	25 %	0 %	25 %	50 %	300313766
116068	NC_014323	CGG	2	6	5130555	5130560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313766
116069	NC_014323	CTG	2	6	5130577	5130582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313766
116070	NC_014323	TCA	2	6	5130669	5130674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313766
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116081	NC_014323	GCTCC	2	10	5131229	5131238	0 %	20 %	20 %	60 %	300313768
116082	NC_014323	GC	3	6	5131255	5131260	0 %	0 %	50 %	50 %	300313768
116083	NC_014323	GAA	2	6	5131293	5131298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313768
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116086	NC_014323	CGG	2	6	5131331	5131336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313768
116087	NC_014323	GCC	2	6	5131356	5131361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313768
116088	NC_014323	GAT	2	6	5131374	5131379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313768
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116096	NC_014323	CG	4	8	5132005	5132012	0 %	0 %	50 %	50 %	300313769
116097	NC_014323	GCT	2	6	5132078	5132083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313769
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116099	NC_014323	CTT	2	6	5132129	5132134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313769
116100	NC_014323	CG	4	8	5132162	5132169	0 %	0 %	50 %	50 %	300313769
116101	NC_014323	CCG	2	6	5132170	5132175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313769
116102	NC_014323	GCCC	2	8	5132199	5132206	0 %	0 %	25 %	75 %	300313769
116103	NC_014323	GAC	2	6	5132212	5132217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313769
116104	NC_014323	GCT	2	6	5132264	5132269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313769
116105	NC_014323	GC	3	6	5132271	5132276	0 %	0 %	50 %	50 %	300313769
116106	NC_014323	GCTGGA	2	12	5132303	5132314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300313769
116107	NC_014323	TGG	2	6	5132398	5132403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313769
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116109	NC_014323	CAGC	2	8	5132437	5132444	25 %	0 %	25 %	50 %	300313769
116110	NC_014323	CGG	2	6	5132516	5132521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313769
116111	NC_014323	CGG	2	6	5132639	5132644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313769
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116114	NC_014323	TGG	3	9	5132704	5132712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313769
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116221	NC_014323	GGC	2	6	5137490	5137495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313773
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116225	NC_014323	AGC	2	6	5137569	5137574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313773
116226	NC_014323	AACATG	2	12	5137668	5137679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300313773
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116346	NC_014323	CCG	2	6	5143376	5143381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313778
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116456	NC_014323	CCA	2	6	5147438	5147443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313781
116457	NC_014323	CTG	2	6	5147499	5147504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313781
116458	NC_014323	GCT	2	6	5147537	5147542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313781
116459	NC_014323	GC	3	6	5147580	5147585	0 %	0 %	50 %	50 %	300313781
116460	NC_014323	CTG	2	6	5147610	5147615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313781
116461	NC_014323	GGCGC	2	10	5147621	5147630	0 %	0 %	60 %	40 %	300313781
116462	NC_014323	CAT	2	6	5147648	5147653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313781
116463	NC_014323	CCA	2	6	5147732	5147737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313781
116464	NC_014323	GCTG	2	8	5147800	5147807	0 %	25 %	50 %	25 %	300313781
116465	NC_014323	ACC	2	6	5147908	5147913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313781
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116467	NC_014323	GCT	2	6	5148026	5148031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313781
116468	NC_014323	CG	3	6	5148064	5148069	0 %	0 %	50 %	50 %	300313781
116469	NC_014323	CTGC	2	8	5148155	5148162	0 %	25 %	25 %	50 %	300313781
116470	NC_014323	GCC	2	6	5148165	5148170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313781
116471	NC_014323	GTG	2	6	5148183	5148188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313781
116472	NC_014323	GTG	2	6	5148192	5148197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313781
116473	NC_014323	TGA	2	6	5148428	5148433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313782
116474	NC_014323	CAGG	2	8	5148471	5148478	25 %	0 %	50 %	25 %	300313782
116475	NC_014323	CGC	2	6	5148486	5148491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313782
116476	NC_014323	GCT	2	6	5148552	5148557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116477	NC_014323	GCA	2	6	5148621	5148626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116478	NC_014323	CTG	2	6	5148640	5148645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116479	NC_014323	CGC	2	6	5148672	5148677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313782
116480	NC_014323	TCG	2	6	5148686	5148691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116481	NC_014323	TGG	3	9	5148707	5148715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313782
116482	NC_014323	CGG	2	6	5148719	5148724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313782
116483	NC_014323	TTC	2	6	5148766	5148771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313782
116484	NC_014323	GCG	2	6	5148846	5148851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313782
116485	NC_014323	GTG	3	9	5148859	5148867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313782
116486	NC_014323	ACT	2	6	5148935	5148940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313782
116487	NC_014323	ACG	2	6	5148974	5148979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116488	NC_014323	TGGCC	2	10	5149005	5149014	0 %	20 %	40 %	40 %	300313782
116489	NC_014323	TCT	2	6	5149085	5149090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313782
116490	NC_014323	CG	3	6	5149126	5149131	0 %	0 %	50 %	50 %	300313782
116491	NC_014323	CG	4	8	5149164	5149171	0 %	0 %	50 %	50 %	300313782
116492	NC_014323	ACA	2	6	5149235	5149240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313782
116493	NC_014323	GCGCGT	2	12	5149302	5149313	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300313782
116494	NC_014323	GC	3	6	5149331	5149336	0 %	0 %	50 %	50 %	300313782
116495	NC_014323	GC	3	6	5149360	5149365	0 %	0 %	50 %	50 %	300313782
116496	NC_014323	GC	3	6	5149395	5149400	0 %	0 %	50 %	50 %	300313782
116497	NC_014323	GC	4	8	5149417	5149424	0 %	0 %	50 %	50 %	300313782
116498	NC_014323	GAG	2	6	5149438	5149443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313782
116499	NC_014323	GCT	2	6	5149464	5149469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313782
116500	NC_014323	CGTGGA	2	12	5149473	5149484	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300313782

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