MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115001	NC_014323	CGC	2	6	5084868	5084873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313731
115002	NC_014323	CGC	2	6	5084885	5084890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313731
115003	NC_014323	CGC	2	6	5084908	5084913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313731
115004	NC_014323	CATCGC	2	12	5084943	5084954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300313731
115005	NC_014323	GC	3	6	5084983	5084988	0 %	0 %	50 %	50 %	300313731
115006	NC_014323	GCTGG	2	10	5085003	5085012	0 %	20 %	60 %	20 %	300313731
115007	NC_014323	GC	3	6	5085066	5085071	0 %	0 %	50 %	50 %	300313731
115008	NC_014323	CCG	2	6	5085168	5085173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313731
115009	NC_014323	CTGG	2	8	5085183	5085190	0 %	25 %	50 %	25 %	300313731
115010	NC_014323	CGG	2	6	5085216	5085221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313731
115011	NC_014323	GC	3	6	5085223	5085228	0 %	0 %	50 %	50 %	300313731
115012	NC_014323	CGCGC	2	10	5085253	5085262	0 %	0 %	40 %	60 %	300313731
115013	NC_014323	GGC	2	6	5085264	5085269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313731
115014	NC_014323	CAT	2	6	5085273	5085278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313731
115015	NC_014323	TGC	2	6	5085284	5085289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313731
115016	NC_014323	GCA	2	6	5085362	5085367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313731
115017	NC_014323	CCT	2	6	5085398	5085403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313731
115018	NC_014323	CCGC	2	8	5085432	5085439	0 %	0 %	25 %	75 %	300313731
115019	NC_014323	GCC	2	6	5085475	5085480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313731
115020	NC_014323	AGCC	2	8	5085486	5085493	25 %	0 %	25 %	50 %	300313731
115021	NC_014323	CGC	2	6	5085498	5085503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313731
115022	NC_014323	CGC	2	6	5085528	5085533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313731
115023	NC_014323	CTA	2	6	5085534	5085539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313731
115024	NC_014323	GCCC	2	8	5085550	5085557	0 %	0 %	25 %	75 %	300313731
115025	NC_014323	ATCT	2	8	5085592	5085599	25 %	50 %	0 %	25 %	300313731
115026	NC_014323	CCGC	2	8	5085644	5085651	0 %	0 %	25 %	75 %	300313731
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115030	NC_014323	CGG	5	15	5085831	5085845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313731
115031	NC_014323	GC	3	6	5085862	5085867	0 %	0 %	50 %	50 %	300313731
115032	NC_014323	GCT	2	6	5085870	5085875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313731
115033	NC_014323	GTG	2	6	5085976	5085981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313731
115034	NC_014323	GAC	2	6	5086011	5086016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313731
115035	NC_014323	CGG	2	6	5086044	5086049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313731
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115038	NC_014323	TC	3	6	5086131	5086136	0 %	50 %	0 %	50 %	300313731
115039	NC_014323	GCCGC	2	10	5086166	5086175	0 %	0 %	40 %	60 %	300313731
115040	NC_014323	GCA	2	6	5086208	5086213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313731
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115043	NC_014323	CGT	2	6	5086347	5086352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313731
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115048	NC_014323	GCA	2	6	5086466	5086471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313731
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115050	NC_014323	CTT	2	6	5086518	5086523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313731
115051	NC_014323	TATCG	2	10	5086690	5086699	20 %	40 %	20 %	20 %	300313732
115052	NC_014323	CG	3	6	5086729	5086734	0 %	0 %	50 %	50 %	300313732
115053	NC_014323	CGCGG	2	10	5086781	5086790	0 %	0 %	60 %	40 %	300313732
115054	NC_014323	CGG	2	6	5086863	5086868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313732
115055	NC_014323	CG	3	6	5086878	5086883	0 %	0 %	50 %	50 %	300313732
115056	NC_014323	CGA	2	6	5086926	5086931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313732
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115059	NC_014323	CAC	2	6	5086998	5087003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313732
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115062	NC_014323	ACA	2	6	5087162	5087167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313732
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115065	NC_014323	CTGC	2	8	5087311	5087318	0 %	25 %	25 %	50 %	300313732
115066	NC_014323	CTGG	2	8	5087322	5087329	0 %	25 %	50 %	25 %	300313732
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115104	NC_014323	GC	3	6	5088641	5088646	0 %	0 %	50 %	50 %	300313733
115105	NC_014323	CAG	2	6	5088666	5088671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313733
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115344	NC_014323	AGA	2	6	5098873	5098878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313744
115345	NC_014323	GTC	2	6	5098893	5098898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313744
115346	NC_014323	CGG	2	6	5098930	5098935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313744
115347	NC_014323	TTCCT	2	10	5098963	5098972	0 %	60 %	0 %	40 %	300313744
115348	NC_014323	TCT	2	6	5099095	5099100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313744
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115350	NC_014323	GCT	2	6	5099156	5099161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313744
115351	NC_014323	CAA	2	6	5099234	5099239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313744
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115355	NC_014323	TAC	2	6	5099340	5099345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313744
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115357	NC_014323	CTT	2	6	5099369	5099374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313744
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115362	NC_014323	CG	3	6	5099524	5099529	0 %	0 %	50 %	50 %	300313744
115363	NC_014323	CAT	2	6	5099549	5099554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313744
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115366	NC_014323	CAT	2	6	5099612	5099617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313744
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115371	NC_014323	TGGG	2	8	5099745	5099752	0 %	25 %	75 %	0 %	300313744
115372	NC_014323	CTG	2	6	5099769	5099774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313744
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115375	NC_014323	GAT	3	9	5099822	5099830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313744
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115378	NC_014323	CAT	2	6	5099849	5099854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313744
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115381	NC_014323	GC	3	6	5099899	5099904	0 %	0 %	50 %	50 %	300313744
115382	NC_014323	TGC	3	9	5099905	5099913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313744
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115400	NC_014323	CGC	3	9	5100791	5100799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313745
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115414	NC_014323	CG	3	6	5101527	5101532	0 %	0 %	50 %	50 %	300313746
115415	NC_014323	CGG	2	6	5101552	5101557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313746
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115443	NC_014323	TCA	2	6	5102956	5102961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313747
115444	NC_014323	GAC	2	6	5102997	5103002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313747
115445	NC_014323	GC	3	6	5103034	5103039	0 %	0 %	50 %	50 %	300313747
115446	NC_014323	GGC	2	6	5103069	5103074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313747
115447	NC_014323	GCAA	2	8	5103088	5103095	50 %	0 %	25 %	25 %	300313747
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115449	NC_014323	TAC	2	6	5103120	5103125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313747
115450	NC_014323	CGGC	2	8	5103148	5103155	0 %	0 %	50 %	50 %	300313747
115451	NC_014323	AGTT	2	8	5103291	5103298	25 %	50 %	25 %	0 %	300313747
115452	NC_014323	GTC	2	6	5103365	5103370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313748
115453	NC_014323	GGC	2	6	5103379	5103384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313748
115454	NC_014323	AGC	2	6	5103398	5103403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313748
115455	NC_014323	GGCCA	2	10	5103409	5103418	20 %	0 %	40 %	40 %	300313748
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115457	NC_014323	AGC	2	6	5103449	5103454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313748
115458	NC_014323	CTG	2	6	5103461	5103466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313748
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