MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114501	NC_014323	CAG	2	6	5061973	5061978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313711
114502	NC_014323	TGC	2	6	5062005	5062010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313711
114503	NC_014323	AGTC	2	8	5062042	5062049	25 %	25 %	25 %	25 %	300313711
114504	NC_014323	TCTCG	2	10	5062084	5062093	0 %	40 %	20 %	40 %	300313711
114505	NC_014323	CCT	2	6	5062099	5062104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313711
114506	NC_014323	GCTG	2	8	5062216	5062223	0 %	25 %	50 %	25 %	300313711
114507	NC_014323	TTGC	2	8	5062280	5062287	0 %	50 %	25 %	25 %	300313711
114508	NC_014323	TTC	2	6	5062357	5062362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313711
114509	NC_014323	GCT	2	6	5062421	5062426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313711
114510	NC_014323	GGAA	2	8	5062513	5062520	50 %	0 %	50 %	0 %	300313712
114511	NC_014323	CGG	2	6	5062532	5062537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313712
114512	NC_014323	TCC	2	6	5062633	5062638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313712
114513	NC_014323	GGC	2	6	5062665	5062670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313712
114514	NC_014323	ACG	2	6	5062707	5062712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313712
114515	NC_014323	GAA	2	6	5062739	5062744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313712
114516	NC_014323	GAA	2	6	5062748	5062753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313712
114517	NC_014323	GAA	2	6	5062917	5062922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313712
114518	NC_014323	AGT	2	6	5063065	5063070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313712
114519	NC_014323	ACT	2	6	5063091	5063096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313712
114520	NC_014323	TGA	2	6	5063111	5063116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313712
114521	NC_014323	TCT	2	6	5063143	5063148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313712
114522	NC_014323	ACG	2	6	5063196	5063201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313712
114523	NC_014323	TGG	2	6	5063210	5063215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313712
114524	NC_014323	TC	3	6	5063233	5063238	0 %	50 %	0 %	50 %	300313712
114525	NC_014323	AGGC	2	8	5063316	5063323	25 %	0 %	50 %	25 %	300313712
114526	NC_014323	CCT	2	6	5063324	5063329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313712
114527	NC_014323	T	6	6	5063344	5063349	0 %	100 %	0 %	0 %	300313712
114528	NC_014323	TCA	2	6	5063410	5063415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313712
114529	NC_014323	ATG	2	6	5064480	5064485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313713
114530	NC_014323	CCAG	2	8	5064489	5064496	25 %	0 %	25 %	50 %	300313713
114531	NC_014323	CCA	2	6	5064571	5064576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313713
114532	NC_014323	GGGC	2	8	5064685	5064692	0 %	0 %	75 %	25 %	300313713
114533	NC_014323	GTA	2	6	5064708	5064713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313713
114534	NC_014323	CCA	2	6	5064715	5064720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313713
114535	NC_014323	GC	3	6	5064736	5064741	0 %	0 %	50 %	50 %	300313713
114536	NC_014323	CAA	2	6	5064742	5064747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313713
114537	NC_014323	GTC	2	6	5064807	5064812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313713
114538	NC_014323	CGA	2	6	5064820	5064825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313713
114539	NC_014323	GAAC	2	8	5064844	5064851	50 %	0 %	25 %	25 %	300313713
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114541	NC_014323	GAA	2	6	5064944	5064949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313714
114542	NC_014323	GTC	2	6	5064972	5064977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313714
114543	NC_014323	C	6	6	5064981	5064986	0 %	0 %	0 %	100 %	300313714
114544	NC_014323	CTC	2	6	5064992	5064997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313714
114545	NC_014323	GGT	2	6	5065004	5065009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313714
114546	NC_014323	GTG	2	6	5065104	5065109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313714
114547	NC_014323	GCG	2	6	5065209	5065214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313714
114548	NC_014323	CAG	2	6	5065244	5065249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313714
114549	NC_014323	GC	3	6	5065369	5065374	0 %	0 %	50 %	50 %	300313714
114550	NC_014323	GCCA	2	8	5065428	5065435	25 %	0 %	25 %	50 %	300313714
114551	NC_014323	AGGC	2	8	5065439	5065446	25 %	0 %	50 %	25 %	300313714
114552	NC_014323	GAC	2	6	5065656	5065661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313715
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114554	NC_014323	CT	3	6	5065804	5065809	0 %	50 %	0 %	50 %	300313715
114555	NC_014323	TGCA	2	8	5065881	5065888	25 %	25 %	25 %	25 %	300313715
114556	NC_014323	TGC	2	6	5065919	5065924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313715
114557	NC_014323	GCT	2	6	5065925	5065930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313715
114558	NC_014323	CCTCAT	2	12	5065994	5066005	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	300313715
114559	NC_014323	CTG	2	6	5066046	5066051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313715
114560	NC_014323	AGC	2	6	5066085	5066090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313715
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114562	NC_014323	CGG	2	6	5066212	5066217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313716
114563	NC_014323	CGG	2	6	5066224	5066229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313716
114564	NC_014323	TCT	2	6	5066243	5066248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313716
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114568	NC_014323	CAC	2	6	5066329	5066334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313716
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114582	NC_014323	GGC	2	6	5066987	5066992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313716
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114584	NC_014323	GCG	2	6	5067067	5067072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313716
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114588	NC_014323	TCT	2	6	5067243	5067248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313716
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114598	NC_014323	GC	3	6	5067735	5067740	0 %	0 %	50 %	50 %	300313716
114599	NC_014323	GAC	2	6	5067754	5067759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313716
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114602	NC_014323	ACG	2	6	5067920	5067925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313716
114603	NC_014323	ATG	2	6	5067995	5068000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313716
114604	NC_014323	GC	3	6	5068027	5068032	0 %	0 %	50 %	50 %	300313716
114605	NC_014323	GGC	3	9	5068039	5068047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313716
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114724	NC_014323	CCG	2	6	5074303	5074308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313721
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