MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114001	NC_014323	GC	3	6	5039234	5039239	0 %	0 %	50 %	50 %	300313691
114002	NC_014323	ACC	3	9	5039258	5039266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313691
114003	NC_014323	GGC	2	6	5039305	5039310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313691
114004	NC_014323	CCA	2	6	5039391	5039396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313691
114005	NC_014323	CTG	2	6	5039417	5039422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313691
114006	NC_014323	GCA	2	6	5039433	5039438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313691
114007	NC_014323	GC	3	6	5039449	5039454	0 %	0 %	50 %	50 %	300313691
114008	NC_014323	GGT	4	12	5039455	5039466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313691
114009	NC_014323	CAG	2	6	5039467	5039472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313691
114010	NC_014323	CAA	2	6	5039473	5039478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313691
114011	NC_014323	GAC	2	6	5039519	5039524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313691
114012	NC_014323	GGC	2	6	5039531	5039536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313691
114013	NC_014323	CAG	3	9	5039548	5039556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313691
114014	NC_014323	CGG	2	6	5039580	5039585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313691
114015	NC_014323	CTT	2	6	5039599	5039604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313691
114016	NC_014323	CGG	3	9	5039662	5039670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313691
114017	NC_014323	CG	3	6	5039708	5039713	0 %	0 %	50 %	50 %	300313691
114018	NC_014323	CACCGA	2	12	5039863	5039874	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300313691
114019	NC_014323	AGA	2	6	5039922	5039927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313691
114020	NC_014323	TGC	2	6	5039988	5039993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313691
114021	NC_014323	GC	3	6	5040011	5040016	0 %	0 %	50 %	50 %	300313691
114022	NC_014323	GC	3	6	5040109	5040114	0 %	0 %	50 %	50 %	300313691
114023	NC_014323	AGGC	2	8	5040276	5040283	25 %	0 %	50 %	25 %	300313692
114024	NC_014323	CAG	2	6	5040316	5040321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313692
114025	NC_014323	GCA	2	6	5040343	5040348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313692
114026	NC_014323	AGC	2	6	5040399	5040404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313692
114027	NC_014323	AGC	2	6	5040483	5040488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313692
114028	NC_014323	TAC	2	6	5040497	5040502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313692
114029	NC_014323	ACA	2	6	5040504	5040509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313692
114030	NC_014323	GCA	2	6	5040660	5040665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313692
114031	NC_014323	TGC	2	6	5040684	5040689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313692
114032	NC_014323	ACT	2	6	5040693	5040698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313692
114033	NC_014323	GCT	2	6	5040727	5040732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313692
114034	NC_014323	GC	3	6	5040753	5040758	0 %	0 %	50 %	50 %	300313692
114035	NC_014323	GGC	2	6	5040788	5040793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313692
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114039	NC_014323	GC	3	6	5040926	5040931	0 %	0 %	50 %	50 %	300313692
114040	NC_014323	GCC	2	6	5040941	5040946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313692
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114049	NC_014323	GCA	2	6	5041446	5041451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313693
114050	NC_014323	CCGC	2	8	5041452	5041459	0 %	0 %	25 %	75 %	300313693
114051	NC_014323	GC	3	6	5041458	5041463	0 %	0 %	50 %	50 %	300313693
114052	NC_014323	GCC	2	6	5041477	5041482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313693
114053	NC_014323	CCGGC	2	10	5041508	5041517	0 %	0 %	40 %	60 %	300313693
114054	NC_014323	ACT	2	6	5041574	5041579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313693
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114056	NC_014323	CGA	2	6	5041635	5041640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313693
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114072	NC_014323	GC	3	6	5042313	5042318	0 %	0 %	50 %	50 %	300313694
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114075	NC_014323	TGC	2	6	5042419	5042424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313694
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114083	NC_014323	TTGCC	2	10	5043008	5043017	0 %	40 %	20 %	40 %	300313695
114084	NC_014323	ATG	2	6	5043028	5043033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313695
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114086	NC_014323	GC	3	6	5043131	5043136	0 %	0 %	50 %	50 %	300313695
114087	NC_014323	GCG	2	6	5043163	5043168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313695
114088	NC_014323	TGCA	2	8	5043204	5043211	25 %	25 %	25 %	25 %	300313695
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114096	NC_014323	ACG	2	6	5043590	5043595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313696
114097	NC_014323	GC	3	6	5043607	5043612	0 %	0 %	50 %	50 %	300313696
114098	NC_014323	CTTC	2	8	5043632	5043639	0 %	50 %	0 %	50 %	300313696
114099	NC_014323	TGC	2	6	5043650	5043655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313696
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114102	NC_014323	CGG	2	6	5043770	5043775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313696
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114108	NC_014323	GCTC	2	8	5044073	5044080	0 %	25 %	25 %	50 %	300313696
114109	NC_014323	CCA	2	6	5044094	5044099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313696
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114112	NC_014323	GCGG	2	8	5044165	5044172	0 %	0 %	75 %	25 %	300313696
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114224	NC_014323	CCCA	2	8	5048696	5048703	25 %	0 %	0 %	75 %	300313702
114225	NC_014323	GCG	2	6	5048733	5048738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313702
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114229	NC_014323	GTG	2	6	5048999	5049004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313702
114230	NC_014323	TGC	2	6	5049030	5049035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313702
114231	NC_014323	CGA	2	6	5049040	5049045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313702
114232	NC_014323	TGG	2	6	5049092	5049097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313702
114233	NC_014323	CG	3	6	5049111	5049116	0 %	0 %	50 %	50 %	300313702
114234	NC_014323	GCCCA	2	10	5049138	5049147	20 %	0 %	20 %	60 %	300313702
114235	NC_014323	TCT	2	6	5049159	5049164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313702
114236	NC_014323	CTG	2	6	5049221	5049226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313702
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114240	NC_014323	GCA	2	6	5049409	5049414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313702
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114245	NC_014323	CGA	2	6	5049547	5049552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313702
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114297	NC_014323	AGC	2	6	5052100	5052105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
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114300	NC_014323	CAT	2	6	5052204	5052209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313705
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114309	NC_014323	CTG	2	6	5052603	5052608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313705
114310	NC_014323	CGT	2	6	5052620	5052625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313705
114311	NC_014323	GCA	2	6	5052635	5052640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
114312	NC_014323	GCA	3	9	5052755	5052763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
114313	NC_014323	CACC	2	8	5052789	5052796	25 %	0 %	0 %	75 %	300313705
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114315	NC_014323	GATCA	2	10	5052861	5052870	40 %	20 %	20 %	20 %	300313705
114316	NC_014323	GCA	2	6	5052998	5053003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
114317	NC_014323	GGT	2	6	5053020	5053025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313705
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114320	NC_014323	TCC	2	6	5053372	5053377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313706
114321	NC_014323	CTG	2	6	5053414	5053419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114322	NC_014323	CCGC	2	8	5053436	5053443	0 %	0 %	25 %	75 %	300313706
114323	NC_014323	GC	3	6	5053442	5053447	0 %	0 %	50 %	50 %	300313706
114324	NC_014323	CGG	2	6	5053482	5053487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313706
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114327	NC_014323	GCT	2	6	5053659	5053664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114328	NC_014323	GAC	2	6	5053711	5053716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114329	NC_014323	TCG	2	6	5053766	5053771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114330	NC_014323	GC	3	6	5053797	5053802	0 %	0 %	50 %	50 %	300313706
114331	NC_014323	CAT	2	6	5053824	5053829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313706
114332	NC_014323	CTGG	2	8	5053857	5053864	0 %	25 %	50 %	25 %	300313706
114333	NC_014323	TAC	2	6	5053897	5053902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313706
114334	NC_014323	CGC	3	9	5053917	5053925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313706
114335	NC_014323	CTG	2	6	5054050	5054055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114336	NC_014323	CGC	2	6	5054220	5054225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313706
114337	NC_014323	GGT	2	6	5054265	5054270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313706
114338	NC_014323	GC	3	6	5054299	5054304	0 %	0 %	50 %	50 %	300313706
114339	NC_014323	CGA	2	6	5054328	5054333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114340	NC_014323	TCG	2	6	5054351	5054356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114341	NC_014323	GCA	2	6	5054384	5054389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114342	NC_014323	GCA	2	6	5054429	5054434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114343	NC_014323	ACG	2	6	5054471	5054476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313706
114344	NC_014323	CAA	2	6	5054481	5054486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313706
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114455	NC_014323	TC	3	6	5058946	5058951	0 %	50 %	0 %	50 %	300313710
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114491	NC_014323	GCA	2	6	5061288	5061293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313711
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