MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_014323	CAT	2	6	4994573	4994578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313646
113002	NC_014323	GACC	2	8	4994614	4994621	25 %	0 %	25 %	50 %	300313646
113003	NC_014323	ACC	2	6	4994624	4994629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313646
113004	NC_014323	CAG	2	6	4994675	4994680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313646
113005	NC_014323	TCG	2	6	4994700	4994705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313646
113006	NC_014323	GACCG	2	10	4994750	4994759	20 %	0 %	40 %	40 %	300313646
113007	NC_014323	TCG	2	6	4994763	4994768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313646
113008	NC_014323	ATG	2	6	4994790	4994795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313646
113009	NC_014323	CGA	2	6	4994876	4994881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313646
113010	NC_014323	GCT	3	9	4994917	4994925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313646
113011	NC_014323	GCATC	2	10	4994980	4994989	20 %	20 %	20 %	40 %	300313646
113012	NC_014323	CCA	2	6	4995007	4995012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313646
113013	NC_014323	CGA	2	6	4995130	4995135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313647
113014	NC_014323	TTG	2	6	4995174	4995179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313647
113015	NC_014323	GGC	2	6	4995224	4995229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313647
113016	NC_014323	GC	3	6	4995245	4995250	0 %	0 %	50 %	50 %	300313647
113017	NC_014323	CAG	2	6	4995314	4995319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313647
113018	NC_014323	CCA	2	6	4995325	4995330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313647
113019	NC_014323	GCA	2	6	4995409	4995414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313647
113020	NC_014323	GCT	2	6	4995415	4995420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313647
113021	NC_014323	TGA	2	6	4995448	4995453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313647
113022	NC_014323	AGC	2	6	4995507	4995512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313647
113023	NC_014323	GCG	2	6	4995544	4995549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313647
113024	NC_014323	GGC	2	6	4995572	4995577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313647
113025	NC_014323	TTG	2	6	4995615	4995620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313647
113026	NC_014323	TTG	2	6	4995672	4995677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313647
113027	NC_014323	GCC	2	6	4995707	4995712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313647
113028	NC_014323	GTCG	2	8	4995725	4995732	0 %	25 %	50 %	25 %	300313647
113029	NC_014323	GAC	2	6	4995734	4995739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313647
113030	NC_014323	CTG	2	6	4995767	4995772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313647
113031	NC_014323	CGGG	2	8	4995848	4995855	0 %	0 %	75 %	25 %	300313647
113032	NC_014323	TCT	2	6	4995922	4995927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313647
113033	NC_014323	GGC	2	6	4996043	4996048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313648
113034	NC_014323	TCT	2	6	4996096	4996101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313648
113035	NC_014323	AGC	2	6	4996104	4996109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113036	NC_014323	TCT	2	6	4996162	4996167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313648
113037	NC_014323	CGT	2	6	4996177	4996182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113038	NC_014323	TTG	2	6	4996194	4996199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313648
113039	NC_014323	GATCGA	2	12	4996223	4996234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300313648
113040	NC_014323	CAG	2	6	4996259	4996264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113041	NC_014323	CG	3	6	4996273	4996278	0 %	0 %	50 %	50 %	300313648
113042	NC_014323	GCT	2	6	4996291	4996296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113043	NC_014323	CCG	2	6	4996377	4996382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313648
113044	NC_014323	TGA	2	6	4996393	4996398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313648
113045	NC_014323	CG	3	6	4996423	4996428	0 %	0 %	50 %	50 %	300313648
113046	NC_014323	GAT	2	6	4996562	4996567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313648
113047	NC_014323	GCA	2	6	4996647	4996652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113048	NC_014323	CAG	2	6	4996658	4996663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113049	NC_014323	CGG	2	6	4996709	4996714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313648
113050	NC_014323	GCA	3	9	4996720	4996728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113051	NC_014323	GCTT	2	8	4996752	4996759	0 %	50 %	25 %	25 %	300313648
113052	NC_014323	GTC	2	6	4996766	4996771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113053	NC_014323	ACG	2	6	4996881	4996886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313648
113054	NC_014323	GC	3	6	4996920	4996925	0 %	0 %	50 %	50 %	300313648
113055	NC_014323	CGA	2	6	4996940	4996945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313648
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113057	NC_014323	GAT	2	6	4997048	4997053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313648
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113065	NC_014323	TCG	2	6	4997658	4997663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313649
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113082	NC_014323	GC	3	6	4998355	4998360	0 %	0 %	50 %	50 %	300313650
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113096	NC_014323	CAG	2	6	4999160	4999165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313652
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113101	NC_014323	AGCC	2	8	4999265	4999272	25 %	0 %	25 %	50 %	300313652
113102	NC_014323	TGC	2	6	4999286	4999291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313652
113103	NC_014323	GCC	2	6	4999310	4999315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313652
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113107	NC_014323	TCA	2	6	4999486	4999491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313652
113108	NC_014323	CCA	2	6	4999573	4999578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313652
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113110	NC_014323	CGA	2	6	4999594	4999599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313652
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113112	NC_014323	AGGC	2	8	4999659	4999666	25 %	0 %	50 %	25 %	300313652
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113228	NC_014323	CGA	2	6	5005150	5005155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313657
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113341	NC_014323	GCG	2	6	5009121	5009126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313661
113342	NC_014323	CGA	2	6	5009182	5009187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313661
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113448	NC_014323	CTCATG	2	12	5014037	5014048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300313665
113449	NC_014323	TCG	2	6	5014071	5014076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313665
113450	NC_014323	ACG	2	6	5014077	5014082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313665
113451	NC_014323	CTG	2	6	5014100	5014105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313665
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113455	NC_014323	ATG	2	6	5014214	5014219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313665
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113457	NC_014323	CGC	2	6	5014272	5014277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313665
113458	NC_014323	GC	3	6	5014292	5014297	0 %	0 %	50 %	50 %	300313665
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113462	NC_014323	CG	4	8	5014406	5014413	0 %	0 %	50 %	50 %	300313665
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113481	NC_014323	GAC	2	6	5015197	5015202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313666
113482	NC_014323	TGG	2	6	5015227	5015232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313666
113483	NC_014323	GCT	2	6	5015235	5015240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313666
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