MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110501	NC_014323	CGG	2	6	4881455	4881460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313549
110502	NC_014323	TCG	2	6	4881576	4881581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313550
110503	NC_014323	GATC	2	8	4881655	4881662	25 %	25 %	25 %	25 %	300313550
110504	NC_014323	GC	3	6	4881676	4881681	0 %	0 %	50 %	50 %	300313550
110505	NC_014323	CTG	3	9	4881692	4881700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313550
110506	NC_014323	TG	3	6	4881720	4881725	0 %	50 %	50 %	0 %	300313550
110507	NC_014323	GT	3	6	4881740	4881745	0 %	50 %	50 %	0 %	300313550
110508	NC_014323	GC	3	6	4881795	4881800	0 %	0 %	50 %	50 %	300313550
110509	NC_014323	CGG	2	6	4881853	4881858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313550
110510	NC_014323	TGA	2	6	4881873	4881878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313550
110511	NC_014323	CGG	2	6	4881895	4881900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313550
110512	NC_014323	GGC	2	6	4881910	4881915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313550
110513	NC_014323	GCT	3	9	4881991	4881999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313550
110514	NC_014323	TGC	2	6	4882080	4882085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313550
110515	NC_014323	GGC	2	6	4882138	4882143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313550
110516	NC_014323	ATG	2	6	4882163	4882168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313550
110517	NC_014323	GTGGC	2	10	4882200	4882209	0 %	20 %	60 %	20 %	300313550
110518	NC_014323	GCG	2	6	4882217	4882222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313550
110519	NC_014323	GC	3	6	4882241	4882246	0 %	0 %	50 %	50 %	300313550
110520	NC_014323	CAT	2	6	4882369	4882374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313550
110521	NC_014323	GCC	2	6	4882389	4882394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313550
110522	NC_014323	GCT	2	6	4882435	4882440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313550
110523	NC_014323	GCG	2	6	4882449	4882454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313550
110524	NC_014323	GT	3	6	4882497	4882502	0 %	50 %	50 %	0 %	300313550
110525	NC_014323	TGC	2	6	4882512	4882517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313550
110526	NC_014323	CTG	3	9	4882523	4882531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313550
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110528	NC_014323	CTC	2	6	4882612	4882617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313551
110529	NC_014323	CTG	3	9	4882650	4882658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313551
110530	NC_014323	AACG	2	8	4882680	4882687	50 %	0 %	25 %	25 %	300313551
110531	NC_014323	ATG	2	6	4882719	4882724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313551
110532	NC_014323	TGG	2	6	4882726	4882731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313551
110533	NC_014323	ACC	2	6	4882761	4882766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313551
110534	NC_014323	GCT	2	6	4882775	4882780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313551
110535	NC_014323	GGCG	2	8	4882790	4882797	0 %	0 %	75 %	25 %	300313551
110536	NC_014323	CTGG	2	8	4882832	4882839	0 %	25 %	50 %	25 %	300313551
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110539	NC_014323	GCT	2	6	4882967	4882972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313551
110540	NC_014323	CTTCC	2	10	4882980	4882989	0 %	40 %	0 %	60 %	300313551
110541	NC_014323	CCA	2	6	4883006	4883011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313551
110542	NC_014323	CG	3	6	4883074	4883079	0 %	0 %	50 %	50 %	300313551
110543	NC_014323	GC	3	6	4883093	4883098	0 %	0 %	50 %	50 %	300313551
110544	NC_014323	GCT	2	6	4883165	4883170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313551
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110547	NC_014323	TGG	2	6	4883245	4883250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313551
110548	NC_014323	GCT	2	6	4883324	4883329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313551
110549	NC_014323	CGG	2	6	4883333	4883338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313551
110550	NC_014323	CCA	2	6	4883419	4883424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313551
110551	NC_014323	GTG	2	6	4883427	4883432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313551
110552	NC_014323	TCCG	2	8	4883500	4883507	0 %	25 %	25 %	50 %	300313551
110553	NC_014323	GCA	2	6	4883640	4883645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313552
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110555	NC_014323	GAA	2	6	4883670	4883675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313552
110556	NC_014323	GCC	2	6	4883682	4883687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313552
110557	NC_014323	GCT	2	6	4883694	4883699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313552
110558	NC_014323	GCC	2	6	4883721	4883726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313552
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110565	NC_014323	GC	3	6	4884175	4884180	0 %	0 %	50 %	50 %	300313552
110566	NC_014323	CCA	2	6	4884199	4884204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313552
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110570	NC_014323	ACC	2	6	4884261	4884266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313552
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110573	NC_014323	GCC	2	6	4884402	4884407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313552
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110580	NC_014323	TCG	2	6	4884583	4884588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313552
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110582	NC_014323	TGGG	2	8	4884853	4884860	0 %	25 %	75 %	0 %	300313553
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110586	NC_014323	CGGTCA	2	12	4885036	4885047	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300313553
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110588	NC_014323	GCC	2	6	4885187	4885192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313554
110589	NC_014323	AGC	2	6	4885332	4885337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313554
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110594	NC_014323	GC	3	6	4885653	4885658	0 %	0 %	50 %	50 %	300313555
110595	NC_014323	CGGG	2	8	4885756	4885763	0 %	0 %	75 %	25 %	300313555
110596	NC_014323	TTC	2	6	4885773	4885778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313555
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110598	NC_014323	TCG	2	6	4885927	4885932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313555
110599	NC_014323	TGGCC	2	10	4885937	4885946	0 %	20 %	40 %	40 %	300313555
110600	NC_014323	GCC	3	9	4886001	4886009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313555
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110602	NC_014323	CAGCC	2	10	4886071	4886080	20 %	0 %	20 %	60 %	300313555
110603	NC_014323	GCT	2	6	4886082	4886087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313555
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110607	NC_014323	GC	3	6	4886151	4886156	0 %	0 %	50 %	50 %	300313555
110608	NC_014323	TGG	2	6	4886167	4886172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313555
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110610	NC_014323	CAA	2	6	4886186	4886191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313555
110611	NC_014323	CGC	2	6	4886233	4886238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313555
110612	NC_014323	GC	3	6	4886280	4886285	0 %	0 %	50 %	50 %	300313555
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110614	NC_014323	GCAGGT	2	12	4886378	4886389	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300313555
110615	NC_014323	TGC	2	6	4886416	4886421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313555
110616	NC_014323	GTC	2	6	4886426	4886431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313555
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