MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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109002	NC_014323	GC	3	6	4811201	4811206	0 %	0 %	50 %	50 %	300313491
109003	NC_014323	TCA	2	6	4811257	4811262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313491
109004	NC_014323	G	6	6	4811263	4811268	0 %	0 %	100 %	0 %	300313491
109005	NC_014323	TCA	3	9	4811401	4811409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313491
109006	NC_014323	C	6	6	4811410	4811415	0 %	0 %	0 %	100 %	300313491
109007	NC_014323	CTG	2	6	4811451	4811456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313491
109008	NC_014323	GCATC	2	10	4811473	4811482	20 %	20 %	20 %	40 %	300313491
109009	NC_014323	TCA	2	6	4811542	4811547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313491
109010	NC_014323	CAA	2	6	4811804	4811809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313491
109011	NC_014323	CGT	2	6	4811900	4811905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313491
109012	NC_014323	GGTA	2	8	4811978	4811985	25 %	25 %	50 %	0 %	300313491
109013	NC_014323	ATG	2	6	4812004	4812009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313491
109014	NC_014323	CGCTA	2	10	4812029	4812038	20 %	20 %	20 %	40 %	300313491
109015	NC_014323	CAGTA	2	10	4812317	4812326	40 %	20 %	20 %	20 %	300313492
109016	NC_014323	CGC	2	6	4812338	4812343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313492
109017	NC_014323	GAA	2	6	4812398	4812403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313492
109018	NC_014323	CAT	2	6	4812406	4812411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313492
109019	NC_014323	CAA	2	6	4812625	4812630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313492
109020	NC_014323	AGA	2	6	4812791	4812796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313493
109021	NC_014323	CAA	2	6	4812806	4812811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313493
109022	NC_014323	TGC	2	6	4812889	4812894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313493
109023	NC_014323	CAAGG	2	10	4812897	4812906	40 %	0 %	40 %	20 %	300313493
109024	NC_014323	TCG	2	6	4812934	4812939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313493
109025	NC_014323	TGC	2	6	4812982	4812987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313493
109026	NC_014323	GCT	2	6	4813039	4813044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313493
109027	NC_014323	TCG	2	6	4813141	4813146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313493
109028	NC_014323	TGG	2	6	4813201	4813206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313493
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109030	NC_014323	GCA	2	6	4813326	4813331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313493
109031	NC_014323	TCTA	2	8	4813399	4813406	25 %	50 %	0 %	25 %	300313493
109032	NC_014323	TTG	2	6	4813429	4813434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313493
109033	NC_014323	GTC	2	6	4813508	4813513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313493
109034	NC_014323	CTG	2	6	4813569	4813574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313493
109035	NC_014323	CAT	2	6	4813653	4813658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313494
109036	NC_014323	CAT	2	6	4813662	4813667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313494
109037	NC_014323	TGC	2	6	4813760	4813765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313494
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109041	NC_014323	GC	3	6	4814108	4814113	0 %	0 %	50 %	50 %	300313495
109042	NC_014323	CGG	2	6	4814202	4814207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313495
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109047	NC_014323	ATTCT	2	10	4814309	4814318	20 %	60 %	0 %	20 %	300313495
109048	NC_014323	GGTCG	2	10	4814327	4814336	0 %	20 %	60 %	20 %	300313495
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109051	NC_014323	CAT	2	6	4814680	4814685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313495
109052	NC_014323	GCT	2	6	4814737	4814742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313495
109053	NC_014323	CTT	2	6	4814896	4814901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313495
109054	NC_014323	GCT	2	6	4814905	4814910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313495
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109056	NC_014323	CTG	2	6	4814954	4814959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313495
109057	NC_014323	CTG	2	6	4814963	4814968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313495
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109065	NC_014323	GAT	2	6	4815593	4815598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313496
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109067	NC_014323	GC	3	6	4815764	4815769	0 %	0 %	50 %	50 %	300313496
109068	NC_014323	CCCCA	2	10	4815776	4815785	20 %	0 %	0 %	80 %	300313496
109069	NC_014323	CCCG	2	8	4815792	4815799	0 %	0 %	25 %	75 %	300313496
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109103	NC_014323	TGCT	2	8	4817442	4817449	0 %	50 %	25 %	25 %	300313497
109104	NC_014323	GCT	2	6	4817461	4817466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313497
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109112	NC_014323	GC	3	6	4817894	4817899	0 %	0 %	50 %	50 %	300313497
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109114	NC_014323	CGG	2	6	4817947	4817952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313497
109115	NC_014323	GCAG	2	8	4817965	4817972	25 %	0 %	50 %	25 %	300313497
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109228	NC_014323	CTCC	2	8	4824235	4824242	0 %	25 %	0 %	75 %	300313502
109229	NC_014323	TGC	2	6	4824247	4824252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313502
109230	NC_014323	GGT	2	6	4824296	4824301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313502
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