MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014323	GTG	2	6	434884	434889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309740
10002	NC_014323	GC	3	6	434959	434964	0 %	0 %	50 %	50 %	300309740
10003	NC_014323	CTG	2	6	434986	434991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309740
10004	NC_014323	GC	3	6	435022	435027	0 %	0 %	50 %	50 %	300309740
10005	NC_014323	CTG	2	6	435028	435033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309740
10006	NC_014323	GCCG	2	8	435039	435046	0 %	0 %	50 %	50 %	300309740
10007	NC_014323	GAG	2	6	435079	435084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309740
10008	NC_014323	GGC	2	6	435108	435113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309740
10009	NC_014323	CGC	2	6	435134	435139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309740
10010	NC_014323	CGG	2	6	435149	435154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309740
10011	NC_014323	CCCG	2	8	435177	435184	0 %	0 %	25 %	75 %	300309740
10012	NC_014323	ATG	2	6	435198	435203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309740
10013	NC_014323	TCTTT	2	10	435245	435254	0 %	80 %	0 %	20 %	300309741
10014	NC_014323	CTG	2	6	435256	435261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309741
10015	NC_014323	CTG	2	6	435293	435298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309741
10016	NC_014323	GCT	2	6	435319	435324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309741
10017	NC_014323	CGC	2	6	435355	435360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309741
10018	NC_014323	CGG	3	9	435475	435483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
10019	NC_014323	GGC	2	6	435556	435561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
10020	NC_014323	GGT	2	6	435571	435576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309741
10021	NC_014323	CAG	3	9	435587	435595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309741
10022	NC_014323	CGG	2	6	435596	435601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
10023	NC_014323	ATG	2	6	435602	435607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309741
10024	NC_014323	GCA	3	9	435625	435633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309741
10025	NC_014323	AGC	2	6	435648	435653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309741
10026	NC_014323	CG	4	8	435682	435689	0 %	0 %	50 %	50 %	300309741
10027	NC_014323	CG	4	8	435703	435710	0 %	0 %	50 %	50 %	300309741
10028	NC_014323	ACA	2	6	435756	435761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309741
10029	NC_014323	GAA	2	6	435769	435774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309741
10030	NC_014323	CCA	2	6	435870	435875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309741
10031	NC_014323	AAG	2	6	435884	435889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309741
10032	NC_014323	GCA	2	6	435933	435938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309741
10033	NC_014323	GGC	2	6	435953	435958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
10034	NC_014323	GTG	2	6	435959	435964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309741
10035	NC_014323	GGC	2	6	436000	436005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
10036	NC_014323	GGC	2	6	436064	436069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
10037	NC_014323	ATC	2	6	436088	436093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309741
10038	NC_014323	CG	3	6	436110	436115	0 %	0 %	50 %	50 %	300309741
10039	NC_014323	G	6	6	436138	436143	0 %	0 %	100 %	0 %	300309741
10040	NC_014323	CGT	2	6	436250	436255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309742
10041	NC_014323	GCC	2	6	436308	436313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
10042	NC_014323	CTG	2	6	436344	436349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309742
10043	NC_014323	GGC	2	6	436370	436375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309742
10044	NC_014323	GCG	2	6	436391	436396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309742
10045	NC_014323	GC	5	10	436469	436478	0 %	0 %	50 %	50 %	300309742
10046	NC_014323	ACA	2	6	436531	436536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309742
10047	NC_014323	CAT	2	6	436562	436567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309742
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10049	NC_014323	TCC	2	6	436603	436608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309742
10050	NC_014323	CG	3	6	436630	436635	0 %	0 %	50 %	50 %	300309742
10051	NC_014323	TTG	2	6	436641	436646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309742
10052	NC_014323	TGC	2	6	436651	436656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309742
10053	NC_014323	AGC	2	6	436657	436662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309742
10054	NC_014323	TGG	3	9	436675	436683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309742
10055	NC_014323	CGC	2	6	436727	436732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
10056	NC_014323	GCA	2	6	436747	436752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309742
10057	NC_014323	CGA	2	6	436817	436822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309742
10058	NC_014323	GCC	2	6	436826	436831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
10059	NC_014323	GCC	2	6	436835	436840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
10060	NC_014323	ATG	2	6	436875	436880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309742
10061	NC_014323	CAG	2	6	436917	436922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309742
10062	NC_014323	TGG	2	6	436957	436962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309742
10063	NC_014323	GCC	2	6	436968	436973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
10064	NC_014323	GTG	2	6	436985	436990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309742
10065	NC_014323	CCG	2	6	437011	437016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
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10067	NC_014323	TGC	2	6	437118	437123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
10068	NC_014323	CTGGTG	2	12	437126	437137	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300309743
10069	NC_014323	CTG	2	6	437138	437143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
10070	NC_014323	TTC	2	6	437156	437161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309743
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10072	NC_014323	GCT	2	6	437227	437232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
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10075	NC_014323	CAT	2	6	437311	437316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309743
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10079	NC_014323	GGT	2	6	437407	437412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309743
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10081	NC_014323	CAG	2	6	437435	437440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309743
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10083	NC_014323	CTG	2	6	437525	437530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
10084	NC_014323	AGC	2	6	437535	437540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309743
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10086	NC_014323	TAC	2	6	437615	437620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309743
10087	NC_014323	CGG	2	6	437628	437633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309743
10088	NC_014323	TGC	2	6	437673	437678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
10089	NC_014323	GCC	2	6	437723	437728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309743
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10091	NC_014323	CGC	2	6	437758	437763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309743
10092	NC_014323	GCCG	2	8	437770	437777	0 %	0 %	50 %	50 %	300309743
10093	NC_014323	ACG	2	6	438118	438123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309744
10094	NC_014323	GC	3	6	438128	438133	0 %	0 %	50 %	50 %	300309744
10095	NC_014323	CGA	2	6	438167	438172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309744
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10097	NC_014323	CGA	3	9	438263	438271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309744
10098	NC_014323	GC	5	10	438368	438377	0 %	0 %	50 %	50 %	300309744
10099	NC_014323	TGC	2	6	438412	438417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309744
10100	NC_014323	AAG	2	6	438507	438512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309744
10101	NC_014323	CGC	2	6	438530	438535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309744
10102	NC_014323	GAA	2	6	438561	438566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309744
10103	NC_014323	CCG	2	6	438584	438589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309744
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10105	NC_014323	CGC	2	6	438606	438611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309744
10106	NC_014323	CGGC	2	8	438632	438639	0 %	0 %	50 %	50 %	300309744
10107	NC_014323	CGCC	2	8	438665	438672	0 %	0 %	25 %	75 %	300309744
10108	NC_014323	CTT	2	6	438734	438739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309744
10109	NC_014323	TCA	2	6	438760	438765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309744
10110	NC_014323	ATC	2	6	438783	438788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309744
10111	NC_014323	TCT	2	6	438793	438798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309744
10112	NC_014323	GCC	2	6	438821	438826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309744
10113	NC_014323	ACTGG	2	10	438875	438884	20 %	20 %	40 %	20 %	300309744
10114	NC_014323	TGA	3	9	438910	438918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309744
10115	NC_014323	TCGGC	2	10	438919	438928	0 %	20 %	40 %	40 %	300309744
10116	NC_014323	CCG	2	6	438950	438955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309744
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10118	NC_014323	TCA	2	6	439119	439124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309745
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10241	NC_014323	CGA	2	6	444554	444559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309750
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10353	NC_014323	ACATCG	2	12	449496	449507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300309756
10354	NC_014323	CGGCC	2	10	449509	449518	0 %	0 %	40 %	60 %	300309756
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10476	NC_014323	TGC	2	6	454810	454815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
10477	NC_014323	GCC	2	6	454827	454832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309761
10478	NC_014323	ATC	2	6	454833	454838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309761
10479	NC_014323	CCA	2	6	454856	454861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309761
10480	NC_014323	CCG	2	6	454874	454879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309761
10481	NC_014323	CCA	2	6	454898	454903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309761
10482	NC_014323	CTG	3	9	454914	454922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
10483	NC_014323	GAT	2	6	454959	454964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309761
10484	NC_014323	GGC	2	6	455052	455057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309761
10485	NC_014323	TCG	2	6	455074	455079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
10486	NC_014323	GCG	2	6	455150	455155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309761
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10491	NC_014323	CTG	2	6	455283	455288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
10492	NC_014323	GTC	2	6	455304	455309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
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10495	NC_014323	GCC	2	6	455335	455340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309761
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10499	NC_014323	A	6	6	455397	455402	100 %	0 %	0 %	0 %	300309761
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