MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014313	GCGTC	2	10	173736	173745	0 %	20 %	40 %	40 %	300021717
3502	NC_014313	CGAG	2	8	173833	173840	25 %	0 %	50 %	25 %	300021717
3503	NC_014313	GTC	2	6	173849	173854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021717
3504	NC_014313	GCG	2	6	173870	173875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021717
3505	NC_014313	TTCGG	2	10	173954	173963	0 %	40 %	40 %	20 %	300021717
3506	NC_014313	TGA	2	6	174225	174230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021718
3507	NC_014313	GCG	2	6	174251	174256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021718
3508	NC_014313	TGC	2	6	174292	174297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3509	NC_014313	GTG	2	6	174305	174310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021718
3510	NC_014313	CTG	2	6	174348	174353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3511	NC_014313	TGA	2	6	174390	174395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021718
3512	NC_014313	TGG	2	6	174424	174429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021718
3513	NC_014313	CTG	2	6	174501	174506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3514	NC_014313	ATC	2	6	174533	174538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021718
3515	NC_014313	CTG	2	6	174617	174622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3516	NC_014313	GTC	2	6	174641	174646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3517	NC_014313	TAA	2	6	174652	174657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300021718
3518	NC_014313	TC	3	6	174658	174663	0 %	50 %	0 %	50 %	300021718
3519	NC_014313	GCAGC	2	10	174685	174694	20 %	0 %	40 %	40 %	300021718
3520	NC_014313	TCA	2	6	174699	174704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021718
3521	NC_014313	TAT	2	6	174705	174710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300021718
3522	NC_014313	GGT	2	6	174808	174813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021718
3523	NC_014313	CGT	2	6	174866	174871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3524	NC_014313	ACG	2	6	174884	174889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3525	NC_014313	CG	3	6	174888	174893	0 %	0 %	50 %	50 %	300021718
3526	NC_014313	GTC	2	6	174929	174934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3527	NC_014313	TCGC	2	8	174938	174945	0 %	25 %	25 %	50 %	300021718
3528	NC_014313	CGCT	2	8	174954	174961	0 %	25 %	25 %	50 %	300021718
3529	NC_014313	CGG	2	6	174985	174990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021718
3530	NC_014313	GTC	2	6	175007	175012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3531	NC_014313	TTC	2	6	175058	175063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021718
3532	NC_014313	TTA	2	6	175093	175098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300021718
3533	NC_014313	CATGT	2	10	175142	175151	20 %	40 %	20 %	20 %	300021718
3534	NC_014313	G	6	6	175175	175180	0 %	0 %	100 %	0 %	300021718
3535	NC_014313	CCT	2	6	175195	175200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300021718
3536	NC_014313	CAG	2	6	175250	175255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021718
3537	NC_014313	TTG	2	6	175272	175277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300021718
3538	NC_014313	T	7	7	175282	175288	0 %	100 %	0 %	0 %	300021718
3539	NC_014313	T	6	6	175304	175309	0 %	100 %	0 %	0 %	300021718
3540	NC_014313	T	6	6	175311	175316	0 %	100 %	0 %	0 %	300021718
3541	NC_014313	GC	3	6	175483	175488	0 %	0 %	50 %	50 %	300021718
3542	NC_014313	CTG	2	6	175543	175548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021719
3543	NC_014313	TCG	2	6	175601	175606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021719
3544	NC_014313	AGG	2	6	175658	175663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300021719
3545	NC_014313	TGC	2	6	175706	175711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021719
3546	NC_014313	CTT	2	6	175784	175789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021719
3547	NC_014313	CGCAG	2	10	175803	175812	20 %	0 %	40 %	40 %	300021719
3548	NC_014313	GTC	2	6	175843	175848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021719
3549	NC_014313	CAG	3	9	175894	175902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021719
3550	NC_014313	T	6	6	175932	175937	0 %	100 %	0 %	0 %	300021719
3551	NC_014313	GCA	2	6	175984	175989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021719
3552	NC_014313	GTG	2	6	175990	175995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021719
3553	NC_014313	ATG	2	6	176104	176109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021719
3554	NC_014313	TGA	2	6	176157	176162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021719
3555	NC_014313	TGG	2	6	176211	176216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021719
3556	NC_014313	AGTCGA	2	12	176383	176394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300021719
3557	NC_014313	GGC	2	6	176409	176414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021719
3558	NC_014313	ATC	2	6	176545	176550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021719
3559	NC_014313	A	7	7	176606	176612	100 %	0 %	0 %	0 %	300021719
3560	NC_014313	TAT	2	6	176674	176679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300021719
3561	NC_014313	CTA	2	6	176745	176750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021720
3562	NC_014313	TGG	2	6	176782	176787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021720
3563	NC_014313	TGGG	2	8	176970	176977	0 %	25 %	75 %	0 %	300021720
3564	NC_014313	GTG	2	6	176989	176994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021720
3565	NC_014313	TGA	2	6	177104	177109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021720
3566	NC_014313	TGC	2	6	177175	177180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021720
3567	NC_014313	GGAA	2	8	177214	177221	50 %	0 %	50 %	0 %	300021720
3568	NC_014313	TATG	2	8	177256	177263	25 %	50 %	25 %	0 %	300021720
3569	NC_014313	TTA	2	6	177304	177309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300021720
3570	NC_014313	TC	3	6	177370	177375	0 %	50 %	0 %	50 %	300021720
3571	NC_014313	GTT	2	6	177405	177410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300021720
3572	NC_014313	CTG	2	6	177472	177477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021720
3573	NC_014313	TAA	2	6	177488	177493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300021720
3574	NC_014313	AGT	2	6	177543	177548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021720
3575	NC_014313	AGC	2	6	177569	177574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021720
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3580	NC_014313	TCAAA	2	10	177702	177711	60 %	20 %	0 %	20 %	300021720
3581	NC_014313	TGC	2	6	177727	177732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021720
3582	NC_014313	CGAAG	2	10	177737	177746	40 %	0 %	40 %	20 %	300021720
3583	NC_014313	CTG	2	6	177864	177869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021720
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3585	NC_014313	AAATA	2	10	177920	177929	80 %	20 %	0 %	0 %	300021720
3586	NC_014313	AGAT	2	8	177932	177939	50 %	25 %	25 %	0 %	300021720
3587	NC_014313	TGG	2	6	177975	177980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021720
3588	NC_014313	GCG	2	6	178020	178025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021720
3589	NC_014313	AGC	2	6	178066	178071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021720
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3591	NC_014313	TGTTT	2	10	178172	178181	0 %	80 %	20 %	0 %	300021720
3592	NC_014313	GC	4	8	178231	178238	0 %	0 %	50 %	50 %	300021720
3593	NC_014313	CAA	2	6	178245	178250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300021720
3594	NC_014313	TTC	2	6	178298	178303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021721
3595	NC_014313	TC	3	6	178341	178346	0 %	50 %	0 %	50 %	300021721
3596	NC_014313	GAA	2	6	178356	178361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021721
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3598	NC_014313	CAAG	2	8	178488	178495	50 %	0 %	25 %	25 %	300021721
3599	NC_014313	CGG	2	6	178542	178547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021721
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3601	NC_014313	CG	3	6	178589	178594	0 %	0 %	50 %	50 %	300021721
3602	NC_014313	GAT	2	6	178656	178661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021721
3603	NC_014313	ATCACC	2	12	178801	178812	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	300021721
3604	NC_014313	ATG	2	6	178834	178839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021721
3605	NC_014313	CGG	2	6	178919	178924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021721
3606	NC_014313	CGA	2	6	178925	178930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021721
3607	NC_014313	GCT	2	6	179028	179033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021721
3608	NC_014313	TAT	2	6	179074	179079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300021721
3609	NC_014313	GCC	2	6	179085	179090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021721
3610	NC_014313	CGC	2	6	179137	179142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021721
3611	NC_014313	CA	3	6	179168	179173	50 %	0 %	0 %	50 %	300021721
3612	NC_014313	CTG	2	6	179209	179214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021721
3613	NC_014313	GTTC	2	8	179226	179233	0 %	50 %	25 %	25 %	300021721
3614	NC_014313	A	6	6	179314	179319	100 %	0 %	0 %	0 %	300021722
3615	NC_014313	CTT	3	9	179321	179329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021722
3616	NC_014313	CCTG	2	8	179355	179362	0 %	25 %	25 %	50 %	300021722
3617	NC_014313	TTC	2	6	179377	179382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021722
3618	NC_014313	GAAG	2	8	179452	179459	50 %	0 %	50 %	0 %	300021722
3619	NC_014313	ACA	2	6	179475	179480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300021722
3620	NC_014313	TTAT	2	8	179532	179539	25 %	75 %	0 %	0 %	300021722
3621	NC_014313	GC	3	6	179666	179671	0 %	0 %	50 %	50 %	300021722
3622	NC_014313	CG	4	8	179713	179720	0 %	0 %	50 %	50 %	300021722
3623	NC_014313	TGC	2	6	179749	179754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021722
3624	NC_014313	GAT	2	6	179774	179779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021722
3625	NC_014313	GGC	2	6	179797	179802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021722
3626	NC_014313	CGATC	2	10	179839	179848	20 %	20 %	20 %	40 %	300021722
3627	NC_014313	GCAGA	2	10	179873	179882	40 %	0 %	40 %	20 %	300021722
3628	NC_014313	GGC	2	6	179906	179911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021722
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3631	NC_014313	CAT	2	6	180119	180124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021722
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3644	NC_014313	TCC	2	6	180916	180921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300021723
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3653	NC_014313	GC	3	6	181328	181333	0 %	0 %	50 %	50 %	300021723
3654	NC_014313	CG	3	6	181357	181362	0 %	0 %	50 %	50 %	300021723
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3695	NC_014313	CGT	2	6	183697	183702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021726
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3703	NC_014313	GTC	2	6	183992	183997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021726
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3727	NC_014313	TCG	2	6	185263	185268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021727
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3729	NC_014313	CGT	2	6	185869	185874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021728
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3735	NC_014313	ACG	2	6	186183	186188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021728
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3737	NC_014313	GC	3	6	186331	186336	0 %	0 %	50 %	50 %	300021728
3738	NC_014313	GAC	2	6	186380	186385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021728
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3741	NC_014313	AGCCA	2	10	186457	186466	40 %	0 %	20 %	40 %	300021728
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3743	NC_014313	TCG	2	6	186516	186521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021728
3744	NC_014313	TGC	2	6	186523	186528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021728
3745	NC_014313	CGA	2	6	186535	186540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021728
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3748	NC_014313	ATG	2	6	186612	186617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021728
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3864	NC_014313	GCG	2	6	192326	192331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021731
3865	NC_014313	CGG	2	6	192369	192374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021731
3866	NC_014313	CCG	2	6	192393	192398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021731
3867	NC_014313	CGAAG	2	10	192415	192424	40 %	0 %	40 %	20 %	300021731
3868	NC_014313	TGC	2	6	192433	192438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021731
3869	NC_014313	GCA	2	6	192455	192460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021731
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3872	NC_014313	GAC	2	6	192674	192679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021731
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3875	NC_014313	GCT	2	6	192772	192777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021731
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3877	NC_014313	GAC	2	6	192821	192826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021731
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3879	NC_014313	CCGAT	2	10	192840	192849	20 %	20 %	20 %	40 %	300021731
3880	NC_014313	CG	4	8	192856	192863	0 %	0 %	50 %	50 %	300021731
3881	NC_014313	CGCA	2	8	192958	192965	25 %	0 %	25 %	50 %	300021731
3882	NC_014313	CGC	2	6	192982	192987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021731
3883	NC_014313	CGT	3	9	192988	192996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021731
3884	NC_014313	CG	4	8	193033	193040	0 %	0 %	50 %	50 %	300021731
3885	NC_014313	GGC	2	6	193049	193054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021731
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3887	NC_014313	TCG	2	6	193089	193094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021731
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3899	NC_014313	CGG	2	6	193425	193430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021732
3900	NC_014313	GTC	3	9	193435	193443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021732
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3902	NC_014313	CGA	2	6	193500	193505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021732
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3904	NC_014313	CGCGG	2	10	193647	193656	0 %	0 %	60 %	40 %	300021732
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3906	NC_014313	CG	3	6	193721	193726	0 %	0 %	50 %	50 %	300021732
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3940	NC_014313	CGT	2	6	196115	196120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021733
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3943	NC_014313	ATCA	2	8	197218	197225	50 %	25 %	0 %	25 %	300021734
3944	NC_014313	ATC	2	6	197312	197317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021734
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3950	NC_014313	CGG	2	6	197523	197528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021734
3951	NC_014313	CGA	2	6	197622	197627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021734
3952	NC_014313	AGCA	2	8	197731	197738	50 %	0 %	25 %	25 %	300021734
3953	NC_014313	GAT	2	6	197740	197745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021734
3954	NC_014313	GCT	2	6	198172	198177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021735
3955	NC_014313	GTC	2	6	198202	198207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021735
3956	NC_014313	GCCG	2	8	198213	198220	0 %	0 %	50 %	50 %	300021735
3957	NC_014313	CG	4	8	198230	198237	0 %	0 %	50 %	50 %	300021735
3958	NC_014313	GTG	2	6	198299	198304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021735
3959	NC_014313	AGGC	2	8	198352	198359	25 %	0 %	50 %	25 %	300021735
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3963	NC_014313	GTC	2	6	198478	198483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021735
3964	NC_014313	GCG	2	6	198549	198554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021735
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3966	NC_014313	GCA	2	6	198593	198598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021735
3967	NC_014313	GGGC	2	8	198602	198609	0 %	0 %	75 %	25 %	300021735
3968	NC_014313	CGG	2	6	198634	198639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021735
3969	NC_014313	GGC	2	6	198645	198650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021735
3970	NC_014313	TTGA	2	8	198693	198700	25 %	50 %	25 %	0 %	300021735
3971	NC_014313	CGC	2	6	198702	198707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021735
3972	NC_014313	CAG	2	6	198762	198767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021735
3973	NC_014313	TCCAG	2	10	198836	198845	20 %	20 %	20 %	40 %	300021735
3974	NC_014313	GC	3	6	198858	198863	0 %	0 %	50 %	50 %	300021735
3975	NC_014313	TGC	2	6	198885	198890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021735
3976	NC_014313	GGC	2	6	198941	198946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021735
3977	NC_014313	GTT	2	6	198987	198992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300021735
3978	NC_014313	GC	3	6	198996	199001	0 %	0 %	50 %	50 %	300021735
3979	NC_014313	GC	3	6	199037	199042	0 %	0 %	50 %	50 %	300021735
3980	NC_014313	CG	4	8	199168	199175	0 %	0 %	50 %	50 %	300021735
3981	NC_014313	TCA	2	6	199540	199545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021736
3982	NC_014313	GCAA	2	8	199555	199562	50 %	0 %	25 %	25 %	300021736
3983	NC_014313	GTC	2	6	199584	199589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021736
3984	NC_014313	CG	3	6	199729	199734	0 %	0 %	50 %	50 %	300021736
3985	NC_014313	GCC	2	6	199762	199767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021736
3986	NC_014313	CGC	2	6	199779	199784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021736
3987	NC_014313	AAG	2	6	199785	199790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021736
3988	NC_014313	A	6	6	199884	199889	100 %	0 %	0 %	0 %	300021737
3989	NC_014313	GGC	2	6	199893	199898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021737
3990	NC_014313	CGG	2	6	199952	199957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021737
3991	NC_014313	GAA	2	6	200061	200066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021737
3992	NC_014313	CCGC	2	8	200267	200274	0 %	0 %	25 %	75 %	300021738
3993	NC_014313	GCC	2	6	200305	200310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021738
3994	NC_014313	TCCCTA	2	12	200364	200375	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	300021738
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3997	NC_014313	GCG	2	6	200405	200410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021738
3998	NC_014313	CGAT	2	8	200477	200484	25 %	25 %	25 %	25 %	300021738
3999	NC_014313	GCG	2	6	200554	200559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021738
4000	NC_014313	GGCG	2	8	200589	200596	0 %	0 %	75 %	25 %	300021738

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