MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20117	NC_014313	CTGG	2	8	1013996	1014003	0 %	25 %	50 %	25 %	300022481
20118	NC_014313	ATC	2	6	1014048	1014053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022481
20119	NC_014313	GAC	2	6	1014104	1014109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022481
20120	NC_014313	TCCGTG	2	12	1014177	1014188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022481
20121	NC_014313	GAT	2	6	1014192	1014197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022481
20122	NC_014313	ACG	2	6	1014204	1014209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022481
20123	NC_014313	TGG	2	6	1014220	1014225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022481
20124	NC_014313	AAG	2	6	1014237	1014242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022481
20125	NC_014313	AGGC	2	8	1014255	1014262	25 %	0 %	50 %	25 %	300022481
20126	NC_014313	CGAG	2	8	1014307	1014314	25 %	0 %	50 %	25 %	300022481
20127	NC_014313	GGGC	2	8	1014319	1014326	0 %	0 %	75 %	25 %	300022481
20128	NC_014313	CAG	2	6	1014331	1014336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022481
20129	NC_014313	CCG	2	6	1014343	1014348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022481
20130	NC_014313	GC	3	6	1014387	1014392	0 %	0 %	50 %	50 %	300022481
20131	NC_014313	CCA	2	6	1014454	1014459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022481
20132	NC_014313	GC	3	6	1014468	1014473	0 %	0 %	50 %	50 %	300022481
20133	NC_014313	GAG	2	6	1014477	1014482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300022481
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20135	NC_014313	CGA	2	6	1014596	1014601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022481
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20138	NC_014313	TC	3	6	1014872	1014877	0 %	50 %	0 %	50 %	300022482
20139	NC_014313	CGC	2	6	1014920	1014925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022482
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20143	NC_014313	CCGT	2	8	1015230	1015237	0 %	25 %	25 %	50 %	300022483
20144	NC_014313	TCG	2	6	1015267	1015272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022483
20145	NC_014313	GGC	2	6	1015284	1015289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022483
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20147	NC_014313	GGC	2	6	1015403	1015408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022483
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20152	NC_014313	ATC	2	6	1015584	1015589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022483
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20154	NC_014313	GCG	4	12	1015717	1015728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022483
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20185	NC_014313	ACGA	2	8	1017363	1017370	50 %	0 %	25 %	25 %	300022484
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20197	NC_014313	AAC	2	6	1017834	1017839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300022484
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20217	NC_014313	CGA	2	6	1018816	1018821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022486
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20219	NC_014313	CG	4	8	1018840	1018847	0 %	0 %	50 %	50 %	300022486
20220	NC_014313	CGG	2	6	1018861	1018866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022486
20221	NC_014313	CCGC	2	8	1018867	1018874	0 %	0 %	25 %	75 %	300022486
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20223	NC_014313	GCGCG	2	10	1018915	1018924	0 %	0 %	60 %	40 %	300022486
20224	NC_014313	TCG	2	6	1018989	1018994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022486
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20228	NC_014313	GCCG	2	8	1019160	1019167	0 %	0 %	50 %	50 %	300022486
20229	NC_014313	CG	4	8	1019209	1019216	0 %	0 %	50 %	50 %	300022486
20230	NC_014313	TGC	2	6	1019271	1019276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022486
20231	NC_014313	ACG	2	6	1019289	1019294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022486
20232	NC_014313	TCG	2	6	1019301	1019306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022486
20233	NC_014313	CGA	3	9	1019323	1019331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022486
20234	NC_014313	GCC	2	6	1019346	1019351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022486
20235	NC_014313	GATC	2	8	1019362	1019369	25 %	25 %	25 %	25 %	300022486
20236	NC_014313	TAT	2	6	1019383	1019388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300022486
20237	NC_014313	CGCT	2	8	1019396	1019403	0 %	25 %	25 %	50 %	300022486
20238	NC_014313	GCG	2	6	1019442	1019447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022486
20239	NC_014313	GAT	2	6	1019458	1019463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022486
20240	NC_014313	TCG	2	6	1019538	1019543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022486
20241	NC_014313	CAT	2	6	1019566	1019571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022486
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20243	NC_014313	GGGC	2	8	1019614	1019621	0 %	0 %	75 %	25 %	300022486
20244	NC_014313	CGA	2	6	1019659	1019664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022486
20245	NC_014313	GAT	2	6	1019696	1019701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022486
20246	NC_014313	GATG	2	8	1019707	1019714	25 %	25 %	50 %	0 %	300022486
20247	NC_014313	TCG	2	6	1019751	1019756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022486
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20253	NC_014313	CGA	2	6	1020099	1020104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022487
20254	NC_014313	GGC	2	6	1020109	1020114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022487
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20258	NC_014313	TGG	2	6	1020523	1020528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022488
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20260	NC_014313	CTGACG	2	12	1020633	1020644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300022488
20261	NC_014313	GC	5	10	1020648	1020657	0 %	0 %	50 %	50 %	300022488
20262	NC_014313	ATCG	2	8	1020722	1020729	25 %	25 %	25 %	25 %	300022488
20263	NC_014313	GC	3	6	1020732	1020737	0 %	0 %	50 %	50 %	300022488
20264	NC_014313	CG	4	8	1020771	1020778	0 %	0 %	50 %	50 %	300022488
20265	NC_014313	ACC	2	6	1020801	1020806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022488
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20267	NC_014313	CG	4	8	1020854	1020861	0 %	0 %	50 %	50 %	300022488
20268	NC_014313	GGC	2	6	1020864	1020869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022488
20269	NC_014313	CG	3	6	1020879	1020884	0 %	0 %	50 %	50 %	300022488
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20294	NC_014313	ATG	2	6	1022079	1022084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022489
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20343	NC_014313	AAGA	2	8	1024056	1024063	75 %	0 %	25 %	0 %	300022492
20344	NC_014313	TCG	2	6	1024156	1024161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022492
20345	NC_014313	GCG	2	6	1024165	1024170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022492
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20347	NC_014313	GAT	2	6	1024215	1024220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022492
20348	NC_014313	CG	3	6	1024222	1024227	0 %	0 %	50 %	50 %	300022492
20349	NC_014313	CGGCA	2	10	1024344	1024353	20 %	0 %	40 %	40 %	300022492
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20352	NC_014313	GAT	2	6	1024598	1024603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022492
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20354	NC_014313	CAAG	2	8	1024796	1024803	50 %	0 %	25 %	25 %	300022492
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20461	NC_014313	GCCC	2	8	1029012	1029019	0 %	0 %	25 %	75 %	300022496
20462	NC_014313	GAC	2	6	1029040	1029045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022496
20463	NC_014313	GC	3	6	1029091	1029096	0 %	0 %	50 %	50 %	300022496
20464	NC_014313	GTC	2	6	1029139	1029144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022496
20465	NC_014313	GCC	2	6	1029193	1029198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022496
20466	NC_014313	GAT	3	9	1029217	1029225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022496
20467	NC_014313	TGC	2	6	1029294	1029299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022496
20468	NC_014313	CTT	2	6	1029361	1029366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022496
20469	NC_014313	GAT	2	6	1029436	1029441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022496
20470	NC_014313	GC	4	8	1029461	1029468	0 %	0 %	50 %	50 %	300022496
20471	NC_014313	TTC	2	6	1029628	1029633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022496
20472	NC_014313	TTC	2	6	1029737	1029742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022496
20473	NC_014313	CGC	2	6	1029777	1029782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022496
20474	NC_014313	CGG	2	6	1029789	1029794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022496
20475	NC_014313	CGG	2	6	1029800	1029805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022496
20476	NC_014313	CGG	2	6	1029816	1029821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022496
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20480	NC_014313	GC	3	6	1029930	1029935	0 %	0 %	50 %	50 %	300022497
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20483	NC_014313	GAT	2	6	1030141	1030146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022497
20484	NC_014313	CGACG	2	10	1030147	1030156	20 %	0 %	40 %	40 %	300022497
20485	NC_014313	TCG	2	6	1030188	1030193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022497
20486	NC_014313	TGA	2	6	1030206	1030211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022497
20487	NC_014313	GAA	2	6	1030222	1030227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022497
20488	NC_014313	CGTG	2	8	1030236	1030243	0 %	25 %	50 %	25 %	300022497
20489	NC_014313	CCA	2	6	1030253	1030258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022497
20490	NC_014313	GCG	2	6	1030403	1030408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022497
20491	NC_014313	CG	3	6	1030507	1030512	0 %	0 %	50 %	50 %	300022497
20492	NC_014313	TCG	2	6	1030526	1030531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022497
20493	NC_014313	GCC	2	6	1030552	1030557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022497
20494	NC_014313	CGG	2	6	1030587	1030592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022497
20495	NC_014313	CGT	2	6	1030696	1030701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022497
20496	NC_014313	CGG	2	6	1030720	1030725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022497
20497	NC_014313	GC	3	6	1030761	1030766	0 %	0 %	50 %	50 %	300022497
20498	NC_014313	TTC	2	6	1030777	1030782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022497
20499	NC_014313	GAT	2	6	1030795	1030800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022497
20500	NC_014313	GCT	2	6	1030893	1030898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022497

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