MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014313	TCA	2	6	68101	68106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021588
1502	NC_014313	AGC	2	6	68112	68117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021588
1503	NC_014313	CGG	2	6	68149	68154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021588
1504	NC_014313	CGA	2	6	68233	68238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021588
1505	NC_014313	CGG	5	15	68242	68256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021588
1506	NC_014313	GGC	2	6	68288	68293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021588
1507	NC_014313	CGC	2	6	68300	68305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021588
1508	NC_014313	GAG	2	6	68306	68311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300021588
1509	NC_014313	CAT	2	6	68495	68500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021588
1510	NC_014313	CCG	2	6	68503	68508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021588
1511	NC_014313	GCC	2	6	68687	68692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021588
1512	NC_014313	CGA	2	6	68761	68766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021588
1513	NC_014313	CG	4	8	68797	68804	0 %	0 %	50 %	50 %	300021588
1514	NC_014313	CGGC	2	8	68850	68857	0 %	0 %	50 %	50 %	300021588
1515	NC_014313	GGC	2	6	68900	68905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021588
1516	NC_014313	TCGACG	2	12	68907	68918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300021588
1517	NC_014313	CGGTCG	2	12	68926	68937	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300021588
1518	NC_014313	GTTC	2	8	68978	68985	0 %	50 %	25 %	25 %	300021589
1519	NC_014313	CGC	2	6	69009	69014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021589
1520	NC_014313	CGC	2	6	69079	69084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021589
1521	NC_014313	CGA	2	6	69187	69192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021589
1522	NC_014313	CGTCGG	2	12	69407	69418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300021590
1523	NC_014313	GCC	3	9	69522	69530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021590
1524	NC_014313	GC	3	6	69533	69538	0 %	0 %	50 %	50 %	300021590
1525	NC_014313	ATG	2	6	69545	69550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021590
1526	NC_014313	GCGATC	2	12	69599	69610	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300021590
1527	NC_014313	TCG	2	6	69714	69719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021591
1528	NC_014313	CGC	2	6	69837	69842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021591
1529	NC_014313	GCC	3	9	69853	69861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021591
1530	NC_014313	TGG	2	6	69867	69872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021591
1531	NC_014313	GTA	2	6	69967	69972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021591
1532	NC_014313	CGC	2	6	69994	69999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021591
1533	NC_014313	GC	3	6	70010	70015	0 %	0 %	50 %	50 %	300021591
1534	NC_014313	GAC	2	6	70025	70030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021591
1535	NC_014313	GCCG	2	8	70056	70063	0 %	0 %	50 %	50 %	300021591
1536	NC_014313	CG	3	6	70065	70070	0 %	0 %	50 %	50 %	300021591
1537	NC_014313	TG	3	6	70316	70321	0 %	50 %	50 %	0 %	300021591
1538	NC_014313	CGT	2	6	70413	70418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021591
1539	NC_014313	CGG	2	6	70495	70500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021591
1540	NC_014313	CGAG	2	8	70515	70522	25 %	0 %	50 %	25 %	300021591
1541	NC_014313	CGT	2	6	70585	70590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021591
1542	NC_014313	CGT	2	6	70620	70625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021591
1543	NC_014313	AGC	2	6	70670	70675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021591
1544	NC_014313	GCCG	2	8	70681	70688	0 %	0 %	50 %	50 %	300021591
1545	NC_014313	GCC	2	6	70739	70744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021591
1546	NC_014313	CAT	2	6	70753	70758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021591
1547	NC_014313	CGT	2	6	71143	71148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1548	NC_014313	CGG	2	6	71244	71249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021592
1549	NC_014313	GGC	2	6	71358	71363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021592
1550	NC_014313	TCA	2	6	71366	71371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021592
1551	NC_014313	TGG	2	6	71378	71383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021592
1552	NC_014313	GGC	2	6	71455	71460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021592
1553	NC_014313	CGT	2	6	71496	71501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1554	NC_014313	GCC	2	6	71502	71507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021592
1555	NC_014313	TTC	2	6	71533	71538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021592
1556	NC_014313	GGC	2	6	71581	71586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021592
1557	NC_014313	TCG	2	6	71591	71596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1558	NC_014313	ACA	2	6	71597	71602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300021592
1559	NC_014313	TCA	2	6	71624	71629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021592
1560	NC_014313	CGTTC	2	10	71631	71640	0 %	40 %	20 %	40 %	300021592
1561	NC_014313	CGCTG	2	10	71646	71655	0 %	20 %	40 %	40 %	300021592
1562	NC_014313	GCT	2	6	71727	71732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1563	NC_014313	CGT	2	6	71751	71756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1564	NC_014313	GCT	2	6	71880	71885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1565	NC_014313	CG	3	6	71908	71913	0 %	0 %	50 %	50 %	300021592
1566	NC_014313	CGT	2	6	71924	71929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1567	NC_014313	CGGT	2	8	71930	71937	0 %	25 %	50 %	25 %	300021592
1568	NC_014313	GATC	2	8	71963	71970	25 %	25 %	25 %	25 %	300021592
1569	NC_014313	CGA	2	6	72014	72019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1570	NC_014313	GAT	2	6	72042	72047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021592
1571	NC_014313	TGA	2	6	72137	72142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021592
1572	NC_014313	TTTC	2	8	72157	72164	0 %	75 %	0 %	25 %	300021592
1573	NC_014313	GCTCGG	2	12	72222	72233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300021592
1574	NC_014313	GAC	2	6	72309	72314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1575	NC_014313	CGG	2	6	72330	72335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021592
1576	NC_014313	CGGCG	2	10	72342	72351	0 %	0 %	60 %	40 %	300021592
1577	NC_014313	CGG	2	6	72357	72362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021592
1578	NC_014313	CAT	2	6	72382	72387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021592
1579	NC_014313	ACGA	2	8	72424	72431	50 %	0 %	25 %	25 %	300021592
1580	NC_014313	TCCG	2	8	72432	72439	0 %	25 %	25 %	50 %	300021592
1581	NC_014313	GC	3	6	72465	72470	0 %	0 %	50 %	50 %	300021592
1582	NC_014313	CA	3	6	72478	72483	50 %	0 %	0 %	50 %	300021592
1583	NC_014313	CTG	2	6	72547	72552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1584	NC_014313	TCGC	2	8	72640	72647	0 %	25 %	25 %	50 %	300021592
1585	NC_014313	GCATC	2	10	72654	72663	20 %	20 %	20 %	40 %	300021592
1586	NC_014313	CG	3	6	72680	72685	0 %	0 %	50 %	50 %	300021592
1587	NC_014313	CGG	2	6	72780	72785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021592
1588	NC_014313	CG	3	6	72796	72801	0 %	0 %	50 %	50 %	300021592
1589	NC_014313	CGAT	2	8	72821	72828	25 %	25 %	25 %	25 %	300021592
1590	NC_014313	CG	3	6	72840	72845	0 %	0 %	50 %	50 %	300021592
1591	NC_014313	CTG	2	6	72859	72864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1592	NC_014313	GC	3	6	72918	72923	0 %	0 %	50 %	50 %	300021592
1593	NC_014313	CTG	2	6	72937	72942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021592
1594	NC_014313	GAT	2	6	72955	72960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021592
1595	NC_014313	CG	3	6	73041	73046	0 %	0 %	50 %	50 %	300021592
1596	NC_014313	CAAG	2	8	73071	73078	50 %	0 %	25 %	25 %	300021592
1597	NC_014313	GCG	2	6	73306	73311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021593
1598	NC_014313	GAG	2	6	73312	73317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300021593
1599	NC_014313	CTT	2	6	73354	73359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021593
1600	NC_014313	CGCC	2	8	73398	73405	0 %	0 %	25 %	75 %	300021593
1601	NC_014313	GAAT	2	8	73422	73429	50 %	25 %	25 %	0 %	300021593
1602	NC_014313	GCT	2	6	73468	73473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021593
1603	NC_014313	GCC	2	6	73529	73534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021593
1604	NC_014313	GCG	2	6	73626	73631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021593
1605	NC_014313	CTG	2	6	73705	73710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021593
1606	NC_014313	ACC	2	6	73768	73773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300021593
1607	NC_014313	CCG	2	6	73854	73859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021593
1608	NC_014313	GGC	2	6	73890	73895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021593
1609	NC_014313	CCG	2	6	73997	74002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021593
1610	NC_014313	GAA	2	6	74498	74503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021594
1611	NC_014313	GCA	2	6	74506	74511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021594
1612	NC_014313	GCA	3	9	74518	74526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021594
1613	NC_014313	GGT	2	6	74551	74556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021594
1614	NC_014313	GATGC	2	10	74600	74609	20 %	20 %	40 %	20 %	300021594
1615	NC_014313	GC	4	8	74608	74615	0 %	0 %	50 %	50 %	300021594
1616	NC_014313	TCG	2	6	74621	74626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021594
1617	NC_014313	ATT	2	6	74688	74693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300021594
1618	NC_014313	TGCG	2	8	74798	74805	0 %	25 %	50 %	25 %	300021594
1619	NC_014313	GTC	2	6	74864	74869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021594
1620	NC_014313	GAC	2	6	74876	74881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021594
1621	NC_014313	CGG	2	6	74928	74933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021594
1622	NC_014313	GCCC	2	8	75025	75032	0 %	0 %	25 %	75 %	300021594
1623	NC_014313	CTG	2	6	75080	75085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021594
1624	NC_014313	GGA	2	6	75109	75114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300021594
1625	NC_014313	AAG	2	6	75191	75196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021594
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1627	NC_014313	GGC	2	6	75349	75354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021594
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1630	NC_014313	AAG	2	6	75407	75412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021594
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1744	NC_014313	GCG	2	6	80460	80465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021600
1745	NC_014313	GCG	2	6	80468	80473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021600
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1749	NC_014313	CTTGC	2	10	81114	81123	0 %	40 %	20 %	40 %	300021601
1750	NC_014313	CGT	2	6	81130	81135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021601
1751	NC_014313	GC	3	6	81154	81159	0 %	0 %	50 %	50 %	300021601
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1754	NC_014313	CGCTG	2	10	81258	81267	0 %	20 %	40 %	40 %	300021601
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1998	NC_014313	GCG	2	6	94589	94594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021618
1999	NC_014313	ATC	2	6	94616	94621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021618
2000	NC_014313	GGTGT	2	10	94633	94642	0 %	40 %	60 %	0 %	300021618

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