MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_014313	AAC	2	6	957637	957642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300022438
19003	NC_014313	ACG	2	6	957686	957691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022438
19004	NC_014313	CGG	4	12	957759	957770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022438
19005	NC_014313	AAC	2	6	957796	957801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300022438
19006	NC_014313	TCGA	2	8	957934	957941	25 %	25 %	25 %	25 %	300022438
19007	NC_014313	AAT	2	6	957961	957966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300022438
19008	NC_014313	TGC	2	6	958002	958007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022438
19009	NC_014313	ACG	2	6	958070	958075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022438
19010	NC_014313	GGT	2	6	958138	958143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022438
19011	NC_014313	ACC	2	6	958192	958197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022438
19012	NC_014313	ACA	2	6	958235	958240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300022438
19013	NC_014313	AGC	2	6	958256	958261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022438
19014	NC_014313	CGG	2	6	958278	958283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022438
19015	NC_014313	CGTT	2	8	958346	958353	0 %	50 %	25 %	25 %	300022438
19016	NC_014313	CAC	2	6	958371	958376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022438
19017	NC_014313	GCA	2	6	958408	958413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022438
19018	NC_014313	GTTC	2	8	958430	958437	0 %	50 %	25 %	25 %	300022438
19019	NC_014313	CGCTTC	2	12	958576	958587	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	300022438
19020	NC_014313	CGC	2	6	958996	959001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022439
19021	NC_014313	CG	4	8	959134	959141	0 %	0 %	50 %	50 %	300022439
19022	NC_014313	TCAC	2	8	959157	959164	25 %	25 %	0 %	50 %	300022439
19023	NC_014313	CGA	2	6	959182	959187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022439
19024	NC_014313	GCTA	2	8	959246	959253	25 %	25 %	25 %	25 %	300022439
19025	NC_014313	GCC	2	6	959587	959592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022440
19026	NC_014313	TCC	2	6	959621	959626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300022440
19027	NC_014313	CCGT	2	8	959670	959677	0 %	25 %	25 %	50 %	300022440
19028	NC_014313	AGCGCA	2	12	959726	959737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022440
19029	NC_014313	TCT	2	6	959826	959831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022440
19030	NC_014313	GAA	2	6	959873	959878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022440
19031	NC_014313	ACG	2	6	960068	960073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022440
19032	NC_014313	ACG	2	6	960075	960080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022440
19033	NC_014313	AGAA	2	8	960103	960110	75 %	0 %	25 %	0 %	300022440
19034	NC_014313	TCG	2	6	960188	960193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022440
19035	NC_014313	GATTGC	2	12	960202	960213	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300022440
19036	NC_014313	ACGA	2	8	960264	960271	50 %	0 %	25 %	25 %	300022441
19037	NC_014313	CGT	2	6	960284	960289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022441
19038	NC_014313	AGA	2	6	960295	960300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022441
19039	NC_014313	CCA	2	6	960307	960312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022441
19040	NC_014313	CGA	2	6	960320	960325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022441
19041	NC_014313	GCC	2	6	960384	960389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022441
19042	NC_014313	TC	3	6	960489	960494	0 %	50 %	0 %	50 %	300022441
19043	NC_014313	CATCG	2	10	960516	960525	20 %	20 %	20 %	40 %	300022441
19044	NC_014313	ATG	2	6	960538	960543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022441
19045	NC_014313	TCA	2	6	960545	960550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022441
19046	NC_014313	CTGC	2	8	960699	960706	0 %	25 %	25 %	50 %	300022441
19047	NC_014313	ACC	2	6	960739	960744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022441
19048	NC_014313	GCC	2	6	960745	960750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022441
19049	NC_014313	CGATCG	2	12	960788	960799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300022441
19050	NC_014313	CG	3	6	960798	960803	0 %	0 %	50 %	50 %	300022441
19051	NC_014313	CG	3	6	960841	960846	0 %	0 %	50 %	50 %	300022441
19052	NC_014313	TGAT	2	8	960871	960878	25 %	50 %	25 %	0 %	300022441
19053	NC_014313	GCG	2	6	960972	960977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022441
19054	NC_014313	GCC	2	6	960993	960998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022441
19055	NC_014313	GTC	2	6	961045	961050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022441
19056	NC_014313	AGC	2	6	961078	961083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022441
19057	NC_014313	GAT	2	6	961086	961091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022441
19058	NC_014313	AAG	2	6	961110	961115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022441
19059	NC_014313	GAT	2	6	961158	961163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022441
19060	NC_014313	GCC	2	6	961231	961236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022441
19061	NC_014313	GGTC	2	8	961269	961276	0 %	25 %	50 %	25 %	300022441
19062	NC_014313	GCC	2	6	961284	961289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022441
19063	NC_014313	AGA	2	6	961306	961311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022441
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19065	NC_014313	CGG	2	6	961379	961384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022441
19066	NC_014313	CGA	2	6	961430	961435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022441
19067	NC_014313	CTG	2	6	961518	961523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022441
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19074	NC_014313	GAT	2	6	962427	962432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022442
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19077	NC_014313	CGC	2	6	962575	962580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022442
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19079	NC_014313	TCA	2	6	962752	962757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022442
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19083	NC_014313	GTCA	2	8	963018	963025	25 %	25 %	25 %	25 %	300022442
19084	NC_014313	GGC	2	6	963104	963109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022442
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19089	NC_014313	GGC	2	6	963268	963273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022442
19090	NC_014313	ATC	2	6	963279	963284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022442
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19095	NC_014313	CGT	2	6	963530	963535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022442
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19099	NC_014313	GC	3	6	963723	963728	0 %	0 %	50 %	50 %	300022442
19100	NC_014313	CAT	2	6	963743	963748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022442
19101	NC_014313	GTG	2	6	963809	963814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022442
19102	NC_014313	CGA	2	6	963832	963837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022442
19103	NC_014313	TTC	2	6	963843	963848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022442
19104	NC_014313	CTT	2	6	963899	963904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022442
19105	NC_014313	GC	4	8	963941	963948	0 %	0 %	50 %	50 %	300022442
19106	NC_014313	TCG	2	6	964015	964020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022442
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19108	NC_014313	CCG	2	6	964181	964186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022442
19109	NC_014313	T	6	6	964221	964226	0 %	100 %	0 %	0 %	300022442
19110	NC_014313	ATG	2	6	964471	964476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022442
19111	NC_014313	CA	3	6	964531	964536	50 %	0 %	0 %	50 %	300022442
19112	NC_014313	TCG	2	6	964555	964560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022442
19113	NC_014313	CGA	2	6	964588	964593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022442
19114	NC_014313	CTG	2	6	964644	964649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022442
19115	NC_014313	ACGA	2	8	964670	964677	50 %	0 %	25 %	25 %	300022442
19116	NC_014313	GACC	2	8	964794	964801	25 %	0 %	25 %	50 %	300022442
19117	NC_014313	GA	3	6	964855	964860	50 %	0 %	50 %	0 %	300022442
19118	NC_014313	CAT	2	6	964988	964993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022442
19119	NC_014313	TGA	2	6	965179	965184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022442
19120	NC_014313	CGGC	2	8	965185	965192	0 %	0 %	50 %	50 %	300022442
19121	NC_014313	CGG	2	6	965276	965281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022442
19122	NC_014313	CCG	2	6	965470	965475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022443
19123	NC_014313	GGC	2	6	965496	965501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022443
19124	NC_014313	GAT	2	6	965532	965537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022443
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19128	NC_014313	TTC	2	6	965708	965713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022443
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19132	NC_014313	CTG	2	6	965818	965823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022443
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19135	NC_014313	GC	4	8	965866	965873	0 %	0 %	50 %	50 %	300022443
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19143	NC_014313	CGGAT	2	10	966218	966227	20 %	20 %	40 %	20 %	300022443
19144	NC_014313	GAC	2	6	966342	966347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022443
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19148	NC_014313	CTG	2	6	966732	966737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022444
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19150	NC_014313	CAG	2	6	966824	966829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022444
19151	NC_014313	TCG	2	6	966870	966875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022444
19152	NC_014313	TGG	2	6	966891	966896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022444
19153	NC_014313	CG	3	6	966936	966941	0 %	0 %	50 %	50 %	300022444
19154	NC_014313	CGC	2	6	966944	966949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022444
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19158	NC_014313	CGA	2	6	967114	967119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022444
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19178	NC_014313	TGAGCT	2	12	968072	968083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300022444
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19225	NC_014313	CTC	2	6	971915	971920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300022448
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19475	NC_014313	GCT	2	6	982889	982894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022454
19476	NC_014313	CG	3	6	982902	982907	0 %	0 %	50 %	50 %	300022454
19477	NC_014313	CT	3	6	982986	982991	0 %	50 %	0 %	50 %	300022455
19478	NC_014313	GTC	2	6	983002	983007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022455
19479	NC_014313	GGC	2	6	983022	983027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022455
19480	NC_014313	GCCGAA	2	12	983068	983079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022455
19481	NC_014313	GGCC	2	8	983080	983087	0 %	0 %	50 %	50 %	300022455
19482	NC_014313	CGA	2	6	983105	983110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022455
19483	NC_014313	CAT	2	6	983166	983171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022455
19484	NC_014313	TGCG	2	8	983204	983211	0 %	25 %	50 %	25 %	300022455
19485	NC_014313	TCG	2	6	983402	983407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022456
19486	NC_014313	GCG	2	6	983436	983441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022456
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19488	NC_014313	TCG	2	6	983499	983504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022456
19489	NC_014313	GAT	2	6	983521	983526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022456
19490	NC_014313	CAG	2	6	983557	983562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022456
19491	NC_014313	ACG	2	6	983574	983579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022456
19492	NC_014313	GGC	2	6	983795	983800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022457
19493	NC_014313	CGA	2	6	983816	983821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022457
19494	NC_014313	TTG	2	6	983822	983827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022457
19495	NC_014313	TCA	2	6	983865	983870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022457
19496	NC_014313	CGT	2	6	983963	983968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022457
19497	NC_014313	ACGGCG	2	12	984088	984099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300022458
19498	NC_014313	CGC	2	6	984117	984122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022458
19499	NC_014313	CGC	2	6	984167	984172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022458
19500	NC_014313	GCGCC	2	10	984212	984221	0 %	0 %	40 %	60 %	300022458

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