MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014313	GCA	2	6	794963	794968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022292
16002	NC_014313	TCT	2	6	795132	795137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022293
16003	NC_014313	AG	3	6	795159	795164	50 %	0 %	50 %	0 %	300022293
16004	NC_014313	CGA	3	9	795169	795177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022293
16005	NC_014313	ATA	2	6	795192	795197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300022293
16006	NC_014313	AGC	2	6	795202	795207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022293
16007	NC_014313	GGC	2	6	795263	795268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022293
16008	NC_014313	GTC	2	6	795344	795349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022293
16009	NC_014313	ATC	2	6	795429	795434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022293
16010	NC_014313	CGC	2	6	795469	795474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022293
16011	NC_014313	GA	3	6	795495	795500	50 %	0 %	50 %	0 %	300022293
16012	NC_014313	GAA	2	6	796743	796748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022294
16013	NC_014313	AGC	2	6	796803	796808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16014	NC_014313	TC	3	6	796852	796857	0 %	50 %	0 %	50 %	300022294
16015	NC_014313	GCT	2	6	796896	796901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16016	NC_014313	CGGT	2	8	796942	796949	0 %	25 %	50 %	25 %	300022294
16017	NC_014313	CGT	2	6	796955	796960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16018	NC_014313	CGA	2	6	796997	797002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16019	NC_014313	CTG	2	6	797052	797057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16020	NC_014313	GAC	2	6	797060	797065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16021	NC_014313	GTT	2	6	797082	797087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022294
16022	NC_014313	CTA	2	6	797192	797197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022294
16023	NC_014313	CGAATG	2	12	797221	797232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300022294
16024	NC_014313	GC	3	6	797391	797396	0 %	0 %	50 %	50 %	300022294
16025	NC_014313	GAT	2	6	797405	797410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022294
16026	NC_014313	ACG	2	6	797422	797427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16027	NC_014313	TAA	2	6	797432	797437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300022294
16028	NC_014313	CTG	2	6	797461	797466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16029	NC_014313	ACG	2	6	797496	797501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022294
16030	NC_014313	GGCG	2	8	797559	797566	0 %	0 %	75 %	25 %	300022294
16031	NC_014313	GAG	2	6	797593	797598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300022294
16032	NC_014313	TCA	2	6	797624	797629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022295
16033	NC_014313	GCT	2	6	797640	797645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022295
16034	NC_014313	GTC	2	6	797728	797733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022295
16035	NC_014313	T	6	6	797846	797851	0 %	100 %	0 %	0 %	300022296
16036	NC_014313	GC	3	6	797868	797873	0 %	0 %	50 %	50 %	300022296
16037	NC_014313	CTT	2	6	798002	798007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022296
16038	NC_014313	TCA	2	6	798057	798062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022296
16039	NC_014313	TCGCCT	2	12	798483	798494	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	300022297
16040	NC_014313	GGGA	2	8	798536	798543	25 %	0 %	75 %	0 %	300022297
16041	NC_014313	GAT	2	6	798557	798562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022297
16042	NC_014313	AG	3	6	798691	798696	50 %	0 %	50 %	0 %	300022297
16043	NC_014313	CGA	2	6	798712	798717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022297
16044	NC_014313	GAG	2	6	798718	798723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300022297
16045	NC_014313	GAC	2	6	799216	799221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022298
16046	NC_014313	CG	3	6	799274	799279	0 %	0 %	50 %	50 %	300022298
16047	NC_014313	CG	4	8	799320	799327	0 %	0 %	50 %	50 %	300022298
16048	NC_014313	CTG	2	6	799355	799360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022298
16049	NC_014313	GAT	2	6	799513	799518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022298
16050	NC_014313	GC	3	6	799568	799573	0 %	0 %	50 %	50 %	300022298
16051	NC_014313	GGAT	2	8	799627	799634	25 %	25 %	50 %	0 %	300022298
16052	NC_014313	GCGA	2	8	799700	799707	25 %	0 %	50 %	25 %	300022298
16053	NC_014313	GC	5	10	799721	799730	0 %	0 %	50 %	50 %	300022298
16054	NC_014313	TCG	2	6	799735	799740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022298
16055	NC_014313	CTG	2	6	799745	799750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022298
16056	NC_014313	CGA	2	6	799801	799806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022298
16057	NC_014313	TGC	2	6	799839	799844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022298
16058	NC_014313	GAA	2	6	799876	799881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022298
16059	NC_014313	ATC	2	6	799913	799918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022298
16060	NC_014313	GAG	2	6	799925	799930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300022298
16061	NC_014313	TCA	2	6	799951	799956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022298
16062	NC_014313	CG	3	6	800048	800053	0 %	0 %	50 %	50 %	300022298
16063	NC_014313	TCG	2	6	800055	800060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022298
16064	NC_014313	GC	3	6	800075	800080	0 %	0 %	50 %	50 %	300022298
16065	NC_014313	CGG	2	6	800175	800180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022298
16066	NC_014313	CGGGGT	2	12	800182	800193	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300022298
16067	NC_014313	CAGAT	2	10	800301	800310	40 %	20 %	20 %	20 %	300022298
16068	NC_014313	CGAT	2	8	800328	800335	25 %	25 %	25 %	25 %	300022298
16069	NC_014313	CGC	2	6	800379	800384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022298
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16071	NC_014313	CG	3	6	800579	800584	0 %	0 %	50 %	50 %	300022298
16072	NC_014313	GGC	2	6	800620	800625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022298
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16074	NC_014313	ATC	2	6	800679	800684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022298
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16089	NC_014313	CG	3	6	801265	801270	0 %	0 %	50 %	50 %	300022298
16090	NC_014313	CCG	3	9	801296	801304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022298
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16099	NC_014313	ATCGC	2	10	801934	801943	20 %	20 %	20 %	40 %	300022299
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16102	NC_014313	GTC	2	6	802035	802040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022299
16103	NC_014313	GC	3	6	802197	802202	0 %	0 %	50 %	50 %	300022300
16104	NC_014313	CGC	2	6	802230	802235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022300
16105	NC_014313	ATC	2	6	802252	802257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022300
16106	NC_014313	GGC	3	9	802260	802268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022300
16107	NC_014313	T	7	7	802273	802279	0 %	100 %	0 %	0 %	300022300
16108	NC_014313	CGA	2	6	802361	802366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022300
16109	NC_014313	CGAG	2	8	802380	802387	25 %	0 %	50 %	25 %	300022300
16110	NC_014313	TGTT	2	8	802400	802407	0 %	75 %	25 %	0 %	300022300
16111	NC_014313	GATC	2	8	802444	802451	25 %	25 %	25 %	25 %	300022300
16112	NC_014313	TCA	2	6	802598	802603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022300
16113	NC_014313	TGC	2	6	802609	802614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022300
16114	NC_014313	CG	3	6	802624	802629	0 %	0 %	50 %	50 %	300022300
16115	NC_014313	CGC	2	6	802667	802672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022300
16116	NC_014313	GAA	3	9	802675	802683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022300
16117	NC_014313	AG	3	6	802888	802893	50 %	0 %	50 %	0 %	300022301
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16119	NC_014313	ACG	2	6	803039	803044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022301
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16237	NC_014313	GGCGCT	2	12	808743	808754	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300022306
16238	NC_014313	TGCAGT	2	12	808764	808775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300022306
16239	NC_014313	CG	3	6	808847	808852	0 %	0 %	50 %	50 %	300022306
16240	NC_014313	ACG	2	6	808862	808867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022306
16241	NC_014313	CGG	2	6	808889	808894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022306
16242	NC_014313	ACG	2	6	808900	808905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022306
16243	NC_014313	GGC	2	6	808941	808946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022306
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16245	NC_014313	ACC	2	6	809021	809026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022306
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16251	NC_014313	CAG	2	6	809461	809466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022307
16252	NC_014313	CCG	2	6	809592	809597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022307
16253	NC_014313	CG	3	6	809716	809721	0 %	0 %	50 %	50 %	300022307
16254	NC_014313	TGA	2	6	809730	809735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022307
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16261	NC_014313	TGA	2	6	810214	810219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022308
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16270	NC_014313	TGC	2	6	810611	810616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022308
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16273	NC_014313	TTC	2	6	810708	810713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022308
16274	NC_014313	CTGATG	2	12	810726	810737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300022308
16275	NC_014313	TGG	2	6	810802	810807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022308
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16278	NC_014313	A	6	6	811020	811025	100 %	0 %	0 %	0 %	300022308
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16286	NC_014313	GGCT	2	8	811290	811297	0 %	25 %	50 %	25 %	300022308
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16339	NC_014313	GA	3	6	814716	814721	50 %	0 %	50 %	0 %	300022311
16340	NC_014313	GTA	2	6	814875	814880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022311
16341	NC_014313	TGA	2	6	814939	814944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022311
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16343	NC_014313	CGT	2	6	815012	815017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022311
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16345	NC_014313	GTC	2	6	815086	815091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022311
16346	NC_014313	CGC	2	6	815103	815108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022311
16347	NC_014313	GGC	2	6	815109	815114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022311
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16349	NC_014313	GACT	2	8	815150	815157	25 %	25 %	25 %	25 %	300022311
16350	NC_014313	GCA	2	6	815529	815534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022312
16351	NC_014313	CG	3	6	815581	815586	0 %	0 %	50 %	50 %	300022312
16352	NC_014313	ATG	2	6	815603	815608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022312
16353	NC_014313	GCC	2	6	815614	815619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022312
16354	NC_014313	CGCGA	2	10	815698	815707	20 %	0 %	40 %	40 %	300022312
16355	NC_014313	TGGTCA	2	12	815724	815735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300022312
16356	NC_014313	GAT	2	6	815766	815771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022312
16357	NC_014313	GGC	2	6	815815	815820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022312
16358	NC_014313	TCG	2	6	815870	815875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022312
16359	NC_014313	G	6	6	815878	815883	0 %	0 %	100 %	0 %	300022312
16360	NC_014313	CCG	2	6	815884	815889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022312
16361	NC_014313	TGC	2	6	815901	815906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022312
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16363	NC_014313	ACG	2	6	815980	815985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022312
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16365	NC_014313	TCG	3	9	816032	816040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022312
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16367	NC_014313	CTT	2	6	816150	816155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022312
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16369	NC_014313	GCT	2	6	816216	816221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022312
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16372	NC_014313	GAT	2	6	816364	816369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022312
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16426	NC_014313	CTGACG	2	12	819706	819717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300022315
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16431	NC_014313	TCG	2	6	819943	819948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022315
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16450	NC_014313	GCCG	2	8	821393	821400	0 %	0 %	50 %	50 %	300022316
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16455	NC_014313	GGGA	2	8	821545	821552	25 %	0 %	75 %	0 %	300022316
16456	NC_014313	CAT	2	6	821593	821598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022316
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16460	NC_014313	TGC	2	6	821765	821770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022317
16461	NC_014313	GAC	2	6	821798	821803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022317
16462	NC_014313	ATG	2	6	821808	821813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022317
16463	NC_014313	GGAT	2	8	821895	821902	25 %	25 %	50 %	0 %	300022318
16464	NC_014313	GTC	2	6	821990	821995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022318
16465	NC_014313	GCA	2	6	822006	822011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022318
16466	NC_014313	GCC	2	6	822068	822073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022319
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16468	NC_014313	TGAGC	2	10	822216	822225	20 %	20 %	40 %	20 %	300022319
16469	NC_014313	A	6	6	822399	822404	100 %	0 %	0 %	0 %	300022319
16470	NC_014313	ACG	2	6	822408	822413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022319
16471	NC_014313	TGT	2	6	822423	822428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022319
16472	NC_014313	CCGA	2	8	822553	822560	25 %	0 %	25 %	50 %	300022319
16473	NC_014313	CGA	2	6	822639	822644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022319
16474	NC_014313	CGG	2	6	822651	822656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022319
16475	NC_014313	TCG	2	6	822722	822727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022319
16476	NC_014313	CGA	2	6	822747	822752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022319
16477	NC_014313	GC	3	6	822799	822804	0 %	0 %	50 %	50 %	300022319
16478	NC_014313	TCC	2	6	822824	822829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300022319
16479	NC_014313	CCCGA	2	10	822917	822926	20 %	0 %	20 %	60 %	300022319
16480	NC_014313	GAGT	2	8	822999	823006	25 %	25 %	50 %	0 %	300022319
16481	NC_014313	GCA	2	6	823011	823016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022319
16482	NC_014313	ATG	2	6	823043	823048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022319
16483	NC_014313	CCGG	2	8	823063	823070	0 %	0 %	50 %	50 %	300022319
16484	NC_014313	GC	3	6	823161	823166	0 %	0 %	50 %	50 %	300022319
16485	NC_014313	GCC	2	6	823175	823180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022319
16486	NC_014313	GAT	2	6	823189	823194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022319
16487	NC_014313	TGT	2	6	823200	823205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022319
16488	NC_014313	CGC	2	6	823227	823232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022319
16489	NC_014313	GCT	2	6	823239	823244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022319
16490	NC_014313	CGA	2	6	823419	823424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022319
16491	NC_014313	AGC	2	6	823447	823452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022319
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16493	NC_014313	GCT	2	6	824004	824009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022320
16494	NC_014313	GTT	2	6	824078	824083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022320
16495	NC_014313	GCT	2	6	824091	824096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022320
16496	NC_014313	CGC	2	6	824155	824160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022320
16497	NC_014313	AAG	2	6	824177	824182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022320
16498	NC_014313	TGTCGT	2	12	824194	824205	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	300022320
16499	NC_014313	AGA	2	6	824221	824226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022320
16500	NC_014313	TTG	2	6	824241	824246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022320

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