MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014313	ATCGCC	2	12	684870	684881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300022190
14002	NC_014313	ACC	2	6	684929	684934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022190
14003	NC_014313	ATC	2	6	684965	684970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022190
14004	NC_014313	TCA	2	6	685098	685103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022191
14005	NC_014313	AAC	2	6	685144	685149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300022191
14006	NC_014313	GAC	2	6	685169	685174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022191
14007	NC_014313	TTG	2	6	685224	685229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022191
14008	NC_014313	CACG	2	8	685233	685240	25 %	0 %	25 %	50 %	300022191
14009	NC_014313	TCT	2	6	685359	685364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022191
14010	NC_014313	GGT	2	6	685438	685443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022191
14011	NC_014313	ACG	2	6	685542	685547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022191
14012	NC_014313	T	6	6	685553	685558	0 %	100 %	0 %	0 %	300022191
14013	NC_014313	GTGCA	2	10	685636	685645	20 %	20 %	40 %	20 %	300022191
14014	NC_014313	CG	3	6	685646	685651	0 %	0 %	50 %	50 %	300022191
14015	NC_014313	GTC	2	6	685662	685667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022191
14016	NC_014313	CGG	2	6	685712	685717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022191
14017	NC_014313	AAG	2	6	685786	685791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022191
14018	NC_014313	GCT	2	6	685826	685831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022191
14019	NC_014313	GCC	2	6	685850	685855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022191
14020	NC_014313	GCG	2	6	685859	685864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022191
14021	NC_014313	GCT	2	6	685874	685879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022191
14022	NC_014313	CAA	2	6	685995	686000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300022191
14023	NC_014313	TCG	2	6	686027	686032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022191
14024	NC_014313	AGA	2	6	686088	686093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022191
14025	NC_014313	TGGG	2	8	686130	686137	0 %	25 %	75 %	0 %	300022191
14026	NC_014313	GAA	2	6	686154	686159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022191
14027	NC_014313	CGC	2	6	686658	686663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14028	NC_014313	GCCC	2	8	686680	686687	0 %	0 %	25 %	75 %	300022192
14029	NC_014313	GC	3	6	686760	686765	0 %	0 %	50 %	50 %	300022192
14030	NC_014313	CGC	2	6	686771	686776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14031	NC_014313	TCC	2	6	686792	686797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300022192
14032	NC_014313	CGC	2	6	686858	686863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14033	NC_014313	CGGT	2	8	686881	686888	0 %	25 %	50 %	25 %	300022192
14034	NC_014313	AGC	2	6	686907	686912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14035	NC_014313	CGA	2	6	686990	686995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14036	NC_014313	TCG	2	6	687056	687061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14037	NC_014313	TCGGCG	2	12	687109	687120	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300022192
14038	NC_014313	GC	3	6	687146	687151	0 %	0 %	50 %	50 %	300022192
14039	NC_014313	CG	4	8	687254	687261	0 %	0 %	50 %	50 %	300022192
14040	NC_014313	GC	3	6	687294	687299	0 %	0 %	50 %	50 %	300022192
14041	NC_014313	CAG	2	6	687300	687305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14042	NC_014313	CGA	2	6	687324	687329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14043	NC_014313	GCC	2	6	687397	687402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14044	NC_014313	AAAG	2	8	687429	687436	75 %	0 %	25 %	0 %	300022192
14045	NC_014313	CGC	2	6	687441	687446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14046	NC_014313	CAG	2	6	687459	687464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14047	NC_014313	GC	3	6	687496	687501	0 %	0 %	50 %	50 %	300022192
14048	NC_014313	GCC	2	6	687525	687530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14049	NC_014313	GCG	2	6	687550	687555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022192
14050	NC_014313	CG	3	6	687604	687609	0 %	0 %	50 %	50 %	300022192
14051	NC_014313	CGGCTG	2	12	687632	687643	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300022192
14052	NC_014313	GTT	2	6	687711	687716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022192
14053	NC_014313	AGCGC	2	10	687775	687784	20 %	0 %	40 %	40 %	300022192
14054	NC_014313	GCT	2	6	687813	687818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14055	NC_014313	TCCA	2	8	687823	687830	25 %	25 %	0 %	50 %	300022192
14056	NC_014313	ATA	2	6	687835	687840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300022192
14057	NC_014313	CGG	2	6	687855	687860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022192
14058	NC_014313	TTC	2	6	688056	688061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022192
14059	NC_014313	CGC	2	6	688095	688100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14060	NC_014313	GGC	2	6	688168	688173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022192
14061	NC_014313	CGG	2	6	688183	688188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022192
14062	NC_014313	TCC	2	6	688219	688224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300022192
14063	NC_014313	GCG	2	6	688282	688287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022192
14064	NC_014313	CTTCG	2	10	688341	688350	0 %	40 %	20 %	40 %	300022192
14065	NC_014313	ACCAA	2	10	688374	688383	60 %	0 %	0 %	40 %	300022192
14066	NC_014313	GC	3	6	688393	688398	0 %	0 %	50 %	50 %	300022192
14067	NC_014313	CGA	2	6	688469	688474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14068	NC_014313	TCG	2	6	688483	688488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14069	NC_014313	CAT	2	6	688535	688540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022192
14070	NC_014313	TCG	2	6	688568	688573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14071	NC_014313	TCG	2	6	688594	688599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14072	NC_014313	GGC	2	6	688611	688616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022192
14073	NC_014313	CCG	2	6	688626	688631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14074	NC_014313	GGCA	2	8	688659	688666	25 %	0 %	50 %	25 %	300022192
14075	NC_014313	GCG	2	6	688708	688713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022192
14076	NC_014313	GC	3	6	688741	688746	0 %	0 %	50 %	50 %	300022192
14077	NC_014313	CGA	2	6	688754	688759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022192
14078	NC_014313	GCC	2	6	688792	688797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022192
14079	NC_014313	TTTG	2	8	688944	688951	0 %	75 %	25 %	0 %	300022193
14080	NC_014313	GCA	2	6	688993	688998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022193
14081	NC_014313	CGA	2	6	689053	689058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022193
14082	NC_014313	GGC	3	9	689089	689097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022193
14083	NC_014313	GC	3	6	689137	689142	0 %	0 %	50 %	50 %	300022193
14084	NC_014313	AGCG	2	8	689162	689169	25 %	0 %	50 %	25 %	300022193
14085	NC_014313	GCA	2	6	689199	689204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022194
14086	NC_014313	TGG	2	6	689226	689231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022194
14087	NC_014313	ATCG	2	8	689389	689396	25 %	25 %	25 %	25 %	300022194
14088	NC_014313	CG	3	6	689418	689423	0 %	0 %	50 %	50 %	300022194
14089	NC_014313	TCGGCA	2	12	689426	689437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300022194
14090	NC_014313	GGC	2	6	689467	689472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022194
14091	NC_014313	GCA	2	6	689480	689485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022194
14092	NC_014313	ATCGC	2	10	689507	689516	20 %	20 %	20 %	40 %	300022194
14093	NC_014313	GC	3	6	689543	689548	0 %	0 %	50 %	50 %	300022194
14094	NC_014313	TTCGA	2	10	689606	689615	20 %	40 %	20 %	20 %	300022194
14095	NC_014313	CGC	2	6	689635	689640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022194
14096	NC_014313	GC	3	6	689661	689666	0 %	0 %	50 %	50 %	300022194
14097	NC_014313	GCG	2	6	689686	689691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022194
14098	NC_014313	GTTTC	2	10	689772	689781	0 %	60 %	20 %	20 %	300022194
14099	NC_014313	GGC	2	6	689782	689787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022194
14100	NC_014313	CGA	2	6	689799	689804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022194
14101	NC_014313	GCG	2	6	689831	689836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022194
14102	NC_014313	GGC	2	6	690355	690360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022195
14103	NC_014313	TGTTC	2	10	690366	690375	0 %	60 %	20 %	20 %	300022195
14104	NC_014313	TCC	2	6	690418	690423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300022195
14105	NC_014313	CT	3	6	690461	690466	0 %	50 %	0 %	50 %	300022195
14106	NC_014313	CGA	2	6	690484	690489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022195
14107	NC_014313	AAT	2	6	690503	690508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300022195
14108	NC_014313	TGT	2	6	690527	690532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022195
14109	NC_014313	TGC	2	6	690619	690624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022195
14110	NC_014313	CCA	2	6	690647	690652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022195
14111	NC_014313	GATAGC	2	12	690728	690739	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300022195
14112	NC_014313	GCC	2	6	690835	690840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022195
14113	NC_014313	GTCG	2	8	690855	690862	0 %	25 %	50 %	25 %	300022195
14114	NC_014313	CAG	2	6	691002	691007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022195
14115	NC_014313	GAT	2	6	691131	691136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022195
14116	NC_014313	TG	3	6	691324	691329	0 %	50 %	50 %	0 %	300022196
14117	NC_014313	GCC	2	6	691364	691369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022196
14118	NC_014313	CGA	2	6	691671	691676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022196
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14120	NC_014313	TTG	2	6	691784	691789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022196
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14122	NC_014313	GCT	2	6	691918	691923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022196
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14241	NC_014313	CGT	3	9	698237	698245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022202
14242	NC_014313	GCA	2	6	698260	698265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022202
14243	NC_014313	GCA	2	6	698303	698308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022202
14244	NC_014313	TCG	2	6	698380	698385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022202
14245	NC_014313	TCG	2	6	698413	698418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022202
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14248	NC_014313	GCA	2	6	698576	698581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022202
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14265	NC_014313	GACC	2	8	699197	699204	25 %	0 %	25 %	50 %	300022202
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14345	NC_014313	GC	3	6	703296	703301	0 %	0 %	50 %	50 %	300022206
14346	NC_014313	GC	3	6	703344	703349	0 %	0 %	50 %	50 %	300022206
14347	NC_014313	CGAG	2	8	703384	703391	25 %	0 %	50 %	25 %	300022206
14348	NC_014313	TCCG	2	8	703405	703412	0 %	25 %	25 %	50 %	300022206
14349	NC_014313	GGC	2	6	703420	703425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022206
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14351	NC_014313	A	7	7	703560	703566	100 %	0 %	0 %	0 %	300022206
14352	NC_014313	GC	3	6	703651	703656	0 %	0 %	50 %	50 %	300022206
14353	NC_014313	TGGCCT	2	12	703697	703708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022206
14354	NC_014313	TGC	3	9	703792	703800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022206
14355	NC_014313	GCT	2	6	703814	703819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022206
14356	NC_014313	CGT	2	6	703823	703828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022206
14357	NC_014313	GGC	2	6	703892	703897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022206
14358	NC_014313	TTC	2	6	703932	703937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022206
14359	NC_014313	CGAA	2	8	703950	703957	50 %	0 %	25 %	25 %	300022206
14360	NC_014313	T	6	6	704042	704047	0 %	100 %	0 %	0 %	300022207
14361	NC_014313	TGA	2	6	704073	704078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022207
14362	NC_014313	GCG	2	6	704241	704246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022207
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14364	NC_014313	GGC	2	6	704329	704334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022207
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14366	NC_014313	TGC	2	6	704382	704387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022207
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14390	NC_014313	GTC	2	6	705594	705599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022209
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14393	NC_014313	CGA	2	6	705808	705813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022209
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14397	NC_014313	ACTC	2	8	706105	706112	25 %	25 %	0 %	50 %	300022210
14398	NC_014313	GTC	2	6	706113	706118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022210
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14422	NC_014313	TCG	2	6	707202	707207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022211
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14464	NC_014313	CTG	2	6	709652	709657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022214
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14468	NC_014313	CG	3	6	709942	709947	0 %	0 %	50 %	50 %	300022214
14469	NC_014313	TGC	2	6	709980	709985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022214
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14472	NC_014313	CGG	2	6	710087	710092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022214
14473	NC_014313	CGCT	2	8	710101	710108	0 %	25 %	25 %	50 %	300022214
14474	NC_014313	GC	3	6	710115	710120	0 %	0 %	50 %	50 %	300022214
14475	NC_014313	GCG	2	6	710188	710193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022214
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14477	NC_014313	GAC	2	6	710251	710256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022214
14478	NC_014313	GGC	2	6	710398	710403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022214
14479	NC_014313	TGC	2	6	710441	710446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022214
14480	NC_014313	TGC	2	6	710457	710462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022214
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14482	NC_014313	CG	3	6	710620	710625	0 %	0 %	50 %	50 %	300022214
14483	NC_014313	CGG	2	6	710660	710665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022214
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