MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014313	GCC	2	6	535567	535572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022042
11002	NC_014313	GAA	2	6	535579	535584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022042
11003	NC_014313	TCT	2	6	535599	535604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022042
11004	NC_014313	CAT	2	6	535621	535626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022042
11005	NC_014313	TCA	2	6	535662	535667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022042
11006	NC_014313	CGG	2	6	535677	535682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022042
11007	NC_014313	GCA	2	6	535749	535754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022042
11008	NC_014313	GATGCC	2	12	535789	535800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300022042
11009	NC_014313	TTC	2	6	535869	535874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022042
11010	NC_014313	GCA	2	6	535893	535898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022042
11011	NC_014313	AGC	2	6	536000	536005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022042
11012	NC_014313	CAT	2	6	536049	536054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022042
11013	NC_014313	CGC	2	6	536088	536093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022042
11014	NC_014313	CAGT	2	8	536130	536137	25 %	25 %	25 %	25 %	300022042
11015	NC_014313	CGC	2	6	536149	536154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022042
11016	NC_014313	GC	3	6	536165	536170	0 %	0 %	50 %	50 %	300022042
11017	NC_014313	CGA	2	6	536244	536249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022042
11018	NC_014313	CGG	2	6	536299	536304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022042
11019	NC_014313	GGC	2	6	536318	536323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022042
11020	NC_014313	GCG	2	6	536374	536379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022042
11021	NC_014313	CTT	2	6	536389	536394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022042
11022	NC_014313	TGG	2	6	536518	536523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022042
11023	NC_014313	GA	4	8	536555	536562	50 %	0 %	50 %	0 %	300022042
11024	NC_014313	T	6	6	536626	536631	0 %	100 %	0 %	0 %	300022042
11025	NC_014313	GAC	2	6	537247	537252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022043
11026	NC_014313	AAGA	2	8	537377	537384	75 %	0 %	25 %	0 %	300022043
11027	NC_014313	GGCGA	2	10	537512	537521	20 %	0 %	60 %	20 %	300022043
11028	NC_014313	CCGA	2	8	537548	537555	25 %	0 %	25 %	50 %	300022043
11029	NC_014313	GCCAT	2	10	537594	537603	20 %	20 %	20 %	40 %	300022043
11030	NC_014313	CGG	2	6	537630	537635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022043
11031	NC_014313	ACG	2	6	537638	537643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022043
11032	NC_014313	GC	3	6	537648	537653	0 %	0 %	50 %	50 %	300022043
11033	NC_014313	CGA	2	6	537847	537852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022043
11034	NC_014313	CTT	2	6	537862	537867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022043
11035	NC_014313	TCG	3	9	537873	537881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022043
11036	NC_014313	GAA	2	6	537886	537891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022043
11037	NC_014313	CGT	2	6	537901	537906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022043
11038	NC_014313	CGG	2	6	537930	537935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022043
11039	NC_014313	CGA	2	6	537949	537954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022043
11040	NC_014313	TG	3	6	538018	538023	0 %	50 %	50 %	0 %	300022043
11041	NC_014313	CGAT	2	8	538093	538100	25 %	25 %	25 %	25 %	300022044
11042	NC_014313	CGT	2	6	538168	538173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022044
11043	NC_014313	CG	3	6	538189	538194	0 %	0 %	50 %	50 %	300022044
11044	NC_014313	GCA	2	6	538196	538201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022044
11045	NC_014313	CTA	2	6	538259	538264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022044
11046	NC_014313	GCG	2	6	538267	538272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022044
11047	NC_014313	GGC	2	6	538286	538291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022044
11048	NC_014313	ATG	2	6	538335	538340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022044
11049	NC_014313	GTC	2	6	538350	538355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022044
11050	NC_014313	GCCA	2	8	538368	538375	25 %	0 %	25 %	50 %	300022044
11051	NC_014313	GGC	2	6	538398	538403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022044
11052	NC_014313	CAT	2	6	538463	538468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022044
11053	NC_014313	TCG	2	6	538522	538527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022044
11054	NC_014313	GCG	2	6	538531	538536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022044
11055	NC_014313	CGAAG	2	10	538568	538577	40 %	0 %	40 %	20 %	300022044
11056	NC_014313	TGA	2	6	538770	538775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022044
11057	NC_014313	CGC	2	6	538797	538802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022045
11058	NC_014313	CGA	2	6	538819	538824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022045
11059	NC_014313	CGT	2	6	538844	538849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022045
11060	NC_014313	GGC	3	9	538880	538888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022045
11061	NC_014313	CGA	2	6	538912	538917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022045
11062	NC_014313	CCT	2	6	538918	538923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300022045
11063	NC_014313	CGA	2	6	538980	538985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022045
11064	NC_014313	GAA	2	6	539011	539016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022045
11065	NC_014313	GC	3	6	539064	539069	0 %	0 %	50 %	50 %	300022045
11066	NC_014313	CGA	3	9	539124	539132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022045
11067	NC_014313	CGG	2	6	539140	539145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022045
11068	NC_014313	GAA	2	6	539156	539161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022045
11069	NC_014313	GTT	2	6	539252	539257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022045
11070	NC_014313	CGG	4	12	539278	539289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022045
11071	NC_014313	TGC	2	6	539292	539297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022045
11072	NC_014313	AGA	2	6	539304	539309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022045
11073	NC_014313	CTA	2	6	539482	539487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022045
11074	NC_014313	GGC	2	6	539546	539551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022045
11075	NC_014313	TCCG	2	8	539610	539617	0 %	25 %	25 %	50 %	300022045
11076	NC_014313	ACG	2	6	539864	539869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022045
11077	NC_014313	GCCG	2	8	539909	539916	0 %	0 %	50 %	50 %	300022045
11078	NC_014313	TGA	2	6	539940	539945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022045
11079	NC_014313	CGC	2	6	539971	539976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022045
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11081	NC_014313	GAAC	2	8	540066	540073	50 %	0 %	25 %	25 %	300022045
11082	NC_014313	AAT	2	6	540089	540094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300022045
11083	NC_014313	GCGG	2	8	540098	540105	0 %	0 %	75 %	25 %	300022045
11084	NC_014313	CGA	2	6	540208	540213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022046
11085	NC_014313	GCC	2	6	540447	540452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022046
11086	NC_014313	CG	3	6	540490	540495	0 %	0 %	50 %	50 %	300022046
11087	NC_014313	GCC	3	9	540522	540530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022046
11088	NC_014313	TTC	2	6	540567	540572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022046
11089	NC_014313	CGC	2	6	540617	540622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022046
11090	NC_014313	CAG	2	6	540639	540644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022046
11091	NC_014313	ATG	2	6	540661	540666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022046
11092	NC_014313	GAACT	2	10	540696	540705	40 %	20 %	20 %	20 %	300022046
11093	NC_014313	CGA	2	6	540767	540772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022046
11094	NC_014313	TTC	2	6	540801	540806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022046
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11098	NC_014313	CGA	2	6	541042	541047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022046
11099	NC_014313	CAA	2	6	541127	541132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300022046
11100	NC_014313	CGCA	2	8	541134	541141	25 %	0 %	25 %	50 %	300022046
11101	NC_014313	TCA	2	6	541222	541227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022046
11102	NC_014313	TGC	2	6	541229	541234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022046
11103	NC_014313	CAA	2	6	541250	541255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300022046
11104	NC_014313	AAGATG	2	12	541422	541433	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300022046
11105	NC_014313	GACG	2	8	541498	541505	25 %	0 %	50 %	25 %	300022046
11106	NC_014313	GCA	2	6	541654	541659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022047
11107	NC_014313	CGTCGA	2	12	541660	541671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300022047
11108	NC_014313	TTC	2	6	541694	541699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022047
11109	NC_014313	GA	3	6	541743	541748	50 %	0 %	50 %	0 %	300022047
11110	NC_014313	ATG	2	6	541775	541780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022047
11111	NC_014313	TCG	3	9	541863	541871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022047
11112	NC_014313	CGGC	2	8	541876	541883	0 %	0 %	50 %	50 %	300022047
11113	NC_014313	GGC	2	6	541931	541936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022047
11114	NC_014313	ATGGC	2	10	542050	542059	20 %	20 %	40 %	20 %	300022047
11115	NC_014313	GTC	2	6	542066	542071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022047
11116	NC_014313	GAC	2	6	542081	542086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022047
11117	NC_014313	GCG	2	6	542201	542206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022047
11118	NC_014313	CGGC	2	8	542345	542352	0 %	0 %	50 %	50 %	300022047
11119	NC_014313	GTT	2	6	542815	542820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022048
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11121	NC_014313	GCG	2	6	542891	542896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022048
11122	NC_014313	GCT	2	6	542909	542914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022048
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11220	NC_014313	GAA	2	6	547528	547533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022050
11221	NC_014313	GAC	2	6	547589	547594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022050
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11223	NC_014313	GAA	2	6	547666	547671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022050
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11227	NC_014313	AGAT	2	8	547948	547955	50 %	25 %	25 %	0 %	300022051
11228	NC_014313	TCG	2	6	548008	548013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022051
11229	NC_014313	AGCG	2	8	548025	548032	25 %	0 %	50 %	25 %	300022051
11230	NC_014313	GTCGAG	2	12	548034	548045	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300022051
11231	NC_014313	CGC	2	6	548094	548099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022051
11232	NC_014313	CGT	2	6	548147	548152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022051
11233	NC_014313	CGA	3	9	548225	548233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022051
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11235	NC_014313	CGC	2	6	548320	548325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022051
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11237	NC_014313	ATC	2	6	548507	548512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022052
11238	NC_014313	CGAAG	2	10	548521	548530	40 %	0 %	40 %	20 %	300022052
11239	NC_014313	CGT	2	6	548653	548658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022052
11240	NC_014313	CAGCCG	2	12	548706	548717	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300022052
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11242	NC_014313	CGA	3	9	549079	549087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022053
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11349	NC_014313	CT	3	6	554793	554798	0 %	50 %	0 %	50 %	300022058
11350	NC_014313	CGA	2	6	554823	554828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022058
11351	NC_014313	CG	3	6	554834	554839	0 %	0 %	50 %	50 %	300022058
11352	NC_014313	GC	4	8	554862	554869	0 %	0 %	50 %	50 %	300022058
11353	NC_014313	GACG	2	8	554884	554891	25 %	0 %	50 %	25 %	300022058
11354	NC_014313	CGG	2	6	554961	554966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022058
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11356	NC_014313	GC	3	6	555023	555028	0 %	0 %	50 %	50 %	300022058
11357	NC_014313	CGG	3	9	555035	555043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022058
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11360	NC_014313	TCG	2	6	555215	555220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022058
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11362	NC_014313	GTGC	2	8	555275	555282	0 %	25 %	50 %	25 %	300022058
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11424	NC_014313	GC	3	6	558998	559003	0 %	0 %	50 %	50 %	300022062
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11450	NC_014313	TGA	2	6	561145	561150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022063
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11462	NC_014313	CGA	2	6	561680	561685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022063
11463	NC_014313	GCT	2	6	561689	561694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022063
11464	NC_014313	CG	4	8	561828	561835	0 %	0 %	50 %	50 %	300022063
11465	NC_014313	GAT	2	6	561863	561868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022063
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11469	NC_014313	TCG	2	6	561997	562002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022063
11470	NC_014313	GTG	2	6	562022	562027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300022063
11471	NC_014313	CTG	2	6	562044	562049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022063
11472	NC_014313	GAA	2	6	562092	562097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022063
11473	NC_014313	GCGT	2	8	562178	562185	0 %	25 %	50 %	25 %	300022064
11474	NC_014313	GTC	2	6	562193	562198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022064
11475	NC_014313	GC	3	6	562201	562206	0 %	0 %	50 %	50 %	300022064
11476	NC_014313	CG	3	6	562327	562332	0 %	0 %	50 %	50 %	300022064
11477	NC_014313	CAG	2	6	562388	562393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022064
11478	NC_014313	TCA	2	6	562420	562425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022064
11479	NC_014313	CTT	2	6	562430	562435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022064
11480	NC_014313	T	6	6	562471	562476	0 %	100 %	0 %	0 %	300022064
11481	NC_014313	TCG	2	6	562482	562487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022064
11482	NC_014313	CGC	2	6	562532	562537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022064
11483	NC_014313	GAT	2	6	562559	562564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022064
11484	NC_014313	CT	3	6	562632	562637	0 %	50 %	0 %	50 %	300022064
11485	NC_014313	TTC	2	6	562668	562673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022064
11486	NC_014313	ACG	2	6	562719	562724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022064
11487	NC_014313	CGC	2	6	562760	562765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022064
11488	NC_014313	TGA	2	6	562845	562850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022064
11489	NC_014313	TGA	2	6	562885	562890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022064
11490	NC_014313	GAT	2	6	562894	562899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022064
11491	NC_014313	GTC	2	6	562943	562948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022064
11492	NC_014313	TGT	2	6	562951	562956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022064
11493	NC_014313	T	6	6	563245	563250	0 %	100 %	0 %	0 %	300022065
11494	NC_014313	T	6	6	563266	563271	0 %	100 %	0 %	0 %	300022065
11495	NC_014313	TGC	2	6	563281	563286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022065
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11497	NC_014313	GAA	2	6	563513	563518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022066
11498	NC_014313	GCC	2	6	563577	563582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022066
11499	NC_014313	CTG	2	6	563618	563623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022066
11500	NC_014313	TCA	2	6	563701	563706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022066

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