MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014313	GC	3	6	513420	513425	0 %	0 %	50 %	50 %	300022017
10502	NC_014313	GCG	2	6	513465	513470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022018
10503	NC_014313	GAA	2	6	513510	513515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300022018
10504	NC_014313	CG	5	10	513537	513546	0 %	0 %	50 %	50 %	300022018
10505	NC_014313	CAG	2	6	513550	513555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022018
10506	NC_014313	CCG	2	6	513747	513752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022018
10507	NC_014313	CGA	2	6	513756	513761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022018
10508	NC_014313	CGA	2	6	513768	513773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022018
10509	NC_014313	TCG	2	6	513783	513788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022018
10510	NC_014313	GGC	2	6	513798	513803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022018
10511	NC_014313	GGC	2	6	513829	513834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022018
10512	NC_014313	TCG	2	6	513854	513859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022018
10513	NC_014313	CGCTG	2	10	513921	513930	0 %	20 %	40 %	40 %	300022018
10514	NC_014313	GGC	2	6	513931	513936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022018
10515	NC_014313	GCCA	2	8	513973	513980	25 %	0 %	25 %	50 %	300022018
10516	NC_014313	CAC	2	6	513986	513991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022018
10517	NC_014313	A	6	6	514045	514050	100 %	0 %	0 %	0 %	300022018
10518	NC_014313	GCTG	2	8	514053	514060	0 %	25 %	50 %	25 %	300022018
10519	NC_014313	CG	4	8	514134	514141	0 %	0 %	50 %	50 %	300022018
10520	NC_014313	CGCCGG	2	12	514152	514163	0 %	0 %	50 %	50 %	300022018
10521	NC_014313	GC	3	6	514204	514209	0 %	0 %	50 %	50 %	300022018
10522	NC_014313	GGC	2	6	514238	514243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022018
10523	NC_014313	CGG	2	6	514356	514361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022018
10524	NC_014313	ACG	2	6	514373	514378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022018
10525	NC_014313	TCA	2	6	514469	514474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022018
10526	NC_014313	GCC	2	6	514512	514517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022019
10527	NC_014313	GCG	2	6	514518	514523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022019
10528	NC_014313	CGG	2	6	514537	514542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022019
10529	NC_014313	TGT	2	6	514594	514599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022019
10530	NC_014313	A	6	6	514626	514631	100 %	0 %	0 %	0 %	300022019
10531	NC_014313	GTGGC	2	10	514669	514678	0 %	20 %	60 %	20 %	300022019
10532	NC_014313	GC	3	6	514732	514737	0 %	0 %	50 %	50 %	300022019
10533	NC_014313	GAT	2	6	514739	514744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022019
10534	NC_014313	CGA	2	6	514753	514758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022019
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10536	NC_014313	GAC	2	6	514808	514813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022019
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10538	NC_014313	CGA	2	6	514903	514908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022019
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10540	NC_014313	GC	3	6	514952	514957	0 %	0 %	50 %	50 %	300022019
10541	NC_014313	CCG	2	6	515013	515018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022019
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10546	NC_014313	CGC	2	6	515315	515320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022019
10547	NC_014313	CGA	3	9	515350	515358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022019
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10550	NC_014313	GC	3	6	515431	515436	0 %	0 %	50 %	50 %	300022019
10551	NC_014313	CAGA	2	8	515468	515475	50 %	0 %	25 %	25 %	300022019
10552	NC_014313	CG	3	6	515564	515569	0 %	0 %	50 %	50 %	300022019
10553	NC_014313	GC	3	6	515589	515594	0 %	0 %	50 %	50 %	300022019
10554	NC_014313	GCG	2	6	515784	515789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022020
10555	NC_014313	GCCTT	2	10	515833	515842	0 %	40 %	20 %	40 %	300022020
10556	NC_014313	TCC	2	6	515872	515877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300022020
10557	NC_014313	TCG	2	6	515890	515895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022020
10558	NC_014313	CGT	2	6	515949	515954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022020
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10560	NC_014313	CGC	2	6	516005	516010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022020
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10562	NC_014313	CGC	3	9	516064	516072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022020
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10587	NC_014313	GC	3	6	517349	517354	0 %	0 %	50 %	50 %	300022022
10588	NC_014313	GAC	2	6	517372	517377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022022
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10591	NC_014313	GC	3	6	517449	517454	0 %	0 %	50 %	50 %	300022022
10592	NC_014313	CGG	2	6	517458	517463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022022
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10599	NC_014313	GT	3	6	518067	518072	0 %	50 %	50 %	0 %	300022023
10600	NC_014313	CG	5	10	518088	518097	0 %	0 %	50 %	50 %	300022023
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10604	NC_014313	CGATGC	2	12	518215	518226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300022023
10605	NC_014313	CGG	2	6	518329	518334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300022023
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10607	NC_014313	CGC	2	6	518446	518451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300022023
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10609	NC_014313	GTGCC	2	10	518519	518528	0 %	20 %	40 %	40 %	300022023
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10611	NC_014313	AGCC	2	8	518649	518656	25 %	0 %	25 %	50 %	300022024
10612	NC_014313	TCG	2	6	518660	518665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022024
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10615	NC_014313	AG	3	6	518838	518843	50 %	0 %	50 %	0 %	300022024
10616	NC_014313	CG	3	6	518844	518849	0 %	0 %	50 %	50 %	300022024
10617	NC_014313	ACGGCA	2	12	518860	518871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022024
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10620	NC_014313	TCG	2	6	518932	518937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022024
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10729	NC_014313	GTCGGC	2	12	523684	523695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300022028
10730	NC_014313	TCGA	2	8	523718	523725	25 %	25 %	25 %	25 %	300022028
10731	NC_014313	GA	3	6	523765	523770	50 %	0 %	50 %	0 %	300022028
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10734	NC_014313	GGCGTC	2	12	524087	524098	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300022029
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10739	NC_014313	GATT	2	8	524510	524517	25 %	50 %	25 %	0 %	300022030
10740	NC_014313	TAC	2	6	524560	524565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022030
10741	NC_014313	TCA	2	6	524585	524590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300022030
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10745	NC_014313	CGA	2	6	524701	524706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022030
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10752	NC_014313	GCA	2	6	524873	524878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022030
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10846	NC_014313	GC	3	6	528422	528427	0 %	0 %	50 %	50 %	300022032
10847	NC_014313	CGT	2	6	528468	528473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022032
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10852	NC_014313	TGCCGC	2	12	528596	528607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300022032
10853	NC_014313	ATG	2	6	528616	528621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022032
10854	NC_014313	CGGC	2	8	528673	528680	0 %	0 %	50 %	50 %	300022033
10855	NC_014313	CCA	2	6	528731	528736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300022033
10856	NC_014313	GC	3	6	528798	528803	0 %	0 %	50 %	50 %	300022033
10857	NC_014313	GATC	2	8	528832	528839	25 %	25 %	25 %	25 %	300022033
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10977	NC_014313	TCT	2	6	534239	534244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300022040
10978	NC_014313	CGA	2	6	534246	534251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022040
10979	NC_014313	CGA	2	6	534519	534524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300022041
10980	NC_014313	CCTT	2	8	534566	534573	0 %	50 %	0 %	50 %	300022041
10981	NC_014313	GCTC	2	8	534648	534655	0 %	25 %	25 %	50 %	300022041
10982	NC_014313	CG	3	6	534738	534743	0 %	0 %	50 %	50 %	300022041
10983	NC_014313	TCGCC	2	10	534777	534786	0 %	20 %	20 %	60 %	300022041
10984	NC_014313	AT	3	6	534788	534793	50 %	50 %	0 %	0 %	300022041
10985	NC_014313	CATG	2	8	534858	534865	25 %	25 %	25 %	25 %	300022041
10986	NC_014313	ATG	2	6	534908	534913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300022041
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10989	NC_014313	CCTT	2	8	535028	535035	0 %	50 %	0 %	50 %	300022041
10990	NC_014313	TGC	2	6	535040	535045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022041
10991	NC_014313	GC	3	6	535059	535064	0 %	0 %	50 %	50 %	300022041
10992	NC_014313	GTC	2	6	535099	535104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300022041
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10996	NC_014313	GGCC	2	8	535142	535149	0 %	0 %	50 %	50 %	300022041
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10999	NC_014313	GTT	3	9	535534	535542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300022042
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