MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014313	T	6	6	320136	320141	0 %	100 %	0 %	0 %	300021844
6502	NC_014313	TGCC	2	8	320159	320166	0 %	25 %	25 %	50 %	300021844
6503	NC_014313	GCC	2	6	320173	320178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021844
6504	NC_014313	ACG	2	6	320349	320354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6505	NC_014313	GACGCT	2	12	320393	320404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6506	NC_014313	TTTTC	2	10	320533	320542	0 %	80 %	0 %	20 %	300021845
6507	NC_014313	CGA	2	6	320566	320571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6508	NC_014313	GCT	3	9	320612	320620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6509	NC_014313	CGC	2	6	320690	320695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021845
6510	NC_014313	CTG	2	6	320736	320741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6511	NC_014313	CGG	2	6	320768	320773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021845
6512	NC_014313	CGA	2	6	320813	320818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6513	NC_014313	GTC	2	6	320855	320860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6514	NC_014313	TCG	2	6	320904	320909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6515	NC_014313	GGC	3	9	320918	320926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021845
6516	NC_014313	TCG	2	6	320968	320973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6517	NC_014313	AGC	2	6	321010	321015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6518	NC_014313	GCT	2	6	321017	321022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6519	NC_014313	GCC	2	6	321023	321028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021845
6520	NC_014313	GC	3	6	321066	321071	0 %	0 %	50 %	50 %	300021845
6521	NC_014313	CGG	2	6	321133	321138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021845
6522	NC_014313	GCA	2	6	321147	321152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021845
6523	NC_014313	CGG	2	6	321157	321162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021845
6524	NC_014313	GCG	2	6	321186	321191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021845
6525	NC_014313	CGAG	2	8	321232	321239	25 %	0 %	50 %	25 %	300021845
6526	NC_014313	ATC	2	6	321244	321249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021845
6527	NC_014313	CGAG	2	8	321265	321272	25 %	0 %	50 %	25 %	300021845
6528	NC_014313	GGCG	2	8	321328	321335	0 %	0 %	75 %	25 %	300021846
6529	NC_014313	GC	3	6	321342	321347	0 %	0 %	50 %	50 %	300021846
6530	NC_014313	TCGC	2	8	321353	321360	0 %	25 %	25 %	50 %	300021846
6531	NC_014313	ACGG	2	8	321460	321467	25 %	0 %	50 %	25 %	300021846
6532	NC_014313	ATC	2	6	321478	321483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021846
6533	NC_014313	GAAGA	2	10	321538	321547	60 %	0 %	40 %	0 %	300021846
6534	NC_014313	CGTT	2	8	321618	321625	0 %	50 %	25 %	25 %	300021846
6535	NC_014313	GAT	2	6	321645	321650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021846
6536	NC_014313	CGA	2	6	321651	321656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021846
6537	NC_014313	AAG	2	6	321664	321669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021846
6538	NC_014313	GTC	2	6	321694	321699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021846
6539	NC_014313	CG	3	6	321749	321754	0 %	0 %	50 %	50 %	300021846
6540	NC_014313	CG	3	6	321761	321766	0 %	0 %	50 %	50 %	300021846
6541	NC_014313	CTC	2	6	321832	321837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300021846
6542	NC_014313	GAC	2	6	322268	322273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021847
6543	NC_014313	AGGACC	2	12	322354	322365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021847
6544	NC_014313	CG	3	6	322559	322564	0 %	0 %	50 %	50 %	300021847
6545	NC_014313	TG	3	6	322576	322581	0 %	50 %	50 %	0 %	300021847
6546	NC_014313	CG	4	8	322589	322596	0 %	0 %	50 %	50 %	300021847
6547	NC_014313	TCA	2	6	322618	322623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021847
6548	NC_014313	CAG	2	6	322628	322633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021847
6549	NC_014313	GCC	2	6	322659	322664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021847
6550	NC_014313	CG	3	6	322710	322715	0 %	0 %	50 %	50 %	300021847
6551	NC_014313	CAT	2	6	322791	322796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021848
6552	NC_014313	CGC	2	6	322946	322951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021848
6553	NC_014313	GCC	2	6	322992	322997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021848
6554	NC_014313	CCG	2	6	322999	323004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021848
6555	NC_014313	TCT	2	6	323117	323122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021848
6556	NC_014313	AAG	2	6	323194	323199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021848
6557	NC_014313	GGAAT	2	10	323237	323246	40 %	20 %	40 %	0 %	300021848
6558	NC_014313	GTC	2	6	323283	323288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021848
6559	NC_014313	CGC	2	6	323299	323304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021848
6560	NC_014313	GAA	2	6	323333	323338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021848
6561	NC_014313	GC	3	6	323349	323354	0 %	0 %	50 %	50 %	300021848
6562	NC_014313	GCTG	2	8	323539	323546	0 %	25 %	50 %	25 %	300021849
6563	NC_014313	GCT	2	6	323552	323557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6564	NC_014313	CGA	2	6	323567	323572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6565	NC_014313	TCT	2	6	323590	323595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021849
6566	NC_014313	ATT	2	6	323597	323602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300021849
6567	NC_014313	AAG	2	6	323622	323627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021849
6568	NC_014313	GTC	2	6	323633	323638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6569	NC_014313	TGC	2	6	323692	323697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6570	NC_014313	TCG	2	6	323724	323729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6571	NC_014313	GAC	2	6	323816	323821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6572	NC_014313	CGA	2	6	323869	323874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6573	NC_014313	GGCGG	2	10	323885	323894	0 %	0 %	80 %	20 %	300021849
6574	NC_014313	CGA	2	6	323980	323985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6575	NC_014313	TGC	2	6	324001	324006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021849
6576	NC_014313	T	8	8	324025	324032	0 %	100 %	0 %	0 %	300021849
6577	NC_014313	GCT	2	6	324665	324670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021850
6578	NC_014313	GCC	2	6	324767	324772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021850
6579	NC_014313	TGC	2	6	324872	324877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021851
6580	NC_014313	CGA	2	6	324903	324908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021851
6581	NC_014313	TCGA	2	8	324922	324929	25 %	25 %	25 %	25 %	300021851
6582	NC_014313	TCG	2	6	324965	324970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021851
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6585	NC_014313	AAT	2	6	325138	325143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300021852
6586	NC_014313	TCT	2	6	325159	325164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021852
6587	NC_014313	TGC	2	6	325195	325200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021852
6588	NC_014313	CGT	2	6	325315	325320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021852
6589	NC_014313	TGC	2	6	325335	325340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021852
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6591	NC_014313	GGC	2	6	325399	325404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021852
6592	NC_014313	ACG	2	6	325454	325459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021852
6593	NC_014313	CGG	2	6	325465	325470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021852
6594	NC_014313	CTT	2	6	325481	325486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021852
6595	NC_014313	CTGG	2	8	325533	325540	0 %	25 %	50 %	25 %	300021852
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6601	NC_014313	C	6	6	325896	325901	0 %	0 %	0 %	100 %	300021853
6602	NC_014313	GCC	2	6	325950	325955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021853
6603	NC_014313	GCTC	2	8	326094	326101	0 %	25 %	25 %	50 %	300021853
6604	NC_014313	ACG	2	6	326127	326132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021853
6605	NC_014313	GGCC	2	8	326147	326154	0 %	0 %	50 %	50 %	300021853
6606	NC_014313	GC	3	6	326192	326197	0 %	0 %	50 %	50 %	300021853
6607	NC_014313	CCA	2	6	326203	326208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300021853
6608	NC_014313	CGG	2	6	326224	326229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021853
6609	NC_014313	TTC	2	6	326242	326247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021853
6610	NC_014313	CGCAGC	2	12	326286	326297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300021853
6611	NC_014313	AGG	2	6	326302	326307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300021853
6612	NC_014313	CGTG	2	8	326336	326343	0 %	25 %	50 %	25 %	300021853
6613	NC_014313	CAG	2	6	326358	326363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021853
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6615	NC_014313	ATG	2	6	326445	326450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021853
6616	NC_014313	GA	3	6	326470	326475	50 %	0 %	50 %	0 %	300021853
6617	NC_014313	CT	3	6	326479	326484	0 %	50 %	0 %	50 %	300021853
6618	NC_014313	GCGG	2	8	326522	326529	0 %	0 %	75 %	25 %	300021853
6619	NC_014313	CAA	2	6	326543	326548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300021853
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6621	NC_014313	GC	3	6	326680	326685	0 %	0 %	50 %	50 %	300021854
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6623	NC_014313	GC	3	6	326776	326781	0 %	0 %	50 %	50 %	300021854
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6742	NC_014313	CG	3	6	331486	331491	0 %	0 %	50 %	50 %	300021857
6743	NC_014313	GGC	2	6	331527	331532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021857
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6852	NC_014313	CGA	2	6	336202	336207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021861
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6982	NC_014313	A	6	6	342877	342882	100 %	0 %	0 %	0 %	300021869
6983	NC_014313	GCC	2	6	343052	343057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021869
6984	NC_014313	TGA	2	6	343096	343101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021869
6985	NC_014313	CGG	2	6	343114	343119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021869
6986	NC_014313	ATG	2	6	343122	343127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021869
6987	NC_014313	TGCGA	2	10	343172	343181	20 %	20 %	40 %	20 %	300021869
6988	NC_014313	TCTG	2	8	343291	343298	0 %	50 %	25 %	25 %	300021870
6989	NC_014313	CGG	2	6	343325	343330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021870
6990	NC_014313	CGA	2	6	343415	343420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021870
6991	NC_014313	CGT	2	6	343427	343432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021870
6992	NC_014313	TCG	2	6	343445	343450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021870
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6995	NC_014313	TCGACG	2	12	343534	343545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300021870
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6997	NC_014313	TCT	2	6	343661	343666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021870
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6999	NC_014313	TGC	2	6	343703	343708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021870
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