MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 5

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014302	GTA	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883475
2	NC_014302	AAG	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883475
3	NC_014302	A	6	6	1353	1358	100 %	0 %	0 %	0 %	299883475
4	NC_014302	AGCA	2	8	1375	1382	50 %	0 %	25 %	25 %	299883475
5	NC_014302	AAAGG	2	10	1432	1441	60 %	0 %	40 %	0 %	299883475
6	NC_014302	AGT	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883475
7	NC_014302	CA	3	6	1553	1558	50 %	0 %	0 %	50 %	299883475
8	NC_014302	GAA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883475
9	NC_014302	GTC	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883475
10	NC_014302	GTG	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883475
11	NC_014302	CAC	2	6	1644	1649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883475
12	NC_014302	GTA	2	6	1663	1668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883475
13	NC_014302	TTA	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883476
14	NC_014302	TC	3	6	1796	1801	0 %	50 %	0 %	50 %	299883476
15	NC_014302	CTC	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883476
16	NC_014302	GTC	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883476
17	NC_014302	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883476
18	NC_014302	TGA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883476
19	NC_014302	GTG	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883476
20	NC_014302	TCGG	2	8	1935	1942	0 %	25 %	50 %	25 %	299883476
21	NC_014302	CTG	2	6	1954	1959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883476
22	NC_014302	GTCG	2	8	2382	2389	0 %	25 %	50 %	25 %	299883477
23	NC_014302	GAT	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883477
24	NC_014302	TAC	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883477
25	NC_014302	ATG	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883477
26	NC_014302	GAT	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883477
27	NC_014302	ATT	2	6	2597	2602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883477
28	NC_014302	A	7	7	2756	2762	100 %	0 %	0 %	0 %	299883477
29	NC_014302	AAAG	2	8	2801	2808	75 %	0 %	25 %	0 %	299883477
30	NC_014302	ATTA	2	8	2839	2846	50 %	50 %	0 %	0 %	299883477
31	NC_014302	AGA	3	9	3155	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883478
32	NC_014302	GTT	2	6	3192	3197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883478
33	NC_014302	AC	3	6	3200	3205	50 %	0 %	0 %	50 %	299883478
34	NC_014302	T	6	6	3236	3241	0 %	100 %	0 %	0 %	299883478
35	NC_014302	AGTA	2	8	3347	3354	50 %	25 %	25 %	0 %	299883478
36	NC_014302	CGC	2	6	4059	4064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883479
37	NC_014302	ATG	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883479
38	NC_014302	AGGGT	2	10	4279	4288	20 %	20 %	60 %	0 %	299883479
39	NC_014302	GAAG	2	8	4351	4358	50 %	0 %	50 %	0 %	299883479
40	NC_014302	GAA	2	6	4374	4379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883479
41	NC_014302	GACG	2	8	4384	4391	25 %	0 %	50 %	25 %	299883479
42	NC_014302	ATT	2	6	4402	4407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883479
43	NC_014302	CG	3	6	4408	4413	0 %	0 %	50 %	50 %	299883479
44	NC_014302	CT	3	6	4455	4460	0 %	50 %	0 %	50 %	299883479
45	NC_014302	ACA	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883479
46	NC_014302	CCA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883479
47	NC_014302	CGA	2	6	4599	4604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883479
48	NC_014302	TTA	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883479
49	NC_014302	GGC	2	6	4779	4784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883479
50	NC_014302	GAC	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883479
51	NC_014302	GAC	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883479
52	NC_014302	GTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883479
53	NC_014302	GCG	2	6	4996	5001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883479
54	NC_014302	GCC	3	9	5008	5016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883479
55	NC_014302	GAA	3	9	5766	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883480
56	NC_014302	GAC	2	6	5805	5810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883480
57	NC_014302	AC	3	6	5809	5814	50 %	0 %	0 %	50 %	299883480
58	NC_014302	GAA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883480
59	NC_014302	ACA	2	6	6024	6029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883480
60	NC_014302	GCG	2	6	6066	6071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883480
61	NC_014302	CAG	2	6	6091	6096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883480
62	NC_014302	GTCG	2	8	6123	6130	0 %	25 %	50 %	25 %	299883480
63	NC_014302	TGA	4	12	6185	6196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883480
64	NC_014302	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883480
65	NC_014302	AAT	2	6	6215	6220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	299883480
66	NC_014302	TTC	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883480
67	NC_014302	TTC	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883480
68	NC_014302	ACA	2	6	6539	6544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883480
69	NC_014302	GAC	3	9	6555	6563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883480
70	NC_014302	TCA	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
71	NC_014302	CT	4	8	7234	7241	0 %	50 %	0 %	50 %	299883481
72	NC_014302	AATC	2	8	7331	7338	50 %	25 %	0 %	25 %	299883481
73	NC_014302	TCA	2	6	7366	7371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
74	NC_014302	TTC	2	6	7429	7434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
75	NC_014302	TCTT	2	8	7513	7520	0 %	75 %	0 %	25 %	299883481
76	NC_014302	CAT	2	6	7529	7534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
77	NC_014302	TCA	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
78	NC_014302	T	6	6	7730	7735	0 %	100 %	0 %	0 %	299883481
79	NC_014302	TCT	2	6	7756	7761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
80	NC_014302	TGGT	2	8	7840	7847	0 %	50 %	50 %	0 %	299883481
81	NC_014302	GAT	2	6	7856	7861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883481
82	NC_014302	CTT	2	6	7946	7951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
83	NC_014302	GGT	2	6	7952	7957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883481
84	NC_014302	AG	3	6	8008	8013	50 %	0 %	50 %	0 %	299883481
85	NC_014302	TAG	2	6	8015	8020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883481
86	NC_014302	CTA	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
87	NC_014302	CTG	2	6	8054	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883481
88	NC_014302	GTTG	2	8	8149	8156	0 %	50 %	50 %	0 %	299883481
89	NC_014302	TTC	2	6	8223	8228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
90	NC_014302	TTC	2	6	8284	8289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
91	NC_014302	TCC	2	6	8314	8319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883481
92	NC_014302	TGG	2	6	8382	8387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883481
93	NC_014302	TCC	2	6	8401	8406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883481
94	NC_014302	CA	3	6	8462	8467	50 %	0 %	0 %	50 %	299883481
95	NC_014302	CTT	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
96	NC_014302	ACC	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883481
97	NC_014302	TCA	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
98	NC_014302	AGA	2	6	8549	8554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883481
99	NC_014302	ATC	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
100	NC_014302	GTTT	2	8	8726	8733	0 %	75 %	25 %	0 %	299883481
101	NC_014302	TCT	2	6	8750	8755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
102	NC_014302	CT	3	6	8767	8772	0 %	50 %	0 %	50 %	299883481
103	NC_014302	TC	3	6	8775	8780	0 %	50 %	0 %	50 %	299883481
104	NC_014302	TCG	2	6	8803	8808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883481
105	NC_014302	TCA	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
106	NC_014302	CAT	5	15	8873	8887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
107	NC_014302	ATT	2	6	8943	8948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883481
108	NC_014302	ACT	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883482
109	NC_014302	ACCTCA	2	12	9198	9209	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	299883482
110	NC_014302	TCC	2	6	9231	9236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883482
111	NC_014302	GTA	2	6	9246	9251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883482
112	NC_014302	ATT	2	6	9264	9269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883482
113	NC_014302	CTT	2	6	9286	9291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883483
114	NC_014302	TTC	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883483
115	NC_014302	TTC	2	6	9343	9348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883483
116	NC_014302	CTT	2	6	9369	9374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883483
117	NC_014302	TG	3	6	9512	9517	0 %	50 %	50 %	0 %	299883484
118	NC_014302	CCT	2	6	9577	9582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883484
119	NC_014302	TCAT	2	8	9615	9622	25 %	50 %	0 %	25 %	299883484
120	NC_014302	GTG	2	6	9637	9642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883484
121	NC_014302	GTGA	2	8	9675	9682	25 %	25 %	50 %	0 %	299883484
122	NC_014302	TCC	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883484
123	NC_014302	CAT	2	6	9724	9729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
124	NC_014302	ATC	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
125	NC_014302	TGA	2	6	9856	9861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
126	NC_014302	TCA	3	9	9990	9998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
127	NC_014302	TCA	2	6	10008	10013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
128	NC_014302	CGT	2	6	10087	10092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883484
129	NC_014302	TCG	2	6	10125	10130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883484
130	NC_014302	GAT	2	6	10152	10157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
131	NC_014302	ACA	2	6	10198	10203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
132	NC_014302	CTGT	2	8	10228	10235	0 %	50 %	25 %	25 %	299883484
133	NC_014302	TTCCTC	2	12	10496	10507	0 %	50 %	0 %	50 %	299883484
134	NC_014302	AGTTC	2	10	10540	10549	20 %	40 %	20 %	20 %	299883484
135	NC_014302	AAC	2	6	10620	10625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
136	NC_014302	TGA	2	6	10726	10731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
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138	NC_014302	CGGA	2	8	10796	10803	25 %	0 %	50 %	25 %	299883484
139	NC_014302	TC	4	8	10806	10813	0 %	50 %	0 %	50 %	299883484
140	NC_014302	CGCTT	2	10	10821	10830	0 %	40 %	20 %	40 %	299883484
141	NC_014302	CAA	2	6	10834	10839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
142	NC_014302	CAA	2	6	10927	10932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
143	NC_014302	GAT	2	6	10971	10976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
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148	NC_014302	GTA	2	6	11162	11167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
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158	NC_014302	CAT	3	9	12001	12009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883485
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163	NC_014302	G	6	6	14899	14904	0 %	0 %	100 %	0 %	299883487
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246	NC_014302	AGACA	2	10	20095	20104	60 %	0 %	20 %	20 %	299883493
247	NC_014302	AGA	2	6	20172	20177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883494
248	NC_014302	CAT	2	6	20180	20185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883494
249	NC_014302	ACC	2	6	20217	20222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883494
250	NC_014302	TC	4	8	20234	20241	0 %	50 %	0 %	50 %	299883494
251	NC_014302	CTG	2	6	20270	20275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883494
252	NC_014302	CTC	2	6	20292	20297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883494
253	NC_014302	GTCCTT	2	12	20328	20339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	299883494
254	NC_014302	T	7	7	21509	21515	0 %	100 %	0 %	0 %	299883495
255	NC_014302	AGCGTC	2	12	21691	21702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	299883495
256	NC_014302	AG	3	6	21748	21753	50 %	0 %	50 %	0 %	299883495
257	NC_014302	AG	3	6	21827	21832	50 %	0 %	50 %	0 %	299883495
258	NC_014302	AGG	2	6	21838	21843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883495
259	NC_014302	TGC	2	6	21894	21899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883495
260	NC_014302	AAC	2	6	21914	21919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883495
261	NC_014302	CAT	2	6	21924	21929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883495
262	NC_014302	ATG	2	6	22135	22140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883496
263	NC_014302	AATC	2	8	22582	22589	50 %	25 %	0 %	25 %	299883497
264	NC_014302	GATT	2	8	22641	22648	25 %	50 %	25 %	0 %	299883497
265	NC_014302	CAT	2	6	22671	22676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883497
266	NC_014302	GCCT	2	8	22698	22705	0 %	25 %	25 %	50 %	299883497
267	NC_014302	TGT	2	6	22712	22717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883497
268	NC_014302	CGT	2	6	22739	22744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883497
269	NC_014302	GATG	2	8	22754	22761	25 %	25 %	50 %	0 %	299883497
270	NC_014302	GTC	2	6	22785	22790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883497

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.