MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014301	TCG	2	6	32631	32636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883460
502	NC_014301	GTC	2	6	32678	32683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883460
503	NC_014301	CGA	2	6	32737	32742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883460
504	NC_014301	C	6	6	32765	32770	0 %	0 %	0 %	100 %	299883460
505	NC_014301	CCG	2	6	32790	32795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883460
506	NC_014301	GTT	2	6	32834	32839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883460
507	NC_014301	GGT	2	6	32870	32875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883460
508	NC_014301	TGA	2	6	32887	32892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883460
509	NC_014301	GACC	2	8	33001	33008	25 %	0 %	25 %	50 %	299883460
510	NC_014301	CGA	2	6	33013	33018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883460
511	NC_014301	GTA	2	6	33092	33097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883460
512	NC_014301	ATC	2	6	33123	33128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883460
513	NC_014301	CCG	2	6	33198	33203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883460
514	NC_014301	CCA	2	6	33304	33309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883460
515	NC_014301	GAA	2	6	33433	33438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883460
516	NC_014301	ATC	2	6	33456	33461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883460
517	NC_014301	GAA	2	6	33575	33580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883460
518	NC_014301	CCG	2	6	33631	33636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883460
519	NC_014301	CGC	2	6	33674	33679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883460
520	NC_014301	CGA	2	6	33733	33738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883460
521	NC_014301	GTG	2	6	33746	33751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883460
522	NC_014301	CCA	2	6	33795	33800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883460
523	NC_014301	GCA	2	6	33819	33824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883460
524	NC_014301	CAG	2	6	33860	33865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883460
525	NC_014301	CCAGAA	2	12	34068	34079	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	299883461
526	NC_014301	TTC	2	6	34139	34144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883461
527	NC_014301	CCT	2	6	34267	34272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883461
528	NC_014301	CGA	2	6	34291	34296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883461
529	NC_014301	CTGGC	2	10	34300	34309	0 %	20 %	40 %	40 %	299883461
530	NC_014301	GAC	2	6	34406	34411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883461
531	NC_014301	TCG	2	6	34465	34470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883461
532	NC_014301	GGTC	2	8	34477	34484	0 %	25 %	50 %	25 %	299883461
533	NC_014301	ATG	2	6	34491	34496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883461
534	NC_014301	TTTG	2	8	34597	34604	0 %	75 %	25 %	0 %	299883461
535	NC_014301	TC	4	8	34605	34612	0 %	50 %	0 %	50 %	299883461
536	NC_014301	GAT	3	9	34685	34693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883461
537	NC_014301	GTTC	2	8	34761	34768	0 %	50 %	25 %	25 %	299883462
538	NC_014301	TTG	2	6	34808	34813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883462
539	NC_014301	GTCAC	2	10	34826	34835	20 %	20 %	20 %	40 %	299883462
540	NC_014301	CAA	2	6	34840	34845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883462
541	NC_014301	GCG	2	6	34997	35002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883462
542	NC_014301	GCT	2	6	35028	35033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883462
543	NC_014301	GTCC	2	8	35098	35105	0 %	25 %	25 %	50 %	299883462
544	NC_014301	GAA	2	6	35182	35187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883462
545	NC_014301	GAC	2	6	35346	35351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883463
546	NC_014301	TTC	2	6	35385	35390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883463
547	NC_014301	TGC	2	6	35443	35448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883463
548	NC_014301	GAT	2	6	35457	35462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883463
549	NC_014301	CTG	2	6	35482	35487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883463
550	NC_014301	TGGA	2	8	35540	35547	25 %	25 %	50 %	0 %	299883463
551	NC_014301	TGA	2	6	36427	36432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883464
552	NC_014301	TAT	2	6	36452	36457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883464
553	NC_014301	GCG	2	6	36518	36523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883464
554	NC_014301	GAA	2	6	36551	36556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883464
555	NC_014301	CATT	2	8	36586	36593	25 %	50 %	0 %	25 %	299883464
556	NC_014301	GGC	2	6	36670	36675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883464
557	NC_014301	GAA	2	6	36815	36820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883464
558	NC_014301	GGAG	2	8	36949	36956	25 %	0 %	75 %	0 %	299883464
559	NC_014301	AGCA	2	8	36981	36988	50 %	0 %	25 %	25 %	299883464
560	NC_014301	GTT	2	6	37000	37005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883464
561	NC_014301	AAC	2	6	37069	37074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883464
562	NC_014301	ACT	2	6	37818	37823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883465
563	NC_014301	CGT	2	6	37921	37926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883465
564	NC_014301	TGT	2	6	37995	38000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883465
565	NC_014301	GAA	2	6	38004	38009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883465
566	NC_014301	ACT	2	6	38047	38052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883465
567	NC_014301	T	6	6	38052	38057	0 %	100 %	0 %	0 %	299883465
568	NC_014301	ATG	2	6	38807	38812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883466
569	NC_014301	GAA	2	6	38843	38848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883466
570	NC_014301	GAT	2	6	38849	38854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883466
571	NC_014301	GAT	3	9	38960	38968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883466
572	NC_014301	TAAT	2	8	38976	38983	50 %	50 %	0 %	0 %	299883466
573	NC_014301	AGA	2	6	39148	39153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883466
574	NC_014301	AC	3	6	39177	39182	50 %	0 %	0 %	50 %	299883466
575	NC_014301	GAG	2	6	39223	39228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883466
576	NC_014301	GA	3	6	39235	39240	50 %	0 %	50 %	0 %	299883466
577	NC_014301	AGT	2	6	39303	39308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883466
578	NC_014301	CGA	2	6	39527	39532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883467
579	NC_014301	CA	3	6	39593	39598	50 %	0 %	0 %	50 %	299883467
580	NC_014301	CTC	2	6	39619	39624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883467
581	NC_014301	CGA	2	6	39675	39680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883467
582	NC_014301	AAC	2	6	39835	39840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883467
583	NC_014301	TCA	2	6	39887	39892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883467
584	NC_014301	TGA	2	6	39894	39899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883467
585	NC_014301	CAC	2	6	39905	39910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883467
586	NC_014301	AGG	2	6	39944	39949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883467
587	NC_014301	ACA	2	6	39950	39955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883467
588	NC_014301	AGC	2	6	40025	40030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883467
589	NC_014301	GGC	2	6	40053	40058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883467
590	NC_014301	GAC	2	6	40066	40071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883467
591	NC_014301	CGA	2	6	40112	40117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883467
592	NC_014301	ACG	2	6	40129	40134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883467
593	NC_014301	CGA	3	9	40260	40268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883467
594	NC_014301	GC	3	6	40287	40292	0 %	0 %	50 %	50 %	299883467
595	NC_014301	ATA	2	6	40347	40352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	299883467
596	NC_014301	ACT	2	6	40381	40386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883468
597	NC_014301	CGA	2	6	40475	40480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883468
598	NC_014301	AAC	2	6	40487	40492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883468
599	NC_014301	GCA	2	6	40532	40537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883468
600	NC_014301	TCG	2	6	40542	40547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883468
601	NC_014301	CT	3	6	40568	40573	0 %	50 %	0 %	50 %	299883468
602	NC_014301	CTG	2	6	40590	40595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883468
603	NC_014301	TCC	2	6	40638	40643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883468
604	NC_014301	GTT	2	6	40645	40650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883468
605	NC_014301	AGA	2	6	40726	40731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883468
606	NC_014301	TCG	2	6	40964	40969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883469
607	NC_014301	GAC	2	6	40987	40992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883469
608	NC_014301	ATC	2	6	41000	41005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883469
609	NC_014301	CTCGC	2	10	41159	41168	0 %	20 %	20 %	60 %	299883470
610	NC_014301	AGC	2	6	41254	41259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883470
611	NC_014301	GAGT	2	8	41265	41272	25 %	25 %	50 %	0 %	299883470
612	NC_014301	GAT	2	6	41277	41282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883470
613	NC_014301	GGA	2	6	41349	41354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883470
614	NC_014301	CAAA	2	8	41358	41365	75 %	0 %	0 %	25 %	299883470
615	NC_014301	GATTC	2	10	41397	41406	20 %	40 %	20 %	20 %	299883470
616	NC_014301	GAG	2	6	41407	41412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883470
617	NC_014301	GCT	2	6	41515	41520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883471
618	NC_014301	TCGG	2	8	41598	41605	0 %	25 %	50 %	25 %	299883471
619	NC_014301	CCA	2	6	41612	41617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883471
620	NC_014301	GCC	2	6	41630	41635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883471
621	NC_014301	CTT	2	6	41639	41644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883471
622	NC_014301	GAC	2	6	41648	41653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883471
623	NC_014301	CT	3	6	41659	41664	0 %	50 %	0 %	50 %	299883471
624	NC_014301	AGCCG	2	10	41707	41716	20 %	0 %	40 %	40 %	299883471
625	NC_014301	ATC	2	6	41753	41758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883471
626	NC_014301	CTC	2	6	41771	41776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883471
627	NC_014301	AT	4	8	41823	41830	50 %	50 %	0 %	0 %	299883471
628	NC_014301	GAAC	2	8	42378	42385	50 %	0 %	25 %	25 %	299883472
629	NC_014301	AGC	2	6	42401	42406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883472
630	NC_014301	AGA	2	6	42413	42418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883472
631	NC_014301	GA	3	6	42421	42426	50 %	0 %	50 %	0 %	299883472
632	NC_014301	ATC	2	6	42450	42455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883472
633	NC_014301	GGTG	2	8	42463	42470	0 %	25 %	75 %	0 %	299883472
634	NC_014301	GC	4	8	42660	42667	0 %	0 %	50 %	50 %	299883472
635	NC_014301	CGC	3	9	42753	42761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883472
636	NC_014301	AAG	2	6	42769	42774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883472
637	NC_014301	CA	3	6	42776	42781	50 %	0 %	0 %	50 %	299883472
638	NC_014301	TGA	2	6	42813	42818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883472
639	NC_014301	GAC	2	6	42829	42834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883472
640	NC_014301	GAA	2	6	42843	42848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883472
641	NC_014301	GAA	2	6	42858	42863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883472
642	NC_014301	GTC	2	6	42871	42876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883472
643	NC_014301	G	6	6	42917	42922	0 %	0 %	100 %	0 %	299883472
644	NC_014301	GA	3	6	42940	42945	50 %	0 %	50 %	0 %	299883472
645	NC_014301	GCAA	2	8	43310	43317	50 %	0 %	25 %	25 %	299883473
646	NC_014301	CGGA	2	8	43320	43327	25 %	0 %	50 %	25 %	299883473
647	NC_014301	ACC	2	6	43494	43499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883473

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