MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 5458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014299	ACT	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712770
2	NC_014299	CGT	2	6	626	631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712770
3	NC_014299	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712770
4	NC_014299	GAA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712770
5	NC_014299	ACT	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712770
6	NC_014299	T	6	6	757	762	0 %	100 %	0 %	0 %	300712770
7	NC_014299	ATG	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712771
8	NC_014299	GAA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712771
9	NC_014299	GAT	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712771
10	NC_014299	GAT	3	9	1665	1673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712771
11	NC_014299	TAAT	2	8	1681	1688	50 %	50 %	0 %	0 %	300712771
12	NC_014299	AGA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712771
13	NC_014299	AC	3	6	1882	1887	50 %	0 %	0 %	50 %	300712771
14	NC_014299	GAG	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712771
15	NC_014299	GA	3	6	1940	1945	50 %	0 %	50 %	0 %	300712771
16	NC_014299	AGT	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712771
17	NC_014299	CGA	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
18	NC_014299	CA	3	6	2298	2303	50 %	0 %	0 %	50 %	300712772
19	NC_014299	CTC	2	6	2324	2329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712772
20	NC_014299	CGA	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
21	NC_014299	AAC	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712772
22	NC_014299	TCA	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712772
23	NC_014299	TGA	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712772
24	NC_014299	CAC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712772
25	NC_014299	AGG	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712772
26	NC_014299	ACA	2	6	2655	2660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712772
27	NC_014299	AGC	2	6	2730	2735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
28	NC_014299	GGC	2	6	2758	2763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712772
29	NC_014299	GAC	2	6	2771	2776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
30	NC_014299	CGA	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
31	NC_014299	ACG	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
32	NC_014299	CGA	3	9	2965	2973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
33	NC_014299	GC	3	6	2992	2997	0 %	0 %	50 %	50 %	300712772
34	NC_014299	ATA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300712772
35	NC_014299	ACT	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712773
36	NC_014299	CGA	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712773
37	NC_014299	AAC	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712773
38	NC_014299	GCA	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712773
39	NC_014299	TCG	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712773
40	NC_014299	CT	3	6	3273	3278	0 %	50 %	0 %	50 %	300712773
41	NC_014299	CTG	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712773
42	NC_014299	TCC	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712773
43	NC_014299	GTT	2	6	3350	3355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712773
44	NC_014299	AGA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712773
45	NC_014299	TCG	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712774
46	NC_014299	GAC	2	6	3692	3697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712774
47	NC_014299	ATC	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712774
48	NC_014299	CTCGC	2	10	3864	3873	0 %	20 %	20 %	60 %	300712775
49	NC_014299	AGC	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712775
50	NC_014299	GAGT	2	8	3970	3977	25 %	25 %	50 %	0 %	300712775
51	NC_014299	GAT	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712775
52	NC_014299	GGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712775
53	NC_014299	CAAA	2	8	4063	4070	75 %	0 %	0 %	25 %	300712775
54	NC_014299	GATTC	2	10	4102	4111	20 %	40 %	20 %	20 %	300712775
55	NC_014299	GAG	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712775
56	NC_014299	GCT	2	6	4220	4225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712776
57	NC_014299	TCGG	2	8	4303	4310	0 %	25 %	50 %	25 %	300712776
58	NC_014299	CCA	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712776
59	NC_014299	GCC	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712776
60	NC_014299	CTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712776
61	NC_014299	GAC	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712776
62	NC_014299	CT	3	6	4364	4369	0 %	50 %	0 %	50 %	300712776
63	NC_014299	AGCCG	2	10	4412	4421	20 %	0 %	40 %	40 %	300712776
64	NC_014299	ATC	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712776
65	NC_014299	CTC	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712776
66	NC_014299	AT	4	8	4528	4535	50 %	50 %	0 %	0 %	300712776
67	NC_014299	GAAC	2	8	5083	5090	50 %	0 %	25 %	25 %	300712777
68	NC_014299	AGC	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712777
69	NC_014299	AGA	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712777
70	NC_014299	GA	3	6	5126	5131	50 %	0 %	50 %	0 %	300712777
71	NC_014299	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712777
72	NC_014299	GGTG	2	8	5168	5175	0 %	25 %	75 %	0 %	300712777
73	NC_014299	GC	4	8	5365	5372	0 %	0 %	50 %	50 %	300712777
74	NC_014299	CGC	3	9	5458	5466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712777
75	NC_014299	AAG	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712777
76	NC_014299	CA	3	6	5481	5486	50 %	0 %	0 %	50 %	300712777
77	NC_014299	TGA	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712777
78	NC_014299	GAC	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712777
79	NC_014299	GAA	2	6	5548	5553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712777
80	NC_014299	GAA	2	6	5563	5568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712777
81	NC_014299	GTC	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712777
82	NC_014299	G	6	6	5622	5627	0 %	0 %	100 %	0 %	300712777
83	NC_014299	GA	3	6	5645	5650	50 %	0 %	50 %	0 %	300712777
84	NC_014299	GCAA	2	8	6015	6022	50 %	0 %	25 %	25 %	300712778
85	NC_014299	CGGA	2	8	6025	6032	25 %	0 %	50 %	25 %	300712778
86	NC_014299	ACC	2	6	6199	6204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712778
87	NC_014299	CGAA	2	8	6226	6233	50 %	0 %	25 %	25 %	300712779
88	NC_014299	CGA	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
89	NC_014299	GAA	2	6	6283	6288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712779
90	NC_014299	GAG	2	6	6328	6333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712779
91	NC_014299	GAA	2	6	6448	6453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712779
92	NC_014299	T	6	6	6490	6495	0 %	100 %	0 %	0 %	300712779
93	NC_014299	GCA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
94	NC_014299	CGC	2	6	6529	6534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712779
95	NC_014299	CCA	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712779
96	NC_014299	GCG	2	6	6857	6862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712779
97	NC_014299	GAC	2	6	6874	6879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
98	NC_014299	ACA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712779
99	NC_014299	ACG	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
100	NC_014299	GAT	2	6	7003	7008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
101	NC_014299	ATCT	2	8	7036	7043	25 %	50 %	0 %	25 %	300712779
102	NC_014299	AG	3	6	7071	7076	50 %	0 %	50 %	0 %	300712779
103	NC_014299	ACTC	2	8	7136	7143	25 %	25 %	0 %	50 %	300712779
104	NC_014299	AAGT	2	8	7251	7258	50 %	25 %	25 %	0 %	300712779
105	NC_014299	CCA	2	6	7270	7275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712779
106	NC_014299	CGG	2	6	7302	7307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712779
107	NC_014299	CTCG	2	8	7387	7394	0 %	25 %	25 %	50 %	300712779
108	NC_014299	CTC	2	6	7405	7410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712779
109	NC_014299	G	6	6	7435	7440	0 %	0 %	100 %	0 %	300712779
110	NC_014299	ACT	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712779
111	NC_014299	TCAAC	2	10	7512	7521	40 %	20 %	0 %	40 %	300712779
112	NC_014299	CGA	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
113	NC_014299	GGT	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712779
114	NC_014299	TCG	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712779
115	NC_014299	CTA	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712779
116	NC_014299	GAC	2	6	7711	7716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
117	NC_014299	AAGG	2	8	7753	7760	50 %	0 %	50 %	0 %	300712779
118	NC_014299	GGT	2	6	7762	7767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712779
119	NC_014299	GT	3	6	7793	7798	0 %	50 %	50 %	0 %	300712779
120	NC_014299	CGA	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
121	NC_014299	ACG	2	6	8141	8146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
122	NC_014299	CAG	2	6	8197	8202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
123	NC_014299	AAG	2	6	8272	8277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712779
124	NC_014299	ACG	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
125	NC_014299	GAT	2	6	8305	8310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
126	NC_014299	ACA	2	6	8429	8434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712779
127	NC_014299	GC	3	6	8459	8464	0 %	0 %	50 %	50 %	300712779
128	NC_014299	GGC	2	6	8472	8477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712779
129	NC_014299	TTC	2	6	8488	8493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712779
130	NC_014299	TCC	2	6	8580	8585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712779
131	NC_014299	TGA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
132	NC_014299	AGCG	2	8	8650	8657	25 %	0 %	50 %	25 %	300712779
133	NC_014299	CAT	2	6	8727	8732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712779
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260	NC_014299	GA	3	6	15951	15956	50 %	0 %	50 %	0 %	300712784
261	NC_014299	CCG	2	6	15963	15968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712784
262	NC_014299	CTC	2	6	16024	16029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712784
263	NC_014299	GA	3	6	16058	16063	50 %	0 %	50 %	0 %	300712784
264	NC_014299	CGT	2	6	16130	16135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712784
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267	NC_014299	CTC	2	6	16303	16308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712784
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269	NC_014299	TAC	2	6	16557	16562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712785
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272	NC_014299	GCT	2	6	16650	16655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712785
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292	NC_014299	GCA	2	6	17864	17869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712788
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294	NC_014299	CGA	2	6	17932	17937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712788
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379	NC_014299	GA	3	6	23455	23460	50 %	0 %	50 %	0 %	300712794
380	NC_014299	CGA	2	6	23528	23533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712794
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382	NC_014299	CAC	2	6	23599	23604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712794
383	NC_014299	CGA	2	6	23620	23625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712794
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