MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 5458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014299	CCA	2	6	232729	232734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713020
3502	NC_014299	ATC	2	6	232757	232762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713020
3503	NC_014299	TTA	2	6	232811	232816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300713020
3504	NC_014299	CAGGA	2	10	232826	232835	40 %	0 %	40 %	20 %	300713020
3505	NC_014299	G	7	7	232959	232965	0 %	0 %	100 %	0 %	300713020
3506	NC_014299	GAC	2	6	233053	233058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713020
3507	NC_014299	CCGA	2	8	233080	233087	25 %	0 %	25 %	50 %	300713020
3508	NC_014299	ATC	2	6	233120	233125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713020
3509	NC_014299	TCGA	2	8	233140	233147	25 %	25 %	25 %	25 %	300713020
3510	NC_014299	GGA	2	6	233483	233488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300713021
3511	NC_014299	GATTC	2	10	233496	233505	20 %	40 %	20 %	20 %	300713021
3512	NC_014299	TTTC	2	8	233550	233557	0 %	75 %	0 %	25 %	300713021
3513	NC_014299	CGA	2	6	233588	233593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713021
3514	NC_014299	ATG	2	6	233629	233634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713021
3515	NC_014299	TCG	2	6	233689	233694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713021
3516	NC_014299	CTTC	2	8	233716	233723	0 %	50 %	0 %	50 %	300713021
3517	NC_014299	CCT	2	6	233816	233821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300713021
3518	NC_014299	AAC	2	6	233839	233844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300713021
3519	NC_014299	A	6	6	233973	233978	100 %	0 %	0 %	0 %	300713021
3520	NC_014299	TCG	2	6	234495	234500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713022
3521	NC_014299	TGA	2	6	234520	234525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713022
3522	NC_014299	TTC	2	6	234560	234565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713022
3523	NC_014299	GTA	2	6	234623	234628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713022
3524	NC_014299	TCA	2	6	234735	234740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713022
3525	NC_014299	CTG	2	6	234751	234756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713022
3526	NC_014299	GCCA	2	8	234778	234785	25 %	0 %	25 %	50 %	300713022
3527	NC_014299	GTC	2	6	234812	234817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713022
3528	NC_014299	ACT	2	6	234987	234992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713022
3529	NC_014299	CGG	2	6	235067	235072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713022
3530	NC_014299	GAAT	2	8	235123	235130	50 %	25 %	25 %	0 %	300713022
3531	NC_014299	GTT	2	6	235170	235175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300713022
3532	NC_014299	CAC	2	6	235649	235654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713023
3533	NC_014299	TCA	2	6	235689	235694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713023
3534	NC_014299	GTT	2	6	235833	235838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300713023
3535	NC_014299	GAT	2	6	235884	235889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713023
3536	NC_014299	GGC	2	6	235907	235912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713023
3537	NC_014299	TGC	2	6	235972	235977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713023
3538	NC_014299	CT	3	6	236014	236019	0 %	50 %	0 %	50 %	300713023
3539	NC_014299	CGG	2	6	236032	236037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713023
3540	NC_014299	GCG	2	6	236078	236083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713023
3541	NC_014299	CAC	2	6	236160	236165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713023
3542	NC_014299	ATC	2	6	236243	236248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713023
3543	NC_014299	TTC	2	6	236312	236317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713023
3544	NC_014299	TG	3	6	236323	236328	0 %	50 %	50 %	0 %	300713023
3545	NC_014299	CTT	2	6	236331	236336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713023
3546	NC_014299	AGTT	2	8	236394	236401	25 %	50 %	25 %	0 %	300713023
3547	NC_014299	TTCC	2	8	236433	236440	0 %	50 %	0 %	50 %	300713023
3548	NC_014299	TGC	2	6	236458	236463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713023
3549	NC_014299	TTG	2	6	236479	236484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300713023
3550	NC_014299	CAA	2	6	236499	236504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300713023
3551	NC_014299	TCAGT	2	10	236529	236538	20 %	40 %	20 %	20 %	300713023
3552	NC_014299	TGC	2	6	236560	236565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713023
3553	NC_014299	ATC	2	6	236570	236575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713023
3554	NC_014299	ATA	2	6	236633	236638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300713023
3555	NC_014299	CTT	2	6	236673	236678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713023
3556	NC_014299	CTT	2	6	236859	236864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713023
3557	NC_014299	GCGA	2	8	236880	236887	25 %	0 %	50 %	25 %	300713023
3558	NC_014299	ATT	2	6	236915	236920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300713023
3559	NC_014299	TCT	2	6	236924	236929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713023
3560	NC_014299	CGG	2	6	237168	237173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713024
3561	NC_014299	TCGA	2	8	237178	237185	25 %	25 %	25 %	25 %	300713024
3562	NC_014299	GAA	2	6	237198	237203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300713024
3563	NC_014299	TCT	2	6	237256	237261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713024
3564	NC_014299	GT	3	6	237273	237278	0 %	50 %	50 %	0 %	300713024
3565	NC_014299	GAC	2	6	237297	237302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
3566	NC_014299	CAG	2	6	237332	237337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
3567	NC_014299	GAT	2	6	237428	237433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713024
3568	NC_014299	TGA	2	6	237462	237467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713024
3569	NC_014299	TTGCA	2	10	237474	237483	20 %	40 %	20 %	20 %	300713024
3570	NC_014299	ACTGG	2	10	237526	237535	20 %	20 %	40 %	20 %	300713024
3571	NC_014299	TGA	2	6	237563	237568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713024
3572	NC_014299	TG	4	8	237587	237594	0 %	50 %	50 %	0 %	300713024
3573	NC_014299	TACG	2	8	237642	237649	25 %	25 %	25 %	25 %	300713024
3574	NC_014299	CT	3	6	237685	237690	0 %	50 %	0 %	50 %	300713024
3575	NC_014299	TCCG	2	8	237711	237718	0 %	25 %	25 %	50 %	300713024
3576	NC_014299	TTCAC	2	10	237742	237751	20 %	40 %	0 %	40 %	300713024
3577	NC_014299	CCA	2	6	237836	237841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713024
3578	NC_014299	GTCT	2	8	237867	237874	0 %	50 %	25 %	25 %	300713024
3579	NC_014299	ATGA	2	8	237982	237989	50 %	25 %	25 %	0 %	300713024
3580	NC_014299	CCG	2	6	237999	238004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300713024
3581	NC_014299	TCG	3	9	238018	238026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713024
3582	NC_014299	AG	3	6	238052	238057	50 %	0 %	50 %	0 %	300713024
3583	NC_014299	CAGA	2	8	238077	238084	50 %	0 %	25 %	25 %	300713024
3584	NC_014299	TCACCA	2	12	238108	238119	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	300713024
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3586	NC_014299	GAC	2	6	238190	238195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
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3588	NC_014299	TCA	3	9	238315	238323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713024
3589	NC_014299	GAC	2	6	238437	238442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
3590	NC_014299	TCT	2	6	238480	238485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713024
3591	NC_014299	GTA	2	6	238488	238493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713024
3592	NC_014299	GTT	2	6	238506	238511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300713024
3593	NC_014299	ACG	2	6	238513	238518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
3594	NC_014299	TTC	2	6	238525	238530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713024
3595	NC_014299	CGA	2	6	238541	238546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
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3597	NC_014299	CGGT	2	8	238599	238606	0 %	25 %	50 %	25 %	300713024
3598	NC_014299	TCATCG	2	12	238624	238635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300713024
3599	NC_014299	CGG	2	6	238709	238714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713024
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3601	NC_014299	ATC	2	6	238825	238830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713024
3602	NC_014299	TGCC	2	8	238938	238945	0 %	25 %	25 %	50 %	300713024
3603	NC_014299	TGTT	2	8	238962	238969	0 %	75 %	25 %	0 %	300713024
3604	NC_014299	TGG	2	6	238992	238997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300713024
3605	NC_014299	TCA	2	6	239029	239034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713024
3606	NC_014299	TC	3	6	239060	239065	0 %	50 %	0 %	50 %	300713024
3607	NC_014299	TCA	2	6	239125	239130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713024
3608	NC_014299	TGG	2	6	239987	239992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300713025
3609	NC_014299	TCGA	2	8	240012	240019	25 %	25 %	25 %	25 %	300713025
3610	NC_014299	GAA	2	6	240021	240026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300713025
3611	NC_014299	AAC	2	6	240152	240157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300713025
3612	NC_014299	GAA	2	6	240308	240313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300713025
3613	NC_014299	GA	3	6	240385	240390	50 %	0 %	50 %	0 %	300713025
3614	NC_014299	AGC	2	6	240469	240474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713025
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3616	NC_014299	CCA	2	6	240527	240532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713025
3617	NC_014299	GC	3	6	240560	240565	0 %	0 %	50 %	50 %	300713025
3618	NC_014299	GAC	2	6	240639	240644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713025
3619	NC_014299	CGG	2	6	240746	240751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713025
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3621	NC_014299	TGA	2	6	240791	240796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713025
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3982	NC_014299	CAT	2	6	267947	267952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713043
3983	NC_014299	CTT	2	6	267953	267958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713043
3984	NC_014299	TGCA	2	8	267961	267968	25 %	25 %	25 %	25 %	300713043
3985	NC_014299	TCCCG	2	10	267995	268004	0 %	20 %	20 %	60 %	300713043
3986	NC_014299	GGA	2	6	268178	268183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300713043
3987	NC_014299	CGT	2	6	268199	268204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713043
3988	NC_014299	TGT	2	6	268217	268222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300713043
3989	NC_014299	GGC	2	6	268390	268395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713043
3990	NC_014299	TCG	2	6	268408	268413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713043
3991	NC_014299	CGA	2	6	268427	268432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713043
3992	NC_014299	CGA	2	6	268436	268441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713043
3993	NC_014299	TCA	2	6	268450	268455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713043
3994	NC_014299	CTG	2	6	268579	268584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713043
3995	NC_014299	T	6	6	268635	268640	0 %	100 %	0 %	0 %	300713043
3996	NC_014299	CGC	2	6	268641	268646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300713043
3997	NC_014299	ACC	2	6	268836	268841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713043
3998	NC_014299	CTT	3	9	268856	268864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713043
3999	NC_014299	TAC	2	6	268904	268909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713043
4000	NC_014299	TCC	2	6	269488	269493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300713044

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