MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 5458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014299	CGT	2	6	62399	62404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712825
1002	NC_014299	GAT	2	6	62409	62414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712825
1003	NC_014299	CGGCG	2	10	62454	62463	0 %	0 %	60 %	40 %	300712825
1004	NC_014299	CCT	2	6	62474	62479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712825
1005	NC_014299	GTC	2	6	62482	62487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712825
1006	NC_014299	CTT	2	6	62565	62570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712825
1007	NC_014299	CGCT	2	8	62625	62632	0 %	25 %	25 %	50 %	300712825
1008	NC_014299	C	6	6	62652	62657	0 %	0 %	0 %	100 %	300712825
1009	NC_014299	CGG	2	6	62667	62672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712825
1010	NC_014299	GTA	2	6	62721	62726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712825
1011	NC_014299	GTT	2	6	62745	62750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712825
1012	NC_014299	CGG	2	6	62852	62857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712825
1013	NC_014299	ACG	2	6	62869	62874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712825
1014	NC_014299	GCA	2	6	62939	62944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712825
1015	NC_014299	GCCA	2	8	62985	62992	25 %	0 %	25 %	50 %	300712825
1016	NC_014299	GTC	2	6	63027	63032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712825
1017	NC_014299	GTG	2	6	63039	63044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712825
1018	NC_014299	CGG	2	6	63134	63139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712825
1019	NC_014299	CTC	2	6	63181	63186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712826
1020	NC_014299	CGG	2	6	63244	63249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712826
1021	NC_014299	GCT	2	6	63270	63275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712826
1022	NC_014299	CCGGC	2	10	63296	63305	0 %	0 %	40 %	60 %	300712826
1023	NC_014299	CGA	2	6	63361	63366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712826
1024	NC_014299	AAC	2	6	63429	63434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712826
1025	NC_014299	CGA	2	6	63454	63459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712826
1026	NC_014299	GGAC	2	8	63670	63677	25 %	0 %	50 %	25 %	300712826
1027	NC_014299	AGG	2	6	63711	63716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712826
1028	NC_014299	GGC	3	9	63800	63808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712826
1029	NC_014299	CCG	2	6	63831	63836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712826
1030	NC_014299	AAC	2	6	63851	63856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712826
1031	NC_014299	CGA	2	6	63895	63900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712826
1032	NC_014299	TCG	3	9	63913	63921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712826
1033	NC_014299	TTC	2	6	63933	63938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712826
1034	NC_014299	CG	3	6	63968	63973	0 %	0 %	50 %	50 %	300712826
1035	NC_014299	GCGA	2	8	63974	63981	25 %	0 %	50 %	25 %	300712826
1036	NC_014299	CGA	2	6	63985	63990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712826
1037	NC_014299	GT	4	8	64031	64038	0 %	50 %	50 %	0 %	300712826
1038	NC_014299	GT	3	6	64058	64063	0 %	50 %	50 %	0 %	300712826
1039	NC_014299	TGT	2	6	64074	64079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712826
1040	NC_014299	CGG	2	6	64271	64276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712827
1041	NC_014299	ACG	2	6	64297	64302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712827
1042	NC_014299	CCT	2	6	64307	64312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712827
1043	NC_014299	CGA	2	6	64405	64410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712827
1044	NC_014299	CGC	2	6	64493	64498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712827
1045	NC_014299	TGT	2	6	64522	64527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712827
1046	NC_014299	CGA	2	6	64574	64579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712827
1047	NC_014299	GTT	2	6	64617	64622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712827
1048	NC_014299	GTC	2	6	64658	64663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712827
1049	NC_014299	CGG	2	6	64670	64675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712827
1050	NC_014299	GGC	2	6	64686	64691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712827
1051	NC_014299	ATCGA	2	10	64696	64705	40 %	20 %	20 %	20 %	300712827
1052	NC_014299	CGA	2	6	64745	64750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712827
1053	NC_014299	CA	3	6	64814	64819	50 %	0 %	0 %	50 %	300712827
1054	NC_014299	TGA	2	6	64864	64869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712827
1055	NC_014299	TCG	2	6	64876	64881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712827
1056	NC_014299	GATG	2	8	64925	64932	25 %	25 %	50 %	0 %	300712827
1057	NC_014299	TGA	2	6	65027	65032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712827
1058	NC_014299	GAG	2	6	65064	65069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712827
1059	NC_014299	CGA	2	6	65098	65103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712827
1060	NC_014299	CAA	2	6	65186	65191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712828
1061	NC_014299	GTC	2	6	65197	65202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712828
1062	NC_014299	GGC	2	6	65264	65269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712828
1063	NC_014299	CG	3	6	65283	65288	0 %	0 %	50 %	50 %	300712828
1064	NC_014299	GCA	2	6	65389	65394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712828
1065	NC_014299	GAG	2	6	65400	65405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712828
1066	NC_014299	CCA	2	6	65419	65424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712828
1067	NC_014299	GCA	2	6	65474	65479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712828
1068	NC_014299	CTC	2	6	65496	65501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712828
1069	NC_014299	GAG	2	6	65526	65531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712828
1070	NC_014299	GCG	2	6	65608	65613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712829
1071	NC_014299	AGT	2	6	65699	65704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712829
1072	NC_014299	CAG	2	6	65758	65763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712829
1073	NC_014299	GGC	2	6	65822	65827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712829
1074	NC_014299	GTT	2	6	65855	65860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712829
1075	NC_014299	GAC	2	6	65933	65938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712829
1076	NC_014299	CCG	2	6	65946	65951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712829
1077	NC_014299	CT	3	6	65963	65968	0 %	50 %	0 %	50 %	300712829
1078	NC_014299	AC	3	6	65989	65994	50 %	0 %	0 %	50 %	300712829
1079	NC_014299	CGA	2	6	66010	66015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712829
1080	NC_014299	GTT	2	6	66074	66079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712829
1081	NC_014299	GGA	2	6	66169	66174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712829
1082	NC_014299	ACTGTC	2	12	66185	66196	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300712829
1083	NC_014299	CGT	2	6	66294	66299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712829
1084	NC_014299	TGA	2	6	66322	66327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712829
1085	NC_014299	TTG	2	6	66354	66359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712829
1086	NC_014299	TGTCC	2	10	66436	66445	0 %	40 %	20 %	40 %	300712830
1087	NC_014299	CGG	2	6	66697	66702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712830
1088	NC_014299	CGA	2	6	66706	66711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712830
1089	NC_014299	GGT	2	6	66721	66726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712830
1090	NC_014299	CCG	2	6	66744	66749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712830
1091	NC_014299	CGT	2	6	66835	66840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712830
1092	NC_014299	GAT	2	6	66884	66889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712830
1093	NC_014299	AAGAT	2	10	66918	66927	60 %	20 %	20 %	0 %	300712830
1094	NC_014299	CTC	2	6	67070	67075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712830
1095	NC_014299	CGG	2	6	67234	67239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712830
1096	NC_014299	CGA	2	6	67240	67245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712830
1097	NC_014299	CACAG	2	10	67319	67328	40 %	0 %	20 %	40 %	300712830
1098	NC_014299	AC	3	6	67369	67374	50 %	0 %	0 %	50 %	300712830
1099	NC_014299	GA	3	6	67418	67423	50 %	0 %	50 %	0 %	300712830
1100	NC_014299	CTG	2	6	67430	67435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712830
1101	NC_014299	AAT	2	6	67439	67444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300712830
1102	NC_014299	TTA	2	6	67716	67721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300712831
1103	NC_014299	TGA	2	6	67733	67738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712831
1104	NC_014299	GC	3	6	67759	67764	0 %	0 %	50 %	50 %	300712831
1105	NC_014299	GAA	2	6	67815	67820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712831
1106	NC_014299	ACG	2	6	67823	67828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712831
1107	NC_014299	CGAA	2	8	67850	67857	50 %	0 %	25 %	25 %	300712831
1108	NC_014299	ATG	2	6	68002	68007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712831
1109	NC_014299	CGACT	2	10	68017	68026	20 %	20 %	20 %	40 %	300712831
1110	NC_014299	CAA	2	6	68034	68039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712831
1111	NC_014299	TG	3	6	68083	68088	0 %	50 %	50 %	0 %	300712831
1112	NC_014299	CGG	2	6	68143	68148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712831
1113	NC_014299	CTG	2	6	68168	68173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712831
1114	NC_014299	ATCC	2	8	68181	68188	25 %	25 %	0 %	50 %	300712831
1115	NC_014299	GAG	2	6	68206	68211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712831
1116	NC_014299	ATT	2	6	68221	68226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300712831
1117	NC_014299	GAG	2	6	68287	68292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712831
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1119	NC_014299	GCCCA	2	10	68417	68426	20 %	0 %	20 %	60 %	300712831
1120	NC_014299	GAA	2	6	68451	68456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712831
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1122	NC_014299	GCG	2	6	68682	68687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712832
1123	NC_014299	CGA	2	6	68694	68699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712832
1124	NC_014299	GAG	2	6	68815	68820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712832
1125	NC_014299	CAA	2	6	68824	68829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712832
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1128	NC_014299	GAG	2	6	68881	68886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712832
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1141	NC_014299	TCCG	2	8	69344	69351	0 %	25 %	25 %	50 %	300712832
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1155	NC_014299	CGA	2	6	70092	70097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712833
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1241	NC_014299	CA	3	6	74211	74216	50 %	0 %	0 %	50 %	300712836
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1244	NC_014299	CCGT	2	8	74283	74290	0 %	25 %	25 %	50 %	300712836
1245	NC_014299	AGG	2	6	74321	74326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712836
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1495	NC_014299	TGA	2	6	87590	87595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712850
1496	NC_014299	TTC	2	6	87606	87611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712850
1497	NC_014299	TCA	2	6	87619	87624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712850
1498	NC_014299	TTC	2	6	87717	87722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712850
1499	NC_014299	GTCT	2	8	87782	87789	0 %	50 %	25 %	25 %	300712850
1500	NC_014299	CGA	2	6	87854	87859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712850

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