MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 chromosome

Total Repeats: 65207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014297	GTC	2	6	110	115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709372
2	NC_014297	CGG	2	6	134	139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
3	NC_014297	ACG	2	6	193	198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709372
4	NC_014297	GGA	2	6	245	250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709372
5	NC_014297	CCGA	2	8	260	267	25 %	0 %	25 %	50 %	300709372
6	NC_014297	CGC	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709372
7	NC_014297	CG	3	6	281	286	0 %	0 %	50 %	50 %	300709372
8	NC_014297	GAGC	2	8	293	300	25 %	0 %	50 %	25 %	300709372
9	NC_014297	CCT	2	6	335	340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709372
10	NC_014297	CGG	2	6	344	349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
11	NC_014297	CAA	2	6	362	367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300709372
12	NC_014297	GAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300709372
13	NC_014297	GC	3	6	466	471	0 %	0 %	50 %	50 %	300709372
14	NC_014297	CGCC	2	8	515	522	0 %	0 %	25 %	75 %	300709372
15	NC_014297	CGT	2	6	533	538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709372
16	NC_014297	CGG	2	6	581	586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
17	NC_014297	GGA	2	6	620	625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709372
18	NC_014297	CGT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709372
19	NC_014297	GAG	2	6	726	731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709372
20	NC_014297	GGC	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
21	NC_014297	CCGC	2	8	886	893	0 %	0 %	25 %	75 %	300709372
22	NC_014297	CGC	2	6	896	901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709372
23	NC_014297	GGGAC	2	10	914	923	20 %	0 %	60 %	20 %	300709372
24	NC_014297	CGA	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709372
25	NC_014297	CGG	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
26	NC_014297	TCGG	2	8	1039	1046	0 %	25 %	50 %	25 %	300709372
27	NC_014297	CGA	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709372
28	NC_014297	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300709372
29	NC_014297	GGT	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300709373
30	NC_014297	CGGT	2	8	1341	1348	0 %	25 %	50 %	25 %	300709373
31	NC_014297	GTC	2	6	1523	1528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709373
32	NC_014297	CGG	2	6	1567	1572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709373
33	NC_014297	GCGG	2	8	1574	1581	0 %	0 %	75 %	25 %	300709373
34	NC_014297	CGA	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709373
35	NC_014297	CG	4	8	1838	1845	0 %	0 %	50 %	50 %	300709374
36	NC_014297	CGT	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709374
37	NC_014297	CGA	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709374
38	NC_014297	GGA	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
39	NC_014297	GTC	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709374
40	NC_014297	TGACC	2	10	1949	1958	20 %	20 %	20 %	40 %	300709374
41	NC_014297	TCG	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709374
42	NC_014297	GAG	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
43	NC_014297	CGG	2	6	2006	2011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709374
44	NC_014297	GCGG	2	8	2034	2041	0 %	0 %	75 %	25 %	300709374
45	NC_014297	GCC	2	6	2042	2047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709374
46	NC_014297	TGA	2	6	2107	2112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709374
47	NC_014297	AGG	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
48	NC_014297	G	6	6	2160	2165	0 %	0 %	100 %	0 %	300709374
49	NC_014297	AGG	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
50	NC_014297	CTCG	2	8	2210	2217	0 %	25 %	25 %	50 %	300709374
51	NC_014297	CG	3	6	2327	2332	0 %	0 %	50 %	50 %	300709374
52	NC_014297	GAG	2	6	2385	2390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
53	NC_014297	CTC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709374
54	NC_014297	TCA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300709374
55	NC_014297	CGG	2	6	2519	2524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709374
56	NC_014297	CGA	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709375
57	NC_014297	GAG	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709375
58	NC_014297	CGA	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709375
59	NC_014297	GCC	2	6	2650	2655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709375
60	NC_014297	TCC	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709375
61	NC_014297	GTCT	2	8	2696	2703	0 %	50 %	25 %	25 %	300709375
62	NC_014297	GAG	2	6	2756	2761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709375
63	NC_014297	CGAG	2	8	2811	2818	25 %	0 %	50 %	25 %	300709375
64	NC_014297	CGTT	2	8	2855	2862	0 %	50 %	25 %	25 %	300709375
65	NC_014297	CGCA	2	8	2895	2902	25 %	0 %	25 %	50 %	300709376
66	NC_014297	CCG	2	6	2903	2908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
67	NC_014297	GCC	2	6	2912	2917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
68	NC_014297	CTT	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300709376
69	NC_014297	CGC	2	6	2991	2996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
70	NC_014297	GCG	2	6	2998	3003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
71	NC_014297	GCCC	2	8	3012	3019	0 %	0 %	25 %	75 %	300709376
72	NC_014297	CGA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709376
73	NC_014297	ACGG	2	8	3186	3193	25 %	0 %	50 %	25 %	300709376
74	NC_014297	CGG	2	6	3207	3212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
75	NC_014297	GCC	2	6	3225	3230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
76	NC_014297	CGAA	2	8	3234	3241	50 %	0 %	25 %	25 %	300709376
77	NC_014297	CGG	2	6	3254	3259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
78	NC_014297	CGA	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709376
79	NC_014297	CTAC	2	8	3330	3337	25 %	25 %	0 %	50 %	300709376
80	NC_014297	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
81	NC_014297	CG	4	8	3392	3399	0 %	0 %	50 %	50 %	300709376
82	NC_014297	GGCC	2	8	3428	3435	0 %	0 %	50 %	50 %	300709376
83	NC_014297	C	6	6	3454	3459	0 %	0 %	0 %	100 %	300709376
84	NC_014297	CGA	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709376
85	NC_014297	CGG	2	6	3472	3477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
86	NC_014297	CGC	2	6	3539	3544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
87	NC_014297	TGA	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709376
88	NC_014297	CGG	2	6	3632	3637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
89	NC_014297	GTCG	2	8	3672	3679	0 %	25 %	50 %	25 %	300709376
90	NC_014297	GTC	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709376
91	NC_014297	GCG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709377
92	NC_014297	TCG	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709377
93	NC_014297	CGA	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709377
94	NC_014297	CGT	2	6	3834	3839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709377
95	NC_014297	CGGT	2	8	3851	3858	0 %	25 %	50 %	25 %	300709377
96	NC_014297	GC	4	8	3915	3922	0 %	0 %	50 %	50 %	300709377
97	NC_014297	CGT	2	6	3930	3935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709377
98	NC_014297	GAC	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709377
99	NC_014297	ACC	2	6	4009	4014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300709377
100	NC_014297	AGC	2	6	4018	4023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709377
101	NC_014297	GC	3	6	4064	4069	0 %	0 %	50 %	50 %	300709377
102	NC_014297	CGG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709377
103	NC_014297	AGGA	2	8	4186	4193	50 %	0 %	50 %	0 %	300709377
104	NC_014297	ACG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709377
105	NC_014297	CTCG	2	8	4331	4338	0 %	25 %	25 %	50 %	300709378
106	NC_014297	GCG	2	6	4353	4358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709378
107	NC_014297	CGG	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709378
108	NC_014297	GGGC	2	8	4423	4430	0 %	0 %	75 %	25 %	300709378
109	NC_014297	CGTC	2	8	4525	4532	0 %	25 %	25 %	50 %	300709378
110	NC_014297	ATG	2	6	4593	4598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709378
111	NC_014297	GTC	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
112	NC_014297	GTC	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
113	NC_014297	TCG	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
114	NC_014297	AGG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709379
115	NC_014297	TCC	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709379
116	NC_014297	TCG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
117	NC_014297	CGA	3	9	4817	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709379
118	NC_014297	TCG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
119	NC_014297	CGG	2	6	4856	4861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709379
120	NC_014297	CTG	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
121	NC_014297	ACC	2	6	4921	4926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300709379
122	NC_014297	AGG	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709379
123	NC_014297	GA	3	6	5071	5076	50 %	0 %	50 %	0 %	300709379
124	NC_014297	CGA	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709379
125	NC_014297	CGA	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709379
126	NC_014297	TCG	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
127	NC_014297	TTC	2	6	5278	5283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300709379
128	NC_014297	TCG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
129	NC_014297	GTA	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709379
130	NC_014297	CGT	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
131	NC_014297	CGG	2	6	5471	5476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709379
132	NC_014297	AGT	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709379
133	NC_014297	CTC	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709379
134	NC_014297	GGA	2	6	5552	5557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709379
135	NC_014297	TCG	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
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261	NC_014297	GCC	2	6	18038	18043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709388
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263	NC_014297	CGA	2	6	18116	18121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709388
264	NC_014297	TCCC	2	8	18130	18137	0 %	25 %	0 %	75 %	300709388
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380	NC_014297	GC	5	10	22816	22825	0 %	0 %	50 %	50 %	300709392
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382	NC_014297	AGCC	2	8	22847	22854	25 %	0 %	25 %	50 %	300709392
383	NC_014297	TCC	2	6	22919	22924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709392
384	NC_014297	AGG	2	6	22958	22963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709392
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387	NC_014297	CCGC	2	8	23037	23044	0 %	0 %	25 %	75 %	300709392
388	NC_014297	AC	3	6	23126	23131	50 %	0 %	0 %	50 %	300709392
389	NC_014297	CGGG	2	8	23132	23139	0 %	0 %	75 %	25 %	300709392
390	NC_014297	CAG	2	6	23176	23181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709392
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393	NC_014297	GTT	2	6	23287	23292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300709392
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395	NC_014297	CACC	2	8	23337	23344	25 %	0 %	0 %	75 %	300709392
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