MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 74220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013967	GGC	2	6	282	287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654179
2	NC_013967	GAC	2	6	318	323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
3	NC_013967	GGC	2	6	324	329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654179
4	NC_013967	GACGCC	2	12	333	344	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654179
5	NC_013967	CACCGA	2	12	353	364	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	292654179
6	NC_013967	AC	3	6	367	372	50 %	0 %	0 %	50 %	292654179
7	NC_013967	ACG	2	6	379	384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
8	NC_013967	CGG	2	6	389	394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654179
9	NC_013967	CCG	2	6	403	408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654179
10	NC_013967	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654179
11	NC_013967	GAC	2	6	426	431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
12	NC_013967	CGACGC	2	12	473	484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654179
13	NC_013967	CGA	2	6	497	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
14	NC_013967	ACG	3	9	556	564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
15	NC_013967	CGA	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
16	NC_013967	TCC	2	6	628	633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654179
17	NC_013967	CGT	2	6	637	642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654179
18	NC_013967	GACC	2	8	668	675	25 %	0 %	25 %	50 %	292654179
19	NC_013967	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
20	NC_013967	GA	3	6	718	723	50 %	0 %	50 %	0 %	292654179
21	NC_013967	ACG	2	6	820	825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
22	NC_013967	GAA	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654179
23	NC_013967	CGA	2	6	950	955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
24	NC_013967	CGA	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
25	NC_013967	GC	3	6	1031	1036	0 %	0 %	50 %	50 %	292654179
26	NC_013967	CGA	3	9	1046	1054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
27	NC_013967	CGA	2	6	1058	1063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
28	NC_013967	CCGA	2	8	1092	1099	25 %	0 %	25 %	50 %	292654179
29	NC_013967	ACG	2	6	1110	1115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
30	NC_013967	TTC	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654179
31	NC_013967	GTC	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654179
32	NC_013967	CGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
33	NC_013967	CGA	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
34	NC_013967	GAG	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654179
35	NC_013967	ACG	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
36	NC_013967	TCC	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654179
37	NC_013967	GC	3	6	1411	1416	0 %	0 %	50 %	50 %	292654179
38	NC_013967	CGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
39	NC_013967	CGC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654179
40	NC_013967	CGC	2	6	1451	1456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654179
41	NC_013967	GC	4	8	1478	1485	0 %	0 %	50 %	50 %	292654179
42	NC_013967	CGGC	2	8	1501	1508	0 %	0 %	50 %	50 %	292654179
43	NC_013967	GAG	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654179
44	NC_013967	GGT	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654179
45	NC_013967	GTC	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654179
46	NC_013967	CAT	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654179
47	NC_013967	CCT	2	6	1649	1654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654179
48	NC_013967	GAG	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654179
49	NC_013967	CGT	3	9	1802	1810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654179
50	NC_013967	GTCC	2	8	1850	1857	0 %	25 %	25 %	50 %	292654179
51	NC_013967	CGA	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654179
52	NC_013967	CTG	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654179
53	NC_013967	AACTGA	2	12	1947	1958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	292654179
54	NC_013967	CGC	2	6	2003	2008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654180
55	NC_013967	GCG	2	6	2013	2018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654180
56	NC_013967	GT	3	6	2029	2034	0 %	50 %	50 %	0 %	292654180
57	NC_013967	CGT	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654180
58	NC_013967	CGC	3	9	2066	2074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654180
59	NC_013967	CCG	2	6	2128	2133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654180
60	NC_013967	TCG	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654180
61	NC_013967	CGA	2	6	2152	2157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654180
62	NC_013967	GGGC	2	8	2167	2174	0 %	0 %	75 %	25 %	292654180
63	NC_013967	CGT	3	9	2183	2191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654180
64	NC_013967	ACCC	2	8	2220	2227	25 %	0 %	0 %	75 %	292654180
65	NC_013967	CG	3	6	2247	2252	0 %	0 %	50 %	50 %	292654180
66	NC_013967	GTT	2	6	2315	2320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654180
67	NC_013967	TGA	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654180
68	NC_013967	CGG	2	6	2350	2355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654180
69	NC_013967	TC	3	6	2422	2427	0 %	50 %	0 %	50 %	292654180
70	NC_013967	CGT	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654180
71	NC_013967	GTC	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654180
72	NC_013967	GCC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654180
73	NC_013967	GAC	2	6	2555	2560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654180
74	NC_013967	CCG	2	6	2575	2580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654180
75	NC_013967	TGA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654180
76	NC_013967	CGG	2	6	2672	2677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654180
77	NC_013967	CGC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654180
78	NC_013967	GC	3	6	2728	2733	0 %	0 %	50 %	50 %	292654180
79	NC_013967	CTC	2	6	2768	2773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654180
80	NC_013967	TCG	2	6	2802	2807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654180
81	NC_013967	CCGCG	2	10	2817	2826	0 %	0 %	40 %	60 %	292654180
82	NC_013967	GGGC	2	8	2837	2844	0 %	0 %	75 %	25 %	292654180
83	NC_013967	TCG	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654180
84	NC_013967	TCA	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654180
85	NC_013967	GC	3	6	2960	2965	0 %	0 %	50 %	50 %	292654181
86	NC_013967	TCG	2	6	2979	2984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654181
87	NC_013967	CGA	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
88	NC_013967	CGT	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654181
89	NC_013967	GCC	2	6	3071	3076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654181
90	NC_013967	GAC	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
91	NC_013967	CCG	2	6	3099	3104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654181
92	NC_013967	CGC	2	6	3136	3141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654181
93	NC_013967	GAACC	2	10	3153	3162	40 %	0 %	20 %	40 %	292654181
94	NC_013967	CGC	2	6	3193	3198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654181
95	NC_013967	GCC	2	6	3212	3217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654181
96	NC_013967	CCG	2	6	3219	3224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654181
97	NC_013967	GGC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654181
98	NC_013967	ACG	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
99	NC_013967	ACC	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654181
100	NC_013967	CGG	2	6	3499	3504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654181
101	NC_013967	TCG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654181
102	NC_013967	ACG	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
103	NC_013967	CCA	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654181
104	NC_013967	ACG	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
105	NC_013967	TGA	2	6	3609	3614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654181
106	NC_013967	AGGACA	2	12	3615	3626	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	292654181
107	NC_013967	CGA	2	6	3640	3645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
108	NC_013967	CTC	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654181
109	NC_013967	TCG	2	6	3708	3713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654181
110	NC_013967	CCG	2	6	3759	3764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654181
111	NC_013967	GGC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654181
112	NC_013967	GAG	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654181
113	NC_013967	GC	3	6	3872	3877	0 %	0 %	50 %	50 %	292654181
114	NC_013967	CCT	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654181
115	NC_013967	GGCGTC	2	12	3914	3925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292654181
116	NC_013967	GAA	2	6	3941	3946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654181
117	NC_013967	TGA	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654181
118	NC_013967	ACG	2	6	4044	4049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
119	NC_013967	CGA	3	9	4081	4089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
120	NC_013967	CAT	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654181
121	NC_013967	ACG	2	6	4113	4118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
122	NC_013967	GCCG	2	8	4213	4220	0 %	0 %	50 %	50 %	292654181
123	NC_013967	ACG	2	6	4233	4238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654181
124	NC_013967	CGC	2	6	4284	4289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654181
125	NC_013967	GGA	2	6	4342	4347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654181
126	NC_013967	GCT	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654181
127	NC_013967	TCG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654181
128	NC_013967	TGA	2	6	4684	4689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654182
129	NC_013967	CGA	2	6	4691	4696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654182
130	NC_013967	CGACG	2	10	4706	4715	20 %	0 %	40 %	40 %	292654182
131	NC_013967	CGA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654182
132	NC_013967	ACT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654182
133	NC_013967	CGG	2	6	4835	4840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654182
134	NC_013967	GAC	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654182
135	NC_013967	CGA	2	6	4922	4927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654182
136	NC_013967	AC	3	6	4975	4980	50 %	0 %	0 %	50 %	292654182
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139	NC_013967	GGC	2	6	5129	5134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654182
140	NC_013967	CGA	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654182
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142	NC_013967	CCGC	2	8	5155	5162	0 %	0 %	25 %	75 %	292654182
143	NC_013967	GCGG	2	8	5174	5181	0 %	0 %	75 %	25 %	292654182
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253	NC_013967	CG	3	6	8919	8924	0 %	0 %	50 %	50 %	292654187
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380	NC_013967	CGAG	2	8	14106	14113	25 %	0 %	50 %	25 %	292654191
381	NC_013967	CGA	2	6	14154	14159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654191
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386	NC_013967	TCG	2	6	14435	14440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654191
387	NC_013967	CGA	2	6	14442	14447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654191
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493	NC_013967	ATT	2	6	18036	18041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292654196
494	NC_013967	GAG	2	6	18044	18049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654196
495	NC_013967	TCGACA	2	12	18177	18188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292654196
496	NC_013967	CGG	2	6	18192	18197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654196
497	NC_013967	CGAC	2	8	18210	18217	25 %	0 %	25 %	50 %	292654196
498	NC_013967	CGA	2	6	18328	18333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
499	NC_013967	CGC	2	6	18403	18408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654197
500	NC_013967	ACG	2	6	18423	18428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197

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