MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 74220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_013967	ACGG	2	8	2258537	2258544	25 %	0 %	50 %	25 %	292656514
59002	NC_013967	GGCC	2	8	2258560	2258567	0 %	0 %	50 %	50 %	292656514
59003	NC_013967	ACG	2	6	2258586	2258591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656514
59004	NC_013967	CGT	2	6	2258599	2258604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656514
59005	NC_013967	CG	4	8	2258608	2258615	0 %	0 %	50 %	50 %	292656514
59006	NC_013967	CGGCGA	2	12	2258647	2258658	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292656514
59007	NC_013967	TCG	3	9	2258661	2258669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656514
59008	NC_013967	TCG	3	9	2258688	2258696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656514
59009	NC_013967	GACG	2	8	2258719	2258726	25 %	0 %	50 %	25 %	292656514
59010	NC_013967	CGG	2	6	2258743	2258748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292656514
59011	NC_013967	GCC	2	6	2258768	2258773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656514
59012	NC_013967	GAC	2	6	2258786	2258791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656514
59013	NC_013967	TCA	2	6	2258796	2258801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292656514
59014	NC_013967	CGG	2	6	2258805	2258810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292656514
59015	NC_013967	CTC	2	6	2258830	2258835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292656514
59016	NC_013967	CT	4	8	2258900	2258907	0 %	50 %	0 %	50 %	292656515
59017	NC_013967	GGT	2	6	2258977	2258982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292656515
59018	NC_013967	CCG	2	6	2259009	2259014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656515
59019	NC_013967	CGA	2	6	2259016	2259021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59020	NC_013967	CGC	2	6	2259159	2259164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656515
59021	NC_013967	CGGT	2	8	2259228	2259235	0 %	25 %	50 %	25 %	292656515
59022	NC_013967	CGA	2	6	2259316	2259321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59023	NC_013967	GCG	2	6	2259342	2259347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292656515
59024	NC_013967	CGT	2	6	2259376	2259381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59025	NC_013967	TTC	2	6	2259425	2259430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292656515
59026	NC_013967	GCTC	2	8	2259475	2259482	0 %	25 %	25 %	50 %	292656515
59027	NC_013967	ACCT	2	8	2259551	2259558	25 %	25 %	0 %	50 %	292656515
59028	NC_013967	GGA	2	6	2259562	2259567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292656515
59029	NC_013967	CG	3	6	2259601	2259606	0 %	0 %	50 %	50 %	292656515
59030	NC_013967	GTC	2	6	2259608	2259613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59031	NC_013967	GCG	2	6	2259627	2259632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292656515
59032	NC_013967	GTC	2	6	2259641	2259646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59033	NC_013967	TCGGCG	2	12	2259696	2259707	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292656515
59034	NC_013967	CGC	2	6	2259727	2259732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656515
59035	NC_013967	CGCGGT	2	12	2259736	2259747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292656515
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59040	NC_013967	GC	3	6	2259819	2259824	0 %	0 %	50 %	50 %	292656515
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59045	NC_013967	CGA	2	6	2259910	2259915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59046	NC_013967	CG	3	6	2259923	2259928	0 %	0 %	50 %	50 %	292656515
59047	NC_013967	CGA	2	6	2259949	2259954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59048	NC_013967	ACCGTC	2	12	2259977	2259988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292656515
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59050	NC_013967	GAC	2	6	2260103	2260108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59051	NC_013967	CGA	2	6	2260117	2260122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59052	NC_013967	GTC	2	6	2260130	2260135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656515
59053	NC_013967	ACGG	2	8	2260184	2260191	25 %	0 %	50 %	25 %	292656515
59054	NC_013967	TCCCGT	2	12	2260198	2260209	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	292656515
59055	NC_013967	TCG	3	9	2260221	2260229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656515
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59060	NC_013967	CTCG	2	8	2260315	2260322	0 %	25 %	25 %	50 %	292656515
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59102	NC_013967	TTCC	2	8	2261671	2261678	0 %	50 %	0 %	50 %	292656517
59103	NC_013967	CGT	2	6	2261682	2261687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656517
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59113	NC_013967	GTC	2	6	2262100	2262105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59114	NC_013967	TGCGCC	2	12	2262229	2262240	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292656518
59115	NC_013967	GAG	2	6	2262276	2262281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292656518
59116	NC_013967	GTCG	2	8	2262321	2262328	0 %	25 %	50 %	25 %	292656518
59117	NC_013967	CGA	2	6	2262332	2262337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59118	NC_013967	TCG	2	6	2262349	2262354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59119	NC_013967	GTC	2	6	2262426	2262431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59120	NC_013967	TCG	2	6	2262454	2262459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59121	NC_013967	TCGGGC	2	12	2262463	2262474	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292656518
59122	NC_013967	CG	3	6	2262512	2262517	0 %	0 %	50 %	50 %	292656518
59123	NC_013967	CGT	2	6	2262555	2262560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59124	NC_013967	GGTCTC	2	12	2262579	2262590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59125	NC_013967	ATC	2	6	2262658	2262663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292656518
59126	NC_013967	CGT	2	6	2262668	2262673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59127	NC_013967	GA	3	6	2262736	2262741	50 %	0 %	50 %	0 %	292656518
59128	NC_013967	GTCTGC	2	12	2262796	2262807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59129	NC_013967	GTCTGT	2	12	2262808	2262819	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	292656518
59130	NC_013967	CTG	2	6	2262846	2262851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656518
59131	NC_013967	CCG	2	6	2262860	2262865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656518
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59134	NC_013967	TGA	2	6	2263588	2263593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292656519
59135	NC_013967	CGA	2	6	2263616	2263621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656519
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59139	NC_013967	CGT	2	6	2263723	2263728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656519
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59141	NC_013967	CCCG	2	8	2264176	2264183	0 %	0 %	25 %	75 %	292656520
59142	NC_013967	CCG	2	6	2264189	2264194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656520
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59144	NC_013967	GC	3	6	2264213	2264218	0 %	0 %	50 %	50 %	292656520
59145	NC_013967	GCG	2	6	2264248	2264253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292656520
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59150	NC_013967	AGT	2	6	2264365	2264370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292656520
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59154	NC_013967	CG	3	6	2264707	2264712	0 %	0 %	50 %	50 %	292656521
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59183	NC_013967	GTC	2	6	2265664	2265669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656523
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59192	NC_013967	CG	3	6	2265935	2265940	0 %	0 %	50 %	50 %	292656523
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59215	NC_013967	CGG	2	6	2266802	2266807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292656524
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59218	NC_013967	TCG	2	6	2266915	2266920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656524
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59221	NC_013967	CG	3	6	2266991	2266996	0 %	0 %	50 %	50 %	292656524
59222	NC_013967	GCCC	2	8	2267009	2267016	0 %	0 %	25 %	75 %	292656524
59223	NC_013967	CGA	2	6	2267024	2267029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656524
59224	NC_013967	GC	4	8	2267032	2267039	0 %	0 %	50 %	50 %	292656524
59225	NC_013967	CGGC	2	8	2267135	2267142	0 %	0 %	50 %	50 %	292656524
59226	NC_013967	ACC	2	6	2267155	2267160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292656524
59227	NC_013967	TCG	2	6	2267164	2267169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656524
59228	NC_013967	CCG	2	6	2267210	2267215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656524
59229	NC_013967	GCCAGC	2	12	2267236	2267247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292656524
59230	NC_013967	GC	3	6	2267246	2267251	0 %	0 %	50 %	50 %	292656524
59231	NC_013967	CG	3	6	2267262	2267267	0 %	0 %	50 %	50 %	292656524
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59345	NC_013967	GAG	2	6	2271270	2271275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292656528
59346	NC_013967	CGT	2	6	2271302	2271307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656528
59347	NC_013967	GTC	2	6	2271447	2271452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656528
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59351	NC_013967	TCG	2	6	2271661	2271666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656528
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59453	NC_013967	GTC	3	9	2275349	2275357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656534
59454	NC_013967	CGA	2	6	2275429	2275434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656534
59455	NC_013967	CGA	2	6	2275453	2275458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656534
59456	NC_013967	CGA	2	6	2275499	2275504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656534
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59458	NC_013967	CGA	2	6	2275561	2275566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656534
59459	NC_013967	CGA	2	6	2275618	2275623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656534
59460	NC_013967	CGA	2	6	2275630	2275635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656534
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59462	NC_013967	GCC	2	6	2275673	2275678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656534
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59492	NC_013967	CG	3	6	2276760	2276765	0 %	0 %	50 %	50 %	292656536
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